MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 102537

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_021814	ATA	2	6	548765	548770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837212
11502	NC_021814	TTC	2	6	548823	548828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837212
11503	NC_021814	GCA	2	6	548842	548847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837212
11504	NC_021814	GCG	2	6	548968	548973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837212
11505	NC_021814	CAC	2	6	548984	548989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525837212
11506	NC_021814	CGT	2	6	549069	549074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837212
11507	NC_021814	TTC	2	6	549101	549106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837212
11508	NC_021814	CGG	2	6	549166	549171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837212
11509	NC_021814	CTTT	2	8	549220	549227	0 %	75 %	0 %	25 %	525837212
11510	NC_021814	ATC	2	6	549266	549271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837212
11511	NC_021814	T	6	6	549281	549286	0 %	100 %	0 %	0 %	525837212
11512	NC_021814	ACAGGA	2	12	549294	549305	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	525837212
11513	NC_021814	ATA	2	6	549321	549326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11514	NC_021814	TAA	2	6	549355	549360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11515	NC_021814	CTG	2	6	549403	549408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11516	NC_021814	TAT	2	6	549436	549441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11517	NC_021814	ATT	2	6	549493	549498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11518	NC_021814	TAA	2	6	549536	549541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11519	NC_021814	TAAC	2	8	549550	549557	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11520	NC_021814	AG	4	8	549596	549603	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11521	NC_021814	T	7	7	549685	549691	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11522	NC_021814	TGC	2	6	549702	549707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11523	NC_021814	TTA	2	6	549708	549713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11524	NC_021814	T	7	7	549872	549878	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11525	NC_021814	AAT	2	6	549883	549888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11526	NC_021814	TCTTT	2	10	549896	549905	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
11527	NC_021814	AGG	2	6	549935	549940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11528	NC_021814	ATC	2	6	549953	549958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11529	NC_021814	GGCT	2	8	549963	549970	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11530	NC_021814	AGG	2	6	549991	549996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11531	NC_021814	AG	3	6	549998	550003	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11532	NC_021814	GAT	2	6	550083	550088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11533	NC_021814	TCA	2	6	550200	550205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11534	NC_021814	TA	3	6	550235	550240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11535	NC_021814	ATT	2	6	550358	550363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11536	NC_021814	TAA	2	6	550371	550376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11537	NC_021814	A	6	6	550402	550407	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11538	NC_021814	T	6	6	550458	550463	0 %	100 %	0 %	0 %	525837213
11539	NC_021814	TGAA	2	8	550471	550478	50 %	25 %	25 %	0 %	525837213
11540	NC_021814	TGC	2	6	550551	550556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837213
11541	NC_021814	ATTC	2	8	550560	550567	25 %	50 %	0 %	25 %	525837213
11542	NC_021814	CTT	2	6	550601	550606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837213
11543	NC_021814	AT	3	6	550643	550648	50 %	50 %	0 %	0 %	525837213
11544	NC_021814	TGT	2	6	550700	550705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837213
11545	NC_021814	GAT	2	6	550743	550748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837213
11546	NC_021814	CAG	2	6	550791	550796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837213
11547	NC_021814	TGT	2	6	550835	550840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837213
11548	NC_021814	CT	3	6	550908	550913	0 %	50 %	0 %	50 %	525837213
11549	NC_021814	AGA	2	6	550937	550942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837213
11550	NC_021814	TCT	2	6	550943	550948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837213
11551	NC_021814	TGC	2	6	550981	550986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837213
11552	NC_021814	AG	3	6	551006	551011	50 %	0 %	50 %	0 %	525837213
11553	NC_021814	T	6	6	551097	551102	0 %	100 %	0 %	0 %	525837213
11554	NC_021814	ATCGT	2	10	551134	551143	20 %	40 %	20 %	20 %	525837213
11555	NC_021814	ATT	2	6	551145	551150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837213
11556	NC_021814	CTG	2	6	551223	551228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837213
11557	NC_021814	TGC	2	6	551245	551250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837213
11558	NC_021814	TGA	2	6	551305	551310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11559	NC_021814	TTAC	2	8	551314	551321	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11560	NC_021814	TAT	2	6	551339	551344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11561	NC_021814	TTG	2	6	551349	551354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11562	NC_021814	A	6	6	551390	551395	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11563	NC_021814	GT	3	6	551423	551428	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11564	NC_021814	AGT	2	6	551484	551489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11565	NC_021814	GAT	2	6	551505	551510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11566	NC_021814	TCA	2	6	551583	551588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11567	NC_021814	CTG	2	6	551615	551620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11568	NC_021814	GACA	2	8	551632	551639	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11569	NC_021814	TA	3	6	551650	551655	50 %	50 %	0 %	0 %	525837214
11570	NC_021814	AGA	2	6	551671	551676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837214
11571	NC_021814	CATA	2	8	551695	551702	50 %	25 %	0 %	25 %	525837214
11572	NC_021814	T	6	6	551832	551837	0 %	100 %	0 %	0 %	525837214
11573	NC_021814	AAG	2	6	551917	551922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837214
