MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Heidelberg str. CFSAN002069

Total Repeats: 100993

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17501	NC_021812	GCA	2	6	846882	846887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827149
17502	NC_021812	TCA	2	6	846943	846948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525827149
17503	NC_021812	TTGG	2	8	846951	846958	0 %	50 %	50 %	0 %	525827149
17504	NC_021812	CG	4	8	847000	847007	0 %	0 %	50 %	50 %	525827149
17505	NC_021812	GC	3	6	847054	847059	0 %	0 %	50 %	50 %	525827149
17506	NC_021812	CG	4	8	847154	847161	0 %	0 %	50 %	50 %	525827149
17507	NC_021812	GGC	2	6	847262	847267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827149
17508	NC_021812	GC	3	6	847273	847278	0 %	0 %	50 %	50 %	525827149
17509	NC_021812	CG	3	6	847344	847349	0 %	0 %	50 %	50 %	525827149
17510	NC_021812	CAA	2	6	847373	847378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525827149
17511	NC_021812	TCCGCC	2	12	847410	847421	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	525827149
17512	NC_021812	CAT	2	6	847430	847435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525827149
17513	NC_021812	GC	3	6	847452	847457	0 %	0 %	50 %	50 %	525827149
17514	NC_021812	CG	3	6	847458	847463	0 %	0 %	50 %	50 %	525827149
17515	NC_021812	CAG	2	6	847598	847603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827149
17516	NC_021812	CTG	2	6	847715	847720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827149
17517	NC_021812	GGCG	2	8	847786	847793	0 %	0 %	75 %	25 %	525827149
17518	NC_021812	CGG	2	6	847834	847839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827149
17519	NC_021812	AGCG	2	8	847883	847890	25 %	0 %	50 %	25 %	525827149
17520	NC_021812	GGC	2	6	847908	847913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827149
17521	NC_021812	TGC	2	6	847986	847991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827149
17522	NC_021812	CG	3	6	848028	848033	0 %	0 %	50 %	50 %	525827149
17523	NC_021812	TAT	2	6	848050	848055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525827149
17524	NC_021812	CTCA	2	8	848079	848086	25 %	25 %	0 %	50 %	525827149
17525	NC_021812	GTC	2	6	848105	848110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827150
17526	NC_021812	GCG	2	6	848125	848130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827150
17527	NC_021812	TGG	2	6	848226	848231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525827150
17528	NC_021812	CTG	2	6	848333	848338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827150
17529	NC_021812	CCT	2	6	848539	848544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525827150
17530	NC_021812	GCT	2	6	848597	848602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827150
17531	NC_021812	AG	3	6	848625	848630	50 %	0 %	50 %	0 %	525827150
17532	NC_021812	GGC	2	6	848633	848638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827150
17533	NC_021812	GCT	2	6	848651	848656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827150
17534	NC_021812	T	7	7	848695	848701	0 %	100 %	0 %	0 %	525827150
17535	NC_021812	CAT	2	6	848702	848707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525827150
17536	NC_021812	AGA	2	6	848784	848789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17537	NC_021812	TTG	2	6	848802	848807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17538	NC_021812	GGC	2	6	848857	848862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525830233
17539	NC_021812	ATA	2	6	848932	848937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525830233
17540	NC_021812	CGC	2	6	848940	848945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830233
17541	NC_021812	TTC	2	6	849045	849050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525830233
17542	NC_021812	GCC	2	6	849051	849056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830233
17543	NC_021812	ACCGCC	2	12	849063	849074	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	525830233
17544	NC_021812	TTCGCT	2	12	849078	849089	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	525830233
17545	NC_021812	GAC	2	6	849119	849124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525830233
17546	NC_021812	CG	3	6	849125	849130	0 %	0 %	50 %	50 %	525830233
17547	NC_021812	CAC	2	6	849144	849149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525830233
17548	NC_021812	TGG	2	6	849200	849205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525830233
17549	NC_021812	TTAA	2	8	849331	849338	50 %	50 %	0 %	0 %	525830233
17550	NC_021812	CGAC	2	8	849353	849360	25 %	0 %	25 %	50 %	525830233
17551	NC_021812	GC	4	8	849397	849404	0 %	0 %	50 %	50 %	525830233
17552	NC_021812	CG	3	6	849418	849423	0 %	0 %	50 %	50 %	525830233
17553	NC_021812	T	6	6	849438	849443	0 %	100 %	0 %	0 %	525830233
17554	NC_021812	TCA	3	9	849452	849460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525830233
17555	NC_021812	TCA	2	6	849472	849477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525830233
17556	NC_021812	ACGC	2	8	849618	849625	25 %	0 %	25 %	50 %	525830233
