MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 102537

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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88002	NC_021814	CCG	2	6	4182161	4182166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525841233
88003	NC_021814	GCC	2	6	4182256	4182261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525841233
88004	NC_021814	CGC	2	6	4182377	4182382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525841233
88005	NC_021814	GCC	2	6	4182424	4182429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525841233
88006	NC_021814	ACT	2	6	4182490	4182495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525841233
88007	NC_021814	ACT	2	6	4182518	4182523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525841233
88008	NC_021814	CAAAGC	2	12	4182654	4182665	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	525841233
88009	NC_021814	GGT	2	6	4182666	4182671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525841233
88010	NC_021814	A	6	6	4182760	4182765	100 %	0 %	0 %	0 %	525841233
88011	NC_021814	TCG	2	6	4182794	4182799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525841233
88012	NC_021814	TCCT	2	8	4182832	4182839	0 %	50 %	0 %	50 %	525841233
88013	NC_021814	GAC	2	6	4182866	4182871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88014	NC_021814	CAT	2	6	4182894	4182899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525839951
88015	NC_021814	TCG	2	6	4182900	4182905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525839951
88016	NC_021814	ACC	2	6	4182947	4182952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525839951
88017	NC_021814	CAC	2	6	4182981	4182986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525839951
88018	NC_021814	TGA	2	6	4183041	4183046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525839951
88019	NC_021814	CGG	2	6	4183079	4183084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525839951
88020	NC_021814	CGG	2	6	4183211	4183216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525839951
88021	NC_021814	GCTG	2	8	4183294	4183301	0 %	25 %	50 %	25 %	525839951
88022	NC_021814	CATT	2	8	4183422	4183429	25 %	50 %	0 %	25 %	525839951
88023	NC_021814	GGCG	2	8	4183458	4183465	0 %	0 %	75 %	25 %	525839951
88024	NC_021814	CGG	2	6	4183520	4183525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525839951
88025	NC_021814	CATGT	2	10	4183540	4183549	20 %	40 %	20 %	20 %	525839951
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88028	NC_021814	GCC	2	6	4183681	4183686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525839951
88029	NC_021814	GTCGGC	2	12	4183702	4183713	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	525839951
88030	NC_021814	CG	3	6	4183720	4183725	0 %	0 %	50 %	50 %	525839951
88031	NC_021814	ACG	2	6	4183778	4183783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525839952
88032	NC_021814	TCG	2	6	4183831	4183836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525839952
88033	NC_021814	GGC	2	6	4183853	4183858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525839952
88034	NC_021814	GGGCT	2	10	4183866	4183875	0 %	20 %	60 %	20 %	525839952
88035	NC_021814	TCA	3	9	4183975	4183983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525839952
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88041	NC_021814	GCG	2	6	4184121	4184126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525839952
88042	NC_021814	TGC	3	9	4184140	4184148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525839952
88043	NC_021814	CGC	2	6	4184279	4184284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525839952
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88050	NC_021814	GCTG	2	8	4184533	4184540	0 %	25 %	50 %	25 %	525839953
88051	NC_021814	CGCGCA	2	12	4184584	4184595	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	525839953
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88054	NC_021814	GCC	2	6	4184671	4184676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525839953
88055	NC_021814	TGC	2	6	4184691	4184696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525839953
88056	NC_021814	CTG	2	6	4184720	4184725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525839953
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88058	NC_021814	CAG	2	6	4184860	4184865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525839953
88059	NC_021814	CG	3	6	4184942	4184947	0 %	0 %	50 %	50 %	525839953
88060	NC_021814	GC	3	6	4184960	4184965	0 %	0 %	50 %	50 %	525839953
88061	NC_021814	CAC	2	6	4185019	4185024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525839953
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88064	NC_021814	CGA	2	6	4185235	4185240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525839953
88065	NC_021814	CCTCG	2	10	4185241	4185250	0 %	20 %	20 %	60 %	525839953
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88071	NC_021814	TCAT	2	8	4185619	4185626	25 %	50 %	0 %	25 %	525839954
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88085	NC_021814	TACA	3	12	4186173	4186184	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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88101	NC_021814	TGAT	2	8	4187391	4187398	25 %	50 %	25 %	0 %	525839956
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88104	NC_021814	A	6	6	4187559	4187564	100 %	0 %	0 %	0 %	525841235
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88114	NC_021814	T	6	6	4188114	4188119	0 %	100 %	0 %	0 %	525839957
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88211	NC_021814	TTTG	2	8	4193180	4193187	0 %	75 %	25 %	0 %	525839962
88212	NC_021814	ATG	2	6	4193304	4193309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525839962
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88223	NC_021814	TGA	2	6	4193629	4193634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525839962
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88226	NC_021814	A	6	6	4193846	4193851	100 %	0 %	0 %	0 %	525839962
88227	NC_021814	TGAA	2	8	4193875	4193882	50 %	25 %	25 %	0 %	525839963
88228	NC_021814	CGG	2	6	4193916	4193921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525839963
88229	NC_021814	GCTG	2	8	4193931	4193938	0 %	25 %	50 %	25 %	525839963
88230	NC_021814	TGC	3	9	4193970	4193978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525839963
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88331	NC_021814	CTG	2	6	4198754	4198759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525839966
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88345	NC_021814	CTG	3	9	4199501	4199509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525839967
88346	NC_021814	CGC	2	6	4199575	4199580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525839967
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