MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Heidelberg str. CFSAN002069

Total Repeats: 100993

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_021812	TCA	2	6	726758	726763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525827063
15002	NC_021812	CTG	2	6	726766	726771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827063
15003	NC_021812	CCT	2	6	726789	726794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525827063
15004	NC_021812	CG	3	6	726821	726826	0 %	0 %	50 %	50 %	525827063
15005	NC_021812	TCG	2	6	726827	726832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827063
15006	NC_021812	GC	3	6	726921	726926	0 %	0 %	50 %	50 %	525827063
15007	NC_021812	GACGC	2	10	727013	727022	20 %	0 %	40 %	40 %	525827063
15008	NC_021812	GGC	2	6	727101	727106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827063
15009	NC_021812	GCT	2	6	727113	727118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827063
15010	NC_021812	GC	3	6	727160	727165	0 %	0 %	50 %	50 %	525827063
15011	NC_021812	TGA	2	6	727227	727232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525827063
15012	NC_021812	TCA	3	9	727239	727247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525827063
15013	NC_021812	AGC	2	6	727292	727297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827063
15014	NC_021812	GTT	2	6	727342	727347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525827063
15015	NC_021812	CAA	2	6	727348	727353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525827063
15016	NC_021812	CCG	2	6	727411	727416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827063
15017	NC_021812	ATTA	2	8	727425	727432	50 %	50 %	0 %	0 %	525827063
15018	NC_021812	CGA	2	6	727473	727478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827064
15019	NC_021812	GCT	3	9	727753	727761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827064
15020	NC_021812	GGA	2	6	727842	727847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525827064
15021	NC_021812	CA	3	6	727853	727858	50 %	0 %	0 %	50 %	525827064
15022	NC_021812	TTC	2	6	727871	727876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525827064
15023	NC_021812	CCA	2	6	727906	727911	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525827064
15024	NC_021812	TCC	2	6	727926	727931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525827064
15025	NC_021812	AG	3	6	728021	728026	50 %	0 %	50 %	0 %	525827064
15026	NC_021812	AAT	2	6	728065	728070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15027	NC_021812	GAT	2	6	728126	728131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15028	NC_021812	GATT	2	8	728244	728251	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15029	NC_021812	TTC	2	6	728278	728283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525827065
15030	NC_021812	GC	3	6	728312	728317	0 %	0 %	50 %	50 %	525827065
15031	NC_021812	ATG	2	6	728381	728386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525827065
15032	NC_021812	CAA	2	6	728426	728431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525827065
15033	NC_021812	CGC	2	6	728454	728459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827065
15034	NC_021812	GAT	2	6	728557	728562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525827065
15035	NC_021812	TTGG	2	8	728598	728605	0 %	50 %	50 %	0 %	525827065
15036	NC_021812	GAA	2	6	728612	728617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525827065
15037	NC_021812	AGA	3	9	728623	728631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525827065
15038	NC_021812	AGC	2	6	728650	728655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827065
15039	NC_021812	AGGT	2	8	728658	728665	25 %	25 %	50 %	0 %	525827065
15040	NC_021812	T	8	8	728786	728793	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15041	NC_021812	T	8	8	728824	728831	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15042	NC_021812	ATC	2	6	728881	728886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15043	NC_021812	ATG	2	6	728899	728904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15044	NC_021812	T	7	7	728920	728926	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15045	NC_021812	GAT	2	6	729097	729102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525827066
15046	NC_021812	A	6	6	729113	729118	100 %	0 %	0 %	0 %	525827066
15047	NC_021812	CTGG	2	8	729151	729158	0 %	25 %	50 %	25 %	525827066
15048	NC_021812	TTCA	2	8	729247	729254	25 %	50 %	0 %	25 %	525827066
15049	NC_021812	ATG	2	6	729257	729262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525827066
15050	NC_021812	TGG	2	6	729300	729305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525827066
15051	NC_021812	ACA	2	6	729377	729382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525827066
15052	NC_021812	TGGTA	2	10	729474	729483	20 %	40 %	40 %	0 %	525827066
15053	NC_021812	GGC	2	6	729514	729519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827066
15054	NC_021812	CTA	2	6	729524	729529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525827066
15055	NC_021812	AAC	2	6	729625	729630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525827066
15056	NC_021812	CTG	2	6	729673	729678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827066
15057	NC_021812	AAG	2	6	729710	729715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525827066
15058	NC_021812	GTA	2	6	729724	729729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525827066
15059	NC_021812	GCTCCG	2	12	729742	729753	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	525827066
15060	NC_021812	TTCAAC	2	12	729796	729807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525827066
15061	NC_021812	CAG	2	6	729832	729837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827066
15062	NC_021812	CAGC	2	8	729855	729862	25 %	0 %	25 %	50 %	525827066
15063	NC_021812	TGT	2	6	729969	729974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525827066
15064	NC_021812	TCG	2	6	730110	730115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827066
15065	NC_021812	A	6	6	730184	730189	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15066	NC_021812	T	6	6	730205	730210	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15067	NC_021812	CTT	2	6	730245	730250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525827067
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15069	NC_021812	TCT	2	6	730321	730326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525827067
15070	NC_021812	T	6	6	730419	730424	0 %	100 %	0 %	0 %	525827067
