MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Heidelberg str. CFSAN002069 plasmid pCFSAN002069_01

Total Repeats: 2260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021813	TGA	2	6	71256	71261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525819453
1502	NC_021813	AGG	2	6	71295	71300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525819453
1503	NC_021813	GAA	2	6	71449	71454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525819453
1504	NC_021813	TCAC	2	8	71457	71464	25 %	25 %	0 %	50 %	525819453
1505	NC_021813	T	6	6	71499	71504	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_021813	CAG	2	6	71507	71512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_021813	GAGCA	2	10	71513	71522	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1508	NC_021813	AGG	2	6	71629	71634	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525819526
1509	NC_021813	GAA	2	6	71652	71657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525819526
1510	NC_021813	TGA	2	6	71675	71680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525819526
1511	NC_021813	CA	3	6	71719	71724	50 %	0 %	0 %	50 %	525819527
1512	NC_021813	TGA	2	6	71762	71767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525819527
1513	NC_021813	GCA	2	6	71798	71803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525819527
1514	NC_021813	TCC	2	6	71831	71836	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525819527
1515	NC_021813	A	6	6	71990	71995	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_021813	TTTAT	2	10	72002	72011	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_021813	ATAA	2	8	72036	72043	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_021813	A	6	6	72048	72053	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_021813	GAA	2	6	72056	72061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_021813	T	7	7	72069	72075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_021813	GTG	2	6	72121	72126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_021813	ACC	2	6	72135	72140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1523	NC_021813	TTG	2	6	72149	72154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_021813	CGT	2	6	72158	72163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_021813	TTC	2	6	72166	72171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1526	NC_021813	GCG	2	6	72185	72190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1527	NC_021813	GT	3	6	72209	72214	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_021813	GCC	2	6	72256	72261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1529	NC_021813	TACA	2	8	72301	72308	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1530	NC_021813	GTC	2	6	72327	72332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1531	NC_021813	G	6	6	72335	72340	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_021813	GTG	2	6	72418	72423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_021813	CTC	2	6	72492	72497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1534	NC_021813	GAG	2	6	72535	72540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_021813	TGA	2	6	72547	72552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525819528
1536	NC_021813	CTG	2	6	72568	72573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525819528
1537	NC_021813	CAT	2	6	72626	72631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525819528
1538	NC_021813	GC	3	6	72690	72695	0 %	0 %	50 %	50 %	525819528
1539	NC_021813	TCG	2	6	72764	72769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525819528
1540	NC_021813	GAA	2	6	72783	72788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525819528
1541	NC_021813	TGA	2	6	72838	72843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525819528
1542	NC_021813	TGA	2	6	72884	72889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525819528
1543	NC_021813	CAGC	2	8	72896	72903	25 %	0 %	25 %	50 %	525819528
1544	NC_021813	TGA	2	6	72904	72909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525819528
1545	NC_021813	TGAT	2	8	73000	73007	25 %	50 %	25 %	0 %	525819528
1546	NC_021813	AAT	2	6	73041	73046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525819528
1547	NC_021813	ATT	2	6	73071	73076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525819528
1548	NC_021813	CTG	2	6	73083	73088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525819528
1549	NC_021813	CTG	2	6	73167	73172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525819528
1550	NC_021813	TTG	2	6	73333	73338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525819528
1551	NC_021813	ATT	2	6	73353	73358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525819528
1552	NC_021813	GCC	2	6	73382	73387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525819528
1553	NC_021813	T	8	8	73432	73439	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_021813	ATC	2	6	73445	73450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1555	NC_021813	TTG	2	6	73487	73492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525819529
1556	NC_021813	CCTG	2	8	73513	73520	0 %	25 %	25 %	50 %	525819529
1557	NC_021813	GAA	2	6	73550	73555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525819529
1558	NC_021813	CGG	2	6	73556	73561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525819529
1559	NC_021813	T	6	6	73567	73572	0 %	100 %	0 %	0 %	525819529
1560	NC_021813	AAT	2	6	73588	73593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525819529
1561	NC_021813	TC	3	6	73608	73613	0 %	50 %	0 %	50 %	525819529
1562	NC_021813	AAT	2	6	73687	73692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525819529
1563	NC_021813	TCA	2	6	73694	73699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525819529
1564	NC_021813	AGC	2	6	73765	73770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525819529
