MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 102537

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
93001	NC_021814	CGG	2	6	4415046	4415051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840121
93002	NC_021814	CGG	2	6	4415060	4415065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840121
93003	NC_021814	AAT	2	6	4415103	4415108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525840121
93004	NC_021814	GTGGC	2	10	4415123	4415132	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
93005	NC_021814	ATG	2	6	4415194	4415199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93006	NC_021814	CGC	2	6	4415248	4415253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840122
93007	NC_021814	GC	3	6	4415410	4415415	0 %	0 %	50 %	50 %	525840122
93008	NC_021814	GTG	2	6	4415424	4415429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840122
93009	NC_021814	TGA	2	6	4415483	4415488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840122
93010	NC_021814	CCA	2	6	4415507	4415512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525840122
93011	NC_021814	CCG	2	6	4415513	4415518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840122
93012	NC_021814	G	6	6	4415537	4415542	0 %	0 %	100 %	0 %	525840122
93013	NC_021814	CGATG	2	10	4415555	4415564	20 %	20 %	40 %	20 %	525840122
93014	NC_021814	GC	3	6	4415590	4415595	0 %	0 %	50 %	50 %	525840122
93015	NC_021814	GCG	2	6	4415599	4415604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840122
93016	NC_021814	GCCGT	2	10	4415715	4415724	0 %	20 %	40 %	40 %	525840122
93017	NC_021814	CG	3	6	4415755	4415760	0 %	0 %	50 %	50 %	525840122
93018	NC_021814	ACG	2	6	4415799	4415804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840122
93019	NC_021814	TGGG	2	8	4415856	4415863	0 %	25 %	75 %	0 %	525840122
93020	NC_021814	A	6	6	4415910	4415915	100 %	0 %	0 %	0 %	525840122
93021	NC_021814	CAGG	2	8	4415967	4415974	25 %	0 %	50 %	25 %	525840122
93022	NC_021814	CGC	2	6	4415980	4415985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840122
93023	NC_021814	CGC	2	6	4416013	4416018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840122
93024	NC_021814	GCG	2	6	4416035	4416040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840122
93025	NC_021814	CGC	2	6	4416178	4416183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840122
93026	NC_021814	CAT	2	6	4416210	4416215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840122
93027	NC_021814	CTG	2	6	4416293	4416298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840122
93028	NC_021814	GGA	2	6	4416313	4416318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525840122
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93030	NC_021814	CCG	2	6	4416348	4416353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840122
93031	NC_021814	CGT	2	6	4416365	4416370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840122
93032	NC_021814	T	6	6	4416370	4416375	0 %	100 %	0 %	0 %	525840122
93033	NC_021814	ATGG	2	8	4416398	4416405	25 %	25 %	50 %	0 %	525840122
93034	NC_021814	GAG	2	6	4416462	4416467	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525841268
93035	NC_021814	G	6	6	4416479	4416484	0 %	0 %	100 %	0 %	525841268
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93038	NC_021814	CGG	2	6	4416591	4416596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525841268
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93041	NC_021814	CCG	2	6	4416701	4416706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525841268
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93043	NC_021814	TAA	2	6	4416736	4416741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525841269
93044	NC_021814	T	6	6	4416779	4416784	0 %	100 %	0 %	0 %	525841269
93045	NC_021814	ATC	2	6	4416785	4416790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525841269
93046	NC_021814	TCAT	2	8	4416793	4416800	25 %	50 %	0 %	25 %	525841269
93047	NC_021814	GTTG	2	8	4416803	4416810	0 %	50 %	50 %	0 %	525841269
93048	NC_021814	ATG	2	6	4416822	4416827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525841269
93049	NC_021814	A	8	8	4416943	4416950	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93050	NC_021814	ATG	2	6	4417053	4417058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93051	NC_021814	CCAAAG	2	12	4417176	4417187	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	525840123
93052	NC_021814	GGC	2	6	4417192	4417197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840123
93053	NC_021814	TTGCCG	2	12	4417250	4417261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840123
93054	NC_021814	TGG	2	6	4417307	4417312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840123
93055	NC_021814	AGAA	2	8	4417337	4417344	75 %	0 %	25 %	0 %	525840123
93056	NC_021814	GCT	2	6	4417443	4417448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840123
93057	NC_021814	CTT	2	6	4417600	4417605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93058	NC_021814	CTG	2	6	4417646	4417651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840124
93059	NC_021814	GCG	2	6	4417698	4417703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840124
