MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Heidelberg str. CFSAN002069

Total Repeats: 100993

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_021812	CAGAAA	2	12	775445	775456	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16002	NC_021812	GCA	2	6	775470	775475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16003	NC_021812	ATT	2	6	775566	775571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16004	NC_021812	ACA	2	6	775578	775583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16005	NC_021812	CGT	2	6	775629	775634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827097
16006	NC_021812	TGT	2	6	775663	775668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525827097
16007	NC_021812	GCC	2	6	775679	775684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827097
16008	NC_021812	AT	3	6	775688	775693	50 %	50 %	0 %	0 %	525827097
16009	NC_021812	CGG	2	6	775698	775703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827097
16010	NC_021812	ACG	2	6	775798	775803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827097
16011	NC_021812	TCAG	2	8	775824	775831	25 %	25 %	25 %	25 %	525827097
16012	NC_021812	TTTA	2	8	775847	775854	25 %	75 %	0 %	0 %	525827097
16013	NC_021812	ACG	2	6	775929	775934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827097
16014	NC_021812	CGC	2	6	775978	775983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827097
16015	NC_021812	CCA	2	6	775999	776004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525827097
16016	NC_021812	TTCC	2	8	776011	776018	0 %	50 %	0 %	50 %	525827097
16017	NC_021812	CGG	2	6	776062	776067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827097
16018	NC_021812	GGC	2	6	776084	776089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827097
16019	NC_021812	T	7	7	776182	776188	0 %	100 %	0 %	0 %	525827098
16020	NC_021812	TTA	2	6	776275	776280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525827098
16021	NC_021812	GC	3	6	776318	776323	0 %	0 %	50 %	50 %	525827098
16022	NC_021812	GCCA	2	8	776380	776387	25 %	0 %	25 %	50 %	525827098
16023	NC_021812	AAAG	2	8	776461	776468	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16024	NC_021812	GCC	2	6	776588	776593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16025	NC_021812	TGG	2	6	776614	776619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525830214
16026	NC_021812	ATC	2	6	776665	776670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525830214
16027	NC_021812	AAC	2	6	776755	776760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525830214
16028	NC_021812	CTT	2	6	776787	776792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525830214
16029	NC_021812	TGT	2	6	776876	776881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525830215
16030	NC_021812	GCT	2	6	776886	776891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830215
16031	NC_021812	CAC	2	6	776909	776914	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525830215
16032	NC_021812	GT	3	6	776934	776939	0 %	50 %	50 %	0 %	525830215
16033	NC_021812	CAA	2	6	776975	776980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525830215
16034	NC_021812	GAAAAA	2	12	777009	777020	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	525830215
16035	NC_021812	CT	3	6	777193	777198	0 %	50 %	0 %	50 %	525830216
16036	NC_021812	CTC	2	6	777221	777226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525830216
16037	NC_021812	ACC	2	6	777333	777338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16038	NC_021812	A	7	7	777339	777345	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16039	NC_021812	CGAGG	2	10	777358	777367	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
16040	NC_021812	ATA	2	6	777394	777399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16041	NC_021812	ATT	2	6	777452	777457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16042	NC_021812	CCA	2	6	777521	777526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525827099
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16044	NC_021812	T	6	6	777675	777680	0 %	100 %	0 %	0 %	525827099
16045	NC_021812	CATT	2	8	777715	777722	25 %	50 %	0 %	25 %	525827099
16046	NC_021812	AC	3	6	777753	777758	50 %	0 %	0 %	50 %	525827099
16047	NC_021812	CGGA	2	8	777800	777807	25 %	0 %	50 %	25 %	525827099
16048	NC_021812	TGG	2	6	777837	777842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525827099
16049	NC_021812	GTAA	2	8	777855	777862	50 %	25 %	25 %	0 %	525827099
16050	NC_021812	AATT	2	8	777888	777895	50 %	50 %	0 %	0 %	525827099
16051	NC_021812	AAT	2	6	777944	777949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525827099
16052	NC_021812	GCT	2	6	778037	778042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827099
16053	NC_021812	GAT	2	6	778065	778070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525827099
16054	NC_021812	AGA	2	6	778077	778082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525827099
16055	NC_021812	AGTA	2	8	778134	778141	50 %	25 %	25 %	0 %	525827099
16056	NC_021812	GA	3	6	778146	778151	50 %	0 %	50 %	0 %	525827099
16057	NC_021812	CAT	2	6	778212	778217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525827099
16058	NC_021812	GAA	2	6	778299	778304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16059	NC_021812	T	6	6	778408	778413	0 %	100 %	0 %	0 %	525827100
16060	NC_021812	CTC	2	6	778458	778463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525827100
16061	NC_021812	CCG	2	6	778508	778513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827100
16062	NC_021812	GATG	2	8	778595	778602	25 %	25 %	50 %	0 %	525827100
16063	NC_021812	CGG	3	9	778628	778636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827100