17557	NC_021812	AAC	2	6	849708	849713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525830233
17558	NC_021812	CAG	2	6	849720	849725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525830233
17559	NC_021812	CGAC	2	8	849839	849846	25 %	0 %	25 %	50 %	525830233
17560	NC_021812	CCA	2	6	849869	849874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525830233
17561	NC_021812	CTA	2	6	849902	849907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525830233
17562	NC_021812	GCG	2	6	849947	849952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525830233
17563	NC_021812	GC	3	6	850092	850097	0 %	0 %	50 %	50 %	525830233
17564	NC_021812	CGC	2	6	850125	850130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830233
17565	NC_021812	CAC	2	6	850191	850196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525830233
17566	NC_021812	CGG	3	9	850287	850295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525830233
17567	NC_021812	AGA	2	6	850300	850305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525830233
17568	NC_021812	GCG	2	6	850319	850324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525830233
17569	NC_021812	TCG	2	6	850325	850330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830233
17570	NC_021812	GAC	2	6	850343	850348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525830233
17571	NC_021812	GCG	2	6	850391	850396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525830233
17572	NC_021812	GCT	2	6	850412	850417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830233
17573	NC_021812	GCG	2	6	850430	850435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525830233
17574	NC_021812	GCT	2	6	850451	850456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830233
17575	NC_021812	CTGCGG	2	12	850461	850472	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	525830233
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17577	NC_021812	CTGCGG	2	12	850500	850511	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	525830233
17578	NC_021812	GCT	2	6	850529	850534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830233
17579	NC_021812	GCG	2	6	850547	850552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525830233
17580	NC_021812	GCT	2	6	850568	850573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830233
17581	NC_021812	TGC	2	6	850600	850605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830233
17582	NC_021812	GGC	2	6	850606	850611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525830233
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17584	NC_021812	GCT	2	6	850646	850651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830233
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17586	NC_021812	CTG	2	6	850686	850691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830233
17587	NC_021812	GCG	2	6	850709	850714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525830233
17588	NC_021812	TCA	2	6	850783	850788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525830233
17589	NC_021812	GC	3	6	850838	850843	0 %	0 %	50 %	50 %	525830233
17590	NC_021812	GCT	2	6	850868	850873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830233
17591	NC_021812	TCT	2	6	850927	850932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525830233
17592	NC_021812	TGC	3	9	850972	850980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830233
17593	NC_021812	TGCAT	2	10	851014	851023	20 %	40 %	20 %	20 %	525830233
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17596	NC_021812	GTCGG	2	10	851141	851150	0 %	20 %	60 %	20 %	525830233
17597	NC_021812	GC	3	6	851213	851218	0 %	0 %	50 %	50 %	525830233
17598	NC_021812	CTG	2	6	851261	851266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830233
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17602	NC_021812	GGA	2	6	851467	851472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525830233
17603	NC_021812	CGGG	2	8	851473	851480	0 %	0 %	75 %	25 %	525830233
17604	NC_021812	TCT	2	6	851488	851493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525830233
17605	NC_021812	CGG	3	9	851535	851543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525830233
17606	NC_021812	CCGGCT	2	12	851585	851596	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	525830233
17607	NC_021812	GTT	2	6	851621	851626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525830233
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17609	NC_021812	AG	3	6	851671	851676	50 %	0 %	50 %	0 %	525830233
17610	NC_021812	CTG	2	6	851684	851689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830233
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17612	NC_021812	TGC	2	6	851740	851745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830233
17613	NC_021812	CGGT	2	8	851864	851871	0 %	25 %	50 %	25 %	525830233
17614	NC_021812	GCG	2	6	851903	851908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525830233
17615	NC_021812	CGG	2	6	851924	851929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525830233
17616	NC_021812	CGG	2	6	851951	851956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525830233
