MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 102537

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15502	NC_021814	TAA	2	6	738979	738984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837325
15503	NC_021814	GCT	2	6	739004	739009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837325
15504	NC_021814	CTT	2	6	739039	739044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837325
15505	NC_021814	CCAG	2	8	739060	739067	25 %	0 %	25 %	50 %	525837325
15506	NC_021814	CA	3	6	739105	739110	50 %	0 %	0 %	50 %	525837325
15507	NC_021814	ACGA	2	8	739259	739266	50 %	0 %	25 %	25 %	525837325
15508	NC_021814	T	6	6	739355	739360	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15509	NC_021814	AAT	2	6	739390	739395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837326
15510	NC_021814	T	7	7	739395	739401	0 %	100 %	0 %	0 %	525837326
15511	NC_021814	GCG	2	6	739479	739484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837326
15512	NC_021814	TCCT	2	8	739500	739507	0 %	50 %	0 %	50 %	525837326
15513	NC_021814	CTG	2	6	739588	739593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837326
15514	NC_021814	GCC	2	6	739677	739682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837326
15515	NC_021814	TCA	2	6	739762	739767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837326
15516	NC_021814	GCA	2	6	739811	739816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837326
15517	NC_021814	CAG	2	6	739878	739883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837326
15518	NC_021814	TTG	2	6	739929	739934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837326
15519	NC_021814	CGC	2	6	740048	740053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837326
15520	NC_021814	T	6	6	740113	740118	0 %	100 %	0 %	0 %	525837326
15521	NC_021814	TTG	2	6	740139	740144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837326
15522	NC_021814	ATT	2	6	740256	740261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837326
15523	NC_021814	TGA	2	6	740291	740296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15524	NC_021814	ATA	2	6	740337	740342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15525	NC_021814	A	7	7	740367	740373	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15526	NC_021814	AGT	2	6	740390	740395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837327
15527	NC_021814	GAA	2	6	740429	740434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837327
15528	NC_021814	CTG	2	6	740484	740489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837327
15529	NC_021814	CG	3	6	740502	740507	0 %	0 %	50 %	50 %	525837327
15530	NC_021814	A	6	6	740511	740516	100 %	0 %	0 %	0 %	525837327
15531	NC_021814	CGT	2	6	740606	740611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837327
15532	NC_021814	TGC	2	6	740670	740675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837327
15533	NC_021814	CG	3	6	740696	740701	0 %	0 %	50 %	50 %	525837327
15534	NC_021814	GGC	2	6	740734	740739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837327
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15536	NC_021814	GGCA	2	8	740884	740891	25 %	0 %	50 %	25 %	525837327
15537	NC_021814	TAT	2	6	740902	740907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837327
15538	NC_021814	CG	3	6	740942	740947	0 %	0 %	50 %	50 %	525837327
15539	NC_021814	GCGAAG	2	12	740963	740974	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	525837327
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15541	NC_021814	A	6	6	741019	741024	100 %	0 %	0 %	0 %	525840620
15542	NC_021814	T	7	7	741062	741068	0 %	100 %	0 %	0 %	525840620
15543	NC_021814	TTCA	2	8	741114	741121	25 %	50 %	0 %	25 %	525840620
15544	NC_021814	AAG	2	6	741243	741248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525840620
15545	NC_021814	T	6	6	741277	741282	0 %	100 %	0 %	0 %	525840620
15546	NC_021814	CTT	2	6	741326	741331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525840620
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15549	NC_021814	GGTTG	2	10	741528	741537	0 %	40 %	60 %	0 %	525840620
15550	NC_021814	TG	3	6	741536	741541	0 %	50 %	50 %	0 %	525840620
15551	NC_021814	A	7	7	741544	741550	100 %	0 %	0 %	0 %	525840620
15552	NC_021814	CGA	2	6	741557	741562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840620
15553	NC_021814	GTC	2	6	741570	741575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840620
15554	NC_021814	TCT	2	6	741607	741612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525840620
15555	NC_021814	ATT	2	6	741652	741657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15556	NC_021814	A	6	6	741708	741713	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15557	NC_021814	CG	3	6	741845	741850	0 %	0 %	50 %	50 %	525837328
15558	NC_021814	TCC	2	6	741868	741873	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525837328
15559	NC_021814	GC	3	6	741903	741908	0 %	0 %	50 %	50 %	525837328
15560	NC_021814	AAT	2	6	741972	741977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837328
15561	NC_021814	CGT	2	6	741986	741991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837328
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15565	NC_021814	GCG	2	6	742163	742168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837328
15566	NC_021814	CGG	2	6	742196	742201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837328
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15569	NC_021814	CACG	2	8	742259	742266	25 %	0 %	25 %	50 %	525837328
15570	NC_021814	GCA	2	6	742268	742273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837328
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15572	NC_021814	GTC	2	6	742359	742364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837328
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15585	NC_021814	ATG	2	6	742978	742983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15587	NC_021814	AGCTT	2	10	743041	743050	20 %	40 %	20 %	20 %	525837329
