MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 102537

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_021814	GCG	2	6	307206	307211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837039
6502	NC_021814	GC	3	6	307289	307294	0 %	0 %	50 %	50 %	525837039
6503	NC_021814	GACA	2	8	307320	307327	50 %	0 %	25 %	25 %	525837039
6504	NC_021814	GTT	2	6	307343	307348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837039
6505	NC_021814	GCCA	2	8	307367	307374	25 %	0 %	25 %	50 %	525837039
6506	NC_021814	GCA	3	9	307433	307441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837039
6507	NC_021814	GAT	2	6	307445	307450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837039
6508	NC_021814	GC	3	6	307465	307470	0 %	0 %	50 %	50 %	525837039
6509	NC_021814	GAC	2	6	307489	307494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837039
6510	NC_021814	GGC	2	6	307507	307512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6511	NC_021814	G	6	6	307516	307521	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6512	NC_021814	TCA	2	6	307634	307639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837040
6513	NC_021814	CG	3	6	307749	307754	0 %	0 %	50 %	50 %	525837040
6514	NC_021814	GGC	2	6	307846	307851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837040
6515	NC_021814	GTG	2	6	307925	307930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837040
6516	NC_021814	CCTG	2	8	308027	308034	0 %	25 %	25 %	50 %	525837040
6517	NC_021814	GGC	2	6	308062	308067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837040
6518	NC_021814	GCA	2	6	308137	308142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837040
6519	NC_021814	CGC	2	6	308215	308220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837040
6520	NC_021814	TGA	2	6	308251	308256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837040
6521	NC_021814	GGC	2	6	308263	308268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837040
6522	NC_021814	CTG	2	6	308346	308351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6523	NC_021814	CGG	2	6	308402	308407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837041
6524	NC_021814	GC	3	6	308435	308440	0 %	0 %	50 %	50 %	525837041
6525	NC_021814	GC	4	8	308554	308561	0 %	0 %	50 %	50 %	525837041
6526	NC_021814	CCAT	2	8	308581	308588	25 %	25 %	0 %	50 %	525837041
6527	NC_021814	AAT	2	6	308607	308612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837041
6528	NC_021814	TCA	2	6	308777	308782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837041
6529	NC_021814	CGG	2	6	308887	308892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837042
6530	NC_021814	AGG	2	6	308947	308952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525837042
6531	NC_021814	TGT	2	6	308985	308990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837042
6532	NC_021814	GGT	2	6	309023	309028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837042
6533	NC_021814	CGG	2	6	309074	309079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837042
6534	NC_021814	GCC	2	6	309116	309121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837042
6535	NC_021814	CG	3	6	309157	309162	0 %	0 %	50 %	50 %	525837042
6536	NC_021814	TTA	2	6	309222	309227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837042
6537	NC_021814	AAT	2	6	309230	309235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837042
6538	NC_021814	CGG	2	6	309282	309287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837042
6539	NC_021814	A	7	7	309369	309375	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6540	NC_021814	GCC	2	6	309489	309494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6541	NC_021814	GCG	2	6	309508	309513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6542	NC_021814	CACG	2	8	309633	309640	25 %	0 %	25 %	50 %	525837043
6543	NC_021814	ATA	2	6	309683	309688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837043
6544	NC_021814	CGA	2	6	309696	309701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837043
6545	NC_021814	CGG	2	6	309737	309742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837043
6546	NC_021814	ACGG	2	8	309768	309775	25 %	0 %	50 %	25 %	525837043
6547	NC_021814	CGC	2	6	309780	309785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837043
6548	NC_021814	ACC	2	6	309787	309792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525837043
6549	NC_021814	GCC	2	6	309794	309799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837043
6550	NC_021814	CGC	2	6	309816	309821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837043
6551	NC_021814	CGA	2	6	309864	309869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837043
6552	NC_021814	CCTT	2	8	309980	309987	0 %	50 %	0 %	50 %	525837043
6553	NC_021814	CGC	2	6	310005	310010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837043
6554	NC_021814	TTG	2	6	310163	310168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837043
6555	NC_021814	CTT	3	9	310182	310190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837043
6556	NC_021814	ATAA	2	8	310216	310223	75 %	25 %	0 %	0 %	525837043
6557	NC_021814	CGG	2	6	310237	310242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837043
6558	NC_021814	GCGGGC	2	12	310348	310359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837043
6559	NC_021814	ACG	2	6	310414	310419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837043
6560	NC_021814	CAG	2	6	310429	310434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837043
6561	NC_021814	TCTT	2	8	310451	310458	0 %	75 %	0 %	25 %	525837043
6562	NC_021814	TG	3	6	310467	310472	0 %	50 %	50 %	0 %	525837043
6563	NC_021814	ATT	2	6	310505	310510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837043
6564	NC_021814	GC	3	6	310631	310636	0 %	0 %	50 %	50 %	525837044
6565	NC_021814	CCG	2	6	310654	310659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837044