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11575	NC_021814	A	6	6	552047	552052	100 %	0 %	0 %	0 %	525837214
11576	NC_021814	AGC	2	6	552083	552088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837214
11577	NC_021814	T	6	6	552099	552104	0 %	100 %	0 %	0 %	525837214
11578	NC_021814	CGC	2	6	552148	552153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837214
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11580	NC_021814	CTGG	2	8	552356	552363	0 %	25 %	50 %	25 %	525837214
11581	NC_021814	TAT	2	6	552369	552374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837214
11582	NC_021814	TTA	2	6	552386	552391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837214
11583	NC_021814	GCC	2	6	552436	552441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837214
11584	NC_021814	AAGA	2	8	552459	552466	75 %	0 %	25 %	0 %	525837214
11585	NC_021814	GCA	2	6	552549	552554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837214
11586	NC_021814	CAG	2	6	552579	552584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837214
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11588	NC_021814	GAT	2	6	552648	552653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837214
11589	NC_021814	GGA	2	6	552705	552710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525837214
11590	NC_021814	TTTAA	2	10	552829	552838	40 %	60 %	0 %	0 %	525837214
11591	NC_021814	AGC	2	6	552959	552964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837215
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11593	NC_021814	TGC	2	6	553073	553078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837215
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11595	NC_021814	GAT	2	6	553334	553339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837216
11596	NC_021814	TCG	2	6	553426	553431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837217
11597	NC_021814	TA	3	6	553437	553442	50 %	50 %	0 %	0 %	525837217
11598	NC_021814	CTG	2	6	553448	553453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837217
11599	NC_021814	TAAGGA	2	12	553474	553485	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	525837217
11600	NC_021814	TCC	2	6	553651	553656	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525837217
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11602	NC_021814	GCC	2	6	553839	553844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837217
11603	NC_021814	CGC	2	6	553893	553898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837217
11604	NC_021814	ATCAG	2	10	553905	553914	40 %	20 %	20 %	20 %	525837217
11605	NC_021814	ACA	2	6	553962	553967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525837217
11606	NC_021814	TGT	2	6	553972	553977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837217
11607	NC_021814	ATT	2	6	554063	554068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837217
11608	NC_021814	CAG	2	6	554085	554090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837217
11609	NC_021814	TGA	2	6	554149	554154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837217
11610	NC_021814	ATCC	2	8	554232	554239	25 %	25 %	0 %	50 %	525840554
11611	NC_021814	CGC	2	6	554279	554284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840554
11612	NC_021814	GCG	2	6	554289	554294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840554
11613	NC_021814	GGC	2	6	554312	554317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840554
11614	NC_021814	GGC	2	6	554320	554325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840554
11615	NC_021814	CTTG	2	8	554459	554466	0 %	50 %	25 %	25 %	525840554
11616	NC_021814	TCTG	2	8	554520	554527	0 %	50 %	25 %	25 %	525840554
11617	NC_021814	TCC	2	6	554636	554641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525840554
11618	NC_021814	GAG	2	6	554649	554654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525840554
11619	NC_021814	CAG	2	6	554809	554814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837218
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11621	NC_021814	CAG	2	6	554923	554928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837218
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11623	NC_021814	TGGA	2	8	554971	554978	25 %	25 %	50 %	0 %	525837218
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11873	NC_021814	CG	3	6	566341	566346	0 %	0 %	50 %	50 %	525840558
11874	NC_021814	CGC	2	6	566349	566354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840558
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11942	NC_021814	CGA	2	6	569454	569459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11943	NC_021814	GTC	2	6	569474	569479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11946	NC_021814	GC	3	6	569732	569737	0 %	0 %	50 %	50 %	525837228
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11980	NC_021814	CTG	2	6	571423	571428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840561
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11984	NC_021814	GGC	2	6	571558	571563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840561
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11986	NC_021814	GAT	2	6	571605	571610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840561
11987	NC_021814	CGG	2	6	571623	571628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840561
11988	NC_021814	CAT	2	6	571695	571700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840561
11989	NC_021814	CGG	2	6	571773	571778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840561
11990	NC_021814	CTG	2	6	571789	571794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840561
11991	NC_021814	GCA	2	6	571835	571840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840561
11992	NC_021814	GGTC	2	8	571923	571930	0 %	25 %	50 %	25 %	525840561
11993	NC_021814	GATGGC	2	12	571932	571943	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	525840561
11994	NC_021814	GCC	2	6	571950	571955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840561
11995	NC_021814	CTT	2	6	571995	572000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525840561
11996	NC_021814	GTC	2	6	572030	572035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840561
11997	NC_021814	GCT	2	6	572046	572051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840561
11998	NC_021814	GC	3	6	572075	572080	0 %	0 %	50 %	50 %	525840561
11999	NC_021814	GC	3	6	572126	572131	0 %	0 %	50 %	50 %	525840561
12000	NC_021814	GAAG	2	8	572139	572146	50 %	0 %	50 %	0 %	525840561

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