MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 102537

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
100001	NC_021814	GCG	3	9	4742138	4742146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840352
100002	NC_021814	GC	3	6	4742175	4742180	0 %	0 %	50 %	50 %	525840352
100003	NC_021814	CAG	2	6	4742187	4742192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840352
100004	NC_021814	CAG	2	6	4742197	4742202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840352
100005	NC_021814	GGT	2	6	4742223	4742228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840352
100006	NC_021814	GCAG	2	8	4742288	4742295	25 %	0 %	50 %	25 %	525840352
100007	NC_021814	CGA	2	6	4742345	4742350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840352
100008	NC_021814	CTT	2	6	4742382	4742387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525840352
100009	NC_021814	AGCG	2	8	4742401	4742408	25 %	0 %	50 %	25 %	525840352
100010	NC_021814	CAG	2	6	4742424	4742429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840352
100011	NC_021814	CTG	2	6	4742457	4742462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840352
100012	NC_021814	GTACC	2	10	4742525	4742534	20 %	20 %	20 %	40 %	525840352
100013	NC_021814	TTTC	2	8	4742629	4742636	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
100014	NC_021814	AAAT	2	8	4742652	4742659	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100015	NC_021814	A	6	6	4742680	4742685	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100016	NC_021814	ATTT	2	8	4742688	4742695	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100017	NC_021814	CATGG	2	10	4742719	4742728	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
100018	NC_021814	CGC	2	6	4742794	4742799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525841327
100019	NC_021814	TGA	2	6	4742872	4742877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525841327
100020	NC_021814	ATG	2	6	4742926	4742931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525841327
100021	NC_021814	CGA	2	6	4742954	4742959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525841327
100022	NC_021814	GAT	2	6	4743002	4743007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525841327
100023	NC_021814	GGC	2	6	4743041	4743046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525841327
100024	NC_021814	GCT	2	6	4743059	4743064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525841327
100025	NC_021814	GTA	2	6	4743069	4743074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525841327
100026	NC_021814	CAA	2	6	4743089	4743094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525841327
100027	NC_021814	TGC	2	6	4743103	4743108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525841327
100028	NC_021814	GCG	2	6	4743133	4743138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525841327
100029	NC_021814	GCG	2	6	4743146	4743151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525841327
100030	NC_021814	AAG	2	6	4743171	4743176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525841327
100031	NC_021814	GTTG	2	8	4743187	4743194	0 %	50 %	50 %	0 %	525841327
100032	NC_021814	GGC	2	6	4743287	4743292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525841327
100033	NC_021814	CTT	2	6	4743305	4743310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525841327
100034	NC_021814	A	6	6	4743355	4743360	100 %	0 %	0 %	0 %	525841327
100035	NC_021814	CG	4	8	4743361	4743368	0 %	0 %	50 %	50 %	525841327
100036	NC_021814	CTG	2	6	4743369	4743374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525841327
100037	NC_021814	TAC	2	6	4743424	4743429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525841327
100038	NC_021814	CGC	2	6	4743439	4743444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525841327
100039	NC_021814	GCC	2	6	4743552	4743557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525841327
100040	NC_021814	GCG	2	6	4743649	4743654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525841327
100041	NC_021814	CCG	2	6	4743714	4743719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525841327
100042	NC_021814	TGG	2	6	4743733	4743738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525841327
100043	NC_021814	GTC	2	6	4743767	4743772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525841327
100044	NC_021814	CGC	3	9	4743836	4743844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525841327
100045	NC_021814	TGC	2	6	4743847	4743852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525841327
100046	NC_021814	ATC	2	6	4743856	4743861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525841327
100047	NC_021814	TGC	2	6	4743874	4743879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525841327
100048	NC_021814	GC	3	6	4743915	4743920	0 %	0 %	50 %	50 %	525841327
100049	NC_021814	GGC	2	6	4743950	4743955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525841327
100050	NC_021814	GGC	4	12	4743960	4743971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525841327
100051	NC_021814	CGC	2	6	4743985	4743990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525841327
100052	NC_021814	GTT	2	6	4743998	4744003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525841327
100053	NC_021814	CCA	2	6	4744087	4744092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525841327
100054	NC_021814	GC	3	6	4744131	4744136	0 %	0 %	50 %	50 %	525841327
100055	NC_021814	GT	3	6	4744140	4744145	0 %	50 %	50 %	0 %	525841327
100056	NC_021814	CTG	2	6	4744152	4744157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525841327
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100059	NC_021814	CGG	2	6	4744205	4744210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525841327
100060	NC_021814	CGA	2	6	4744217	4744222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525841327
100061	NC_021814	GATA	2	8	4744235	4744242	50 %	25 %	25 %	0 %	525841327
100062	NC_021814	AGC	2	6	4744263	4744268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525841327
100063	NC_021814	GC	3	6	4744267	4744272	0 %	0 %	50 %	50 %	525841327
100064	NC_021814	CTGG	2	8	4744274	4744281	0 %	25 %	50 %	25 %	525841327
100065	NC_021814	GC	3	6	4744331	4744336	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100066	NC_021814	GT	3	6	4744340	4744345	0 %	50 %	50 %	0 %	525841328
100067	NC_021814	CTG	2	6	4744352	4744357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525841328
