MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Heidelberg str. CFSAN002069

Total Repeats: 100993

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_021812	TCG	2	6	823243	823248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827132
17002	NC_021812	T	6	6	823251	823256	0 %	100 %	0 %	0 %	525827132
17003	NC_021812	CTT	2	6	823271	823276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525827132
17004	NC_021812	GCC	2	6	823326	823331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827132
17005	NC_021812	TTG	2	6	823396	823401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525827132
17006	NC_021812	CTG	2	6	823416	823421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827132
17007	NC_021812	ACG	3	9	823461	823469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827132
17008	NC_021812	TTC	2	6	823470	823475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525827132
17009	NC_021812	GTCCA	2	10	823549	823558	20 %	20 %	20 %	40 %	525827132
17010	NC_021812	CTT	2	6	823589	823594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525827132
17011	NC_021812	AGC	2	6	823607	823612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827132
17012	NC_021812	TCG	2	6	823765	823770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827132
17013	NC_021812	GCA	2	6	823829	823834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827132
17014	NC_021812	CGC	2	6	823844	823849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827132
17015	NC_021812	CAG	2	6	823926	823931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827132
17016	NC_021812	ACG	2	6	823971	823976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827132
17017	NC_021812	GTT	2	6	823989	823994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525827132
17018	NC_021812	CG	3	6	824097	824102	0 %	0 %	50 %	50 %	525827132
17019	NC_021812	GA	3	6	824228	824233	50 %	0 %	50 %	0 %	525827132
17020	NC_021812	TCT	2	6	824254	824259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525827132
17021	NC_021812	TAC	2	6	824376	824381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525827132
17022	NC_021812	CAA	3	9	824396	824404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525827132
17023	NC_021812	CAC	2	6	824405	824410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525827132
17024	NC_021812	CGGG	2	8	824424	824431	0 %	0 %	75 %	25 %	525827132
17025	NC_021812	TTC	2	6	824451	824456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525827132
17026	NC_021812	GTT	2	6	824537	824542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17027	NC_021812	TAC	2	6	824577	824582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17028	NC_021812	GC	3	6	824618	824623	0 %	0 %	50 %	50 %	525827133
17029	NC_021812	CAG	3	9	824689	824697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827133
17030	NC_021812	CGATCG	2	12	824724	824735	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	525827133
17031	NC_021812	TCC	2	6	824823	824828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525827133
17032	NC_021812	GAG	2	6	824829	824834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525827133
17033	NC_021812	GGC	2	6	824932	824937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827133
17034	NC_021812	GAA	2	6	824938	824943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525827133
17035	NC_021812	CACG	2	8	824950	824957	25 %	0 %	25 %	50 %	525827133
17036	NC_021812	GCC	2	6	824967	824972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827133
17037	NC_021812	CGC	2	6	825013	825018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827133
17038	NC_021812	CCGT	2	8	825054	825061	0 %	25 %	25 %	50 %	525827133
17039	NC_021812	TGG	2	6	825129	825134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525827133
17040	NC_021812	GCC	2	6	825141	825146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827133
17041	NC_021812	CAG	2	6	825179	825184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827133
17042	NC_021812	TTA	2	6	825256	825261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525827133
17043	NC_021812	CGC	2	6	825317	825322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17044	NC_021812	AAT	2	6	825396	825401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17045	NC_021812	TGC	2	6	825487	825492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827134
17046	NC_021812	GC	3	6	825491	825496	0 %	0 %	50 %	50 %	525827134
17047	NC_021812	T	6	6	825603	825608	0 %	100 %	0 %	0 %	525827134
17048	NC_021812	CAG	2	6	825609	825614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827134
17049	NC_021812	CATCCG	2	12	825629	825640	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	525827134
17050	NC_021812	TGA	2	6	825668	825673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525827134
17051	NC_021812	GCTGC	2	10	825710	825719	0 %	20 %	40 %	40 %	525827134
17052	NC_021812	TGG	2	6	825728	825733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525827134
17053	NC_021812	ATCGC	2	10	825739	825748	20 %	20 %	20 %	40 %	525827134
17054	NC_021812	GCC	2	6	825751	825756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827134
17055	NC_021812	TCA	2	6	825851	825856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525827134
17056	NC_021812	TGT	2	6	825959	825964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525827134
17057	NC_021812	ATT	2	6	826056	826061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525827134
17058	NC_021812	GGC	2	6	826095	826100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827134
17059	NC_021812	GTAGC	2	10	826166	826175	20 %	20 %	40 %	20 %	525827134
17060	NC_021812	TAA	2	6	826194	826199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525827134
17061	NC_021812	ATTT	2	8	826202	826209	25 %	75 %	0 %	0 %	525827134
17062	NC_021812	TAT	2	6	826235	826240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17063	NC_021812	A	6	6	826241	826246	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17064	NC_021812	ATC	2	6	826267	826272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17065	NC_021812	AGGC	2	8	826360	826367	25 %	0 %	50 %	25 %	525827135
17066	NC_021812	GTT	2	6	826384	826389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525827135
17067	NC_021812	AAT	2	6	826393	826398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525827135
17068	NC_021812	GGT	2	6	826486	826491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525827135
17069	NC_021812	CGG	2	6	826529	826534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827135
17070	NC_021812	CTT	2	6	826558	826563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525827135
