MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 102537

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12502	NC_021814	TGC	2	6	596072	596077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837252
12503	NC_021814	TGC	2	6	596102	596107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837252
12504	NC_021814	ATT	2	6	596113	596118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837252
12505	NC_021814	CG	3	6	596122	596127	0 %	0 %	50 %	50 %	525837252
12506	NC_021814	CTT	2	6	596163	596168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837252
12507	NC_021814	CAG	2	6	596230	596235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837252
12508	NC_021814	GAA	2	6	596263	596268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837252
12509	NC_021814	GCT	2	6	596304	596309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837252
12510	NC_021814	GAA	2	6	596314	596319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837252
12511	NC_021814	CGG	2	6	596402	596407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837252
12512	NC_021814	CG	5	10	596479	596488	0 %	0 %	50 %	50 %	525837252
12513	NC_021814	GAT	2	6	596520	596525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837252
12514	NC_021814	GAC	2	6	596740	596745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837252
12515	NC_021814	GC	3	6	596839	596844	0 %	0 %	50 %	50 %	525837252
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12517	NC_021814	TGC	2	6	596954	596959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837252
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12521	NC_021814	GCG	2	6	597173	597178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837252
12522	NC_021814	TAT	2	6	597219	597224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837252
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12524	NC_021814	CTG	2	6	597334	597339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837252
12525	NC_021814	GTGC	2	8	597370	597377	0 %	25 %	50 %	25 %	525837252
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12539	NC_021814	CGTT	2	8	597815	597822	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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12543	NC_021814	TCG	2	6	598056	598061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840563
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12547	NC_021814	TCGC	2	8	598271	598278	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12548	NC_021814	T	6	6	598299	598304	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12551	NC_021814	T	6	6	598384	598389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12552	NC_021814	CGA	2	6	598484	598489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12555	NC_021814	TCC	2	6	598687	598692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12556	NC_021814	AGTAA	2	10	598746	598755	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
12557	NC_021814	TCC	2	6	598826	598831	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12558	NC_021814	TCC	2	6	598965	598970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12559	NC_021814	TGA	2	6	599000	599005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12561	NC_021814	TCC	2	6	599099	599104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12562	NC_021814	GTA	2	6	599154	599159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12565	NC_021814	AGATA	2	10	599282	599291	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
12566	NC_021814	AGGA	2	8	599313	599320	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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12568	NC_021814	AGATA	2	10	599416	599425	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
12569	NC_021814	TCC	2	6	599490	599495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12570	NC_021814	GCGTG	2	10	599697	599706	0 %	20 %	60 %	20 %	525837253
12571	NC_021814	TGA	2	6	599735	599740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837253
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12586	NC_021814	TTTC	2	8	600373	600380	0 %	75 %	0 %	25 %	525837254
12587	NC_021814	CTGG	2	8	600417	600424	0 %	25 %	50 %	25 %	525837254
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12592	NC_021814	GCGCT	2	10	600554	600563	0 %	20 %	40 %	40 %	525837254
12593	NC_021814	GCG	2	6	600578	600583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837254
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12595	NC_021814	TGG	2	6	600602	600607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837254
12596	NC_021814	TAA	2	6	600608	600613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837254
12597	NC_021814	GCC	2	6	600634	600639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12598	NC_021814	TTA	2	6	600653	600658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12599	NC_021814	CTGGC	2	10	600711	600720	0 %	20 %	40 %	40 %	525837255
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12601	NC_021814	TTA	2	6	600889	600894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837255
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12603	NC_021814	A	6	6	601207	601212	100 %	0 %	0 %	0 %	525837255
12604	NC_021814	A	6	6	601342	601347	100 %	0 %	0 %	0 %	525837255
12605	NC_021814	TAC	2	6	601362	601367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837255
12606	NC_021814	GC	3	6	601478	601483	0 %	0 %	50 %	50 %	525837255
12607	NC_021814	GAG	2	6	601500	601505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525837255
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12609	NC_021814	GTG	2	6	601648	601653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837255
12610	NC_021814	GTTC	2	8	601671	601678	0 %	50 %	25 %	25 %	525837255
12611	NC_021814	TC	3	6	601677	601682	0 %	50 %	0 %	50 %	525837255
12612	NC_021814	GAG	2	6	601965	601970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525837255
12613	NC_021814	GT	3	6	601980	601985	0 %	50 %	50 %	0 %	525837255
12614	NC_021814	TGAT	2	8	602050	602057	25 %	50 %	25 %	0 %	525837255
12615	NC_021814	GGC	2	6	602067	602072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837255
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12617	NC_021814	CGT	2	6	602175	602180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837255
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12619	NC_021814	GGC	2	6	602195	602200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837255
12620	NC_021814	GAT	3	9	602299	602307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12621	NC_021814	A	6	6	602370	602375	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12622	NC_021814	ATT	2	6	602398	602403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837256
12623	NC_021814	CGG	2	6	602442	602447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837256
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12866	NC_021814	CGG	2	6	613723	613728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837265
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12935	NC_021814	GATT	2	8	617447	617454	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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12937	NC_021814	TGA	2	6	617465	617470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12939	NC_021814	GGC	2	6	617512	617517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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12977	NC_021814	CGT	2	6	619830	619835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840565
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12979	NC_021814	TCC	2	6	619862	619867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12980	NC_021814	CTG	2	6	619909	619914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12981	NC_021814	GTAAG	2	10	619980	619989	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
12982	NC_021814	TTATGT	2	12	620120	620131	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	525837270
12983	NC_021814	TCA	2	6	620196	620201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837270
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12986	NC_021814	A	6	6	620356	620361	100 %	0 %	0 %	0 %	525837270
12987	NC_021814	TGA	2	6	620417	620422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840566
12988	NC_021814	GCT	2	6	620425	620430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840566
12989	NC_021814	GGC	2	6	620442	620447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840566
12990	NC_021814	AAT	2	6	620451	620456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525840566
12991	NC_021814	ACA	2	6	620495	620500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525840566
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