MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Heidelberg str. CFSAN002069

Total Repeats: 100993

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21501	NC_021812	AGC	2	6	1031844	1031849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525830259
21502	NC_021812	TGCGT	2	10	1031869	1031878	0 %	40 %	40 %	20 %	525830259
21503	NC_021812	TCG	2	6	1031934	1031939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830259
21504	NC_021812	CAC	2	6	1031978	1031983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525830259
21505	NC_021812	CAG	2	6	1032002	1032007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525830259
21506	NC_021812	GCA	2	6	1032034	1032039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525830259
21507	NC_021812	GC	3	6	1032047	1032052	0 %	0 %	50 %	50 %	525830259
21508	NC_021812	CCG	2	6	1032093	1032098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830259
21509	NC_021812	TAA	2	6	1032114	1032119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525830259
21510	NC_021812	TTG	2	6	1032168	1032173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21511	NC_021812	GCC	2	6	1032187	1032192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21512	NC_021812	CAA	2	6	1032252	1032257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21513	NC_021812	CTA	2	6	1032279	1032284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21514	NC_021812	G	6	6	1032311	1032316	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
21515	NC_021812	AT	3	6	1032336	1032341	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21516	NC_021812	AGG	2	6	1032369	1032374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21517	NC_021812	AAG	3	9	1032387	1032395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525830260
21518	NC_021812	CGA	2	6	1032406	1032411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525830260
21519	NC_021812	AAT	2	6	1032519	1032524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525830260
21520	NC_021812	GGC	2	6	1032554	1032559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525830260
21521	NC_021812	ACAT	2	8	1032580	1032587	50 %	25 %	0 %	25 %	525830260
21522	NC_021812	ATA	2	6	1032663	1032668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525830260
21523	NC_021812	TCT	2	6	1032683	1032688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525827294
21524	NC_021812	AAG	2	6	1032754	1032759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525827294
21525	NC_021812	CTTA	2	8	1032799	1032806	25 %	50 %	0 %	25 %	525827295
21526	NC_021812	AG	3	6	1032811	1032816	50 %	0 %	50 %	0 %	525827295
21527	NC_021812	CCG	2	6	1032908	1032913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827295
21528	NC_021812	TCA	2	6	1032923	1032928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525827295
21529	NC_021812	CTGG	2	8	1032942	1032949	0 %	25 %	50 %	25 %	525827295
21530	NC_021812	TCA	2	6	1032980	1032985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525827295
21531	NC_021812	CCG	2	6	1033025	1033030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827295
21532	NC_021812	AAT	2	6	1033035	1033040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525827295
21533	NC_021812	CAG	2	6	1033110	1033115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827295
21534	NC_021812	AACC	2	8	1033140	1033147	50 %	0 %	0 %	50 %	525827295
21535	NC_021812	ATT	2	6	1033161	1033166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525827295
21536	NC_021812	CCAG	2	8	1033175	1033182	25 %	0 %	25 %	50 %	525827295
21537	NC_021812	CG	3	6	1033193	1033198	0 %	0 %	50 %	50 %	525827295
21538	NC_021812	CTT	2	6	1033202	1033207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525827295
21539	NC_021812	GCA	2	6	1033225	1033230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827295
21540	NC_021812	CGCC	2	8	1033286	1033293	0 %	0 %	25 %	75 %	525827295
21541	NC_021812	GC	6	12	1033339	1033350	0 %	0 %	50 %	50 %	525827295
21542	NC_021812	TGA	2	6	1033400	1033405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525827295
21543	NC_021812	CAG	2	6	1033431	1033436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827295
21544	NC_021812	GAA	2	6	1033458	1033463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525827295
21545	NC_021812	GCG	2	6	1033550	1033555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827295
21546	NC_021812	ACCG	2	8	1033635	1033642	25 %	0 %	25 %	50 %	525827295
21547	NC_021812	GAA	2	6	1033647	1033652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525827295
21548	NC_021812	ATC	2	6	1033672	1033677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525827295
21549	NC_021812	CGC	2	6	1033698	1033703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827295
21550	NC_021812	GCA	2	6	1033723	1033728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827295
21551	NC_021812	AAC	2	6	1033729	1033734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525827295
21552	NC_021812	CCGC	2	8	1033738	1033745	0 %	0 %	25 %	75 %	525827295
21553	NC_021812	CAG	2	6	1033902	1033907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827295
21554	NC_021812	CCA	2	6	1033908	1033913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525827295
21555	NC_021812	GTA	2	6	1033922	1033927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525827295
21556	NC_021812	GAC	2	6	1033946	1033951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21557	NC_021812	GCT	2	6	1034019	1034024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827296
21558	NC_021812	CCA	2	6	1034066	1034071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525827296