17617	NC_021812	GCG	3	9	851968	851976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525830233
17618	NC_021812	TCA	2	6	852019	852024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525830233
17619	NC_021812	CGT	2	6	852062	852067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830233
17620	NC_021812	CGC	2	6	852083	852088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830233
17621	NC_021812	GC	4	8	852087	852094	0 %	0 %	50 %	50 %	525830233
17622	NC_021812	TCA	2	6	852112	852117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525830233
17623	NC_021812	ACG	2	6	852195	852200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525830233
17624	NC_021812	CGCGC	2	10	852207	852216	0 %	0 %	40 %	60 %	525830233
17625	NC_021812	TTC	2	6	852258	852263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525830233
17626	NC_021812	TCA	2	6	852274	852279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525830233
17627	NC_021812	TCG	2	6	852286	852291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830233
17628	NC_021812	ATC	2	6	852303	852308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525830233
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17630	NC_021812	GCC	2	6	852354	852359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830233
17631	NC_021812	CCG	2	6	852442	852447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830233
17632	NC_021812	CTA	2	6	852448	852453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525830233
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17638	NC_021812	ATC	2	6	852615	852620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525830233
17639	NC_021812	TGA	2	6	852628	852633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525830233
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17641	NC_021812	GCCA	2	8	852715	852722	25 %	0 %	25 %	50 %	525830233
17642	NC_021812	GC	3	6	852731	852736	0 %	0 %	50 %	50 %	525830233
17643	NC_021812	ATGG	2	8	852747	852754	25 %	25 %	50 %	0 %	525830233
17644	NC_021812	CAA	2	6	852804	852809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525830233
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17647	NC_021812	GCT	2	6	852876	852881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830233
17648	NC_021812	A	6	6	852928	852933	100 %	0 %	0 %	0 %	525830233
17649	NC_021812	CCCG	2	8	852957	852964	0 %	0 %	25 %	75 %	525830233
17650	NC_021812	ACA	2	6	852977	852982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525830233
17651	NC_021812	TAA	2	6	853075	853080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525827151
17652	NC_021812	GCA	2	6	853150	853155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827151
17653	NC_021812	TC	3	6	853159	853164	0 %	50 %	0 %	50 %	525827151
17654	NC_021812	CGG	2	6	853270	853275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827151
17655	NC_021812	GC	3	6	853300	853305	0 %	0 %	50 %	50 %	525827151
17656	NC_021812	CAAGG	2	10	853420	853429	40 %	0 %	40 %	20 %	525827151
17657	NC_021812	CGAT	2	8	853509	853516	25 %	25 %	25 %	25 %	525827151
17658	NC_021812	CTT	2	6	853541	853546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525827151
17659	NC_021812	ATT	3	9	853557	853565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525827151
17660	NC_021812	TC	3	6	853567	853572	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17661	NC_021812	TTCC	2	8	853577	853584	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17662	NC_021812	CCTG	2	8	853590	853597	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17663	NC_021812	GC	3	6	853665	853670	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17664	NC_021812	CATG	2	8	853783	853790	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17665	NC_021812	GCA	2	6	853796	853801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17666	NC_021812	CATA	2	8	853802	853809	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17667	NC_021812	T	6	6	853816	853821	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17668	NC_021812	CAG	2	6	853845	853850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17669	NC_021812	ACA	2	6	853883	853888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17670	NC_021812	AG	3	6	853904	853909	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17671	NC_021812	TTAA	2	8	853951	853958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17672	NC_021812	TGA	2	6	853965	853970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17673	NC_021812	T	7	7	854040	854046	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17674	NC_021812	CAA	2	6	854085	854090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17675	NC_021812	GCT	2	6	854127	854132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827152
17676	NC_021812	CGG	2	6	854150	854155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827152
17677	NC_021812	CGG	2	6	854165	854170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827152
17678	NC_021812	CG	4	8	854178	854185	0 %	0 %	50 %	50 %	525827152
