MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 102537

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_021814	ATA	2	6	690739	690744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837317
14502	NC_021814	TGAT	2	8	690786	690793	25 %	50 %	25 %	0 %	525837317
14503	NC_021814	TCT	2	6	690799	690804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837317
14504	NC_021814	GTT	2	6	690821	690826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837317
14505	NC_021814	T	6	6	690825	690830	0 %	100 %	0 %	0 %	525837317
14506	NC_021814	TCGA	2	8	691043	691050	25 %	25 %	25 %	25 %	525837317
14507	NC_021814	T	6	6	691058	691063	0 %	100 %	0 %	0 %	525837317
14508	NC_021814	TTC	2	6	691099	691104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837317
14509	NC_021814	CAT	2	6	691235	691240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14510	NC_021814	CT	3	6	691246	691251	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14511	NC_021814	GGA	2	6	691279	691284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14512	NC_021814	CTA	2	6	691321	691326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14513	NC_021814	TA	3	6	691341	691346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14514	NC_021814	ACA	2	6	691390	691395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14515	NC_021814	CAG	2	6	691744	691749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837318
14516	NC_021814	CAG	2	6	691751	691756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837318
14517	NC_021814	CGT	2	6	691842	691847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837318
14518	NC_021814	TCA	2	6	691896	691901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837318
14519	NC_021814	TCA	2	6	691946	691951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837318
14520	NC_021814	GCC	2	6	691956	691961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837318
14521	NC_021814	CGT	2	6	692052	692057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837318
14522	NC_021814	TTC	2	6	692083	692088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837318
14523	NC_021814	ATT	2	6	692212	692217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525840587
14524	NC_021814	TTC	2	6	692240	692245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525840587
14525	NC_021814	AGC	2	6	692253	692258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840587
14526	NC_021814	GGC	2	6	692270	692275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840587
14527	NC_021814	CAC	2	6	692292	692297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525840587
14528	NC_021814	TCT	2	6	692358	692363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525840587
14529	NC_021814	CCTGCG	2	12	692409	692420	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	525840588
14530	NC_021814	GGC	2	6	692426	692431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840588
14531	NC_021814	CGC	2	6	692456	692461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840588
14532	NC_021814	GCG	2	6	692482	692487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840588
14533	NC_021814	CTG	2	6	692496	692501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840588
14534	NC_021814	GGC	2	6	692552	692557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840588
14535	NC_021814	GAA	2	6	692576	692581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525840588
14536	NC_021814	T	6	6	692661	692666	0 %	100 %	0 %	0 %	525840588
14537	NC_021814	ATGTCG	2	12	692668	692679	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525840588
14538	NC_021814	GGGC	2	8	692813	692820	0 %	0 %	75 %	25 %	525840588
14539	NC_021814	T	6	6	692830	692835	0 %	100 %	0 %	0 %	525840588
14540	NC_021814	CGC	2	6	692935	692940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840588
14541	NC_021814	TTC	2	6	692961	692966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525840588
14542	NC_021814	GT	3	6	693017	693022	0 %	50 %	50 %	0 %	525840588
14543	NC_021814	AG	3	6	693028	693033	50 %	0 %	50 %	0 %	525840588
14544	NC_021814	AGCG	2	8	693052	693059	25 %	0 %	50 %	25 %	525840588
14545	NC_021814	TCT	2	6	693104	693109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525840588
14546	NC_021814	CATT	2	8	693145	693152	25 %	50 %	0 %	25 %	525840588
14547	NC_021814	TTC	2	6	693165	693170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525840588
14548	NC_021814	GTC	2	6	693218	693223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840588
14549	NC_021814	GAT	2	6	693311	693316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840588
14550	NC_021814	TCC	2	6	693338	693343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525840588
14551	NC_021814	CAC	2	6	693466	693471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14552	NC_021814	T	6	6	693474	693479	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14553	NC_021814	GTG	2	6	693494	693499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14554	NC_021814	CA	3	6	693545	693550	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14555	NC_021814	CAA	2	6	693553	693558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14556	NC_021814	A	6	6	693557	693562	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14557	NC_021814	T	6	6	693589	693594	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14558	NC_021814	ATG	2	6	693602	693607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14559	NC_021814	CAT	2	6	693608	693613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14560	NC_021814	GAAT	2	8	693614	693621	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14561	NC_021814	TGG	2	6	693625	693630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14562	NC_021814	TAAT	2	8	693656	693663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14563	NC_021814	TTTTA	2	10	693666	693675	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14564	NC_021814	TA	3	6	693736	693741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14565	NC_021814	ATG	2	6	693752	693757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14566	NC_021814	ATA	2	6	693790	693795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14567	NC_021814	GTT	2	6	693880	693885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14568	NC_021814	ACT	2	6	693924	693929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14569	NC_021814	ACGC	2	8	693950	693957	25 %	0 %	25 %	50 %	525840589
