MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 102537

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_021814	CGA	2	6	406296	406301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8502	NC_021814	TCA	2	6	406376	406381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8503	NC_021814	CTT	2	6	406531	406536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8504	NC_021814	TCA	2	6	406582	406587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8505	NC_021814	TTA	2	6	406629	406634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8506	NC_021814	AT	3	6	406693	406698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8507	NC_021814	TGAT	2	8	406723	406730	25 %	50 %	25 %	0 %	525837114
8508	NC_021814	GAA	2	6	406887	406892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837114
8509	NC_021814	GTAT	2	8	406992	406999	25 %	50 %	25 %	0 %	525837114
8510	NC_021814	CAG	2	6	407066	407071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837114
8511	NC_021814	GTG	2	6	407127	407132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837114
8512	NC_021814	GC	3	6	407221	407226	0 %	0 %	50 %	50 %	525837114
8513	NC_021814	TTA	2	6	407411	407416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837115
8514	NC_021814	A	6	6	407439	407444	100 %	0 %	0 %	0 %	525837115
8515	NC_021814	TGA	2	6	407474	407479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837115
8516	NC_021814	TCG	2	6	407485	407490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837115
8517	NC_021814	TGG	2	6	407494	407499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837115
8518	NC_021814	CG	3	6	407586	407591	0 %	0 %	50 %	50 %	525837115
8519	NC_021814	CAG	2	6	407646	407651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837115
8520	NC_021814	CGCT	2	8	407698	407705	0 %	25 %	25 %	50 %	525837115
8521	NC_021814	GGC	2	6	407714	407719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837115
8522	NC_021814	CG	3	6	407778	407783	0 %	0 %	50 %	50 %	525837115
8523	NC_021814	GCG	2	6	407790	407795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837115
8524	NC_021814	CT	3	6	407879	407884	0 %	50 %	0 %	50 %	525837115
8525	NC_021814	GGC	2	6	407918	407923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837115
8526	NC_021814	CGA	2	6	407934	407939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837115
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8528	NC_021814	GC	3	6	407962	407967	0 %	0 %	50 %	50 %	525837115
8529	NC_021814	CGG	2	6	407977	407982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837115
8530	NC_021814	A	7	7	408081	408087	100 %	0 %	0 %	0 %	525837115
8531	NC_021814	GCG	2	6	408114	408119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837115
8532	NC_021814	ACGC	2	8	408158	408165	25 %	0 %	25 %	50 %	525837115
8533	NC_021814	TGA	2	6	408191	408196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837115
8534	NC_021814	TTCAG	2	10	408197	408206	20 %	40 %	20 %	20 %	525837115
8535	NC_021814	ACC	2	6	408261	408266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525837115
8536	NC_021814	GGCG	2	8	408293	408300	0 %	0 %	75 %	25 %	525837115
8537	NC_021814	GCG	2	6	408333	408338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837115
8538	NC_021814	GC	4	8	408347	408354	0 %	0 %	50 %	50 %	525837115
8539	NC_021814	TGG	3	9	408415	408423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837115
8540	NC_021814	GTC	2	6	408511	408516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837115
8541	NC_021814	GGA	2	6	408521	408526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525837115
8542	NC_021814	GCG	2	6	408556	408561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837115
8543	NC_021814	TGC	2	6	408667	408672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837115
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8545	NC_021814	TGC	2	6	408721	408726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837115
8546	NC_021814	GAG	2	6	408807	408812	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525837115
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8548	NC_021814	TGC	2	6	408889	408894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837115
8549	NC_021814	GC	3	6	408893	408898	0 %	0 %	50 %	50 %	525837115
8550	NC_021814	GCG	2	6	408903	408908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837115
8551	NC_021814	TGC	2	6	408928	408933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837115
8552	NC_021814	TGA	2	6	408950	408955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837115
8553	NC_021814	GCG	2	6	408968	408973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837115
8554	NC_021814	GAG	2	6	409002	409007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525837115
8555	NC_021814	TGC	2	6	409075	409080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837115
8556	NC_021814	TCGG	2	8	409110	409117	0 %	25 %	50 %	25 %	525837115
8557	NC_021814	AT	3	6	409136	409141	50 %	50 %	0 %	0 %	525837115
8558	NC_021814	CAA	2	6	409157	409162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525837115
8559	NC_021814	TGC	2	6	409204	409209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837115
8560	NC_021814	GC	3	6	409208	409213	0 %	0 %	50 %	50 %	525837115
