MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 102537

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_021814	TGA	2	6	668113	668118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14002	NC_021814	T	6	6	668121	668126	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14003	NC_021814	GATG	2	8	668159	668166	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14004	NC_021814	ATT	2	6	668179	668184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14005	NC_021814	A	6	6	668193	668198	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14006	NC_021814	A	7	7	668225	668231	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14007	NC_021814	AAAT	2	8	668260	668267	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14008	NC_021814	AT	3	6	668299	668304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14009	NC_021814	TGTCT	2	10	668369	668378	0 %	60 %	20 %	20 %	525840580
14010	NC_021814	TTAAAG	2	12	668414	668425	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	525840580
14011	NC_021814	ATT	2	6	668466	668471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525840580
14012	NC_021814	GGT	2	6	668472	668477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840580
14013	NC_021814	TAA	2	6	668484	668489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525840580
14014	NC_021814	ACT	2	6	668563	668568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840580
14015	NC_021814	TTTA	2	8	668634	668641	25 %	75 %	0 %	0 %	525840580
14016	NC_021814	TTC	2	6	668664	668669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525840580
14017	NC_021814	TTA	2	6	668764	668769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525840580
14018	NC_021814	TA	3	6	668843	668848	50 %	50 %	0 %	0 %	525840580
14019	NC_021814	TG	3	6	668889	668894	0 %	50 %	50 %	0 %	525840580
14020	NC_021814	CCCTAG	2	12	668916	668927	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	525840580
14021	NC_021814	TA	3	6	668990	668995	50 %	50 %	0 %	0 %	525840581
14022	NC_021814	A	6	6	669065	669070	100 %	0 %	0 %	0 %	525840581
14023	NC_021814	TGC	2	6	669157	669162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840581
14024	NC_021814	AAT	2	6	669180	669185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525840581
14025	NC_021814	T	6	6	669190	669195	0 %	100 %	0 %	0 %	525840581
14026	NC_021814	TAA	2	6	669206	669211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525840581
14027	NC_021814	CGG	2	6	669217	669222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840581
14028	NC_021814	TCT	2	6	669227	669232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525840581
14029	NC_021814	ATA	2	6	669238	669243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525840581
14030	NC_021814	ACAG	2	8	669258	669265	50 %	0 %	25 %	25 %	525840581
14031	NC_021814	A	6	6	669276	669281	100 %	0 %	0 %	0 %	525840581
14032	NC_021814	CGA	2	6	669313	669318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840581
14033	NC_021814	AACT	2	8	669338	669345	50 %	25 %	0 %	25 %	525840581
14034	NC_021814	AT	4	8	669445	669452	50 %	50 %	0 %	0 %	525840581
14035	NC_021814	TGAA	2	8	669514	669521	50 %	25 %	25 %	0 %	525840581
14036	NC_021814	A	6	6	669559	669564	100 %	0 %	0 %	0 %	525840581
14037	NC_021814	T	6	6	669574	669579	0 %	100 %	0 %	0 %	525840581
14038	NC_021814	ATT	2	6	669632	669637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525840581
14039	NC_021814	TGA	2	6	669696	669701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840581
14040	NC_021814	TCA	2	6	669783	669788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840581
14041	NC_021814	TGT	2	6	669832	669837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525840581
14042	NC_021814	TTA	3	9	669897	669905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525840581
14043	NC_021814	ACTT	2	8	669938	669945	25 %	50 %	0 %	25 %	525840581
14044	NC_021814	TA	3	6	669974	669979	50 %	50 %	0 %	0 %	525840581
14045	NC_021814	CTT	2	6	669991	669996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525840581
14046	NC_021814	GTA	2	6	670068	670073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840581
14047	NC_021814	T	6	6	670179	670184	0 %	100 %	0 %	0 %	525840581
14048	NC_021814	GAT	2	6	670206	670211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14049	NC_021814	TATC	2	8	670303	670310	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14050	NC_021814	AGT	2	6	670341	670346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14051	NC_021814	TACA	2	8	670357	670364	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14052	NC_021814	AT	4	8	670425	670432	50 %	50 %	0 %	0 %	525837302
14053	NC_021814	AGT	2	6	670600	670605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837302
14054	NC_021814	CGCC	2	8	670728	670735	0 %	0 %	25 %	75 %	525837302
14055	NC_021814	GCA	2	6	670808	670813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837302
14056	NC_021814	GGCT	2	8	670861	670868	0 %	25 %	50 %	25 %	525837302
14057	NC_021814	ATG	2	6	670886	670891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837302
14058	NC_021814	CAC	2	6	670957	670962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525837302
14059	NC_021814	TG	3	6	671007	671012	0 %	50 %	50 %	0 %	525837302
14060	NC_021814	GCCA	2	8	671085	671092	25 %	0 %	25 %	50 %	525837302
14061	NC_021814	AT	3	6	671100	671105	50 %	50 %	0 %	0 %	525837302
14062	NC_021814	T	6	6	671243	671248	0 %	100 %	0 %	0 %	525837302
14063	NC_021814	CTC	2	6	671278	671283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14064	NC_021814	TGG	2	6	671391	671396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14065	NC_021814	GGTAC	2	10	671397	671406	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
14066	NC_021814	GCC	2	6	671421	671426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14067	NC_021814	CAG	2	6	671432	671437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14068	NC_021814	TCG	2	6	671451	671456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14069	NC_021814	TCC	2	6	671481	671486	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14070	NC_021814	ATG	2	6	671509	671514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14071	NC_021814	CGG	2	6	671552	671557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14072	NC_021814	CGC	2	6	671614	671619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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14075	NC_021814	CCG	2	6	671741	671746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14076	NC_021814	AGC	2	6	671790	671795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14079	NC_021814	TAT	2	6	671929	671934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14082	NC_021814	AGGA	2	8	672003	672010	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14083	NC_021814	GCC	2	6	672058	672063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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14102	NC_021814	TCG	2	6	672951	672956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837303
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14115	NC_021814	GCAG	2	8	673450	673457	25 %	0 %	50 %	25 %	525837303
14116	NC_021814	GCGG	2	8	673499	673506	0 %	0 %	75 %	25 %	525837303
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14239	NC_021814	AGGG	2	8	679240	679247	25 %	0 %	75 %	0 %	525837308
14240	NC_021814	ATA	2	6	679250	679255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837308
14241	NC_021814	CTT	2	6	679259	679264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837308
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14243	NC_021814	TTG	2	6	679333	679338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14355	NC_021814	A	7	7	684264	684270	100 %	0 %	0 %	0 %	525840584
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