MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 102537

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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85002	NC_021814	CGA	2	6	4042782	4042787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525839848
85003	NC_021814	GTA	2	6	4042798	4042803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525839848
85004	NC_021814	CGC	2	6	4042839	4042844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525839848
85005	NC_021814	ATC	2	6	4042859	4042864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525839848
85006	NC_021814	CAG	3	9	4042930	4042938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525839848
85007	NC_021814	CAT	2	6	4042963	4042968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525839848
85008	NC_021814	GCC	2	6	4042999	4043004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525839848
85009	NC_021814	CCA	2	6	4043007	4043012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525839848
85010	NC_021814	TCA	2	6	4043100	4043105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525839848
85011	NC_021814	CGC	2	6	4043260	4043265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525839848
85012	NC_021814	CGCC	2	8	4043343	4043350	0 %	0 %	25 %	75 %	525839848
85013	NC_021814	CAT	2	6	4043398	4043403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525839848
85014	NC_021814	GCA	2	6	4043433	4043438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525839848
85015	NC_021814	GC	3	6	4043564	4043569	0 %	0 %	50 %	50 %	525839849
85016	NC_021814	GTA	2	6	4043587	4043592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525839849
85017	NC_021814	CGC	2	6	4043656	4043661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525839849
85018	NC_021814	TCA	2	6	4043686	4043691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525839849
85019	NC_021814	CTC	2	6	4043756	4043761	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525839849
85020	NC_021814	CG	3	6	4043772	4043777	0 %	0 %	50 %	50 %	525839849
85021	NC_021814	CAA	2	6	4043806	4043811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525839849
85022	NC_021814	CAG	2	6	4043861	4043866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525839849
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85024	NC_021814	GTA	2	6	4043918	4043923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525839849
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85031	NC_021814	TGT	2	6	4044320	4044325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85032	NC_021814	ATT	2	6	4044330	4044335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85033	NC_021814	AGC	2	6	4044351	4044356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85034	NC_021814	CAA	2	6	4044426	4044431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525839850
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85041	NC_021814	GCT	2	6	4044663	4044668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525839850
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85047	NC_021814	TAAG	2	8	4045006	4045013	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
85048	NC_021814	TGC	3	9	4045151	4045159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85049	NC_021814	GCG	2	6	4045168	4045173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85050	NC_021814	CGT	2	6	4045192	4045197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85051	NC_021814	T	6	6	4045218	4045223	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85052	NC_021814	ACA	2	6	4045240	4045245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525839851
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85054	NC_021814	AGC	2	6	4045262	4045267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525839851
85055	NC_021814	GC	3	6	4045266	4045271	0 %	0 %	50 %	50 %	525839851
85056	NC_021814	GCA	2	6	4045347	4045352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525839851
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85081	NC_021814	TC	3	6	4046322	4046327	0 %	50 %	0 %	50 %	525839851
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85116	NC_021814	CGA	2	6	4047984	4047989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525839853
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85132	NC_021814	GCA	3	9	4048633	4048641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525839854
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85228	NC_021814	TTA	2	6	4052736	4052741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85229	NC_021814	CAAA	2	8	4052784	4052791	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
85230	NC_021814	GGT	2	6	4052891	4052896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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85232	NC_021814	AAT	2	6	4052980	4052985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85233	NC_021814	A	6	6	4053005	4053010	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85234	NC_021814	AAAAT	2	10	4053073	4053082	80 %	20 %	0 %	0 %	525841217
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85433	NC_021814	ACTC	2	8	4063261	4063268	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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85461	NC_021814	T	6	6	4064657	4064662	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85462	NC_021814	CTGA	2	8	4064688	4064695	25 %	25 %	25 %	25 %	525839863
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