MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 102537

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
90001	NC_021814	GCC	2	6	4278059	4278064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525841248
90002	NC_021814	AAT	2	6	4278108	4278113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525841248
90003	NC_021814	TCCCA	2	10	4278169	4278178	20 %	20 %	0 %	60 %	525841248
90004	NC_021814	GAT	2	6	4278210	4278215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525841248
90005	NC_021814	CAG	2	6	4278314	4278319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525841248
90006	NC_021814	TTAT	2	8	4278337	4278344	25 %	75 %	0 %	0 %	525841248
90007	NC_021814	CCT	3	9	4278414	4278422	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90008	NC_021814	GCCG	2	8	4278484	4278491	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90009	NC_021814	GCA	2	6	4278508	4278513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90010	NC_021814	CTG	2	6	4278527	4278532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840027
90011	NC_021814	GCG	2	6	4278538	4278543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840027
90012	NC_021814	GGC	2	6	4278564	4278569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840027
90013	NC_021814	GC	3	6	4278607	4278612	0 %	0 %	50 %	50 %	525840027
90014	NC_021814	TTC	2	6	4278728	4278733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525840027
90015	NC_021814	GTG	2	6	4278749	4278754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840027
90016	NC_021814	AGA	2	6	4278826	4278831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525840027
90017	NC_021814	CCA	2	6	4278862	4278867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525840027
90018	NC_021814	TGGT	2	8	4278885	4278892	0 %	50 %	50 %	0 %	525840027
90019	NC_021814	GAA	2	6	4278992	4278997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525840027
90020	NC_021814	TGC	2	6	4279095	4279100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840027
90021	NC_021814	CGG	2	6	4279160	4279165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840027
90022	NC_021814	ATC	2	6	4279212	4279217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840027
90023	NC_021814	CGC	2	6	4279367	4279372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840027
90024	NC_021814	TAA	2	6	4279534	4279539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525840027
90025	NC_021814	CAG	2	6	4279559	4279564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840027
90026	NC_021814	CCACGC	2	12	4279574	4279585	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	525840027
90027	NC_021814	TTA	2	6	4279593	4279598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525840027
90028	NC_021814	TGA	2	6	4279630	4279635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840027
90029	NC_021814	GC	3	6	4279651	4279656	0 %	0 %	50 %	50 %	525840027
90030	NC_021814	CGG	2	6	4279694	4279699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840027
90031	NC_021814	GTT	2	6	4279847	4279852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525840027
90032	NC_021814	CAT	2	6	4279889	4279894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840027
90033	NC_021814	CG	3	6	4279971	4279976	0 %	0 %	50 %	50 %	525840027
90034	NC_021814	AGC	2	6	4280077	4280082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840027
90035	NC_021814	CAT	2	6	4280147	4280152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840027
90036	NC_021814	ACGAT	2	10	4280173	4280182	40 %	20 %	20 %	20 %	525840027
90037	NC_021814	GTT	2	6	4280200	4280205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525840027
90038	NC_021814	CAG	2	6	4280219	4280224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840027
90039	NC_021814	CAG	3	9	4280258	4280266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840027
90040	NC_021814	CGG	2	6	4280341	4280346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840027
90041	NC_021814	C	6	6	4280361	4280366	0 %	0 %	0 %	100 %	525840027
90042	NC_021814	GTC	2	6	4280423	4280428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840027
90043	NC_021814	CTT	2	6	4280437	4280442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525840027
90044	NC_021814	TCA	2	6	4280508	4280513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840027
90045	NC_021814	TGC	2	6	4280526	4280531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840027
90046	NC_021814	TCG	2	6	4280589	4280594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840027
90047	NC_021814	GAA	2	6	4280600	4280605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525840027
90048	NC_021814	GGC	2	6	4280627	4280632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840027
90049	NC_021814	CAG	2	6	4280642	4280647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840027
90050	NC_021814	GCA	2	6	4280662	4280667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840027
90051	NC_021814	AGC	2	6	4280728	4280733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840027
90052	NC_021814	GAG	2	6	4280745	4280750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525840027
90053	NC_021814	TGC	2	6	4280752	4280757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840027