16064	NC_021812	CATGC	2	10	778658	778667	20 %	20 %	20 %	40 %	525827100
16065	NC_021812	GC	3	6	778744	778749	0 %	0 %	50 %	50 %	525827100
16066	NC_021812	GTCAA	2	10	778753	778762	40 %	20 %	20 %	20 %	525827100
16067	NC_021812	GGC	2	6	778806	778811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827100
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16069	NC_021812	GCG	2	6	778828	778833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827100
16070	NC_021812	GGC	2	6	778958	778963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827100
16071	NC_021812	TTTG	2	8	778968	778975	0 %	75 %	25 %	0 %	525827100
16072	NC_021812	TGA	2	6	779181	779186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16073	NC_021812	GCG	3	9	779237	779245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827101
16074	NC_021812	CTG	2	6	779323	779328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827101
16075	NC_021812	TGC	2	6	779361	779366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827101
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16079	NC_021812	CCA	2	6	779703	779708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525827101
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16081	NC_021812	GTT	2	6	779844	779849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16082	NC_021812	GGT	2	6	779877	779882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16083	NC_021812	CTT	2	6	779938	779943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16084	NC_021812	CAT	2	6	779944	779949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16085	NC_021812	GATA	2	8	779986	779993	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16086	NC_021812	TGCC	2	8	779997	780004	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16087	NC_021812	TGA	2	6	780005	780010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16088	NC_021812	TCT	2	6	780041	780046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16089	NC_021812	TCT	2	6	780066	780071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16090	NC_021812	GCA	3	9	780146	780154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16091	NC_021812	GC	3	6	780191	780196	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16092	NC_021812	TAA	2	6	780215	780220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525827102
16093	NC_021812	GTC	2	6	780226	780231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827102
16094	NC_021812	T	6	6	780271	780276	0 %	100 %	0 %	0 %	525827102
16095	NC_021812	CAG	2	6	780285	780290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827102
16096	NC_021812	CGA	2	6	780294	780299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827102
16097	NC_021812	TAAT	2	8	780369	780376	50 %	50 %	0 %	0 %	525827102
16098	NC_021812	ACT	2	6	780465	780470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16099	NC_021812	TA	3	6	780472	780477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16100	NC_021812	AGAA	2	8	780495	780502	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16101	NC_021812	TGT	2	6	780542	780547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16102	NC_021812	CCG	2	6	780575	780580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16103	NC_021812	AGG	2	6	780692	780697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525830217
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16105	NC_021812	CAAC	2	8	780800	780807	50 %	0 %	0 %	50 %	525830217
16106	NC_021812	TCAT	2	8	780850	780857	25 %	50 %	0 %	25 %	525830217
16107	NC_021812	GATG	2	8	780888	780895	25 %	25 %	50 %	0 %	525830217
16108	NC_021812	TTA	2	6	780896	780901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525830217
16109	NC_021812	ATC	2	6	780933	780938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525830217
16110	NC_021812	TTA	2	6	780989	780994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525830217
16111	NC_021812	TA	3	6	780993	780998	50 %	50 %	0 %	0 %	525830217
16112	NC_021812	TTA	2	6	781018	781023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525830217
16113	NC_021812	CGG	2	6	781082	781087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525830217
16114	NC_021812	GAAA	2	8	781168	781175	75 %	0 %	25 %	0 %	525830217
16115	NC_021812	TCA	2	6	781216	781221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525830217
16116	NC_021812	TCGA	2	8	781279	781286	25 %	25 %	25 %	25 %	525830217
16117	NC_021812	TCA	2	6	781370	781375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16118	NC_021812	TATGT	2	10	781505	781514	20 %	60 %	20 %	0 %	525830218
16119	NC_021812	CAG	2	6	781517	781522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525830218
16120	NC_021812	TCC	2	6	781557	781562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525830218
16121	NC_021812	CAC	2	6	781642	781647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525830218
16122	NC_021812	CTCG	2	8	781670	781677	0 %	25 %	25 %	50 %	525830218
16123	NC_021812	CGG	2	6	781913	781918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827103
16124	NC_021812	TCA	2	6	781948	781953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525827103
16125	NC_021812	GTC	2	6	782005	782010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827103
16126	NC_021812	GCT	2	6	782268	782273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830219
16127	NC_021812	CGT	2	6	782316	782321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830219
16128	NC_021812	TCA	2	6	782360	782365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525830219
16129	NC_021812	TGT	2	6	782379	782384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525830219
16130	NC_021812	GTC	2	6	782431	782436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830219
