MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 102537

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
84501	NC_021814	TTG	2	6	4019164	4019169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525839832
84502	NC_021814	TCT	2	6	4019215	4019220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525839832
84503	NC_021814	CCG	2	6	4019257	4019262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525839832
84504	NC_021814	GTT	2	6	4019300	4019305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525839832
84505	NC_021814	TGC	2	6	4019312	4019317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525839832
84506	NC_021814	AAC	2	6	4019387	4019392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84507	NC_021814	CCAC	2	8	4019419	4019426	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
84508	NC_021814	GGC	2	6	4019446	4019451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84509	NC_021814	GGC	2	6	4019483	4019488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84510	NC_021814	AGCGC	2	10	4019510	4019519	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
84511	NC_021814	GCT	2	6	4019720	4019725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525839833
84512	NC_021814	CAC	2	6	4019816	4019821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525839833
84513	NC_021814	GCA	3	9	4019825	4019833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525839833
84514	NC_021814	TCG	2	6	4019893	4019898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525839833
84515	NC_021814	AGC	2	6	4019901	4019906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525839833
84516	NC_021814	CTG	2	6	4019925	4019930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525839833
84517	NC_021814	GGA	2	6	4019963	4019968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525839833
84518	NC_021814	TAT	3	9	4020020	4020028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525839833
84519	NC_021814	GTGCA	2	10	4020036	4020045	20 %	20 %	40 %	20 %	525839833
84520	NC_021814	CA	3	6	4020044	4020049	50 %	0 %	0 %	50 %	525839833
84521	NC_021814	GGC	2	6	4020075	4020080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525839833
84522	NC_021814	CTG	2	6	4020153	4020158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525839833
84523	NC_021814	CGC	2	6	4020202	4020207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525839833
84524	NC_021814	GAC	2	6	4020258	4020263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525839833
84525	NC_021814	GAA	2	6	4020264	4020269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525839833
84526	NC_021814	CTGCG	2	10	4020282	4020291	0 %	20 %	40 %	40 %	525839833
84527	NC_021814	CT	3	6	4020336	4020341	0 %	50 %	0 %	50 %	525839833
84528	NC_021814	CGA	2	6	4020368	4020373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525839833
84529	NC_021814	GCG	2	6	4020408	4020413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525839833
84530	NC_021814	TGG	2	6	4020434	4020439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525839833
84531	NC_021814	AGC	2	6	4020454	4020459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525841212
84532	NC_021814	CGA	2	6	4020531	4020536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525841212
84533	NC_021814	GGC	2	6	4020540	4020545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525841212
84534	NC_021814	ACGC	2	8	4020675	4020682	25 %	0 %	25 %	50 %	525841212
84535	NC_021814	CGC	2	6	4020726	4020731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525841212
84536	NC_021814	GAAGGC	2	12	4020736	4020747	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	525841212
84537	NC_021814	T	6	6	4020787	4020792	0 %	100 %	0 %	0 %	525841212
84538	NC_021814	ACGC	2	8	4020867	4020874	25 %	0 %	25 %	50 %	525841212
84539	NC_021814	TCT	2	6	4020907	4020912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525839834
84540	NC_021814	CTT	2	6	4020920	4020925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525839834
84541	NC_021814	GC	4	8	4020941	4020948	0 %	0 %	50 %	50 %	525839834
84542	NC_021814	GCAT	2	8	4020973	4020980	25 %	25 %	25 %	25 %	525839834
84543	NC_021814	CA	3	6	4021013	4021018	50 %	0 %	0 %	50 %	525839834
84544	NC_021814	CTC	2	6	4021032	4021037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525839834
84545	NC_021814	TCGTAG	2	12	4021153	4021164	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525839834
84546	NC_021814	ACA	2	6	4021205	4021210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525839834
84547	NC_021814	GCG	2	6	4021231	4021236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525839834
84548	NC_021814	TTC	2	6	4021263	4021268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525839834
84549	NC_021814	ATCGC	2	10	4021270	4021279	20 %	20 %	20 %	40 %	525839834
84550	NC_021814	CTG	2	6	4021284	4021289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525839834
84551	NC_021814	CCAG	2	8	4021304	4021311	25 %	0 %	25 %	50 %	525839834
84552	NC_021814	TCT	2	6	4021382	4021387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525839834
84553	NC_021814	CTT	2	6	4021394	4021399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525839834
84554	NC_021814	CGAC	2	8	4021480	4021487	25 %	0 %	25 %	50 %	525839834
84555	NC_021814	GCAC	2	8	4021519	4021526	25 %	0 %	25 %	50 %	525839834
84556	NC_021814	GGC	2	6	4021530	4021535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525839834
84557	NC_021814	GGCA	2	8	4021788	4021795	25 %	0 %	50 %	25 %	525839834
84558	NC_021814	GCG	2	6	4021796	4021801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525839834
84559	NC_021814	GTG	2	6	4021855	4021860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525839834
84560	NC_021814	CAGG	2	8	4021863	4021870	25 %	0 %	50 %	25 %	525839834
84561	NC_021814	TCA	2	6	4021891	4021896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525839834