90054	NC_021814	CGG	2	6	4280795	4280800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840027
90055	NC_021814	GCG	2	6	4280806	4280811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840027
90056	NC_021814	GTTC	2	8	4280833	4280840	0 %	50 %	25 %	25 %	525840027
90057	NC_021814	TCA	2	6	4280859	4280864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840027
90058	NC_021814	AAT	2	6	4280937	4280942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525840027
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90060	NC_021814	CTG	2	6	4280963	4280968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840027
90061	NC_021814	GCA	2	6	4280985	4280990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840027
90062	NC_021814	GC	3	6	4280992	4280997	0 %	0 %	50 %	50 %	525840027
90063	NC_021814	CGA	2	6	4281186	4281191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90064	NC_021814	A	6	6	4281191	4281196	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90065	NC_021814	AAAG	2	8	4281240	4281247	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
90066	NC_021814	TACA	2	8	4281254	4281261	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
90067	NC_021814	ATT	2	6	4281319	4281324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90068	NC_021814	GAC	2	6	4281335	4281340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90069	NC_021814	CTCA	2	8	4281356	4281363	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
90070	NC_021814	CT	3	6	4281386	4281391	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90071	NC_021814	TGAT	2	8	4281414	4281421	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
90072	NC_021814	GGCA	2	8	4281490	4281497	25 %	0 %	50 %	25 %	525840028
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90077	NC_021814	AATA	2	8	4281768	4281775	75 %	25 %	0 %	0 %	525840028
90078	NC_021814	GTA	2	6	4281802	4281807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840028
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90081	NC_021814	CGTT	2	8	4281873	4281880	0 %	50 %	25 %	25 %	525840028
90082	NC_021814	TGGCCG	2	12	4281943	4281954	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	525840028
90083	NC_021814	GCC	2	6	4281998	4282003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840028
90084	NC_021814	GTC	2	6	4282051	4282056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840028
90085	NC_021814	GAC	2	6	4282059	4282064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840028
90086	NC_021814	GCT	2	6	4282079	4282084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840028
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90088	NC_021814	ATC	2	6	4282191	4282196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840028
90089	NC_021814	CG	3	6	4282215	4282220	0 %	0 %	50 %	50 %	525840028
90090	NC_021814	GC	3	6	4282228	4282233	0 %	0 %	50 %	50 %	525840028
90091	NC_021814	GCG	2	6	4282255	4282260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840028
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90111	NC_021814	A	7	7	4283222	4283228	100 %	0 %	0 %	0 %	525841249
90112	NC_021814	GCGATT	2	12	4283264	4283275	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525841249
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90115	NC_021814	A	6	6	4283420	4283425	100 %	0 %	0 %	0 %	525841249
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90235	NC_021814	GCCC	2	8	4287883	4287890	0 %	0 %	25 %	75 %	525840030
90236	NC_021814	GGC	2	6	4287904	4287909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840030
90237	NC_021814	CAAT	2	8	4287948	4287955	50 %	25 %	0 %	25 %	525840030
90238	NC_021814	T	6	6	4287994	4287999	0 %	100 %	0 %	0 %	525840030
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90240	NC_021814	TTG	2	6	4288071	4288076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90241	NC_021814	A	7	7	4288119	4288125	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90242	NC_021814	ATC	2	6	4288145	4288150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90243	NC_021814	TGT	2	6	4288156	4288161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90244	NC_021814	AGC	2	6	4288167	4288172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90245	NC_021814	GCT	2	6	4288189	4288194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90246	NC_021814	TCA	2	6	4288199	4288204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90247	NC_021814	GCA	2	6	4288250	4288255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840031
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90249	NC_021814	AT	3	6	4288387	4288392	50 %	50 %	0 %	0 %	525840031
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90469	NC_021814	ATC	2	6	4298261	4298266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840040
90470	NC_021814	TTC	2	6	4298302	4298307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525840040
90471	NC_021814	AGT	2	6	4298394	4298399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840040
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90499	NC_021814	ATG	2	6	4299510	4299515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840041
90500	NC_021814	CCA	2	6	4299578	4299583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525840041

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