MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 102537

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_021814	AAAT	2	8	644662	644669	75 %	25 %	0 %	0 %	525837291
13502	NC_021814	ATA	2	6	644697	644702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837291
13503	NC_021814	ATT	2	6	644726	644731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837291
13504	NC_021814	GGC	2	6	644930	644935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837291
13505	NC_021814	TGGT	2	8	644943	644950	0 %	50 %	50 %	0 %	525837291
13506	NC_021814	ATT	2	6	645080	645085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837291
13507	NC_021814	CGG	2	6	645127	645132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837291
13508	NC_021814	GC	3	6	645309	645314	0 %	0 %	50 %	50 %	525837291
13509	NC_021814	GCAA	2	8	645345	645352	50 %	0 %	25 %	25 %	525837291
13510	NC_021814	CCG	2	6	645519	645524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837291
13511	NC_021814	TTA	2	6	645559	645564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837291
13512	NC_021814	CGC	2	6	645601	645606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13513	NC_021814	GGC	2	6	645622	645627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13514	NC_021814	TGC	2	6	645734	645739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837292
13515	NC_021814	GTT	2	6	645757	645762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837292
13516	NC_021814	ATG	2	6	645854	645859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837292
13517	NC_021814	T	6	6	645862	645867	0 %	100 %	0 %	0 %	525837292
13518	NC_021814	CTG	2	6	645926	645931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837292
13519	NC_021814	AAG	2	6	645962	645967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837292
13520	NC_021814	GAC	2	6	645971	645976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837292
13521	NC_021814	GCC	2	6	646000	646005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837292
13522	NC_021814	GCG	2	6	646065	646070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837292
13523	NC_021814	TC	3	6	646078	646083	0 %	50 %	0 %	50 %	525837292
13524	NC_021814	CGC	2	6	646107	646112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837292
13525	NC_021814	CGAT	2	8	646154	646161	25 %	25 %	25 %	25 %	525837292
13526	NC_021814	CCGGCG	2	12	646164	646175	0 %	0 %	50 %	50 %	525837292
13527	NC_021814	CGG	2	6	646243	646248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837292
13528	NC_021814	AGC	2	6	646271	646276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837292
13529	NC_021814	AT	3	6	646316	646321	50 %	50 %	0 %	0 %	525837292
13530	NC_021814	CGG	2	6	646339	646344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837292
13531	NC_021814	GGC	2	6	646345	646350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837292
13532	NC_021814	GC	3	6	646494	646499	0 %	0 %	50 %	50 %	525837292
13533	NC_021814	TTG	2	6	646541	646546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837292
13534	NC_021814	GC	3	6	646630	646635	0 %	0 %	50 %	50 %	525837293
13535	NC_021814	CCA	2	6	646640	646645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525837293
13536	NC_021814	CCG	2	6	646659	646664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837293
13537	NC_021814	CGG	2	6	646693	646698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837293
13538	NC_021814	CGTA	2	8	646769	646776	25 %	25 %	25 %	25 %	525837293
13539	NC_021814	TCT	2	6	646824	646829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837293
13540	NC_021814	GCGGTT	2	12	646847	646858	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	525837293
13541	NC_021814	CCA	2	6	646868	646873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525837293
13542	NC_021814	CT	3	6	646908	646913	0 %	50 %	0 %	50 %	525837293
13543	NC_021814	GCC	2	6	646926	646931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837293
13544	NC_021814	CGC	2	6	646945	646950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837293
13545	NC_021814	CCG	2	6	646994	646999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837293
13546	NC_021814	GCA	2	6	647026	647031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837293
13547	NC_021814	CCG	2	6	647067	647072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837293
13548	NC_021814	CG	3	6	647091	647096	0 %	0 %	50 %	50 %	525837293
13549	NC_021814	GGC	2	6	647150	647155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837293
13550	NC_021814	GGC	2	6	647162	647167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837293
13551	NC_021814	CTC	2	6	647336	647341	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525837293
13552	NC_021814	GC	3	6	647407	647412	0 %	0 %	50 %	50 %	525837293
13553	NC_021814	GGT	2	6	647490	647495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837293
13554	NC_021814	AAGCG	2	10	647535	647544	40 %	0 %	40 %	20 %	525837293
13555	NC_021814	TCA	2	6	647578	647583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837293
13556	NC_021814	C	6	6	647635	647640	0 %	0 %	0 %	100 %	525837293
13557	NC_021814	AGAGG	2	10	647643	647652	40 %	0 %	60 %	0 %	525837293