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100069	NC_021814	GGC	2	6	4744375	4744380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525841328
100070	NC_021814	CGG	2	6	4744405	4744410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525841328
100071	NC_021814	CGA	2	6	4744417	4744422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525841328
100072	NC_021814	GATA	2	8	4744435	4744442	50 %	25 %	25 %	0 %	525841328
100073	NC_021814	GC	3	6	4744467	4744472	0 %	0 %	50 %	50 %	525841328
100074	NC_021814	CTGG	2	8	4744474	4744481	0 %	25 %	50 %	25 %	525841328
100075	NC_021814	GCGCG	2	10	4744518	4744527	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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100077	NC_021814	TGG	2	6	4744609	4744614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100078	NC_021814	TTG	2	6	4744747	4744752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100079	NC_021814	A	7	7	4744846	4744852	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100080	NC_021814	TGA	2	6	4744853	4744858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840353
100081	NC_021814	ACC	2	6	4744873	4744878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525840353
100082	NC_021814	AGA	2	6	4744920	4744925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525840353
100083	NC_021814	CAG	2	6	4744936	4744941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840353
100084	NC_021814	CGA	2	6	4745039	4745044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840353
100085	NC_021814	ATT	2	6	4745053	4745058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525840353
100086	NC_021814	CGG	3	9	4745060	4745068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840353
100087	NC_021814	CGG	2	6	4745117	4745122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840353
100088	NC_021814	ACC	2	6	4745188	4745193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525840353
100089	NC_021814	CCCG	2	8	4745229	4745236	0 %	0 %	25 %	75 %	525840353
100090	NC_021814	TCTG	2	8	4745369	4745376	0 %	50 %	25 %	25 %	525840353
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100096	NC_021814	GAT	2	6	4745601	4745606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840353
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100099	NC_021814	AGC	2	6	4745702	4745707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840353
100100	NC_021814	CGGCG	2	10	4745750	4745759	0 %	0 %	60 %	40 %	525840353
100101	NC_021814	TGA	2	6	4745867	4745872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840353
100102	NC_021814	CGAA	2	8	4745875	4745882	50 %	0 %	25 %	25 %	525840353
100103	NC_021814	GAA	2	6	4745886	4745891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525840353
100104	NC_021814	CGA	2	6	4745961	4745966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840353
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100110	NC_021814	GCT	2	6	4746210	4746215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840354
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100112	NC_021814	GCG	2	6	4746257	4746262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840354
100113	NC_021814	CGA	2	6	4746276	4746281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840354
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100115	NC_021814	TGC	2	6	4746374	4746379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840354
100116	NC_021814	CGG	2	6	4746435	4746440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840354
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100216	NC_021814	T	8	8	4750571	4750578	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100217	NC_021814	TAAT	2	8	4750587	4750594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100218	NC_021814	A	6	6	4750691	4750696	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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100222	NC_021814	GCT	2	6	4750841	4750846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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100225	NC_021814	GAG	2	6	4751054	4751059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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100228	NC_021814	GCC	2	6	4751162	4751167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840357
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100335	NC_021814	CAT	2	6	4756056	4756061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840359
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100462	NC_021814	CTG	2	6	4762910	4762915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840365
100463	NC_021814	CAG	2	6	4762970	4762975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840365
100464	NC_021814	CGC	2	6	4763044	4763049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840365
100465	NC_021814	TCG	2	6	4763076	4763081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840365
100466	NC_021814	AG	3	6	4763082	4763087	50 %	0 %	50 %	0 %	525840365
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100473	NC_021814	CGT	2	6	4763379	4763384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840366
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100477	NC_021814	G	6	6	4763593	4763598	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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100480	NC_021814	TTAA	2	8	4763805	4763812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100481	NC_021814	TAA	2	6	4763825	4763830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100482	NC_021814	TAAT	2	8	4763836	4763843	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100483	NC_021814	ATTA	2	8	4763864	4763871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100484	NC_021814	TTAA	2	8	4763900	4763907	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100485	NC_021814	A	6	6	4763906	4763911	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100486	NC_021814	AAG	2	6	4763949	4763954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100487	NC_021814	T	7	7	4763985	4763991	0 %	100 %	0 %	0 %	525840367
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100499	NC_021814	TGA	2	6	4764452	4764457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840367
100500	NC_021814	TCG	2	6	4764487	4764492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840367

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