MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 102537

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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87003	NC_021814	TCA	2	6	4138266	4138271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525839916
87004	NC_021814	GCT	2	6	4138281	4138286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525839916
87005	NC_021814	TCA	2	6	4138337	4138342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525839916
87006	NC_021814	GAT	2	6	4138434	4138439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525839916
87007	NC_021814	TCA	2	6	4138475	4138480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525839916
87008	NC_021814	CAT	2	6	4138510	4138515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525839916
87009	NC_021814	ATT	2	6	4138526	4138531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87010	NC_021814	AAATA	2	10	4138534	4138543	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
87011	NC_021814	CTG	2	6	4138633	4138638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525839917
87012	NC_021814	ATG	2	6	4138646	4138651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525839917
87013	NC_021814	TCT	2	6	4138689	4138694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525839917
87014	NC_021814	AT	3	6	4138702	4138707	50 %	50 %	0 %	0 %	525839917
87015	NC_021814	T	6	6	4138784	4138789	0 %	100 %	0 %	0 %	525839917
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87021	NC_021814	AAT	2	6	4139000	4139005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525839917
87022	NC_021814	GCA	3	9	4139055	4139063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525839917
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87025	NC_021814	ATTG	2	8	4139168	4139175	25 %	50 %	25 %	0 %	525839917
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87043	NC_021814	TGC	2	6	4140107	4140112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525839918
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87060	NC_021814	A	8	8	4141033	4141040	100 %	0 %	0 %	0 %	525841223
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87117	NC_021814	TCA	2	6	4143624	4143629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525841225
87118	NC_021814	GCT	2	6	4143751	4143756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525841225
87119	NC_021814	T	6	6	4143760	4143765	0 %	100 %	0 %	0 %	525841225
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87123	NC_021814	TGAC	2	8	4144143	4144150	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
87124	NC_021814	T	6	6	4144166	4144171	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87125	NC_021814	GTA	2	6	4144194	4144199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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87154	NC_021814	A	7	7	4145417	4145423	100 %	0 %	0 %	0 %	525839920
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87230	NC_021814	CGG	2	6	4149073	4149078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525839922
87231	NC_021814	AAT	2	6	4149080	4149085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525839922
87232	NC_021814	GCC	3	9	4149126	4149134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525839922
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87470	NC_021814	CGC	2	6	4158831	4158836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525839931
87471	NC_021814	CCG	2	6	4158880	4158885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525839931
87472	NC_021814	GC	3	6	4158926	4158931	0 %	0 %	50 %	50 %	525839931
87473	NC_021814	TGCGC	2	10	4158951	4158960	0 %	20 %	40 %	40 %	525839931
87474	NC_021814	GAC	2	6	4159027	4159032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525839931
87475	NC_021814	TCCG	2	8	4159070	4159077	0 %	25 %	25 %	50 %	525839931
87476	NC_021814	TGA	2	6	4159089	4159094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525839931
87477	NC_021814	GC	3	6	4159096	4159101	0 %	0 %	50 %	50 %	525839931
87478	NC_021814	GGC	2	6	4159114	4159119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525839931
87479	NC_021814	GGGCTG	2	12	4159123	4159134	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	525839931
87480	NC_021814	GCA	3	9	4159155	4159163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525839931
87481	NC_021814	TGGG	2	8	4159196	4159203	0 %	25 %	75 %	0 %	525839931
87482	NC_021814	T	6	6	4159274	4159279	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87483	NC_021814	CGAT	2	8	4159384	4159391	25 %	25 %	25 %	25 %	525839932
87484	NC_021814	TGC	2	6	4159474	4159479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525839932
87485	NC_021814	CTT	2	6	4159503	4159508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525839932
87486	NC_021814	AGCG	2	8	4159520	4159527	25 %	0 %	50 %	25 %	525839932
87487	NC_021814	GCCA	2	8	4159554	4159561	25 %	0 %	25 %	50 %	525839932
87488	NC_021814	GCG	2	6	4159612	4159617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525839932
87489	NC_021814	ATC	2	6	4159633	4159638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525839932
87490	NC_021814	CCA	2	6	4159643	4159648	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525839932
87491	NC_021814	TCCT	2	8	4159694	4159701	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87492	NC_021814	C	6	6	4159723	4159728	0 %	0 %	0 %	100 %	525839933
87493	NC_021814	GTC	2	6	4159732	4159737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525839933
87494	NC_021814	ACG	2	6	4159766	4159771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525839933
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87497	NC_021814	GACGC	2	10	4159897	4159906	20 %	0 %	40 %	40 %	525839933
87498	NC_021814	CAGC	2	8	4159958	4159965	25 %	0 %	25 %	50 %	525839933
87499	NC_021814	AGG	2	6	4159989	4159994	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525839933
87500	NC_021814	TCG	2	6	4160122	4160127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525839933

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