15071	NC_021812	GTTT	2	8	730477	730484	0 %	75 %	25 %	0 %	525827067
15072	NC_021812	CAA	3	9	730560	730568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525827067
15073	NC_021812	GCA	2	6	730585	730590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827067
15074	NC_021812	ATTTCC	2	12	730646	730657	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	525827067
15075	NC_021812	GTT	2	6	730679	730684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525827067
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15077	NC_021812	GAA	2	6	730751	730756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15078	NC_021812	C	6	6	730846	730851	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15079	NC_021812	ACA	2	6	730856	730861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15080	NC_021812	A	6	6	730866	730871	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15081	NC_021812	CAT	2	6	731040	731045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525827068
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15083	NC_021812	CGG	2	6	731143	731148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827068
15084	NC_021812	CCGCG	2	10	731182	731191	0 %	0 %	40 %	60 %	525827068
15085	NC_021812	CA	3	6	731221	731226	50 %	0 %	0 %	50 %	525827068
15086	NC_021812	GTC	2	6	731228	731233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827068
15087	NC_021812	TCA	2	6	731317	731322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525827068
15088	NC_021812	CGG	2	6	731329	731334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827068
15089	NC_021812	ATT	2	6	731342	731347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525827068
15090	NC_021812	GCC	2	6	731659	731664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827068
15091	NC_021812	AGG	2	6	731769	731774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525827068
15092	NC_021812	GCG	2	6	731802	731807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827068
15093	NC_021812	TGT	2	6	732004	732009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525827068
15094	NC_021812	ATG	2	6	732083	732088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525827068
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15096	NC_021812	TCA	2	6	732219	732224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525827068
15097	NC_021812	CG	3	6	732290	732295	0 %	0 %	50 %	50 %	525827068
15098	NC_021812	GGGC	2	8	732304	732311	0 %	0 %	75 %	25 %	525827068
15099	NC_021812	A	6	6	732318	732323	100 %	0 %	0 %	0 %	525827068
15100	NC_021812	TTC	2	6	732332	732337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525827068
15101	NC_021812	AGC	2	6	732348	732353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827068
15102	NC_021812	GCC	2	6	732389	732394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827068
15103	NC_021812	CTG	2	6	732425	732430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827068
15104	NC_021812	AGA	2	6	732442	732447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525827068
15105	NC_021812	GAC	2	6	732470	732475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827068
15106	NC_021812	ACG	2	6	732530	732535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827068
15107	NC_021812	AATAA	2	10	732685	732694	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15108	NC_021812	AGA	2	6	732738	732743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525827069
15109	NC_021812	CTT	2	6	732745	732750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525827069
15110	NC_021812	GTG	2	6	732761	732766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525827069
15111	NC_021812	TGA	2	6	732812	732817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525827069
15112	NC_021812	CGT	2	6	732825	732830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827069
15113	NC_021812	GGC	2	6	732847	732852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827069
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15116	NC_021812	TGG	2	6	732977	732982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525827069
15117	NC_021812	GCG	2	6	733004	733009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827069
15118	NC_021812	TGGGCG	2	12	733028	733039	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	525827069
15119	NC_021812	TGG	2	6	733154	733159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525827069
15120	NC_021812	GTC	2	6	733163	733168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827069
15121	NC_021812	TCC	2	6	733346	733351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15122	NC_021812	TGG	2	6	733520	733525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15123	NC_021812	A	6	6	733651	733656	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15124	NC_021812	AAC	2	6	733667	733672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15125	NC_021812	A	7	7	733694	733700	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15126	NC_021812	GCT	2	6	733784	733789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830204
15127	NC_021812	TCA	2	6	733826	733831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525830204
15128	NC_021812	CTG	2	6	733843	733848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830204
15129	NC_021812	TAA	2	6	733897	733902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525830204
15130	NC_021812	GGT	2	6	733978	733983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525830204
15131	NC_021812	CGA	2	6	734001	734006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525830204
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15133	NC_021812	CCA	2	6	734037	734042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525830204
15134	NC_021812	ATA	2	6	734236	734241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525830204
15135	NC_021812	TC	3	6	734250	734255	0 %	50 %	0 %	50 %	525830204
15136	NC_021812	GCCA	2	8	734273	734280	25 %	0 %	25 %	50 %	525830204
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15138	NC_021812	T	6	6	734340	734345	0 %	100 %	0 %	0 %	525830205
15139	NC_021812	CCA	2	6	734444	734449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525830205
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15142	NC_021812	CCG	2	6	734525	734530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830205
15143	NC_021812	GCT	2	6	734534	734539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830205
15144	NC_021812	GACT	2	8	734545	734552	25 %	25 %	25 %	25 %	525830205
