MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 102537

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_021814	CGG	2	6	381520	381525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840519
8002	NC_021814	CCGGA	2	10	381543	381552	20 %	0 %	40 %	40 %	525840519
8003	NC_021814	ATCC	2	8	381558	381565	25 %	25 %	0 %	50 %	525840519
8004	NC_021814	GGT	2	6	381615	381620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840519
8005	NC_021814	TGCA	2	8	381697	381704	25 %	25 %	25 %	25 %	525840519
8006	NC_021814	CAC	2	6	381722	381727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525840519
8007	NC_021814	CAG	2	6	381787	381792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840519
8008	NC_021814	GGC	2	6	381803	381808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840519
8009	NC_021814	CTG	2	6	381915	381920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840519
8010	NC_021814	ACA	3	9	381973	381981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525840519
8011	NC_021814	GGT	2	6	382050	382055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840519
8012	NC_021814	GCG	2	6	382062	382067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840519
8013	NC_021814	CAGAC	2	10	382401	382410	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
8014	NC_021814	CAGG	2	8	382433	382440	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8015	NC_021814	CAA	2	6	382556	382561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525840520
8016	NC_021814	GAT	2	6	382596	382601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840520
8017	NC_021814	AAG	2	6	382630	382635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525840520
8018	NC_021814	TA	3	6	382687	382692	50 %	50 %	0 %	0 %	525840520
8019	NC_021814	TAA	2	6	382699	382704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525840520
8020	NC_021814	G	6	6	382715	382720	0 %	0 %	100 %	0 %	525840520
8021	NC_021814	CTG	2	6	382744	382749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840520
8022	NC_021814	G	7	7	382781	382787	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8023	NC_021814	ATA	2	6	382791	382796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8024	NC_021814	ACTG	2	8	382808	382815	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8025	NC_021814	AC	3	6	382843	382848	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8026	NC_021814	TAA	3	9	382851	382859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8027	NC_021814	GTT	2	6	382873	382878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8028	NC_021814	ATA	2	6	382932	382937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837096
8029	NC_021814	A	6	6	382945	382950	100 %	0 %	0 %	0 %	525837096
8030	NC_021814	ACCA	2	8	382994	383001	50 %	0 %	0 %	50 %	525837096
8031	NC_021814	GCA	2	6	383083	383088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837096
8032	NC_021814	GGT	2	6	383185	383190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837096
8033	NC_021814	TAA	2	6	383218	383223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837096
8034	NC_021814	ACG	2	6	383227	383232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837096
8035	NC_021814	CCG	2	6	383300	383305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837096
8036	NC_021814	AGG	2	6	383409	383414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525837096
8037	NC_021814	CCGGC	2	10	383442	383451	0 %	0 %	40 %	60 %	525837097
8038	NC_021814	CTG	2	6	383471	383476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837097
8039	NC_021814	CTGTT	2	10	383554	383563	0 %	60 %	20 %	20 %	525837097
8040	NC_021814	GCA	2	6	383564	383569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837097
8041	NC_021814	ATACTG	2	12	383592	383603	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525837097
8042	NC_021814	GGT	2	6	383708	383713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837097
8043	NC_021814	CGG	2	6	383726	383731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837097
8044	NC_021814	GCT	2	6	383741	383746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837097
8045	NC_021814	GGC	2	6	383779	383784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837097
8046	NC_021814	CAGGA	2	10	383819	383828	40 %	0 %	40 %	20 %	525837097
8047	NC_021814	TGA	2	6	383911	383916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837097
8048	NC_021814	GCTT	2	8	383980	383987	0 %	50 %	25 %	25 %	525837097
8049	NC_021814	TG	3	6	384025	384030	0 %	50 %	50 %	0 %	525837097
8050	NC_021814	CTG	2	6	384117	384122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837097
8051	NC_021814	CGGTGG	2	12	384228	384239	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
8052	NC_021814	T	6	6	384244	384249	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8053	NC_021814	GACCA	2	10	384434	384443	40 %	0 %	20 %	40 %	525840521
8054	NC_021814	CCG	2	6	384470	384475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840521
8055	NC_021814	TGC	2	6	384506	384511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840521
8056	NC_021814	CGC	2	6	384527	384532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840521
8057	NC_021814	GCA	2	6	384738	384743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840521
8058	NC_021814	ATGT	2	8	384794	384801	25 %	50 %	25 %	0 %	525840521
8059	NC_021814	ATG	2	6	384806	384811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840521
8060	NC_021814	GTCGTG	11	66	384812	384877	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	525840521
8061	NC_021814	TGG	2	6	384879	384884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840521
8062	NC_021814	GCCA	2	8	384891	384898	25 %	0 %	25 %	50 %	525840521
8063	NC_021814	CTG	2	6	384899	384904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840521
8064	NC_021814	CTCGC	2	10	384905	384914	0 %	20 %	20 %	60 %	525840521
8065	NC_021814	AAT	3	9	384950	384958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525840521
8066	NC_021814	CCCA	2	8	385022	385029	25 %	0 %	0 %	75 %	525840521
8067	NC_021814	TGC	2	6	385067	385072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840521
8068	NC_021814	GCC	2	6	385125	385130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840521
8069	NC_021814	TAA	2	6	385175	385180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525840521
8070	NC_021814	GAA	2	6	385196	385201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525840521
8071	NC_021814	GAA	2	6	385219	385224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525840521