6566	NC_021814	CAG	2	6	310682	310687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837044
6567	NC_021814	CGGCAG	2	12	310703	310714	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	525837044
6568	NC_021814	GC	3	6	310734	310739	0 %	0 %	50 %	50 %	525837044
6569	NC_021814	CGG	2	6	310799	310804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837044
6570	NC_021814	GGC	2	6	310844	310849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837044
6571	NC_021814	TCT	2	6	310858	310863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837044
6572	NC_021814	CTG	2	6	310868	310873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837044
6573	NC_021814	CGC	2	6	310909	310914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837044
6574	NC_021814	TCGA	2	8	310956	310963	25 %	25 %	25 %	25 %	525837044
6575	NC_021814	T	6	6	310984	310989	0 %	100 %	0 %	0 %	525837044
6576	NC_021814	CG	3	6	310993	310998	0 %	0 %	50 %	50 %	525837044
6577	NC_021814	GCG	2	6	311026	311031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837044
6578	NC_021814	TCG	2	6	311040	311045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837044
6579	NC_021814	TCA	2	6	311056	311061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837044
6580	NC_021814	TGC	2	6	311119	311124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837044
6581	NC_021814	CAA	2	6	311222	311227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525837044
6582	NC_021814	ATA	2	6	311256	311261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837044
6583	NC_021814	A	7	7	311261	311267	100 %	0 %	0 %	0 %	525837044
6584	NC_021814	TTG	2	6	311469	311474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837045
6585	NC_021814	AAAT	2	8	311512	311519	75 %	25 %	0 %	0 %	525837045
6586	NC_021814	CGGGCG	2	12	311536	311547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837045
6587	NC_021814	GGC	2	6	311548	311553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837045
6588	NC_021814	CGC	2	6	311609	311614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837045
6589	NC_021814	T	6	6	311728	311733	0 %	100 %	0 %	0 %	525837045
6590	NC_021814	CGCC	2	8	311734	311741	0 %	0 %	25 %	75 %	525837045
6591	NC_021814	TGA	2	6	311761	311766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837045
6592	NC_021814	ACG	2	6	311860	311865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837045
6593	NC_021814	T	6	6	311868	311873	0 %	100 %	0 %	0 %	525837045
6594	NC_021814	CGC	2	6	311940	311945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837045
6595	NC_021814	GCCTG	2	10	311983	311992	0 %	20 %	40 %	40 %	525837045
6596	NC_021814	CGC	2	6	312186	312191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837046
6597	NC_021814	TAC	2	6	312193	312198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837046
6598	NC_021814	CGG	2	6	312209	312214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837046
6599	NC_021814	TGA	2	6	312287	312292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837046
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6601	NC_021814	CAG	2	6	312439	312444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837046
6602	NC_021814	CCAG	2	8	312477	312484	25 %	0 %	25 %	50 %	525837046
6603	NC_021814	CCG	2	6	312492	312497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837046
6604	NC_021814	GAC	2	6	312582	312587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837046
6605	NC_021814	CTG	2	6	312598	312603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837046
6606	NC_021814	TCC	2	6	312681	312686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6607	NC_021814	AGG	2	6	312693	312698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6608	NC_021814	TCA	2	6	312750	312755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837047
6609	NC_021814	CAG	2	6	312814	312819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837047
6610	NC_021814	CGA	2	6	312903	312908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837047
6611	NC_021814	ATG	2	6	313028	313033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837047
6612	NC_021814	CAG	2	6	313039	313044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837047
6613	NC_021814	ATAGCG	2	12	313046	313057	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	525837047
6614	NC_021814	CAT	2	6	313093	313098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837047
6615	NC_021814	CAA	2	6	313218	313223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525837047
6616	NC_021814	ATG	2	6	313295	313300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837047
6617	NC_021814	TGC	2	6	313319	313324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837047
6618	NC_021814	CAA	2	6	313333	313338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525837047
6619	NC_021814	CGGCG	2	10	313353	313362	0 %	0 %	60 %	40 %	525837047
6620	NC_021814	CAT	2	6	313488	313493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837047
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6992	NC_021814	TCC	2	6	331410	331415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525840502
6993	NC_021814	GCG	3	9	331512	331520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840502
6994	NC_021814	GGCC	2	8	331591	331598	0 %	0 %	50 %	50 %	525840502
6995	NC_021814	GCCA	2	8	331647	331654	25 %	0 %	25 %	50 %	525840502
6996	NC_021814	GA	3	6	331831	331836	50 %	0 %	50 %	0 %	525840503
6997	NC_021814	TGT	2	6	331856	331861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525840503
6998	NC_021814	CAG	2	6	331870	331875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840503
6999	NC_021814	TCA	2	6	331913	331918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840503
7000	NC_021814	GC	3	6	331947	331952	0 %	0 %	50 %	50 %	525840503

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