MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 102537

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_021814	TAC	2	6	331960	331965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840503
7002	NC_021814	CGC	2	6	331977	331982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840503
7003	NC_021814	GATGGC	2	12	331998	332009	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	525840503
7004	NC_021814	TGC	2	6	332153	332158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840503
7005	NC_021814	TGG	2	6	332169	332174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840503
7006	NC_021814	GCC	2	6	332196	332201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840503
7007	NC_021814	CCAG	2	8	332263	332270	25 %	0 %	25 %	50 %	525840503
7008	NC_021814	CGG	2	6	332362	332367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840503
7009	NC_021814	CGGA	2	8	332379	332386	25 %	0 %	50 %	25 %	525840503
7010	NC_021814	CGC	2	6	332544	332549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840504
7011	NC_021814	CG	4	8	332653	332660	0 %	0 %	50 %	50 %	525840504
7012	NC_021814	CGA	2	6	332702	332707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840504
7013	NC_021814	CAG	2	6	332709	332714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840504
7014	NC_021814	GGC	2	6	332743	332748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840504
7015	NC_021814	CAG	2	6	332829	332834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840504
7016	NC_021814	CGCC	2	8	332970	332977	0 %	0 %	25 %	75 %	525840504
7017	NC_021814	CAG	2	6	332997	333002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840504
7018	NC_021814	GCC	2	6	333013	333018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840504
7019	NC_021814	AGC	2	6	333055	333060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840504
7020	NC_021814	GTG	2	6	333061	333066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840504
7021	NC_021814	GCC	2	6	333070	333075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840504
7022	NC_021814	CGTA	2	8	333147	333154	25 %	25 %	25 %	25 %	525837060
7023	NC_021814	GCA	3	9	333167	333175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837060
7024	NC_021814	GAT	2	6	333183	333188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837060
7025	NC_021814	CGAC	2	8	333236	333243	25 %	0 %	25 %	50 %	525837060
7026	NC_021814	CCA	2	6	333245	333250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525837060
7027	NC_021814	CGA	2	6	333278	333283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837060
7028	NC_021814	CGC	2	6	333308	333313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837060
7029	NC_021814	GAC	2	6	333366	333371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837060
7030	NC_021814	GC	4	8	333412	333419	0 %	0 %	50 %	50 %	525837060
7031	NC_021814	AGC	2	6	333487	333492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837060
7032	NC_021814	TCGAG	2	10	333572	333581	20 %	20 %	40 %	20 %	525837060
7033	NC_021814	TAA	2	6	333605	333610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837060
7034	NC_021814	CTGG	2	8	333663	333670	0 %	25 %	50 %	25 %	525837060
7035	NC_021814	GTC	2	6	333707	333712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7036	NC_021814	GAA	2	6	333722	333727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837061
7037	NC_021814	CAT	2	6	333835	333840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837061
7038	NC_021814	GCC	2	6	333844	333849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837061
7039	NC_021814	AGATGC	2	12	333881	333892	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	525837061
7040	NC_021814	GGC	2	6	334021	334026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837061
7041	NC_021814	GC	3	6	334105	334110	0 %	0 %	50 %	50 %	525837061
7042	NC_021814	ATA	2	6	334175	334180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7043	NC_021814	CGA	2	6	334228	334233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7044	NC_021814	TCT	2	6	334326	334331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7045	NC_021814	TTAA	2	8	334392	334399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7046	NC_021814	CGA	2	6	334452	334457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7047	NC_021814	CG	3	6	334592	334597	0 %	0 %	50 %	50 %	525837062
7048	NC_021814	GTG	2	6	334607	334612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837062
7049	NC_021814	TTG	2	6	334652	334657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837062
7050	NC_021814	AGC	2	6	334710	334715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837062
7051	NC_021814	TGT	2	6	334795	334800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837062
7052	NC_021814	GAA	2	6	334864	334869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837062
7053	NC_021814	GCA	2	6	334890	334895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837062
7054	NC_021814	CGT	2	6	334912	334917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837062
7055	NC_021814	GAACCA	2	12	334927	334938	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	525837062
7056	NC_021814	TGCG	2	8	334941	334948	0 %	25 %	50 %	25 %	525837062
7057	NC_021814	TTG	2	6	335009	335014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837062
7058	NC_021814	GAT	2	6	335015	335020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837062
7059	NC_021814	ACG	2	6	335048	335053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837062
7060	NC_021814	CAG	2	6	335075	335080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837062
7061	NC_021814	CG	4	8	335115	335122	0 %	0 %	50 %	50 %	525837062
7062	NC_021814	GCCA	2	8	335123	335130	25 %	0 %	25 %	50 %	525837062
7063	NC_021814	GGC	2	6	335158	335163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837062
7064	NC_021814	CGAT	2	8	335244	335251	25 %	25 %	25 %	25 %	525837062
7065	NC_021814	A	6	6	335267	335272	100 %	0 %	0 %	0 %	525837062
7066	NC_021814	TGC	2	6	335301	335306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837062
7067	NC_021814	AGC	2	6	335311	335316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837062
