MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 102537

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
95001	NC_021814	CCA	2	6	4511036	4511041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525840195
95002	NC_021814	ACT	2	6	4511054	4511059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840195
95003	NC_021814	GAT	2	6	4511103	4511108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840195
95004	NC_021814	TCT	2	6	4511187	4511192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525840195
95005	NC_021814	CG	3	6	4511251	4511256	0 %	0 %	50 %	50 %	525840195
95006	NC_021814	TTC	2	6	4511316	4511321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525840195
95007	NC_021814	AT	3	6	4511348	4511353	50 %	50 %	0 %	0 %	525840195
95008	NC_021814	TC	4	8	4511375	4511382	0 %	50 %	0 %	50 %	525840195
95009	NC_021814	GA	3	6	4511390	4511395	50 %	0 %	50 %	0 %	525840195
95010	NC_021814	TCA	2	6	4511421	4511426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840195
95011	NC_021814	AAAG	2	8	4511452	4511459	75 %	0 %	25 %	0 %	525840195
95012	NC_021814	A	6	6	4511469	4511474	100 %	0 %	0 %	0 %	525840195
95013	NC_021814	TAA	2	6	4511485	4511490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95014	NC_021814	TGAG	2	8	4511514	4511521	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
95015	NC_021814	A	7	7	4511568	4511574	100 %	0 %	0 %	0 %	525841288
95016	NC_021814	ATG	2	6	4511586	4511591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525841288
95017	NC_021814	T	7	7	4511593	4511599	0 %	100 %	0 %	0 %	525841288
95018	NC_021814	GAA	2	6	4511601	4511606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525841288
95019	NC_021814	CTTTG	2	10	4511621	4511630	0 %	60 %	20 %	20 %	525841288
95020	NC_021814	CAG	2	6	4511649	4511654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525841288
95021	NC_021814	AT	3	6	4511663	4511668	50 %	50 %	0 %	0 %	525841288
95022	NC_021814	ATA	2	6	4511682	4511687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525841288
95023	NC_021814	AG	3	6	4511716	4511721	50 %	0 %	50 %	0 %	525841288
95024	NC_021814	TA	3	6	4511811	4511816	50 %	50 %	0 %	0 %	525840196
95025	NC_021814	TTA	2	6	4511871	4511876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525840196
95026	NC_021814	TCG	2	6	4512022	4512027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840196
95027	NC_021814	GAAA	2	8	4512061	4512068	75 %	0 %	25 %	0 %	525840196
95028	NC_021814	GAAA	2	8	4512129	4512136	75 %	0 %	25 %	0 %	525840196
95029	NC_021814	A	6	6	4512188	4512193	100 %	0 %	0 %	0 %	525840196
95030	NC_021814	ATC	2	6	4512222	4512227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840196
95031	NC_021814	AGT	2	6	4512236	4512241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840196
95032	NC_021814	CGT	2	6	4512292	4512297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840196
95033	NC_021814	GCC	3	9	4512331	4512339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840196
95034	NC_021814	ATTT	2	8	4512411	4512418	25 %	75 %	0 %	0 %	525840196
95035	NC_021814	ATT	2	6	4512458	4512463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525840196
95036	NC_021814	AGC	2	6	4512519	4512524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840196
95037	NC_021814	GC	3	6	4512549	4512554	0 %	0 %	50 %	50 %	525840196
95038	NC_021814	A	6	6	4512573	4512578	100 %	0 %	0 %	0 %	525840196
95039	NC_021814	A	6	6	4512580	4512585	100 %	0 %	0 %	0 %	525840196
95040	NC_021814	TAC	2	6	4512597	4512602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840196
95041	NC_021814	CTG	2	6	4512635	4512640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840196
95042	NC_021814	CG	3	6	4512693	4512698	0 %	0 %	50 %	50 %	525840196
95043	NC_021814	GAT	2	6	4512749	4512754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840196
95044	NC_021814	ATT	2	6	4512809	4512814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525840196
95045	NC_021814	GA	3	6	4512827	4512832	50 %	0 %	50 %	0 %	525840196
95046	NC_021814	TAA	2	6	4512862	4512867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525840196
95047	NC_021814	GAA	3	9	4512919	4512927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525840197
95048	NC_021814	CTTT	2	8	4513011	4513018	0 %	75 %	0 %	25 %	525840197
95049	NC_021814	CAG	2	6	4513114	4513119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840197
95050	NC_021814	TACGC	2	10	4513144	4513153	20 %	20 %	20 %	40 %	525840197
95051	NC_021814	TTG	2	6	4513157	4513162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525840197
95052	NC_021814	ATT	2	6	4513250	4513255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525840197
95053	NC_021814	TGG	2	6	4513387	4513392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840197
95054	NC_021814	TTTTA	2	10	4513452	4513461	20 %	80 %	0 %	0 %	525840197
95055	NC_021814	GTA	2	6	4513531	4513536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840197
95056	NC_021814	AT	3	6	4513571	4513576	50 %	50 %	0 %	0 %	525840197
95057	NC_021814	A	6	6	4513606	4513611	100 %	0 %	0 %	0 %	525840197
95058	NC_021814	TTA	2	6	4513655	4513660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525840197
95059	NC_021814	G	6	6	4513724	4513729	0 %	0 %	100 %	0 %	525840197
