MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 102537

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
91001	NC_021814	GCC	2	6	4323405	4323410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91002	NC_021814	TAA	2	6	4323530	4323535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91003	NC_021814	CAGC	2	8	4323543	4323550	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
91004	NC_021814	GACT	2	8	4323561	4323568	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
91005	NC_021814	TC	3	6	4323659	4323664	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91006	NC_021814	ACC	2	6	4323689	4323694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91007	NC_021814	TTG	2	6	4323761	4323766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91008	NC_021814	TCG	2	6	4323785	4323790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91009	NC_021814	AC	4	8	4323829	4323836	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
91010	NC_021814	C	6	6	4323889	4323894	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
91011	NC_021814	AC	3	6	4324094	4324099	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
91012	NC_021814	AACG	2	8	4324131	4324138	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
91013	NC_021814	TCGCT	2	10	4324178	4324187	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
91014	NC_021814	CTTT	2	8	4324308	4324315	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
91015	NC_021814	ATG	2	6	4324318	4324323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91016	NC_021814	GCT	2	6	4324324	4324329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91017	NC_021814	GTT	2	6	4324414	4324419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91018	NC_021814	ACG	2	6	4324429	4324434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91019	NC_021814	GT	3	6	4324451	4324456	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91020	NC_021814	TCGGT	2	10	4324660	4324669	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
91021	NC_021814	CA	3	6	4324844	4324849	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
91022	NC_021814	GTAC	2	8	4324874	4324881	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
91023	NC_021814	GTCA	2	8	4324957	4324964	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
91024	NC_021814	GGA	2	6	4324980	4324985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91025	NC_021814	C	6	6	4324990	4324995	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
91026	NC_021814	CG	3	6	4325082	4325087	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91027	NC_021814	AC	3	6	4325109	4325114	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
91028	NC_021814	CTC	2	6	4325135	4325140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91029	NC_021814	TCGC	2	8	4325146	4325153	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
91030	NC_021814	TTTC	2	8	4325417	4325424	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
91031	NC_021814	TCG	2	6	4325431	4325436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91032	NC_021814	GA	3	6	4325451	4325456	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91033	NC_021814	AAC	2	6	4325463	4325468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91034	NC_021814	GTT	2	6	4325473	4325478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91035	NC_021814	TCAC	2	8	4325575	4325582	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
91036	NC_021814	CCG	2	6	4325626	4325631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91037	NC_021814	TCA	2	6	4325709	4325714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91038	NC_021814	TG	3	6	4325722	4325727	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91039	NC_021814	TAAGG	2	10	4325750	4325759	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
91040	NC_021814	CTAC	2	8	4325855	4325862	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
91041	NC_021814	GT	3	6	4325898	4325903	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91042	NC_021814	ACG	2	6	4325999	4326004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91043	NC_021814	GT	3	6	4326067	4326072	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91044	NC_021814	ATG	2	6	4326092	4326097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91045	NC_021814	TCC	2	6	4326118	4326123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91046	NC_021814	CAA	2	6	4326170	4326175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91047	NC_021814	GAC	2	6	4326231	4326236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91048	NC_021814	GCA	2	6	4326243	4326248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91049	NC_021814	TTC	2	6	4326319	4326324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91050	NC_021814	GCC	2	6	4326562	4326567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91051	NC_021814	TCC	2	6	4326582	4326587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91052	NC_021814	C	6	6	4326626	4326631	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
91053	NC_021814	TGCG	2	8	4326714	4326721	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
91054	NC_021814	GCT	2	6	4326772	4326777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91055	NC_021814	CTT	2	6	4326797	4326802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91056	NC_021814	TGC	2	6	4326820	4326825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91057	NC_021814	TTA	2	6	4326828	4326833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91058	NC_021814	TCC	2	6	4326846	4326851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91059	NC_021814	CTT	2	6	4326881	4326886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91060	NC_021814	CTG	2	6	4326940	4326945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91061	NC_021814	TCG	2	6	4327015	4327020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91062	NC_021814	CAA	2	6	4327043	4327048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91063	NC_021814	AGT	2	6	4327140	4327145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91064	NC_021814	AGC	2	6	4327206	4327211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91065	NC_021814	GCT	2	6	4327214	4327219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91066	NC_021814	GCC	2	6	4327254	4327259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91067	NC_021814	CA	3	6	4327408	4327413	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
91068	NC_021814	CGCTT	2	10	4327445	4327454	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
91069	NC_021814	GCG	2	6	4327462	4327467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91070	NC_021814	CGG	2	6	4327557	4327562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91071	NC_021814	TG	3	6	4327565	4327570	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91072	NC_021814	GTT	2	6	4327573	4327578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91073	NC_021814	GTG	2	6	4327587	4327592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91074	NC_021814	AAT	2	6	4327637	4327642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91075	NC_021814	T	6	6	4327657	4327662	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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91077	NC_021814	GAA	2	6	4327766	4327771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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91088	NC_021814	GGT	2	6	4328361	4328366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840059
91089	NC_021814	TTG	2	6	4328390	4328395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525840059
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91092	NC_021814	A	6	6	4328502	4328507	100 %	0 %	0 %	0 %	525841255
91093	NC_021814	GC	3	6	4328508	4328513	0 %	0 %	50 %	50 %	525841255
91094	NC_021814	TGGC	2	8	4328518	4328525	0 %	25 %	50 %	25 %	525841255
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91098	NC_021814	TAT	2	6	4328645	4328650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525841255
91099	NC_021814	GGCT	3	12	4328691	4328702	0 %	25 %	50 %	25 %	525841255
91100	NC_021814	CGCGT	2	10	4328716	4328725	0 %	20 %	40 %	40 %	525841255
91101	NC_021814	GC	3	6	4328770	4328775	0 %	0 %	50 %	50 %	525841255
91102	NC_021814	CGT	2	6	4328810	4328815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525841255
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91106	NC_021814	GGC	2	6	4328955	4328960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525841255
91107	NC_021814	AT	3	6	4329044	4329049	50 %	50 %	0 %	0 %	525841255
91108	NC_021814	CAC	2	6	4329059	4329064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525841255
91109	NC_021814	CTT	2	6	4329092	4329097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525841255
91110	NC_021814	ATT	2	6	4329183	4329188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525841255
91111	NC_021814	T	6	6	4329187	4329192	0 %	100 %	0 %	0 %	525841255
91112	NC_021814	CTA	2	6	4329204	4329209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525841255
91113	NC_021814	CGCC	2	8	4329227	4329234	0 %	0 %	25 %	75 %	525841255
91114	NC_021814	T	6	6	4329338	4329343	0 %	100 %	0 %	0 %	525841255
91115	NC_021814	GGTT	2	8	4329362	4329369	0 %	50 %	50 %	0 %	525841255
91116	NC_021814	ATG	2	6	4329399	4329404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525841255
91117	NC_021814	TAT	2	6	4329425	4329430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525841255
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91122	NC_021814	GACG	2	8	4329641	4329648	25 %	0 %	50 %	25 %	525841255
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91124	NC_021814	GCA	2	6	4329686	4329691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525841255
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91233	NC_021814	CTG	2	6	4334224	4334229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840063
91234	NC_021814	CAC	2	6	4334392	4334397	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525840063
91235	NC_021814	TCA	2	6	4334457	4334462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840063
91236	NC_021814	GCA	2	6	4334517	4334522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840063
91237	NC_021814	CAT	2	6	4334532	4334537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840063
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