MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 102537

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16502	NC_021814	CTC	2	6	789197	789202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525837364
16503	NC_021814	GATCTG	2	12	789285	789296	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525837364
16504	NC_021814	CAC	2	6	789299	789304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525837364
16505	NC_021814	GTG	2	6	789315	789320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837364
16506	NC_021814	AAC	2	6	789332	789337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525837364
16507	NC_021814	CTAT	2	8	789349	789356	25 %	50 %	0 %	25 %	525837364
16508	NC_021814	GCC	2	6	789377	789382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837364
16509	NC_021814	TTA	2	6	789460	789465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837364
16510	NC_021814	GTG	2	6	789555	789560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837364
16511	NC_021814	CTT	2	6	789566	789571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837364
16512	NC_021814	CG	3	6	789592	789597	0 %	0 %	50 %	50 %	525837364
16513	NC_021814	CAA	2	6	789668	789673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525837364
16514	NC_021814	GCGCTG	2	12	789687	789698	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	525837364
16515	NC_021814	TGG	2	6	789739	789744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837364
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16517	NC_021814	CAG	2	6	789771	789776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837364
16518	NC_021814	GGC	2	6	789794	789799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837364
16519	NC_021814	ATT	2	6	789813	789818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837364
16520	NC_021814	CGG	2	6	789869	789874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837364
16521	NC_021814	A	6	6	789891	789896	100 %	0 %	0 %	0 %	525837364
16522	NC_021814	CTG	2	6	789897	789902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837364
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16525	NC_021814	GTTT	2	8	790095	790102	0 %	75 %	25 %	0 %	525837365
16526	NC_021814	GC	3	6	790120	790125	0 %	0 %	50 %	50 %	525837365
16527	NC_021814	ACGCT	2	10	790166	790175	20 %	20 %	20 %	40 %	525837365
16528	NC_021814	GCTG	2	8	790199	790206	0 %	25 %	50 %	25 %	525837365
16529	NC_021814	TCGT	2	8	790250	790257	0 %	50 %	25 %	25 %	525837365
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16535	NC_021814	CCG	2	6	790816	790821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837365
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16539	NC_021814	ATT	2	6	791048	791053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16540	NC_021814	CTT	2	6	791178	791183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16541	NC_021814	TTG	2	6	791243	791248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837366
16542	NC_021814	CATT	2	8	791252	791259	25 %	50 %	0 %	25 %	525837366
16543	NC_021814	TAAT	2	8	791285	791292	50 %	50 %	0 %	0 %	525837366
16544	NC_021814	ATC	2	6	791324	791329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837366
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16548	NC_021814	GC	3	6	791484	791489	0 %	0 %	50 %	50 %	525837366
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16552	NC_021814	CGT	2	6	791893	791898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837366
16553	NC_021814	GCC	2	6	791914	791919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837366
16554	NC_021814	A	6	6	791932	791937	100 %	0 %	0 %	0 %	525837366
16555	NC_021814	TCG	2	6	791986	791991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837367
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16557	NC_021814	GAA	2	6	792153	792158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837367
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16559	NC_021814	TGA	2	6	792178	792183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837367
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16605	NC_021814	AT	3	6	794763	794768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16606	NC_021814	TTG	2	6	794801	794806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16607	NC_021814	TTC	2	6	794877	794882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837371
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16611	NC_021814	CGGG	2	8	795117	795124	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16612	NC_021814	GCAG	2	8	795210	795217	25 %	0 %	50 %	25 %	525837372
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16741	NC_021814	TGGA	2	8	801613	801620	25 %	25 %	50 %	0 %	525840626
16742	NC_021814	TGC	2	6	801664	801669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840626
16743	NC_021814	GCT	2	6	801689	801694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840626
16744	NC_021814	GTT	2	6	801704	801709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525840626
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16750	NC_021814	GCCA	2	8	802002	802009	25 %	0 %	25 %	50 %	525840626
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16766	NC_021814	CGT	2	6	802722	802727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837378
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16861	NC_021814	A	6	6	806580	806585	100 %	0 %	0 %	0 %	525840627
16862	NC_021814	CCTT	2	8	806586	806593	0 %	50 %	0 %	50 %	525840627
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16982	NC_021814	GAC	2	6	812980	812985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837382
16983	NC_021814	CAT	2	6	813009	813014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837382
16984	NC_021814	TCTTTG	2	12	813053	813064	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	525837382
16985	NC_021814	GAA	2	6	813097	813102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837382
16986	NC_021814	GAC	2	6	813103	813108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837382
16987	NC_021814	TCC	2	6	813142	813147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16988	NC_021814	ACC	2	6	813161	813166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16989	NC_021814	CGA	2	6	813231	813236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837383
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16993	NC_021814	GCCA	3	12	813346	813357	25 %	0 %	25 %	50 %	525837383
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16995	NC_021814	ATC	2	6	813497	813502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837383
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