MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Heidelberg str. CFSAN002069

Total Repeats: 100993

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21002	NC_021812	CAG	2	6	1012221	1012226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827276
21003	NC_021812	GCC	2	6	1012246	1012251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827276
21004	NC_021812	ACC	2	6	1012270	1012275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525827276
21005	NC_021812	CCA	2	6	1012322	1012327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525827276
21006	NC_021812	CCA	2	6	1012406	1012411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525827276
21007	NC_021812	CGC	2	6	1012412	1012417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827276
21008	NC_021812	CAG	2	6	1012452	1012457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827276
21009	NC_021812	GCA	3	9	1012472	1012480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827276
21010	NC_021812	CCA	2	6	1012484	1012489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525827276
21011	NC_021812	GCA	2	6	1012490	1012495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827276
21012	NC_021812	CCG	2	6	1012502	1012507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827276
21013	NC_021812	TCT	2	6	1012517	1012522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525827276
21014	NC_021812	CGG	2	6	1012596	1012601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827276
21015	NC_021812	CGC	2	6	1012635	1012640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827276
21016	NC_021812	CAG	2	6	1012656	1012661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827276
21017	NC_021812	CGC	2	6	1012709	1012714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827276
21018	NC_021812	GAT	2	6	1012716	1012721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525827276
21019	NC_021812	GCC	3	9	1012729	1012737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827276
21020	NC_021812	AGT	2	6	1012766	1012771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525827276
21021	NC_021812	TCAGCG	2	12	1012772	1012783	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	525827276
21022	NC_021812	GCC	3	9	1012816	1012824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827276
21023	NC_021812	CAG	3	9	1012827	1012835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827276
21024	NC_021812	CAG	2	6	1012851	1012856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827276
21025	NC_021812	GCG	2	6	1012901	1012906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827276
21026	NC_021812	CGG	2	6	1012952	1012957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827276
21027	NC_021812	CAGCGC	2	12	1013007	1013018	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	525827276
21028	NC_021812	CCT	2	6	1013024	1013029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525827276
21029	NC_021812	CGT	2	6	1013090	1013095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827276
21030	NC_021812	CAG	2	6	1013103	1013108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827276
21031	NC_021812	CAG	2	6	1013154	1013159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827276
21032	NC_021812	CCG	2	6	1013161	1013166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827276
21033	NC_021812	GCA	4	12	1013177	1013188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827276
21034	NC_021812	CTT	2	6	1013199	1013204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525827276
21035	NC_021812	GCCA	2	8	1013212	1013219	25 %	0 %	25 %	50 %	525827276
21036	NC_021812	CAG	4	12	1013220	1013231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827276
21037	NC_021812	CAG	2	6	1013238	1013243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827276
21038	NC_021812	ATG	2	6	1013245	1013250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525827276
21039	NC_021812	CTC	2	6	1013318	1013323	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21040	NC_021812	TCA	2	6	1013339	1013344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525827277
21041	NC_021812	GCGCG	2	10	1013408	1013417	0 %	0 %	60 %	40 %	525827277
21042	NC_021812	CAG	2	6	1013451	1013456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827277
21043	NC_021812	AGA	2	6	1013568	1013573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525827277
21044	NC_021812	GCA	2	6	1013575	1013580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827277
21045	NC_021812	GCTG	2	8	1013597	1013604	0 %	25 %	50 %	25 %	525827277
21046	NC_021812	CGC	2	6	1013609	1013614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827277
21047	NC_021812	CAC	2	6	1013628	1013633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525827277
21048	NC_021812	CTTCCA	2	12	1013645	1013656	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	525827277
21049	NC_021812	GGC	3	9	1013673	1013681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827277
21050	NC_021812	GCA	3	9	1013692	1013700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827277
21051	NC_021812	CTT	2	6	1013708	1013713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525827277
21052	NC_021812	CGC	2	6	1013736	1013741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827277
21053	NC_021812	GTT	2	6	1013745	1013750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525827277
21054	NC_021812	TCG	2	6	1013806	1013811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827277
21055	NC_021812	CCG	2	6	1013900	1013905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827277