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93061	NC_021814	CGA	2	6	4417741	4417746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840124
93062	NC_021814	GCTG	2	8	4417915	4417922	0 %	25 %	50 %	25 %	525840124
93063	NC_021814	CTG	2	6	4417961	4417966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840124
93064	NC_021814	AACG	2	8	4418024	4418031	50 %	0 %	25 %	25 %	525840124
93065	NC_021814	CCTTG	2	10	4418057	4418066	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
93066	NC_021814	T	7	7	4418088	4418094	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93067	NC_021814	TA	3	6	4418174	4418179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93068	NC_021814	GAA	2	6	4418231	4418236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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93072	NC_021814	TAT	2	6	4418359	4418364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525840125
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93077	NC_021814	GAGGCG	2	12	4418798	4418809	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	525840125
93078	NC_021814	CT	3	6	4418824	4418829	0 %	50 %	0 %	50 %	525840125
93079	NC_021814	CATT	2	8	4418840	4418847	25 %	50 %	0 %	25 %	525840125
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93083	NC_021814	CTG	2	6	4419008	4419013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840125
93084	NC_021814	TCG	2	6	4419018	4419023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840125
93085	NC_021814	GTC	2	6	4419122	4419127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840125
93086	NC_021814	CG	3	6	4419209	4419214	0 %	0 %	50 %	50 %	525840125
93087	NC_021814	AGT	2	6	4419233	4419238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840125
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93091	NC_021814	TGC	2	6	4419351	4419356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840125
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93100	NC_021814	GCG	2	6	4419798	4419803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840125
93101	NC_021814	CGG	2	6	4419804	4419809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840125
93102	NC_021814	CT	3	6	4419812	4419817	0 %	50 %	0 %	50 %	525840125
93103	NC_021814	TAT	2	6	4419853	4419858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525840125
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93105	NC_021814	T	6	6	4419882	4419887	0 %	100 %	0 %	0 %	525840125
93106	NC_021814	CG	3	6	4419960	4419965	0 %	0 %	50 %	50 %	525841270
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93108	NC_021814	T	7	7	4420053	4420059	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93109	NC_021814	AGTT	2	8	4420061	4420068	25 %	50 %	25 %	0 %	525841271
93110	NC_021814	TCT	2	6	4420074	4420079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525841271
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93112	NC_021814	GGT	2	6	4420103	4420108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525841271
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93115	NC_021814	TGC	2	6	4420255	4420260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93116	NC_021814	CAA	2	6	4420283	4420288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93117	NC_021814	AACG	2	8	4420307	4420314	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
93118	NC_021814	GTC	2	6	4420339	4420344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93119	NC_021814	GGC	2	6	4420443	4420448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525841272
93120	NC_021814	CTG	2	6	4420504	4420509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525841272
93121	NC_021814	TTG	2	6	4420516	4420521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525841272
93122	NC_021814	GCGG	2	8	4420531	4420538	0 %	0 %	75 %	25 %	525841272
93123	NC_021814	ATC	2	6	4420627	4420632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525841272
93124	NC_021814	TGA	2	6	4420643	4420648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525841272
93125	NC_021814	GCT	2	6	4420762	4420767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525841273
93126	NC_021814	CAC	2	6	4420802	4420807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525841273
93127	NC_021814	GATG	2	8	4420900	4420907	25 %	25 %	50 %	0 %	525841273
93128	NC_021814	CGTG	2	8	4420939	4420946	0 %	25 %	50 %	25 %	525841273
93129	NC_021814	TCGC	2	8	4420976	4420983	0 %	25 %	25 %	50 %	525841273
93130	NC_021814	GTGA	2	8	4421065	4421072	25 %	25 %	50 %	0 %	525840126
93131	NC_021814	GTC	2	6	4421086	4421091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840126
93132	NC_021814	TTG	2	6	4421176	4421181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525840126
93133	NC_021814	CGGAA	2	10	4421191	4421200	40 %	0 %	40 %	20 %	525840126
93134	NC_021814	CAG	2	6	4421225	4421230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840126
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93144	NC_021814	TCGC	2	8	4421535	4421542	0 %	25 %	25 %	50 %	525840126
93145	NC_021814	GGA	2	6	4421544	4421549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525840126
93146	NC_021814	TGC	2	6	4421561	4421566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840126
