MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 102537

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
94001	NC_021814	ACA	2	6	4462101	4462106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94002	NC_021814	TCATGT	2	12	4462130	4462141	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94003	NC_021814	TCC	2	6	4462158	4462163	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94004	NC_021814	ACG	2	6	4462173	4462178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94005	NC_021814	TTC	2	6	4462231	4462236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94006	NC_021814	A	6	6	4462240	4462245	100 %	0 %	0 %	0 %	525840160
94007	NC_021814	GGA	2	6	4462247	4462252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525840160
94008	NC_021814	GC	3	6	4462306	4462311	0 %	0 %	50 %	50 %	525840160
94009	NC_021814	TGG	2	6	4462369	4462374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840160
94010	NC_021814	GCC	2	6	4462383	4462388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840160
94011	NC_021814	GAC	2	6	4462409	4462414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840160
94012	NC_021814	GCG	2	6	4462440	4462445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840160
94013	NC_021814	TCA	2	6	4462483	4462488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840160
94014	NC_021814	CGG	2	6	4462543	4462548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840160
94015	NC_021814	GGC	2	6	4462592	4462597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840160
94016	NC_021814	ATT	2	6	4462605	4462610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525840160
94017	NC_021814	GCG	2	6	4462638	4462643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840160
94018	NC_021814	TAA	2	6	4462709	4462714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525840160
94019	NC_021814	AGA	2	6	4462715	4462720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525840160
94020	NC_021814	ATA	2	6	4462900	4462905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525840160
94021	NC_021814	AAT	2	6	4462936	4462941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525840160
94022	NC_021814	T	6	6	4462944	4462949	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94023	NC_021814	AGG	2	6	4462980	4462985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94024	NC_021814	ATG	2	6	4462988	4462993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94025	NC_021814	ATAAA	2	10	4463009	4463018	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
94026	NC_021814	T	6	6	4463050	4463055	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94027	NC_021814	TCA	2	6	4463155	4463160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840161
94028	NC_021814	TGAC	2	8	4463161	4463168	25 %	25 %	25 %	25 %	525840161
94029	NC_021814	AGC	2	6	4463218	4463223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840161
94030	NC_021814	A	6	6	4463226	4463231	100 %	0 %	0 %	0 %	525840161
94031	NC_021814	GGA	2	6	4463267	4463272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525840161
94032	NC_021814	AGA	2	6	4463315	4463320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525840161
94033	NC_021814	TCC	2	6	4463375	4463380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525840161
94034	NC_021814	TTTA	2	8	4463418	4463425	25 %	75 %	0 %	0 %	525840161
94035	NC_021814	TCA	2	6	4463455	4463460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840161
94036	NC_021814	ATT	2	6	4463517	4463522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525840161
94037	NC_021814	AGC	2	6	4463582	4463587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840161
94038	NC_021814	CAC	2	6	4463612	4463617	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525840161
94039	NC_021814	CGT	2	6	4463631	4463636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840161
94040	NC_021814	GAA	2	6	4463679	4463684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525840161
94041	NC_021814	CCG	2	6	4463731	4463736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840161
94042	NC_021814	CTG	2	6	4463745	4463750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840161
94043	NC_021814	CG	3	6	4463755	4463760	0 %	0 %	50 %	50 %	525840161
94044	NC_021814	TCAG	2	8	4463770	4463777	25 %	25 %	25 %	25 %	525840161
94045	NC_021814	GTG	2	6	4463788	4463793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840161
94046	NC_021814	GATAAA	2	12	4463862	4463873	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525840161
94047	NC_021814	TCTG	2	8	4463896	4463903	0 %	50 %	25 %	25 %	525840161
94048	NC_021814	GCTG	2	8	4464043	4464050	0 %	25 %	50 %	25 %	525840161
94049	NC_021814	CTG	2	6	4464087	4464092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840161
94050	NC_021814	GATG	2	8	4464275	4464282	25 %	25 %	50 %	0 %	525840161
94051	NC_021814	CAT	2	6	4464336	4464341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840161
94052	NC_021814	AGC	2	6	4464363	4464368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840161
94053	NC_021814	CTGGC	2	10	4464381	4464390	0 %	20 %	40 %	40 %	525840161
94054	NC_021814	TAG	2	6	4464395	4464400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840161
94055	NC_021814	GCG	2	6	4464409	4464414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840161
94056	NC_021814	GC	3	6	4464480	4464485	0 %	0 %	50 %	50 %	525840161
94057	NC_021814	TGG	2	6	4464541	4464546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840161
94058	NC_021814	GCA	2	6	4464554	4464559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840161
94059	NC_021814	GAT	3	9	4464599	4464607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840161
94060	NC_021814	GTG	2	6	4464639	4464644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840161
94061	NC_021814	CGC	2	6	4464660	4464665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840161
94062	NC_021814	CTG	2	6	4464672	4464677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840161
94063	NC_021814	GGA	2	6	4464773	4464778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525840161
94064	NC_021814	CCG	2	6	4464822	4464827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840161
94065	NC_021814	AAAG	2	8	4464828	4464835	75 %	0 %	25 %	0 %	525840161