7068	NC_021814	TTG	2	6	335400	335405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837062
7069	NC_021814	CTGGT	2	10	335450	335459	0 %	40 %	40 %	20 %	525837062
7070	NC_021814	AATG	2	8	335465	335472	50 %	25 %	25 %	0 %	525837062
7071	NC_021814	CAT	2	6	335562	335567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7072	NC_021814	GATCTG	2	12	335603	335614	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525837063
7073	NC_021814	AAG	2	6	335661	335666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837063
7074	NC_021814	CG	3	6	335683	335688	0 %	0 %	50 %	50 %	525837063
7075	NC_021814	GTC	2	6	335763	335768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837063
7076	NC_021814	GAA	2	6	335789	335794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837063
7077	NC_021814	TC	3	6	335796	335801	0 %	50 %	0 %	50 %	525837063
7078	NC_021814	TGC	2	6	335802	335807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837063
7079	NC_021814	GTT	2	6	335810	335815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837063
7080	NC_021814	TGG	2	6	335898	335903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837063
7081	NC_021814	GAC	2	6	335942	335947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837063
7082	NC_021814	A	6	6	335960	335965	100 %	0 %	0 %	0 %	525837063
7083	NC_021814	CGC	2	6	335968	335973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837063
7084	NC_021814	TG	3	6	335976	335981	0 %	50 %	50 %	0 %	525837063
7085	NC_021814	CG	3	6	336017	336022	0 %	0 %	50 %	50 %	525837063
7086	NC_021814	TGCG	2	8	336061	336068	0 %	25 %	50 %	25 %	525837063
7087	NC_021814	GCT	2	6	336076	336081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837063
7088	NC_021814	TGG	2	6	336135	336140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837063
7089	NC_021814	TGG	2	6	336148	336153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837063
7090	NC_021814	CGG	3	9	336220	336228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837063
7091	NC_021814	CTG	2	6	336314	336319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837063
7092	NC_021814	CCGA	2	8	336341	336348	25 %	0 %	25 %	50 %	525837063
7093	NC_021814	ACG	2	6	336405	336410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837063
7094	NC_021814	AGA	2	6	336415	336420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837063
7095	NC_021814	CAG	2	6	336455	336460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837063
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7098	NC_021814	GGC	3	9	336665	336673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837063
7099	NC_021814	GC	3	6	336730	336735	0 %	0 %	50 %	50 %	525837063
7100	NC_021814	AAG	2	6	336737	336742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837063
7101	NC_021814	GGC	2	6	336799	336804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7102	NC_021814	T	6	6	336810	336815	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7103	NC_021814	CGA	2	6	336825	336830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7104	NC_021814	TGA	2	6	336891	336896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837064
7105	NC_021814	CGG	2	6	337035	337040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837064
7106	NC_021814	CTTC	2	8	337043	337050	0 %	50 %	0 %	50 %	525837064
7107	NC_021814	GC	3	6	337115	337120	0 %	0 %	50 %	50 %	525837064
7108	NC_021814	GAA	2	6	337185	337190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837064
7109	NC_021814	CTG	2	6	337192	337197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837064
7110	NC_021814	CTG	2	6	337213	337218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837064
7111	NC_021814	TTCTC	2	10	337261	337270	0 %	60 %	0 %	40 %	525837064
7112	NC_021814	GC	3	6	337333	337338	0 %	0 %	50 %	50 %	525837064
7113	NC_021814	GGT	2	6	337384	337389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837064
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7117	NC_021814	CTTC	2	8	337508	337515	0 %	50 %	0 %	50 %	525837064
7118	NC_021814	CGG	2	6	337641	337646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837064
7119	NC_021814	CGATAC	2	12	337710	337721	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525837064
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7121	NC_021814	CG	3	6	337838	337843	0 %	0 %	50 %	50 %	525837064
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7230	NC_021814	A	6	6	342019	342024	100 %	0 %	0 %	0 %	525837069
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7236	NC_021814	GGGC	2	8	342450	342457	0 %	0 %	75 %	25 %	525837069
7237	NC_021814	TATGG	2	10	342514	342523	20 %	40 %	40 %	0 %	525837069
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7240	NC_021814	A	6	6	342688	342693	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7241	NC_021814	ACG	2	6	342815	342820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7242	NC_021814	T	8	8	342851	342858	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7489	NC_021814	TCT	2	6	355317	355322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7490	NC_021814	TAA	2	6	355352	355357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7491	NC_021814	TTTG	2	8	355365	355372	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7492	NC_021814	AT	3	6	355425	355430	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7493	NC_021814	AATTA	2	10	355490	355499	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7494	NC_021814	T	6	6	355504	355509	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7495	NC_021814	CAT	2	6	355531	355536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7496	NC_021814	TAA	2	6	355555	355560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7497	NC_021814	TC	3	6	355599	355604	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7498	NC_021814	TCA	2	6	355658	355663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7499	NC_021814	TTA	2	6	355666	355671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7500	NC_021814	ATAA	2	8	355698	355705	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

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