MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 102537

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_021814	TGGC	2	8	501083	501090	0 %	25 %	50 %	25 %	525837172
10502	NC_021814	GCCGC	2	10	501135	501144	0 %	0 %	40 %	60 %	525837172
10503	NC_021814	GGC	2	6	501183	501188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837172
10504	NC_021814	AGC	2	6	501214	501219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837172
10505	NC_021814	GCG	2	6	501247	501252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837172
10506	NC_021814	TAT	2	6	501257	501262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837172
10507	NC_021814	TGA	2	6	501347	501352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10508	NC_021814	GTT	2	6	501462	501467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10509	NC_021814	T	6	6	501475	501480	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10510	NC_021814	TGGC	2	8	501556	501563	0 %	25 %	50 %	25 %	525837173
10511	NC_021814	TCA	2	6	501622	501627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837173
10512	NC_021814	CCG	2	6	501655	501660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837173
10513	NC_021814	CGA	2	6	501674	501679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837173
10514	NC_021814	CAA	2	6	501682	501687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525837173
10515	NC_021814	CGC	2	6	501689	501694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837173
10516	NC_021814	AAC	2	6	501764	501769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525837173
10517	NC_021814	T	6	6	501878	501883	0 %	100 %	0 %	0 %	525837173
10518	NC_021814	GCA	2	6	502036	502041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837173
10519	NC_021814	CAAC	2	8	502096	502103	50 %	0 %	0 %	50 %	525837173
10520	NC_021814	ACA	2	6	502157	502162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525837173
10521	NC_021814	CTG	2	6	502166	502171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837173
10522	NC_021814	GC	3	6	502247	502252	0 %	0 %	50 %	50 %	525837173
10523	NC_021814	GCAG	2	8	502339	502346	25 %	0 %	50 %	25 %	525837173
10524	NC_021814	TCG	2	6	502361	502366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837173
10525	NC_021814	CGT	2	6	502383	502388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837173
10526	NC_021814	TTA	2	6	502424	502429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837173
10527	NC_021814	TCA	2	6	502430	502435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837173
10528	NC_021814	GAT	2	6	502444	502449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837173
10529	NC_021814	AAC	2	6	502493	502498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525837173
10530	NC_021814	A	6	6	502517	502522	100 %	0 %	0 %	0 %	525837173
10531	NC_021814	CTA	2	6	502526	502531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837173
10532	NC_021814	GCG	2	6	502628	502633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10533	NC_021814	TGA	2	6	502739	502744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837174
10534	NC_021814	GAA	2	6	502812	502817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837174
10535	NC_021814	CA	3	6	502838	502843	50 %	0 %	0 %	50 %	525837174
10536	NC_021814	GT	3	6	502846	502851	0 %	50 %	50 %	0 %	525837174
10537	NC_021814	CAC	2	6	502891	502896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525837174
10538	NC_021814	GAA	3	9	502908	502916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837174
10539	NC_021814	TGG	2	6	502990	502995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837174
10540	NC_021814	CCG	2	6	503006	503011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837174
10541	NC_021814	TGG	2	6	503130	503135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837174
10542	NC_021814	GAA	2	6	503274	503279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837174
10543	NC_021814	TGA	2	6	503306	503311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837174
10544	NC_021814	GTT	2	6	503474	503479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837174
10545	NC_021814	GC	3	6	503511	503516	0 %	0 %	50 %	50 %	525837174
10546	NC_021814	CTG	2	6	503526	503531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837174
10547	NC_021814	AGTA	2	8	503677	503684	50 %	25 %	25 %	0 %	525837174
10548	NC_021814	A	7	7	503693	503699	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10549	NC_021814	T	8	8	503720	503727	0 %	100 %	0 %	0 %	525837175
10550	NC_021814	TCT	2	6	503736	503741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837175
10551	NC_021814	CAG	2	6	503744	503749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837175
10552	NC_021814	CGG	2	6	503750	503755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837175
10553	NC_021814	TCA	2	6	503778	503783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837175
10554	NC_021814	ATC	2	6	503958	503963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837175
10555	NC_021814	CAA	2	6	504035	504040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525840544
10556	NC_021814	GGCT	2	8	504043	504050	0 %	25 %	50 %	25 %	525840544
10557	NC_021814	GTG	2	6	504082	504087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840544
10558	NC_021814	CCG	2	6	504116	504121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840544
10559	NC_021814	GGAC	2	8	504146	504153	25 %	0 %	50 %	25 %	525840544
10560	NC_021814	CGA	2	6	504195	504200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840544
10561	NC_021814	GCG	2	6	504284	504289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840544
10562	NC_021814	TCGC	2	8	504296	504303	0 %	25 %	25 %	50 %	525840544
