MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 102537

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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96002	NC_021814	AT	3	6	4557736	4557741	50 %	50 %	0 %	0 %	525840229
96003	NC_021814	TGC	2	6	4557742	4557747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840229
96004	NC_021814	TGG	2	6	4558004	4558009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840230
96005	NC_021814	CCG	2	6	4558024	4558029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840230
96006	NC_021814	TCC	2	6	4558089	4558094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525840230
96007	NC_021814	A	6	6	4558098	4558103	100 %	0 %	0 %	0 %	525840230
96008	NC_021814	CGC	2	6	4558124	4558129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840230
96009	NC_021814	GCC	2	6	4558278	4558283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840230
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96047	NC_021814	CGG	2	6	4560490	4560495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840231
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96052	NC_021814	GCGA	2	8	4560684	4560691	25 %	0 %	50 %	25 %	525840231
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96088	NC_021814	CCG	2	6	4562969	4562974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840233
96089	NC_021814	TAA	2	6	4563014	4563019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525840233
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96111	NC_021814	CGC	2	6	4564120	4564125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525841294
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96115	NC_021814	GGC	2	6	4564380	4564385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840234
96116	NC_021814	GCC	2	6	4564461	4564466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840234
96117	NC_021814	GAT	2	6	4564565	4564570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840234
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96122	NC_021814	GAT	2	6	4564713	4564718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840234
96123	NC_021814	AGCGCC	2	12	4564731	4564742	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	525840234
96124	NC_021814	CTG	2	6	4564749	4564754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840234
96125	NC_021814	CGA	2	6	4564793	4564798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840234
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96196	NC_021814	CGGAA	2	10	4568049	4568058	40 %	0 %	40 %	20 %	525840237
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96203	NC_021814	G	6	6	4568290	4568295	0 %	0 %	100 %	0 %	525840237
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96211	NC_021814	A	6	6	4568560	4568565	100 %	0 %	0 %	0 %	525840237
96212	NC_021814	AGC	2	6	4568656	4568661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840237
96213	NC_021814	AGC	3	9	4568669	4568677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840237
96214	NC_021814	GCAG	2	8	4568715	4568722	25 %	0 %	50 %	25 %	525840237
96215	NC_021814	CAC	2	6	4568734	4568739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525840237
96216	NC_021814	GTT	2	6	4568765	4568770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525840238
96217	NC_021814	TTA	2	6	4568789	4568794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525840238
96218	NC_021814	CAG	2	6	4568973	4568978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840238
96219	NC_021814	GA	3	6	4568980	4568985	50 %	0 %	50 %	0 %	525840238
96220	NC_021814	CCA	2	6	4569014	4569019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525840238
96221	NC_021814	CGTAA	2	10	4569137	4569146	40 %	20 %	20 %	20 %	525840238
96222	NC_021814	TAA	2	6	4569155	4569160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525840238
96223	NC_021814	TTTC	2	8	4569250	4569257	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
96224	NC_021814	TGA	2	6	4569341	4569346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96225	NC_021814	GCG	2	6	4569363	4569368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840239
96226	NC_021814	TCA	2	6	4569380	4569385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840239
96227	NC_021814	AT	3	6	4569404	4569409	50 %	50 %	0 %	0 %	525840239
96228	NC_021814	CAA	2	6	4569447	4569452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525840239
96229	NC_021814	GCG	3	9	4569484	4569492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840239
96230	NC_021814	TCA	2	6	4569521	4569526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840239
96231	NC_021814	TCCA	2	8	4569585	4569592	25 %	25 %	0 %	50 %	525840239
96232	NC_021814	CTG	2	6	4569642	4569647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840239
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96333	NC_021814	GCA	2	6	4574217	4574222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840243
96334	NC_021814	GTC	2	6	4574254	4574259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840243
96335	NC_021814	ATCCC	2	10	4574416	4574425	20 %	20 %	0 %	60 %	525840243
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96337	NC_021814	TG	3	6	4574571	4574576	0 %	50 %	50 %	0 %	525840243
96338	NC_021814	CCG	2	6	4574585	4574590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840243
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96340	NC_021814	GCGT	2	8	4574610	4574617	0 %	25 %	50 %	25 %	525840243
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96343	NC_021814	CTGT	2	8	4574716	4574723	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
96344	NC_021814	GGT	2	6	4574777	4574782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96345	NC_021814	T	6	6	4574819	4574824	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96346	NC_021814	GAG	2	6	4574849	4574854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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96348	NC_021814	GCCC	2	8	4574880	4574887	0 %	0 %	25 %	75 %	525840244
96349	NC_021814	GAC	2	6	4574889	4574894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840244
96350	NC_021814	TCG	2	6	4574905	4574910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840244
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96463	NC_021814	ACG	2	6	4580633	4580638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840245
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96497	NC_021814	CGT	2	6	4582463	4582468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840246
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96499	NC_021814	AAGT	2	8	4582585	4582592	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
96500	NC_021814	TG	3	6	4582594	4582599	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

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