95060	NC_021814	T	6	6	4513749	4513754	0 %	100 %	0 %	0 %	525840197
95061	NC_021814	ATT	2	6	4513874	4513879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525840197
95062	NC_021814	CTT	2	6	4513903	4513908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525840197
95063	NC_021814	TGA	2	6	4513976	4513981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840198
95064	NC_021814	TAA	3	9	4513985	4513993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525840198
95065	NC_021814	TGA	2	6	4513994	4513999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840198
95066	NC_021814	TGA	2	6	4514027	4514032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840198
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95068	NC_021814	CGCT	2	8	4514092	4514099	0 %	25 %	25 %	50 %	525840198
95069	NC_021814	ATT	2	6	4514106	4514111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525840198
95070	NC_021814	AT	3	6	4514141	4514146	50 %	50 %	0 %	0 %	525840198
95071	NC_021814	TTA	2	6	4514191	4514196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525840198
95072	NC_021814	AAG	2	6	4514283	4514288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525840198
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95079	NC_021814	TAAT	2	8	4514689	4514696	50 %	50 %	0 %	0 %	525840198
95080	NC_021814	ATA	2	6	4514698	4514703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525840198
95081	NC_021814	TAT	2	6	4514772	4514777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525840198
95082	NC_021814	AAG	2	6	4514847	4514852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525840198
95083	NC_021814	TCT	2	6	4514864	4514869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525840198
95084	NC_021814	ATT	2	6	4514881	4514886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525840198
95085	NC_021814	CTGG	2	8	4514898	4514905	0 %	25 %	50 %	25 %	525840198
95086	NC_021814	AAT	2	6	4514938	4514943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525840198
95087	NC_021814	CCCT	2	8	4514946	4514953	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
95088	NC_021814	ATT	2	6	4514968	4514973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525841289
95089	NC_021814	A	7	7	4514975	4514981	100 %	0 %	0 %	0 %	525841289
95090	NC_021814	A	6	6	4515007	4515012	100 %	0 %	0 %	0 %	525841289
95091	NC_021814	ATC	2	6	4515059	4515064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525841289
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95094	NC_021814	AT	3	6	4515132	4515137	50 %	50 %	0 %	0 %	525841289
95095	NC_021814	A	6	6	4515162	4515167	100 %	0 %	0 %	0 %	525841289
95096	NC_021814	TAC	2	6	4515205	4515210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525841289
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95098	NC_021814	GCG	2	6	4515240	4515245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525841289
95099	NC_021814	GCG	2	6	4515256	4515261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525841289
95100	NC_021814	CTG	2	6	4515277	4515282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525841289
95101	NC_021814	TGA	2	6	4515320	4515325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525841289
95102	NC_021814	TTG	2	6	4515353	4515358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525841289
95103	NC_021814	AT	3	6	4515406	4515411	50 %	50 %	0 %	0 %	525841289
95104	NC_021814	ATGGT	2	10	4515425	4515434	20 %	40 %	40 %	0 %	525841289
95105	NC_021814	GA	3	6	4515579	4515584	50 %	0 %	50 %	0 %	525841289
95106	NC_021814	A	6	6	4515613	4515618	100 %	0 %	0 %	0 %	525841289
95107	NC_021814	CGT	2	6	4515634	4515639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525841289
95108	NC_021814	TTTAA	2	10	4515682	4515691	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
95109	NC_021814	CTGA	2	8	4515696	4515703	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
95110	NC_021814	TGC	2	6	4515712	4515717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95111	NC_021814	GA	3	6	4515735	4515740	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95112	NC_021814	ATTT	2	8	4515774	4515781	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95113	NC_021814	T	6	6	4515807	4515812	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95114	NC_021814	TAT	2	6	4515884	4515889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525840199
95115	NC_021814	TTTC	2	8	4515891	4515898	0 %	75 %	0 %	25 %	525840199
95116	NC_021814	CGC	2	6	4515919	4515924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840199
95117	NC_021814	TCC	2	6	4516030	4516035	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525840199
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95119	NC_021814	CAGT	2	8	4516073	4516080	25 %	25 %	25 %	25 %	525840199
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95238	NC_021814	GGC	2	6	4521760	4521765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840203
95239	NC_021814	AGA	2	6	4521766	4521771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525840203
95240	NC_021814	GCA	2	6	4521810	4521815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840203
95241	NC_021814	TTA	2	6	4521836	4521841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525840203