10563	NC_021814	GCC	2	6	504324	504329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840544
10564	NC_021814	T	6	6	504336	504341	0 %	100 %	0 %	0 %	525840544
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10566	NC_021814	TGC	2	6	504509	504514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840544
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10569	NC_021814	GCG	2	6	504671	504676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840544
10570	NC_021814	GATAG	2	10	504684	504693	40 %	20 %	40 %	0 %	525840544
10571	NC_021814	GC	3	6	504707	504712	0 %	0 %	50 %	50 %	525840544
10572	NC_021814	CTGA	2	8	504728	504735	25 %	25 %	25 %	25 %	525840544
10573	NC_021814	GCG	2	6	504746	504751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840544
10574	NC_021814	GATCG	2	10	504771	504780	20 %	20 %	40 %	20 %	525840544
10575	NC_021814	CA	3	6	504963	504968	50 %	0 %	0 %	50 %	525840544
10576	NC_021814	CCG	2	6	504988	504993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840544
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10578	NC_021814	CGCC	2	8	505080	505087	0 %	0 %	25 %	75 %	525840544
10579	NC_021814	GCG	2	6	505116	505121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840544
10580	NC_021814	T	6	6	505140	505145	0 %	100 %	0 %	0 %	525840544
10581	NC_021814	GGC	2	6	505159	505164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840544
10582	NC_021814	GC	3	6	505262	505267	0 %	0 %	50 %	50 %	525840544
10583	NC_021814	CGTTG	2	10	505284	505293	0 %	40 %	40 %	20 %	525840544
10584	NC_021814	CAG	2	6	505341	505346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840544
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10586	NC_021814	A	6	6	505372	505377	100 %	0 %	0 %	0 %	525840544
10587	NC_021814	ATC	2	6	505386	505391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840544
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10589	NC_021814	GCG	2	6	505448	505453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837176
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10594	NC_021814	ATA	2	6	505743	505748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837176
10595	NC_021814	GGA	2	6	505775	505780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525837176
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10599	NC_021814	GCG	2	6	505951	505956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837176
10600	NC_021814	CAAT	2	8	505981	505988	50 %	25 %	0 %	25 %	525837176
10601	NC_021814	TCGT	2	8	506009	506016	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10602	NC_021814	A	6	6	506109	506114	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10603	NC_021814	GCA	2	6	506229	506234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837177
10604	NC_021814	GCG	2	6	506323	506328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837177
10605	NC_021814	CCG	2	6	506462	506467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837177
10606	NC_021814	GAA	2	6	506521	506526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837177
10607	NC_021814	GAT	2	6	506556	506561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837177
10608	NC_021814	CAG	2	6	506602	506607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837178
10609	NC_021814	GCCA	2	8	506696	506703	25 %	0 %	25 %	50 %	525837178
10610	NC_021814	GTCGC	2	10	506726	506735	0 %	20 %	40 %	40 %	525837178
10611	NC_021814	T	6	6	506745	506750	0 %	100 %	0 %	0 %	525837178
10612	NC_021814	GGC	2	6	506751	506756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837178
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10616	NC_021814	CCGCC	2	10	506919	506928	0 %	0 %	20 %	80 %	525837178
10617	NC_021814	AAT	2	6	506935	506940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837178
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10619	NC_021814	GGC	2	6	507091	507096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837178
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10621	NC_021814	GAT	2	6	507176	507181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837178
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10742	NC_021814	ACG	2	6	512310	512315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837184
10743	NC_021814	GCA	2	6	512320	512325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837184
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10750	NC_021814	TG	3	6	512697	512702	0 %	50 %	50 %	0 %	525837184
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10849	NC_021814	CGCTCG	2	12	517521	517532	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	525837186
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10857	NC_021814	GCT	2	6	517768	517773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837186
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10987	NC_021814	ATT	2	6	523607	523612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525840551
10988	NC_021814	AGC	2	6	523775	523780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840551
10989	NC_021814	TCA	2	6	523806	523811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840551
10990	NC_021814	CTG	2	6	523849	523854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840551
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10993	NC_021814	GTC	2	6	523982	523987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10995	NC_021814	A	7	7	524165	524171	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10999	NC_021814	ATG	2	6	524313	524318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11000	NC_021814	GCA	2	6	524368	524373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837190

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