93147	NC_021814	TGAG	2	8	4421643	4421650	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
93148	NC_021814	GCC	2	6	4421701	4421706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840127
93149	NC_021814	CTGA	2	8	4421749	4421756	25 %	25 %	25 %	25 %	525840127
93150	NC_021814	TTCC	2	8	4421841	4421848	0 %	50 %	0 %	50 %	525840127
93151	NC_021814	GCCA	2	8	4421855	4421862	25 %	0 %	25 %	50 %	525840127
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93154	NC_021814	CGC	2	6	4422123	4422128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840127
93155	NC_021814	GCC	3	9	4422133	4422141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840127
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93158	NC_021814	ACG	2	6	4422185	4422190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840127
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93163	NC_021814	CGAT	2	8	4422456	4422463	25 %	25 %	25 %	25 %	525840127
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93169	NC_021814	T	7	7	4422661	4422667	0 %	100 %	0 %	0 %	525840127
93170	NC_021814	GCC	2	6	4422757	4422762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840127
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93173	NC_021814	GCG	2	6	4422827	4422832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840127
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93181	NC_021814	GCA	2	6	4423205	4423210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840128
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93183	NC_021814	CAT	2	6	4423236	4423241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840128
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93188	NC_021814	CAG	2	6	4423401	4423406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840128
93189	NC_021814	AGT	2	6	4423447	4423452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840128
93190	NC_021814	CCCATA	2	12	4423456	4423467	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	525840128
93191	NC_021814	CAG	2	6	4423545	4423550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840128
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93194	NC_021814	GC	3	6	4423669	4423674	0 %	0 %	50 %	50 %	525840128
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93210	NC_021814	T	6	6	4424501	4424506	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93211	NC_021814	T	7	7	4424514	4424520	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93212	NC_021814	GGC	2	6	4424657	4424662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840129
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93217	NC_021814	CTAT	2	8	4425013	4425020	25 %	50 %	0 %	25 %	525840129
93218	NC_021814	T	6	6	4425056	4425061	0 %	100 %	0 %	0 %	525840129
93219	NC_021814	CGT	2	6	4425105	4425110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840129
93220	NC_021814	GACA	2	8	4425162	4425169	50 %	0 %	25 %	25 %	525840129
93221	NC_021814	GCA	2	6	4425215	4425220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840129
93222	NC_021814	TGGCG	2	10	4425302	4425311	0 %	20 %	60 %	20 %	525840129
93223	NC_021814	TCA	2	6	4425392	4425397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840129
93224	NC_021814	ATT	2	6	4425400	4425405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525840129
93225	NC_021814	CAC	2	6	4425410	4425415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525840129
93226	NC_021814	GGCA	2	8	4425423	4425430	25 %	0 %	50 %	25 %	525840129
93227	NC_021814	TTA	2	6	4425484	4425489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93228	NC_021814	CGT	2	6	4425563	4425568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525841274
93229	NC_021814	CT	3	6	4425587	4425592	0 %	50 %	0 %	50 %	525841274
93230	NC_021814	GTC	2	6	4425609	4425614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525841274
93231	NC_021814	CGG	2	6	4425637	4425642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525841274
93232	NC_021814	GCA	2	6	4425653	4425658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525841274
93233	NC_021814	GATG	2	8	4425671	4425678	25 %	25 %	50 %	0 %	525841274
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93355	NC_021814	TGG	2	6	4430868	4430873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840132
93356	NC_021814	GCA	2	6	4430881	4430886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840132
93357	NC_021814	CGC	2	6	4430953	4430958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840132
93358	NC_021814	TG	3	6	4430960	4430965	0 %	50 %	50 %	0 %	525840132
93359	NC_021814	GAC	2	6	4430966	4430971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840132
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93361	NC_021814	CGG	2	6	4431061	4431066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840132
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93366	NC_021814	TGA	2	6	4431225	4431230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840132
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93402	NC_021814	TGG	2	6	4432945	4432950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840135
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