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15591	NC_021814	CAG	2	6	743275	743280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837329
15592	NC_021814	ACG	2	6	743282	743287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837329
15593	NC_021814	TCA	2	6	743325	743330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837329
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15599	NC_021814	AGCC	2	8	743564	743571	25 %	0 %	25 %	50 %	525837329
15600	NC_021814	ACGCG	2	10	743578	743587	20 %	0 %	40 %	40 %	525837329
15601	NC_021814	TCA	2	6	743595	743600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837329
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15605	NC_021814	AGAA	2	8	743725	743732	75 %	0 %	25 %	0 %	525837329
15606	NC_021814	CGC	2	6	743741	743746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837329
15607	NC_021814	T	7	7	743756	743762	0 %	100 %	0 %	0 %	525837329
15608	NC_021814	AAC	2	6	743910	743915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15609	NC_021814	GCG	2	6	743965	743970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15610	NC_021814	GA	3	6	743993	743998	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15611	NC_021814	GCT	2	6	744111	744116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837330
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15621	NC_021814	TTC	2	6	744475	744480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837330
15622	NC_021814	CGC	2	6	744519	744524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837330
15623	NC_021814	GAAGC	2	10	744532	744541	40 %	0 %	40 %	20 %	525837330
15624	NC_021814	ACG	2	6	744551	744556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837330
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15626	NC_021814	TGG	2	6	744563	744568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837330
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15630	NC_021814	GTC	2	6	744658	744663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837330
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15650	NC_021814	GGC	2	6	745443	745448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15651	NC_021814	GAGCG	2	10	745458	745467	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
15652	NC_021814	GC	3	6	745506	745511	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15653	NC_021814	TCA	2	6	745559	745564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15655	NC_021814	GTT	2	6	745649	745654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15656	NC_021814	CA	3	6	745660	745665	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15657	NC_021814	GTT	2	6	745730	745735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837331
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15734	NC_021814	A	6	6	749789	749794	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15735	NC_021814	AATAA	2	10	749835	749844	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15743	NC_021814	TGG	2	6	750185	750190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837337
15744	NC_021814	ATGG	2	8	750358	750365	25 %	25 %	50 %	0 %	525837337
15745	NC_021814	TGG	2	6	750410	750415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837337
15746	NC_021814	GC	3	6	750511	750516	0 %	0 %	50 %	50 %	525837337
15747	NC_021814	GC	3	6	750621	750626	0 %	0 %	50 %	50 %	525837337
15748	NC_021814	TTG	2	6	750647	750652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837337
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15751	NC_021814	CAGC	2	8	750853	750860	25 %	0 %	25 %	50 %	525837337
15752	NC_021814	GTT	2	6	751093	751098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15753	NC_021814	GAT	2	6	751135	751140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837338
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15755	NC_021814	GCCT	2	8	751220	751227	0 %	25 %	25 %	50 %	525837338
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15839	NC_021814	TTGT	2	8	755154	755161	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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15855	NC_021814	ATT	2	6	756125	756130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837343
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15861	NC_021814	CCG	2	6	756406	756411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837343
15862	NC_021814	CG	4	8	756425	756432	0 %	0 %	50 %	50 %	525837343
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15987	NC_021814	GAG	2	6	763060	763065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15988	NC_021814	TG	3	6	763085	763090	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15989	NC_021814	GC	3	6	763112	763117	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15990	NC_021814	G	6	6	763205	763210	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15991	NC_021814	TCC	2	6	763215	763220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15992	NC_021814	CTGA	2	8	763235	763242	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15993	NC_021814	GGGAG	2	10	763287	763296	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
15994	NC_021814	GTAC	2	8	763318	763325	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15995	NC_021814	CAC	2	6	763341	763346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15996	NC_021814	AGC	2	6	763379	763384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15997	NC_021814	CGT	2	6	763400	763405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15998	NC_021814	AC	3	6	763418	763423	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15999	NC_021814	TGGGG	2	10	763444	763453	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
16000	NC_021814	GGA	2	6	763625	763630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

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