84562	NC_021814	TACC	2	8	4021949	4021956	25 %	25 %	0 %	50 %	525839834
84563	NC_021814	TTA	2	6	4021969	4021974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525839834
84564	NC_021814	AAC	2	6	4021981	4021986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525839834
84565	NC_021814	TCAG	2	8	4022038	4022045	25 %	25 %	25 %	25 %	525839834
84566	NC_021814	ATA	2	6	4022053	4022058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525839834
84567	NC_021814	AAG	2	6	4022152	4022157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525839834
84568	NC_021814	GCG	2	6	4022190	4022195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525839834
84569	NC_021814	AAC	2	6	4022218	4022223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525839834
84570	NC_021814	GGT	2	6	4022243	4022248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525839834
84571	NC_021814	CCA	3	9	4022396	4022404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525839834
84572	NC_021814	ATG	2	6	4022412	4022417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525839834
84573	NC_021814	GCT	2	6	4022483	4022488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525839834
84574	NC_021814	GC	3	6	4022489	4022494	0 %	0 %	50 %	50 %	525839834
84575	NC_021814	T	7	7	4022582	4022588	0 %	100 %	0 %	0 %	525839834
84576	NC_021814	CAC	2	6	4022600	4022605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84577	NC_021814	AGCGC	2	10	4022661	4022670	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
84578	NC_021814	ATCA	2	8	4022679	4022686	50 %	25 %	0 %	25 %	525839835
84579	NC_021814	CTT	2	6	4022695	4022700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525839835
84580	NC_021814	CGC	2	6	4022734	4022739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525839835
84581	NC_021814	AAT	2	6	4022744	4022749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525839835
84582	NC_021814	GGT	2	6	4022750	4022755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525839835
84583	NC_021814	CTG	2	6	4022786	4022791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525839835
84584	NC_021814	CGC	2	6	4022819	4022824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525839835
84585	NC_021814	GTT	2	6	4022836	4022841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525839835
84586	NC_021814	ATGC	2	8	4022884	4022891	25 %	25 %	25 %	25 %	525839835
84587	NC_021814	TAA	2	6	4022938	4022943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525839835
84588	NC_021814	CTG	3	9	4022972	4022980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525839835
84589	NC_021814	GTC	2	6	4022999	4023004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525839835
84590	NC_021814	TTC	2	6	4023009	4023014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525839835
84591	NC_021814	CAG	2	6	4023047	4023052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525839835
84592	NC_021814	ACG	2	6	4023089	4023094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525839835
84593	NC_021814	TAA	2	6	4023229	4023234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525839835
84594	NC_021814	CCGCAT	2	12	4023277	4023288	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	525839835
84595	NC_021814	CATCA	2	10	4023320	4023329	40 %	20 %	0 %	40 %	525839835
84596	NC_021814	GCA	2	6	4023342	4023347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525839835
84597	NC_021814	CCT	2	6	4023364	4023369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525839835
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84600	NC_021814	ATC	2	6	4023462	4023467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525839835
84601	NC_021814	TCA	2	6	4023472	4023477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525839835
84602	NC_021814	CGC	2	6	4023496	4023501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525839835
84603	NC_021814	GATCT	2	10	4023587	4023596	20 %	40 %	20 %	20 %	525839835
84604	NC_021814	ACG	2	6	4023599	4023604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525839835
84605	NC_021814	GTT	2	6	4023611	4023616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525839835
84606	NC_021814	GATCC	2	10	4023617	4023626	20 %	20 %	20 %	40 %	525839835
84607	NC_021814	CCG	2	6	4023631	4023636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525839835
84608	NC_021814	GCC	2	6	4023699	4023704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525839835
84609	NC_021814	CTG	2	6	4023749	4023754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525839835
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84611	NC_021814	GC	3	6	4023775	4023780	0 %	0 %	50 %	50 %	525839835
84612	NC_021814	T	6	6	4023800	4023805	0 %	100 %	0 %	0 %	525839835
84613	NC_021814	GCC	2	6	4023823	4023828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525839835
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84616	NC_021814	CGGG	2	8	4023911	4023918	0 %	0 %	75 %	25 %	525839835
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84734	NC_021814	CA	3	6	4030493	4030498	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
84735	NC_021814	GTAC	2	8	4030523	4030530	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
84736	NC_021814	GTCA	2	8	4030606	4030613	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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84972	NC_021814	T	7	7	4041007	4041013	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84973	NC_021814	G	6	6	4041037	4041042	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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84976	NC_021814	GTA	2	6	4041312	4041317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525839846
84977	NC_021814	CGC	2	6	4041358	4041363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525839846
84978	NC_021814	GTC	2	6	4041437	4041442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525839846
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