17071	NC_021812	TTTC	2	8	826618	826625	0 %	75 %	0 %	25 %	525827135
17072	NC_021812	CGT	2	6	826652	826657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827135
17073	NC_021812	GTG	2	6	826680	826685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525827135
17074	NC_021812	CGC	2	6	826697	826702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827135
17075	NC_021812	CATATC	2	12	826718	826729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525827135
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17077	NC_021812	ATC	2	6	826766	826771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525827135
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17079	NC_021812	CGG	2	6	826885	826890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827135
17080	NC_021812	TTG	2	6	826976	826981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525827135
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17082	NC_021812	TCA	2	6	827107	827112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525827135
17083	NC_021812	CTGG	2	8	827129	827136	0 %	25 %	50 %	25 %	525827135
17084	NC_021812	CGC	2	6	827161	827166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827135
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17086	NC_021812	CG	3	6	827390	827395	0 %	0 %	50 %	50 %	525827135
17087	NC_021812	GCC	2	6	827402	827407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827135
17088	NC_021812	CAG	2	6	827507	827512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827135
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17090	NC_021812	CG	3	6	827610	827615	0 %	0 %	50 %	50 %	525827135
17091	NC_021812	A	6	6	827656	827661	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17092	NC_021812	A	6	6	827698	827703	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17093	NC_021812	TAGA	2	8	827785	827792	50 %	25 %	25 %	0 %	525827136
17094	NC_021812	GC	3	6	827794	827799	0 %	0 %	50 %	50 %	525827136
17095	NC_021812	CAA	2	6	827807	827812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525827136
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17098	NC_021812	ATCA	2	8	827958	827965	50 %	25 %	0 %	25 %	525827136
17099	NC_021812	TGAT	2	8	827992	827999	25 %	50 %	25 %	0 %	525827136
17100	NC_021812	CGC	2	6	828009	828014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827136
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17102	NC_021812	CGG	2	6	828075	828080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827136
17103	NC_021812	TCC	2	6	828163	828168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525827136
17104	NC_021812	TTC	2	6	828205	828210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525827136
17105	NC_021812	GC	3	6	828212	828217	0 %	0 %	50 %	50 %	525827136
17106	NC_021812	GA	3	6	828239	828244	50 %	0 %	50 %	0 %	525827136
17107	NC_021812	GCG	2	6	828251	828256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827136
17108	NC_021812	AGA	2	6	828270	828275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525827136
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17111	NC_021812	GCG	2	6	828452	828457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827136
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17113	NC_021812	CTT	2	6	828473	828478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525827136
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17118	NC_021812	CCG	2	6	828752	828757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827136
17119	NC_021812	CAC	2	6	828808	828813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17120	NC_021812	CCTG	2	8	828826	828833	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17121	NC_021812	CGC	2	6	828891	828896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17122	NC_021812	GAG	2	6	828914	828919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17123	NC_021812	CA	3	6	828936	828941	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17124	NC_021812	AAC	2	6	828989	828994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525827137
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17134	NC_021812	TCA	2	6	829467	829472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525827137
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17141	NC_021812	CCG	2	6	829734	829739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17142	NC_021812	GC	3	6	829784	829789	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17143	NC_021812	CGC	2	6	829844	829849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827138
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17150	NC_021812	CTGA	2	8	830145	830152	25 %	25 %	25 %	25 %	525827138
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17152	NC_021812	GCTT	2	8	830173	830180	0 %	50 %	25 %	25 %	525827138
17153	NC_021812	GC	3	6	830192	830197	0 %	0 %	50 %	50 %	525827138
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17244	NC_021812	AAC	2	6	834602	834607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525827140
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17249	NC_021812	GAC	2	6	834929	834934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827140
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17257	NC_021812	T	6	6	835249	835254	0 %	100 %	0 %	0 %	525827141
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17340	NC_021812	ATTTT	2	10	839410	839419	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17487	NC_021812	TCGA	2	8	846316	846323	25 %	25 %	25 %	25 %	525827148
17488	NC_021812	ACG	2	6	846371	846376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827148
17489	NC_021812	GC	3	6	846387	846392	0 %	0 %	50 %	50 %	525827148
17490	NC_021812	GCA	2	6	846460	846465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827148
17491	NC_021812	AAT	2	6	846501	846506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17492	NC_021812	TGA	2	6	846526	846531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17493	NC_021812	TGA	2	6	846548	846553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17494	NC_021812	CGA	2	6	846600	846605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17495	NC_021812	CAA	2	6	846609	846614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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17497	NC_021812	CAT	2	6	846703	846708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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17500	NC_021812	CGG	2	6	846860	846865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827149

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