MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 102537

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_021814	AC	3	6	763843	763848	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16002	NC_021814	CGTC	2	8	763861	763868	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16003	NC_021814	AAC	2	6	763880	763885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16004	NC_021814	AGC	2	6	763970	763975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16005	NC_021814	CAT	2	6	763976	763981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16006	NC_021814	AAAG	2	8	763984	763991	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16007	NC_021814	GTT	2	6	764079	764084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16008	NC_021814	G	6	6	764321	764326	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16009	NC_021814	GT	4	8	764379	764386	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16010	NC_021814	TGA	2	6	764422	764427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16011	NC_021814	CAA	2	6	764449	764454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16012	NC_021814	GGT	2	6	764521	764526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16013	NC_021814	GA	3	6	764551	764556	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16014	NC_021814	AGTC	2	8	764647	764654	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16015	NC_021814	GCTG	2	8	764665	764672	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16016	NC_021814	TTA	2	6	764680	764685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16017	NC_021814	CGG	2	6	764804	764809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16018	NC_021814	ATG	2	6	764880	764885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16019	NC_021814	ACC	2	6	765075	765080	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16020	NC_021814	TGG	2	6	765135	765140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16021	NC_021814	TCC	2	6	765161	765166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16022	NC_021814	GGA	2	6	765178	765183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16023	NC_021814	AGG	2	6	765216	765221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16024	NC_021814	GGT	2	6	765298	765303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16025	NC_021814	CGG	2	6	765385	765390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16026	NC_021814	TCA	2	6	765413	765418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16027	NC_021814	CGT	2	6	765493	765498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16028	NC_021814	G	6	6	765542	765547	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16029	NC_021814	GAC	3	9	765724	765732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16030	NC_021814	GT	3	6	765746	765751	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16031	NC_021814	CAG	2	6	765847	765852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16032	NC_021814	GGC	2	6	765896	765901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16033	NC_021814	AAGGA	2	10	765907	765916	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
16034	NC_021814	TGAC	2	8	765936	765943	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16035	NC_021814	GCA	2	6	765962	765967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16036	NC_021814	GGC	2	6	766007	766012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16037	NC_021814	GGT	2	6	766021	766026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16038	NC_021814	TTTTGT	2	12	766158	766169	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16039	NC_021814	GGC	2	6	766185	766190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16040	NC_021814	ACCC	2	8	766263	766270	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
16041	NC_021814	TA	3	6	766305	766310	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16042	NC_021814	CAG	2	6	766352	766357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837345
16043	NC_021814	CAG	2	6	766382	766387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837345
16044	NC_021814	TTC	2	6	766455	766460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837345
16045	NC_021814	GTT	2	6	766519	766524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837345
16046	NC_021814	GCA	2	6	766537	766542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837345
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16049	NC_021814	CGG	2	6	766689	766694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837345
16050	NC_021814	TGG	2	6	766712	766717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837345
16051	NC_021814	GAAACG	2	12	766747	766758	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	525837345
16052	NC_021814	CAAA	2	8	766791	766798	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
16053	NC_021814	TTTA	2	8	766809	766816	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16054	NC_021814	CAA	2	6	766871	766876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16055	NC_021814	ATT	2	6	766896	766901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525840622
16056	NC_021814	AAC	2	6	766917	766922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525840622
16057	NC_021814	GCG	2	6	766940	766945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840622
16058	NC_021814	GCTC	2	8	767020	767027	0 %	25 %	25 %	50 %	525840622
16059	NC_021814	TCT	2	6	767041	767046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525840622
16060	NC_021814	ACT	2	6	767064	767069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840622
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16062	NC_021814	T	6	6	767105	767110	0 %	100 %	0 %	0 %	525840622
16063	NC_021814	GGT	2	6	767124	767129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840622
16064	NC_021814	ATG	2	6	767193	767198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840622
16065	NC_021814	GTCTG	2	10	767222	767231	0 %	40 %	40 %	20 %	525840622
16066	NC_021814	TCC	2	6	767234	767239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525840622
16067	NC_021814	AAT	2	6	767251	767256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525840622
16068	NC_021814	CAT	2	6	767260	767265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16069	NC_021814	GAA	2	6	767330	767335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16070	NC_021814	GTA	2	6	767391	767396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16071	NC_021814	TGCC	2	8	767467	767474	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16072	NC_021814	A	7	7	767545	767551	100 %	0 %	0 %	0 %	525840623
16073	NC_021814	CGG	2	6	767558	767563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840623
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16075	NC_021814	CTG	2	6	767705	767710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840623
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16077	NC_021814	GCCGGA	2	12	767755	767766	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	525840623
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16081	NC_021814	TTA	2	6	767888	767893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525840623
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16085	NC_021814	CTGG	2	8	767961	767968	0 %	25 %	50 %	25 %	525840624
16086	NC_021814	CTT	2	6	768217	768222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525840624
16087	NC_021814	GAACG	2	10	768251	768260	40 %	0 %	40 %	20 %	525840624
16088	NC_021814	CGCC	2	8	768325	768332	0 %	0 %	25 %	75 %	525840625
16089	NC_021814	GGC	2	6	768409	768414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840625
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16091	NC_021814	CCGG	2	8	768670	768677	0 %	0 %	50 %	50 %	525840625
16092	NC_021814	CCTG	2	8	768692	768699	0 %	25 %	25 %	50 %	525840625
16093	NC_021814	TGG	2	6	768700	768705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840625
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16095	NC_021814	CAG	2	6	768754	768759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840625
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16097	NC_021814	CGT	2	6	768944	768949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840625
16098	NC_021814	CTG	2	6	769007	769012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840625
16099	NC_021814	TGA	2	6	769069	769074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840625
16100	NC_021814	TGA	2	6	769144	769149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840625
16101	NC_021814	CGG	2	6	769176	769181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840625
16102	NC_021814	CCGGA	2	10	769199	769208	20 %	0 %	40 %	40 %	525840625
16103	NC_021814	ATCC	2	8	769214	769221	25 %	25 %	0 %	50 %	525840625
16104	NC_021814	GGT	2	6	769271	769276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840625
16105	NC_021814	TGCA	2	8	769353	769360	25 %	25 %	25 %	25 %	525840625
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16107	NC_021814	CAG	2	6	769443	769448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840625
16108	NC_021814	GGC	2	6	769459	769464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840625
16109	NC_021814	CTG	2	6	769571	769576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840625
16110	NC_021814	ACA	3	9	769629	769637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525840625
16111	NC_021814	GGT	2	6	769706	769711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840625
16112	NC_021814	GCG	2	6	769718	769723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840625
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16114	NC_021814	AT	3	6	770037	770042	50 %	50 %	0 %	0 %	525837346
16115	NC_021814	CGT	2	6	770081	770086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837346
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16120	NC_021814	CAG	2	6	770414	770419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837346
16121	NC_021814	ATGC	2	8	770422	770429	25 %	25 %	25 %	25 %	525837346
16122	NC_021814	TG	3	6	770462	770467	0 %	50 %	50 %	0 %	525837346
16123	NC_021814	CTATG	2	10	770528	770537	20 %	40 %	20 %	20 %	525837346
16124	NC_021814	TC	3	6	770574	770579	0 %	50 %	0 %	50 %	525837346
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16126	NC_021814	ATTG	2	8	770637	770644	25 %	50 %	25 %	0 %	525837346
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16243	NC_021814	TGG	2	6	776806	776811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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