95242	NC_021814	CAT	2	6	4521844	4521849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840203
95243	NC_021814	GGT	2	6	4521868	4521873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840203
95244	NC_021814	CCA	2	6	4521984	4521989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525840203
95245	NC_021814	CCA	3	9	4522023	4522031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525840203
95246	NC_021814	TGC	2	6	4522074	4522079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840203
95247	NC_021814	CGC	2	6	4522092	4522097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840203
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95249	NC_021814	TGC	2	6	4522222	4522227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95250	NC_021814	TGA	2	6	4522240	4522245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95251	NC_021814	AGA	2	6	4522384	4522389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525840204
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95253	NC_021814	GCA	2	6	4522408	4522413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840204
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95292	NC_021814	GGC	2	6	4524583	4524588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
95293	NC_021814	GAGT	2	8	4524593	4524600	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
95294	NC_021814	ATGG	2	8	4524698	4524705	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
95295	NC_021814	T	6	6	4524824	4524829	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95296	NC_021814	TGCT	2	8	4524939	4524946	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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95349	NC_021814	CGCTC	2	10	4527530	4527539	0 %	20 %	20 %	60 %	525840208
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95351	NC_021814	CCGC	2	8	4527558	4527565	0 %	0 %	25 %	75 %	525840208
95352	NC_021814	GAC	2	6	4527635	4527640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840208
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95354	NC_021814	GC	3	6	4527701	4527706	0 %	0 %	50 %	50 %	525840208
95355	NC_021814	TGT	2	6	4527725	4527730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525840208
95356	NC_021814	GC	3	6	4527811	4527816	0 %	0 %	50 %	50 %	525840208
95357	NC_021814	TCT	2	6	4527866	4527871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525840208
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95461	NC_021814	GAA	2	6	4532691	4532696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525840212
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95467	NC_021814	TGG	2	6	4532977	4532982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840212
95468	NC_021814	CGG	2	6	4532989	4532994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840212
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95471	NC_021814	TGA	2	6	4533088	4533093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840212
95472	NC_021814	GGCGCG	2	12	4533096	4533107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840212
95473	NC_021814	GCGCG	2	10	4533134	4533143	0 %	0 %	60 %	40 %	525840212
95474	NC_021814	CGT	2	6	4533161	4533166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840212
95475	NC_021814	CGC	2	6	4533181	4533186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840212
95476	NC_021814	CCG	2	6	4533193	4533198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840212
95477	NC_021814	A	6	6	4533328	4533333	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95478	NC_021814	GAA	2	6	4533372	4533377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95479	NC_021814	GAT	2	6	4533404	4533409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840213
95480	NC_021814	CGA	2	6	4533435	4533440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840213
95481	NC_021814	CGC	2	6	4533582	4533587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840213
95482	NC_021814	CTTC	2	8	4533603	4533610	0 %	50 %	0 %	50 %	525840213
95483	NC_021814	A	6	6	4533661	4533666	100 %	0 %	0 %	0 %	525840213
95484	NC_021814	CGC	2	6	4533679	4533684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840213
95485	NC_021814	AG	3	6	4533733	4533738	50 %	0 %	50 %	0 %	525840213
95486	NC_021814	CG	3	6	4533767	4533772	0 %	0 %	50 %	50 %	525840213
95487	NC_021814	CGC	2	6	4533816	4533821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840213
95488	NC_021814	GCC	2	6	4533829	4533834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840213
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95491	NC_021814	AG	3	6	4534052	4534057	50 %	0 %	50 %	0 %	525840213
95492	NC_021814	CCA	2	6	4534064	4534069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525840213
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95494	NC_021814	AT	3	6	4534250	4534255	50 %	50 %	0 %	0 %	525840213
95495	NC_021814	ATT	2	6	4534294	4534299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525840213
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95498	NC_021814	AGAT	2	8	4534406	4534413	50 %	25 %	25 %	0 %	525840213
95499	NC_021814	CAAT	2	8	4534446	4534453	50 %	25 %	0 %	25 %	525840213
95500	NC_021814	CCG	2	6	4534499	4534504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840213

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