13558	NC_021814	GCGA	2	8	647721	647728	25 %	0 %	50 %	25 %	525837293
13559	NC_021814	CGG	2	6	647770	647775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837293
13560	NC_021814	CGGG	2	8	647824	647831	0 %	0 %	75 %	25 %	525837293
13561	NC_021814	CTTT	2	8	647921	647928	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13562	NC_021814	GCG	2	6	648099	648104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837294
13563	NC_021814	GGT	2	6	648108	648113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837294
13564	NC_021814	CGA	2	6	648125	648130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837294
13565	NC_021814	CTC	2	6	648186	648191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525837294
13566	NC_021814	TCG	2	6	648220	648225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837294
13567	NC_021814	AGC	2	6	648226	648231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837294
13568	NC_021814	TGCGCC	2	12	648238	648249	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	525837294
13569	NC_021814	GCC	2	6	648303	648308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837294
13570	NC_021814	CCCG	2	8	648364	648371	0 %	0 %	25 %	75 %	525837294
13571	NC_021814	CGCGC	2	10	648373	648382	0 %	0 %	40 %	60 %	525837294
13572	NC_021814	GCT	2	6	648399	648404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837294
13573	NC_021814	CGC	2	6	648440	648445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837294
13574	NC_021814	AAT	2	6	648448	648453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837294
13575	NC_021814	CGA	2	6	648484	648489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837294
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13577	NC_021814	ACC	2	6	648610	648615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525837294
13578	NC_021814	AAT	2	6	648636	648641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837294
13579	NC_021814	GA	3	6	648646	648651	50 %	0 %	50 %	0 %	525837294
13580	NC_021814	T	6	6	648671	648676	0 %	100 %	0 %	0 %	525837294
13581	NC_021814	GC	3	6	648710	648715	0 %	0 %	50 %	50 %	525837294
13582	NC_021814	GGA	2	6	648732	648737	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525837294
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13585	NC_021814	CTG	2	6	648834	648839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837294
13586	NC_021814	GAA	2	6	648870	648875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837294
13587	NC_021814	CGC	2	6	648876	648881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837294
13588	NC_021814	CGG	2	6	648938	648943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837294
13589	NC_021814	GGC	2	6	649050	649055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837294
13590	NC_021814	CTG	2	6	649059	649064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837294
13591	NC_021814	TTG	2	6	649065	649070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837294
13592	NC_021814	AGGC	2	8	649157	649164	25 %	0 %	50 %	25 %	525837294
13593	NC_021814	CGG	2	6	649174	649179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837294
13594	NC_021814	TGG	2	6	649289	649294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837294
13595	NC_021814	CG	3	6	649455	649460	0 %	0 %	50 %	50 %	525837294
13596	NC_021814	GGC	2	6	649461	649466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837294
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13600	NC_021814	GCG	2	6	649639	649644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837294
13601	NC_021814	CAG	2	6	649671	649676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837294
13602	NC_021814	CG	3	6	649733	649738	0 %	0 %	50 %	50 %	525837294
13603	NC_021814	CGG	2	6	649763	649768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837294
13604	NC_021814	CGT	2	6	649787	649792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837294
13605	NC_021814	GTT	2	6	649810	649815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837294
13606	NC_021814	GTT	2	6	649829	649834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837294
13607	NC_021814	CGC	2	6	649865	649870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837294
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13609	NC_021814	GCGA	2	8	649877	649884	25 %	0 %	50 %	25 %	525837294
13610	NC_021814	ACG	2	6	649930	649935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837294
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13612	NC_021814	CGG	2	6	649984	649989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837294
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13616	NC_021814	CAG	2	6	650097	650102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837294
13617	NC_021814	GCC	2	6	650151	650156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837294
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13620	NC_021814	GTC	2	6	650256	650261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837294
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13991	NC_021814	TGC	2	6	667822	667827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840579
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