94066	NC_021814	TCTG	2	8	4464922	4464929	0 %	50 %	25 %	25 %	525840161
94067	NC_021814	A	6	6	4465048	4465053	100 %	0 %	0 %	0 %	525840161
94068	NC_021814	ACG	2	6	4465117	4465122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840161
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94070	NC_021814	TCA	2	6	4465188	4465193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840161
94071	NC_021814	ATT	2	6	4465197	4465202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525840161
94072	NC_021814	CTG	2	6	4465203	4465208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840161
94073	NC_021814	T	6	6	4465315	4465320	0 %	100 %	0 %	0 %	525840161
94074	NC_021814	TCT	2	6	4465512	4465517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525840161
94075	NC_021814	TAA	2	6	4465565	4465570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525840161
94076	NC_021814	AGGCGC	2	12	4465576	4465587	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	525840161
94077	NC_021814	TAT	2	6	4465696	4465701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525840161
94078	NC_021814	GAC	2	6	4465703	4465708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840161
94079	NC_021814	GCCGCT	2	12	4465775	4465786	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	525840161
94080	NC_021814	TGGT	2	8	4465800	4465807	0 %	50 %	50 %	0 %	525840161
94081	NC_021814	ATT	2	6	4465814	4465819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525840161
94082	NC_021814	TGG	2	6	4465831	4465836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840161
94083	NC_021814	TAA	2	6	4465884	4465889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525840161
94084	NC_021814	ATC	2	6	4465929	4465934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525841281
94085	NC_021814	GTGTT	2	10	4465965	4465974	0 %	60 %	40 %	0 %	525841281
94086	NC_021814	A	6	6	4466017	4466022	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94087	NC_021814	T	6	6	4466038	4466043	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94088	NC_021814	ATC	2	6	4466064	4466069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94089	NC_021814	GCT	2	6	4466100	4466105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94090	NC_021814	GTT	2	6	4466141	4466146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94091	NC_021814	AAT	2	6	4466204	4466209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525840162
94092	NC_021814	CGT	2	6	4466210	4466215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840162
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94094	NC_021814	GGC	2	6	4466297	4466302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840162
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94096	NC_021814	TAA	2	6	4466332	4466337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525840162
94097	NC_021814	A	6	6	4466367	4466372	100 %	0 %	0 %	0 %	525840162
94098	NC_021814	CCG	2	6	4466525	4466530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840162
94099	NC_021814	A	7	7	4466540	4466546	100 %	0 %	0 %	0 %	525840162
94100	NC_021814	TTA	2	6	4466578	4466583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525840162
94101	NC_021814	GGT	2	6	4466644	4466649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840162
94102	NC_021814	ATT	2	6	4466657	4466662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525840162
94103	NC_021814	CCA	2	6	4466690	4466695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94104	NC_021814	GC	3	6	4466730	4466735	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94105	NC_021814	GTA	2	6	4466754	4466759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94106	NC_021814	GCC	2	6	4466793	4466798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94107	NC_021814	GCG	2	6	4466803	4466808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
94108	NC_021814	TTAT	2	8	4466905	4466912	25 %	75 %	0 %	0 %	525840163
94109	NC_021814	CAG	2	6	4466927	4466932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840163
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94111	NC_021814	T	6	6	4466940	4466945	0 %	100 %	0 %	0 %	525840163
94112	NC_021814	ACT	2	6	4466946	4466951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840163
94113	NC_021814	TA	3	6	4467007	4467012	50 %	50 %	0 %	0 %	525840163
94114	NC_021814	CCG	2	6	4467070	4467075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840163
94115	NC_021814	TAC	2	6	4467089	4467094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840163
94116	NC_021814	CAC	2	6	4467104	4467109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525840163
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94118	NC_021814	GAT	2	6	4467242	4467247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840163
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94452	NC_021814	GGC	2	6	4484998	4485003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840172
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94465	NC_021814	GAT	2	6	4485547	4485552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840172
94466	NC_021814	GAC	2	6	4485562	4485567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840172
94467	NC_021814	GGC	2	6	4485616	4485621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840172
94468	NC_021814	GCC	3	9	4485625	4485633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840172
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94471	NC_021814	GC	3	6	4485715	4485720	0 %	0 %	50 %	50 %	525840172
94472	NC_021814	GCC	2	6	4485785	4485790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840172
94473	NC_021814	ATC	2	6	4485791	4485796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840172
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94476	NC_021814	TTTGA	2	10	4485913	4485922	20 %	60 %	20 %	0 %	525840172
94477	NC_021814	ATA	2	6	4485923	4485928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525840172
94478	NC_021814	TGC	2	6	4485968	4485973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840172
94479	NC_021814	CAG	2	6	4486045	4486050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840172
94480	NC_021814	GCG	2	6	4486083	4486088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840172
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