14570	NC_021814	ATG	2	6	693983	693988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840589
14571	NC_021814	GTGCT	2	10	694085	694094	0 %	40 %	40 %	20 %	525840589
14572	NC_021814	GAC	2	6	694119	694124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840589
14573	NC_021814	TCCA	2	8	694159	694166	25 %	25 %	0 %	50 %	525840589
14574	NC_021814	GAT	2	6	694264	694269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840589
14575	NC_021814	TCG	2	6	694448	694453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840589
14576	NC_021814	CTT	2	6	694489	694494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525840589
14577	NC_021814	CGC	2	6	694546	694551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840589
14578	NC_021814	CCAGT	2	10	694603	694612	20 %	20 %	20 %	40 %	525840589
14579	NC_021814	GCC	2	6	694621	694626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840589
14580	NC_021814	TGG	2	6	694661	694666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840589
14581	NC_021814	GCG	2	6	694691	694696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840589
14582	NC_021814	TGG	2	6	694725	694730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840589
14583	NC_021814	GTCA	2	8	694750	694757	25 %	25 %	25 %	25 %	525840589
14584	NC_021814	GT	3	6	694778	694783	0 %	50 %	50 %	0 %	525840589
14585	NC_021814	TA	3	6	694806	694811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14586	NC_021814	GGT	2	6	694860	694865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14587	NC_021814	GAG	2	6	694872	694877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525840590
14588	NC_021814	ATC	2	6	694901	694906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840590
14589	NC_021814	TCG	2	6	694967	694972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840590
14590	NC_021814	GAT	2	6	694981	694986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840590
14591	NC_021814	CAGC	2	8	695014	695021	25 %	0 %	25 %	50 %	525840590
14592	NC_021814	ACG	2	6	695159	695164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840591
14593	NC_021814	CGG	2	6	695184	695189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840591
14594	NC_021814	CAG	2	6	695327	695332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840591
14595	NC_021814	GTC	2	6	695339	695344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840591
14596	NC_021814	AGC	2	6	695365	695370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840591
14597	NC_021814	CGG	2	6	695393	695398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840591
14598	NC_021814	ACG	2	6	695508	695513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840591
14599	NC_021814	GGT	2	6	695602	695607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840592
14600	NC_021814	TCA	2	6	695640	695645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840592
14601	NC_021814	ACTGC	2	10	695697	695706	20 %	20 %	20 %	40 %	525840592
14602	NC_021814	TGC	2	6	695798	695803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840592
14603	NC_021814	CGT	2	6	695814	695819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840592
14604	NC_021814	GCA	2	6	695862	695867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840592
14605	NC_021814	CAG	2	6	695875	695880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840592
14606	NC_021814	CGGG	2	8	695925	695932	0 %	0 %	75 %	25 %	525840592
14607	NC_021814	TGT	2	6	695964	695969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14608	NC_021814	CCG	2	6	696049	696054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840593
14609	NC_021814	CGT	2	6	696170	696175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840593
14610	NC_021814	CTG	2	6	696183	696188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840593
14611	NC_021814	AGC	2	6	696271	696276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840593
14612	NC_021814	GCT	2	6	696287	696292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840593
14613	NC_021814	TCA	2	6	696307	696312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840593
14614	NC_021814	GCG	2	6	696338	696343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840593
14615	NC_021814	TGT	2	6	696358	696363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525840593
14616	NC_021814	CAG	2	6	696418	696423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840593
14617	NC_021814	T	6	6	696446	696451	0 %	100 %	0 %	0 %	525840593
14618	NC_021814	GCC	2	6	696462	696467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840593
14619	NC_021814	GGT	3	9	696468	696476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840593
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14621	NC_021814	TCA	2	6	696619	696624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840593
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14984	NC_021814	T	6	6	714336	714341	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14985	NC_021814	ATTA	2	8	714364	714371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14986	NC_021814	TAA	2	6	714398	714403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14987	NC_021814	GAC	2	6	714527	714532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14988	NC_021814	GTT	2	6	714533	714538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14989	NC_021814	TTG	2	6	714590	714595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14990	NC_021814	GAT	2	6	714692	714697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14991	NC_021814	ATGT	2	8	714729	714736	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14992	NC_021814	A	7	7	714740	714746	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14993	NC_021814	T	8	8	714748	714755	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14994	NC_021814	AAAT	2	8	714765	714772	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14995	NC_021814	ATTTT	2	10	714792	714801	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14996	NC_021814	T	7	7	714798	714804	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14997	NC_021814	TCCGG	2	10	714846	714855	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
14998	NC_021814	CAG	2	6	714949	714954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14999	NC_021814	ATT	2	6	714960	714965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15000	NC_021814	CAG	2	6	714991	714996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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