8072	NC_021814	GTT	2	6	385258	385263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8073	NC_021814	C	7	7	385285	385291	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8074	NC_021814	TAC	2	6	385301	385306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8075	NC_021814	C	6	6	385306	385311	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8076	NC_021814	ACAA	2	8	385384	385391	75 %	0 %	0 %	25 %	525837098
8077	NC_021814	A	8	8	385439	385446	100 %	0 %	0 %	0 %	525837098
8078	NC_021814	ACA	2	6	385481	385486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525837098
8079	NC_021814	CGCGG	2	10	385500	385509	0 %	0 %	60 %	40 %	525837098
8080	NC_021814	TCA	2	6	385562	385567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837098
8081	NC_021814	TGA	2	6	385571	385576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837098
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8083	NC_021814	TA	3	6	385626	385631	50 %	50 %	0 %	0 %	525837098
8084	NC_021814	CGA	2	6	385703	385708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837099
8085	NC_021814	ATA	2	6	385780	385785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837099
8086	NC_021814	ATC	2	6	385792	385797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837099
8087	NC_021814	ATA	2	6	385858	385863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837099
8088	NC_021814	GC	3	6	385895	385900	0 %	0 %	50 %	50 %	525837099
8089	NC_021814	T	8	8	385916	385923	0 %	100 %	0 %	0 %	525837099
8090	NC_021814	CTG	2	6	385932	385937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837099
8091	NC_021814	GGT	2	6	385941	385946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837099
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8093	NC_021814	ATA	2	6	386026	386031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837099
8094	NC_021814	AG	3	6	386040	386045	50 %	0 %	50 %	0 %	525837099
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8096	NC_021814	GC	3	6	386103	386108	0 %	0 %	50 %	50 %	525837099
8097	NC_021814	CGG	2	6	386124	386129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837099
8098	NC_021814	GCAG	2	8	386138	386145	25 %	0 %	50 %	25 %	525837099
8099	NC_021814	AAT	2	6	386265	386270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837099
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8102	NC_021814	ATCT	2	8	386529	386536	25 %	50 %	0 %	25 %	525837099
8103	NC_021814	A	6	6	386604	386609	100 %	0 %	0 %	0 %	525837099
8104	NC_021814	TAA	2	6	386630	386635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837099
8105	NC_021814	TAA	2	6	386656	386661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837099
8106	NC_021814	TAA	2	6	386771	386776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837099
8107	NC_021814	GGAA	2	8	386812	386819	50 %	0 %	50 %	0 %	525837099
8108	NC_021814	AG	3	6	386864	386869	50 %	0 %	50 %	0 %	525837099
8109	NC_021814	ATT	2	6	386896	386901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837099
8110	NC_021814	AC	3	6	386921	386926	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8111	NC_021814	AAG	2	6	386930	386935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8112	NC_021814	GATG	2	8	386979	386986	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8113	NC_021814	A	6	6	387025	387030	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8114	NC_021814	GGC	2	6	387059	387064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840522
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8116	NC_021814	GC	3	6	387247	387252	0 %	0 %	50 %	50 %	525840522
8117	NC_021814	CGT	2	6	387333	387338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840522
8118	NC_021814	GCC	2	6	387357	387362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840522
8119	NC_021814	ACAG	2	8	387435	387442	50 %	0 %	25 %	25 %	525840522
8120	NC_021814	AGCG	2	8	387463	387470	25 %	0 %	50 %	25 %	525840522
8121	NC_021814	A	6	6	387500	387505	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8122	NC_021814	CATC	2	8	387573	387580	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8123	NC_021814	TTG	2	6	387629	387634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837100
8124	NC_021814	GCG	3	9	387661	387669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837100
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8249	NC_021814	ACC	2	6	393070	393075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525837103
8250	NC_021814	TGG	2	6	393101	393106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837103
8251	NC_021814	GACT	2	8	393110	393117	25 %	25 %	25 %	25 %	525837103
8252	NC_021814	TC	3	6	393267	393272	0 %	50 %	0 %	50 %	525837103
8253	NC_021814	GAT	2	6	393294	393299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837103
8254	NC_021814	GGT	2	6	393333	393338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837103
8255	NC_021814	ATC	2	6	393427	393432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837103
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8257	NC_021814	C	6	6	393620	393625	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8258	NC_021814	ATG	2	6	393656	393661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8259	NC_021814	G	7	7	393751	393757	0 %	0 %	100 %	0 %	525837104
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8282	NC_021814	GTT	2	6	394870	394875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837105
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8292	NC_021814	TTCT	2	8	395412	395419	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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8355	NC_021814	CTG	2	6	398972	398977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8358	NC_021814	T	9	9	399089	399097	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8359	NC_021814	CG	3	6	399189	399194	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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8361	NC_021814	ATT	2	6	399234	399239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8362	NC_021814	T	8	8	399291	399298	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8363	NC_021814	TA	3	6	399558	399563	50 %	50 %	0 %	0 %	525837108
8364	NC_021814	CAGC	2	8	399571	399578	25 %	0 %	25 %	50 %	525837108
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8496	NC_021814	CATTAC	2	12	406037	406048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837113
8497	NC_021814	A	6	6	406057	406062	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8498	NC_021814	T	6	6	406141	406146	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8499	NC_021814	GTT	2	6	406149	406154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8500	NC_021814	ACT	2	6	406266	406271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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