21559	NC_021812	CAG	2	6	1034112	1034117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827296
21560	NC_021812	GAC	2	6	1034183	1034188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827296
21561	NC_021812	CGA	2	6	1034198	1034203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827296
21562	NC_021812	CG	3	6	1034253	1034258	0 %	0 %	50 %	50 %	525827296
21563	NC_021812	CAG	2	6	1034259	1034264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827296
21564	NC_021812	T	6	6	1034268	1034273	0 %	100 %	0 %	0 %	525827296
21565	NC_021812	GAT	2	6	1034316	1034321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525827296
21566	NC_021812	CAG	3	9	1034325	1034333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827296
21567	NC_021812	CCA	2	6	1034345	1034350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525827296
21568	NC_021812	GCG	2	6	1034372	1034377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827296
21569	NC_021812	GGAAT	2	10	1034386	1034395	40 %	20 %	40 %	0 %	525827296
21570	NC_021812	TCG	2	6	1034399	1034404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827296
21571	NC_021812	GTCA	2	8	1034430	1034437	25 %	25 %	25 %	25 %	525827296
21572	NC_021812	CAG	3	9	1034457	1034465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827296
21573	NC_021812	TCTT	2	8	1034479	1034486	0 %	75 %	0 %	25 %	525827296
21574	NC_021812	GC	3	6	1034530	1034535	0 %	0 %	50 %	50 %	525827296
21575	NC_021812	GCT	2	6	1034537	1034542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827296
21576	NC_021812	CAG	2	6	1034544	1034549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827296
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21578	NC_021812	GCA	2	6	1034857	1034862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827296
21579	NC_021812	GTA	2	6	1034910	1034915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525827296
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21582	NC_021812	GAA	2	6	1035213	1035218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525827296
21583	NC_021812	GCG	2	6	1035242	1035247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827296
21584	NC_021812	AGT	2	6	1035275	1035280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525827296
21585	NC_021812	AAC	2	6	1035352	1035357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525827296
21586	NC_021812	CAG	2	6	1035429	1035434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827296
21587	NC_021812	CAT	2	6	1035525	1035530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525827296
21588	NC_021812	ATTT	2	8	1035605	1035612	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21589	NC_021812	GGAA	2	8	1035640	1035647	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21590	NC_021812	ATG	2	6	1035654	1035659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525830261
21591	NC_021812	TAA	2	6	1035677	1035682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525830261
21592	NC_021812	A	6	6	1035681	1035686	100 %	0 %	0 %	0 %	525830261
21593	NC_021812	AT	3	6	1035705	1035710	50 %	50 %	0 %	0 %	525830261
21594	NC_021812	T	6	6	1035761	1035766	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21595	NC_021812	GTTAAT	2	12	1035885	1035896	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21596	NC_021812	T	6	6	1035925	1035930	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21597	NC_021812	TTTTTG	2	12	1035937	1035948	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21598	NC_021812	T	6	6	1036013	1036018	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21599	NC_021812	A	6	6	1036036	1036041	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21600	NC_021812	ATT	2	6	1036061	1036066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21601	NC_021812	T	6	6	1036084	1036089	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21602	NC_021812	TTA	2	6	1036107	1036112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21603	NC_021812	TATTTT	2	12	1036129	1036140	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21604	NC_021812	CAT	2	6	1036186	1036191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21605	NC_021812	TTCCCT	2	12	1036217	1036228	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21606	NC_021812	ATC	2	6	1036245	1036250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21607	NC_021812	TAA	2	6	1036278	1036283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21608	NC_021812	AAAC	2	8	1036301	1036308	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
21609	NC_021812	ATT	2	6	1036363	1036368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21610	NC_021812	TAA	2	6	1036429	1036434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21611	NC_021812	ACGA	2	8	1036480	1036487	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
21612	NC_021812	TAA	2	6	1036506	1036511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21613	NC_021812	TTA	2	6	1036555	1036560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21614	NC_021812	AAT	2	6	1036586	1036591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21615	NC_021812	GAG	2	6	1036667	1036672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21616	NC_021812	TGC	2	6	1036758	1036763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21617	NC_021812	T	7	7	1036770	1036776	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21618	NC_021812	TGC	2	6	1036846	1036851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21619	NC_021812	TTA	2	6	1036901	1036906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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