17679	NC_021812	TTA	2	6	854204	854209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525827152
17680	NC_021812	ACG	2	6	854242	854247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827152
17681	NC_021812	GCT	2	6	854292	854297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827152
17682	NC_021812	GCAT	2	8	854306	854313	25 %	25 %	25 %	25 %	525827152
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17684	NC_021812	TCCGT	2	10	854382	854391	0 %	40 %	20 %	40 %	525827152
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17686	NC_021812	GAA	2	6	854476	854481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525827152
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17692	NC_021812	GAA	2	6	854728	854733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525827152
17693	NC_021812	GCA	2	6	854781	854786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827152
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17696	NC_021812	CGG	2	6	854954	854959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827152
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17698	NC_021812	A	6	6	855097	855102	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17699	NC_021812	CGT	2	6	855130	855135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17700	NC_021812	CCTG	2	8	855147	855154	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17701	NC_021812	GGT	2	6	855250	855255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525827153
17702	NC_021812	CTG	2	6	855387	855392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827153
17703	NC_021812	TCC	2	6	855406	855411	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525827153
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17716	NC_021812	GCA	2	6	855873	855878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827153
17717	NC_021812	GAACT	2	10	856008	856017	40 %	20 %	20 %	20 %	525827153
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17722	NC_021812	CT	3	6	856355	856360	0 %	50 %	0 %	50 %	525827153
17723	NC_021812	TAT	2	6	856369	856374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525827153
17724	NC_021812	TC	3	6	856382	856387	0 %	50 %	0 %	50 %	525827153
17725	NC_021812	TC	3	6	856430	856435	0 %	50 %	0 %	50 %	525827153
17726	NC_021812	TC	3	6	856457	856462	0 %	50 %	0 %	50 %	525827153
17727	NC_021812	GC	3	6	856521	856526	0 %	0 %	50 %	50 %	525827153
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17730	NC_021812	CAG	2	6	856634	856639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827153
17731	NC_021812	ACTGCT	2	12	856700	856711	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	525827153
17732	NC_021812	CGG	2	6	856720	856725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827153
17733	NC_021812	GCG	2	6	856773	856778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827153
17734	NC_021812	GCC	2	6	856899	856904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827153
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17737	NC_021812	GCT	2	6	857054	857059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827154
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17876	NC_021812	T	7	7	864272	864278	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17981	NC_021812	CAT	2	6	869209	869214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525827163
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17983	NC_021812	AAT	2	6	869257	869262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525827163
17984	NC_021812	CAATAT	2	12	869290	869301	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	525827163
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17986	NC_021812	GTC	2	6	869417	869422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827163
17987	NC_021812	GCG	2	6	869499	869504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827163
17988	NC_021812	ACC	2	6	869511	869516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525827163
17989	NC_021812	ACC	2	6	869526	869531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525827163
17990	NC_021812	ATA	2	6	869544	869549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525827163
17991	NC_021812	GCT	2	6	869627	869632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827163
17992	NC_021812	GCC	2	6	869641	869646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827163
17993	NC_021812	TCC	2	6	869700	869705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525827163
17994	NC_021812	GCGG	2	8	869706	869713	0 %	0 %	75 %	25 %	525827163
17995	NC_021812	AAT	2	6	869744	869749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525827163
17996	NC_021812	GGC	2	6	869762	869767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827163
17997	NC_021812	GC	3	6	869863	869868	0 %	0 %	50 %	50 %	525827163
17998	NC_021812	CCG	2	6	869898	869903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827163
17999	NC_021812	TCA	2	6	869905	869910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525827163
18000	NC_021812	GC	3	6	869911	869916	0 %	0 %	50 %	50 %	525827163

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