16131	NC_021812	CAT	2	6	782544	782549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525830219
16132	NC_021812	TTC	2	6	782590	782595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525830219
16133	NC_021812	GGC	2	6	782604	782609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525830219
16134	NC_021812	TGC	2	6	782634	782639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830219
16135	NC_021812	TGCG	2	8	782664	782671	0 %	25 %	50 %	25 %	525830220
16136	NC_021812	CAA	2	6	782729	782734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525830220
16137	NC_021812	AGT	3	9	782735	782743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525830220
16138	NC_021812	CTGT	2	8	782746	782753	0 %	50 %	25 %	25 %	525830220
16139	NC_021812	GTT	2	6	782757	782762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525830220
16140	NC_021812	GAA	2	6	782766	782771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525830220
16141	NC_021812	GCCA	2	8	782850	782857	25 %	0 %	25 %	50 %	525830220
16142	NC_021812	GCC	2	6	782863	782868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830220
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16144	NC_021812	CCAT	2	8	782884	782891	25 %	25 %	0 %	50 %	525830220
16145	NC_021812	TGC	2	6	782905	782910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830220
16146	NC_021812	CTG	2	6	783001	783006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830220
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16153	NC_021812	GCA	2	6	783426	783431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827104
16154	NC_021812	CGA	2	6	783457	783462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827104
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16165	NC_021812	AGGTT	2	10	784025	784034	20 %	40 %	40 %	0 %	525827105
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16170	NC_021812	GCT	2	6	784130	784135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827105
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16172	NC_021812	CTT	2	6	784390	784395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525827105
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16177	NC_021812	CAT	2	6	784599	784604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525827105
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16180	NC_021812	CCCCA	2	10	784776	784785	20 %	0 %	0 %	80 %	525830221
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16183	NC_021812	TGG	2	6	785057	785062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525830221
16184	NC_021812	CTTGG	2	10	785129	785138	0 %	40 %	40 %	20 %	525830222
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16189	NC_021812	GTTTA	2	10	785389	785398	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
16190	NC_021812	GAG	2	6	785419	785424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16191	NC_021812	TTTAG	2	10	785432	785441	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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16229	NC_021812	TGA	2	6	786999	787004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16230	NC_021812	ATAC	2	8	787030	787037	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16231	NC_021812	CAC	2	6	787044	787049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16232	NC_021812	CAA	2	6	787057	787062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16233	NC_021812	TA	3	6	787077	787082	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16234	NC_021812	AC	3	6	787101	787106	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16235	NC_021812	TAA	2	6	787107	787112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16236	NC_021812	TAAT	2	8	787123	787130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16237	NC_021812	CAA	2	6	787137	787142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16238	NC_021812	ACC	2	6	787146	787151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16239	NC_021812	CAGG	2	8	787152	787159	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16240	NC_021812	GATGA	2	10	787267	787276	40 %	20 %	40 %	0 %	525827107
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16242	NC_021812	CAAC	2	8	787415	787422	50 %	0 %	0 %	50 %	525827107
16243	NC_021812	CAAC	2	8	787443	787450	50 %	0 %	0 %	50 %	525827107
16244	NC_021812	AGAGA	2	10	787633	787642	60 %	0 %	40 %	0 %	525827108
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16248	NC_021812	TGA	2	6	787761	787766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525827108
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16250	NC_021812	AGCAC	2	10	787869	787878	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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16490	NC_021812	TAC	2	6	800384	800389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525827115
16491	NC_021812	CAA	2	6	800392	800397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525827115
16492	NC_021812	CTG	2	6	800432	800437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827115
16493	NC_021812	CGA	2	6	800473	800478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827115
16494	NC_021812	GGC	2	6	800482	800487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827115
16495	NC_021812	TTAC	2	8	800496	800503	25 %	50 %	0 %	25 %	525827115
16496	NC_021812	CAG	2	6	800514	800519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16497	NC_021812	T	7	7	800561	800567	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16498	NC_021812	TC	3	6	800569	800574	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16499	NC_021812	CCG	2	6	800713	800718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827116
16500	NC_021812	TA	3	6	800800	800805	50 %	50 %	0 %	0 %	525827116

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