1565	NC_021813	TCA	2	6	73787	73792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525819529
1566	NC_021813	T	6	6	73804	73809	0 %	100 %	0 %	0 %	525819529
1567	NC_021813	TC	3	6	73827	73832	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1568	NC_021813	ATC	2	6	73857	73862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1569	NC_021813	ATG	2	6	73916	73921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_021813	CG	3	6	73987	73992	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1571	NC_021813	CCT	2	6	74005	74010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1572	NC_021813	GTGA	2	8	74051	74058	25 %	25 %	50 %	0 %	525819530
1573	NC_021813	AAG	2	6	74068	74073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525819530
1574	NC_021813	GGATGA	2	12	74125	74136	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	525819530
1575	NC_021813	GCA	2	6	74195	74200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525819530
1576	NC_021813	GAT	2	6	74228	74233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525819530
1577	NC_021813	TGTT	2	8	74280	74287	0 %	75 %	25 %	0 %	525819530
1578	NC_021813	TTG	2	6	74328	74333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525819530
1579	NC_021813	TTCG	2	8	74435	74442	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1580	NC_021813	ATGAC	2	10	74473	74482	40 %	20 %	20 %	20 %	525819531
1581	NC_021813	TCT	3	9	74502	74510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525819531
1582	NC_021813	AAC	2	6	74521	74526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525819531
1583	NC_021813	TTG	2	6	74551	74556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525819531
1584	NC_021813	GGCA	2	8	74707	74714	25 %	0 %	50 %	25 %	525819531
1585	NC_021813	TGCC	2	8	74969	74976	0 %	25 %	25 %	50 %	525819531
1586	NC_021813	ATCGT	2	10	75040	75049	20 %	40 %	20 %	20 %	525819531
1587	NC_021813	A	7	7	75098	75104	100 %	0 %	0 %	0 %	525819531
1588	NC_021813	TCG	2	6	75185	75190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525819531
1589	NC_021813	GATG	2	8	75242	75249	25 %	25 %	50 %	0 %	525819531
1590	NC_021813	CCT	2	6	75295	75300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525819531
1591	NC_021813	A	7	7	75321	75327	100 %	0 %	0 %	0 %	525819531
1592	NC_021813	A	6	6	75424	75429	100 %	0 %	0 %	0 %	525819531
1593	NC_021813	GCA	2	6	75449	75454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525819531
1594	NC_021813	GTC	2	6	75463	75468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525819531
1595	NC_021813	CTG	2	6	75645	75650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525819531
1596	NC_021813	TGG	2	6	75677	75682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525819531
1597	NC_021813	GTC	2	6	75742	75747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525819531
1598	NC_021813	AAAG	2	8	75843	75850	75 %	0 %	25 %	0 %	525819531
1599	NC_021813	GAA	2	6	75891	75896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525819531
1600	NC_021813	CA	3	6	75902	75907	50 %	0 %	0 %	50 %	525819531
1601	NC_021813	GTT	2	6	75938	75943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525819531
1602	NC_021813	ACA	2	6	75971	75976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525819531
1603	NC_021813	TTG	2	6	75985	75990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525819531
1604	NC_021813	CAG	2	6	76031	76036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525819531
1605	NC_021813	CAG	2	6	76099	76104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525819531
1606	NC_021813	TTTG	2	8	76106	76113	0 %	75 %	25 %	0 %	525819531
1607	NC_021813	GCTG	2	8	76148	76155	0 %	25 %	50 %	25 %	525819531
1608	NC_021813	CAG	2	6	76175	76180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525819531
1609	NC_021813	TGC	2	6	76195	76200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525819531
1610	NC_021813	TCA	2	6	76319	76324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525819531
1611	NC_021813	CA	3	6	76345	76350	50 %	0 %	0 %	50 %	525819531
1612	NC_021813	GAT	2	6	76365	76370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525819531
1613	NC_021813	AGA	2	6	76439	76444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525819531
1614	NC_021813	GCT	2	6	76524	76529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525819531
1615	NC_021813	GCT	2	6	76542	76547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525819531
1616	NC_021813	ACG	2	6	76605	76610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525819531
1617	NC_021813	AGA	2	6	76690	76695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525819531
1618	NC_021813	GTT	2	6	76761	76766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525819531
1619	NC_021813	TAT	2	6	76825	76830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525819531
1620	NC_021813	ACAA	2	8	76873	76880	75 %	0 %	0 %	25 %	525819531
1621	NC_021813	ATC	2	6	76972	76977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525819531
1622	NC_021813	GAAG	2	8	76983	76990	50 %	0 %	50 %	0 %	525819531
1623	NC_021813	CTA	2	6	76997	77002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525819531
1624	NC_021813	CCG	2	6	77049	77054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525819531
1625	NC_021813	A	8	8	77092	77099	100 %	0 %	0 %	0 %	525819531
1626	NC_021813	GGTT	2	8	77156	77163	0 %	50 %	50 %	0 %	525819532
1627	NC_021813	T	7	7	77162	77168	0 %	100 %	0 %	0 %	525819532
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1629	NC_021813	GGT	2	6	77201	77206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525819532
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1999	NC_021813	GAAC	2	8	96657	96664	50 %	0 %	25 %	25 %	525819551
2000	NC_021813	GGA	2	6	96747	96752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525819551

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