8561	NC_021814	GCG	2	6	409267	409272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837115
8562	NC_021814	GGCG	2	8	409277	409284	0 %	0 %	75 %	25 %	525837115
8563	NC_021814	CTG	2	6	409368	409373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837115
8564	NC_021814	TCA	2	6	409448	409453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837115
8565	NC_021814	GGC	2	6	409457	409462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837115
8566	NC_021814	G	6	6	409484	409489	0 %	0 %	100 %	0 %	525837115
8567	NC_021814	GAG	2	6	409498	409503	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525837115
8568	NC_021814	AG	3	6	409528	409533	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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8570	NC_021814	TAT	2	6	409636	409641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8571	NC_021814	GC	3	6	409672	409677	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8572	NC_021814	TGG	2	6	409818	409823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837116
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8574	NC_021814	TATT	2	8	409997	410004	25 %	75 %	0 %	0 %	525837116
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8577	NC_021814	TGA	2	6	410061	410066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837116
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8582	NC_021814	ATC	2	6	410360	410365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837116
8583	NC_021814	ATT	2	6	410413	410418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837116
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8585	NC_021814	TTC	2	6	410456	410461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837116
8586	NC_021814	GTACA	2	10	410495	410504	40 %	20 %	20 %	20 %	525837116
8587	NC_021814	TC	3	6	410521	410526	0 %	50 %	0 %	50 %	525837116
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8590	NC_021814	CGC	3	9	410573	410581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837116
8591	NC_021814	GCA	2	6	410584	410589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837116
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8593	NC_021814	ACCGGC	2	12	410672	410683	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	525837117
8594	NC_021814	GAC	2	6	410743	410748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837117
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8599	NC_021814	TAT	2	6	410989	410994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837117
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8602	NC_021814	CGG	2	6	411214	411219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837117
8603	NC_021814	CG	4	8	411279	411286	0 %	0 %	50 %	50 %	525837117
8604	NC_021814	GAT	2	6	411341	411346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837117
8605	NC_021814	CG	3	6	411435	411440	0 %	0 %	50 %	50 %	525840525
8606	NC_021814	T	8	8	411445	411452	0 %	100 %	0 %	0 %	525840525
8607	NC_021814	GC	3	6	411473	411478	0 %	0 %	50 %	50 %	525840525
8608	NC_021814	T	6	6	411516	411521	0 %	100 %	0 %	0 %	525840525
8609	NC_021814	CCGC	2	8	411568	411575	0 %	0 %	25 %	75 %	525840525
8610	NC_021814	A	6	6	411591	411596	100 %	0 %	0 %	0 %	525837118
8611	NC_021814	GGT	2	6	411623	411628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837118
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8613	NC_021814	GCA	3	9	411686	411694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837118
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8618	NC_021814	CTT	2	6	411923	411928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837118
8619	NC_021814	GGGCA	2	10	411949	411958	20 %	0 %	60 %	20 %	525837118
8620	NC_021814	GTC	2	6	411996	412001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837118
8621	NC_021814	TCC	2	6	412002	412007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525837118
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8623	NC_021814	TGGCGA	2	12	412092	412103	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	525840526
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8625	NC_021814	ATACC	2	10	412344	412353	40 %	20 %	0 %	40 %	525840526
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8988	NC_021814	GATC	2	8	430244	430251	25 %	25 %	25 %	25 %	525837123
8989	NC_021814	GGC	2	6	430301	430306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837123
8990	NC_021814	GA	3	6	430317	430322	50 %	0 %	50 %	0 %	525837123
8991	NC_021814	GAA	2	6	430346	430351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837123
8992	NC_021814	T	6	6	430381	430386	0 %	100 %	0 %	0 %	525837123
8993	NC_021814	GGAT	2	8	430462	430469	25 %	25 %	50 %	0 %	525837123
8994	NC_021814	CGGCG	2	10	430484	430493	0 %	0 %	60 %	40 %	525837123
8995	NC_021814	GAA	2	6	430541	430546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837123
8996	NC_021814	GCG	2	6	430560	430565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837123
8997	NC_021814	AAG	2	6	430636	430641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837124
8998	NC_021814	AAC	2	6	430717	430722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525837124
8999	NC_021814	AGCAG	2	10	430742	430751	40 %	0 %	40 %	20 %	525837124
9000	NC_021814	TAAT	2	8	430759	430766	50 %	50 %	0 %	0 %	525837124

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