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21057	NC_021812	GCCG	2	8	1014000	1014007	0 %	0 %	50 %	50 %	525827277
21058	NC_021812	CCG	2	6	1014158	1014163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827277
21059	NC_021812	CTG	2	6	1014168	1014173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827277
21060	NC_021812	CCA	2	6	1014221	1014226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525827277
21061	NC_021812	CGC	2	6	1014297	1014302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827277
21062	NC_021812	CCA	2	6	1014362	1014367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525827277
21063	NC_021812	CGCC	2	8	1014434	1014441	0 %	0 %	25 %	75 %	525827277
21064	NC_021812	CAG	2	6	1014453	1014458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827277
21065	NC_021812	GGT	2	6	1014477	1014482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525827277
21066	NC_021812	GTGCAG	2	12	1014492	1014503	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	525827277
21067	NC_021812	T	6	6	1014519	1014524	0 %	100 %	0 %	0 %	525827277
21068	NC_021812	CAG	2	6	1014609	1014614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827277
21069	NC_021812	CCAG	2	8	1014629	1014636	25 %	0 %	25 %	50 %	525827277
21070	NC_021812	TGG	2	6	1014659	1014664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525827277
21071	NC_021812	GC	3	6	1014787	1014792	0 %	0 %	50 %	50 %	525827277
21072	NC_021812	GCA	3	9	1014854	1014862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827277
21073	NC_021812	T	6	6	1014888	1014893	0 %	100 %	0 %	0 %	525827277
21074	NC_021812	GCC	2	6	1014957	1014962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827277
21075	NC_021812	CGT	2	6	1014989	1014994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827277
21076	NC_021812	GCA	2	6	1015013	1015018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827277
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21078	NC_021812	GAC	2	6	1015071	1015076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827277
21079	NC_021812	TCC	2	6	1015102	1015107	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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21081	NC_021812	TGG	3	9	1015132	1015140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525827278
21082	NC_021812	GCG	2	6	1015144	1015149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827278
21083	NC_021812	GTC	2	6	1015176	1015181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827278
21084	NC_021812	GCG	3	9	1015189	1015197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827278
21085	NC_021812	GCC	2	6	1015201	1015206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827278
21086	NC_021812	GAA	2	6	1015230	1015235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525827278
21087	NC_021812	CGG	3	9	1015244	1015252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827278
21088	NC_021812	CAG	2	6	1015275	1015280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827278
21089	NC_021812	ATA	2	6	1015357	1015362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525827278
21090	NC_021812	TAA	2	6	1015375	1015380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21091	NC_021812	GTA	2	6	1015431	1015436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525827279
21092	NC_021812	CAAAC	2	10	1015457	1015466	60 %	0 %	0 %	40 %	525827279
21093	NC_021812	A	6	6	1015487	1015492	100 %	0 %	0 %	0 %	525827279
21094	NC_021812	AAT	2	6	1015519	1015524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525827279
21095	NC_021812	ACT	2	6	1015567	1015572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525827279
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21097	NC_021812	AAC	2	6	1015649	1015654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525827279
21098	NC_021812	TGC	2	6	1015660	1015665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827279
21099	NC_021812	ATA	2	6	1015718	1015723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525827279
21100	NC_021812	CAT	2	6	1015813	1015818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525827279
21101	NC_021812	AAT	2	6	1015918	1015923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525827279
21102	NC_021812	CCA	2	6	1015959	1015964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525827279
21103	NC_021812	GAA	2	6	1016089	1016094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525827279
21104	NC_021812	ATA	2	6	1016225	1016230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525827279
21105	NC_021812	TTG	2	6	1016247	1016252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525827279
21106	NC_021812	AAG	2	6	1016272	1016277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525827279
21107	NC_021812	ACT	2	6	1016296	1016301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525827279
21108	NC_021812	GGC	2	6	1016302	1016307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827279
21109	NC_021812	CCA	2	6	1016375	1016380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525827279
21110	NC_021812	CTT	2	6	1016405	1016410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525827279
21111	NC_021812	TGCCA	2	10	1016447	1016456	20 %	20 %	20 %	40 %	525827279
21112	NC_021812	A	6	6	1016467	1016472	100 %	0 %	0 %	0 %	525827279
21113	NC_021812	AC	3	6	1016486	1016491	50 %	0 %	0 %	50 %	525827279
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21115	NC_021812	ATT	2	6	1016630	1016635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525827279
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21231	NC_021812	CG	3	6	1020961	1020966	0 %	0 %	50 %	50 %	525827284
21232	NC_021812	TCA	2	6	1020983	1020988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525827284
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21234	NC_021812	CGG	2	6	1021031	1021036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827284
21235	NC_021812	CAGG	2	8	1021037	1021044	25 %	0 %	50 %	25 %	525827284
21236	NC_021812	CAG	3	9	1021062	1021070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827284
21237	NC_021812	GC	3	6	1021074	1021079	0 %	0 %	50 %	50 %	525827284
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21246	NC_021812	GC	3	6	1021335	1021340	0 %	0 %	50 %	50 %	525827284
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21252	NC_021812	ATCT	2	8	1021503	1021510	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21253	NC_021812	AAT	2	6	1021553	1021558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21254	NC_021812	A	7	7	1021572	1021578	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21255	NC_021812	ATT	2	6	1021644	1021649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21271	NC_021812	A	6	6	1022166	1022171	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21272	NC_021812	ATG	2	6	1022228	1022233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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21344	NC_021812	AAT	2	6	1025112	1025117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21345	NC_021812	GGC	2	6	1025138	1025143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21346	NC_021812	AGCGC	2	10	1025193	1025202	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
21347	NC_021812	GCC	2	6	1025265	1025270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21348	NC_021812	TGG	2	6	1025288	1025293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21349	NC_021812	TCGCT	2	10	1025309	1025318	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
21350	NC_021812	A	6	6	1025411	1025416	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21351	NC_021812	T	6	6	1025432	1025437	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21352	NC_021812	TGG	2	6	1025442	1025447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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21354	NC_021812	A	6	6	1025566	1025571	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21356	NC_021812	TGG	2	6	1025597	1025602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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21359	NC_021812	T	6	6	1025742	1025747	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21360	NC_021812	TGG	2	6	1025752	1025757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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21471	NC_021812	TTCT	2	8	1030238	1030245	0 %	75 %	0 %	25 %	525830258
21472	NC_021812	GTT	2	6	1030249	1030254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525830258
21473	NC_021812	CTG	2	6	1030283	1030288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830258
21474	NC_021812	CTC	2	6	1030292	1030297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525830258
21475	NC_021812	TGCT	2	8	1030298	1030305	0 %	50 %	25 %	25 %	525830258
21476	NC_021812	CTT	2	6	1030327	1030332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525830258
21477	NC_021812	CG	3	6	1030334	1030339	0 %	0 %	50 %	50 %	525830258
21478	NC_021812	CTG	2	6	1030361	1030366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830258
21479	NC_021812	CTG	2	6	1030376	1030381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830258
21480	NC_021812	CCG	5	15	1030425	1030439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830258
21481	NC_021812	TCA	2	6	1030458	1030463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525830258
21482	NC_021812	GAT	2	6	1030493	1030498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525830258
21483	NC_021812	GCA	2	6	1030501	1030506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525830258
21484	NC_021812	AAT	2	6	1030514	1030519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525830258
21485	NC_021812	A	6	6	1030576	1030581	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21486	NC_021812	ATT	2	6	1030696	1030701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525827292
21487	NC_021812	CGC	2	6	1030724	1030729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827292
21488	NC_021812	AAT	2	6	1030860	1030865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525827292
21489	NC_021812	TCG	2	6	1030876	1030881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827292
21490	NC_021812	TAC	2	6	1030883	1030888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525827292
21491	NC_021812	CAG	2	6	1030968	1030973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827292
21492	NC_021812	CGA	2	6	1031029	1031034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827292
21493	NC_021812	TTG	2	6	1031068	1031073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525827293
21494	NC_021812	GGC	2	6	1031199	1031204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827293
21495	NC_021812	CAAT	2	8	1031225	1031232	50 %	25 %	0 %	25 %	525827293
21496	NC_021812	GCAT	2	8	1031299	1031306	25 %	25 %	25 %	25 %	525827293
21497	NC_021812	GCG	2	6	1031620	1031625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827293
21498	NC_021812	ATG	2	6	1031650	1031655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525827293
21499	NC_021812	AATCAA	2	12	1031679	1031690	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	525827293
21500	NC_021812	GTCA	2	8	1031745	1031752	25 %	25 %	25 %	25 %	525827293

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