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15148	NC_021812	GCT	2	6	734715	734720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830205
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15152	NC_021812	GC	3	6	734876	734881	0 %	0 %	50 %	50 %	525830205
15153	NC_021812	TCG	2	6	734956	734961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830205
15154	NC_021812	AAAG	2	8	734988	734995	75 %	0 %	25 %	0 %	525830205
15155	NC_021812	GCG	2	6	735038	735043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525830205
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15157	NC_021812	TCG	2	6	735133	735138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830205
15158	NC_021812	T	6	6	735155	735160	0 %	100 %	0 %	0 %	525830205
15159	NC_021812	CGC	3	9	735209	735217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830205
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15161	NC_021812	CCG	2	6	735257	735262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830205
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15163	NC_021812	AAC	2	6	735343	735348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525830205
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15175	NC_021812	CTC	2	6	735961	735966	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15176	NC_021812	GAC	2	6	736039	736044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15177	NC_021812	AG	3	6	736111	736116	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15178	NC_021812	ATCA	2	8	736135	736142	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15179	NC_021812	ACT	2	6	736166	736171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15181	NC_021812	CAA	2	6	736226	736231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15182	NC_021812	ATA	2	6	736268	736273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15183	NC_021812	CCG	2	6	736290	736295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15184	NC_021812	GCCA	2	8	736333	736340	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15185	NC_021812	ATA	2	6	736428	736433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15186	NC_021812	GCAG	2	8	736511	736518	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15187	NC_021812	CAG	2	6	736529	736534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15188	NC_021812	ATC	2	6	736612	736617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15189	NC_021812	GCG	2	6	736627	736632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15190	NC_021812	AC	3	6	736637	736642	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15191	NC_021812	GCT	2	6	736690	736695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15192	NC_021812	GCCGAT	2	12	736696	736707	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15193	NC_021812	GAG	2	6	736783	736788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15194	NC_021812	T	9	9	736809	736817	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15195	NC_021812	ATA	2	6	736894	736899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15196	NC_021812	AGC	2	6	737019	737024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15198	NC_021812	CCA	2	6	737149	737154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15199	NC_021812	GCA	2	6	737187	737192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15200	NC_021812	CA	3	6	737203	737208	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15201	NC_021812	A	6	6	737341	737346	100 %	0 %	0 %	0 %	525827070
15202	NC_021812	GCTTC	2	10	737382	737391	0 %	40 %	20 %	40 %	525827070
15203	NC_021812	T	8	8	737501	737508	0 %	100 %	0 %	0 %	525827070
15204	NC_021812	TCG	2	6	737523	737528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827070
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15212	NC_021812	AATT	2	8	737683	737690	50 %	50 %	0 %	0 %	525827070
15213	NC_021812	TCGT	2	8	737723	737730	0 %	50 %	25 %	25 %	525827070
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15217	NC_021812	CTTG	2	8	737904	737911	0 %	50 %	25 %	25 %	525827070
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15229	NC_021812	GA	3	6	738501	738506	50 %	0 %	50 %	0 %	525827070
15230	NC_021812	AAT	2	6	738511	738516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525827070
15231	NC_021812	CCAG	2	8	738546	738553	25 %	0 %	25 %	50 %	525827070
15232	NC_021812	CG	3	6	738603	738608	0 %	0 %	50 %	50 %	525827070
15233	NC_021812	CAGC	2	8	738646	738653	25 %	0 %	25 %	50 %	525827070
15234	NC_021812	CGA	2	6	738664	738669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827070
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15236	NC_021812	ATG	2	6	738742	738747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525827070
15237	NC_021812	CG	3	6	738765	738770	0 %	0 %	50 %	50 %	525827070
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15240	NC_021812	CG	3	6	738923	738928	0 %	0 %	50 %	50 %	525827070
15241	NC_021812	ATAA	2	8	738946	738953	75 %	25 %	0 %	0 %	525827070
15242	NC_021812	TCA	2	6	738993	738998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525827070
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15244	NC_021812	CGTT	2	8	739040	739047	0 %	50 %	25 %	25 %	525827070
15245	NC_021812	GCG	2	6	739080	739085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827070
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15367	NC_021812	GGT	2	6	746387	746392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525827075
15368	NC_021812	GCA	2	6	746404	746409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827075
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15387	NC_021812	AACA	2	8	747305	747312	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
15388	NC_021812	GACA	2	8	747361	747368	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15389	NC_021812	TGT	2	6	747410	747415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15489	NC_021812	CGC	2	6	751969	751974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827077
15490	NC_021812	AATT	2	8	752095	752102	50 %	50 %	0 %	0 %	525827077
15491	NC_021812	ACG	2	6	752182	752187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525830209
15492	NC_021812	TCC	2	6	752223	752228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525830209
15493	NC_021812	CAC	2	6	752273	752278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525830209
15494	NC_021812	CCG	2	6	752332	752337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830209
15495	NC_021812	CG	3	6	752431	752436	0 %	0 %	50 %	50 %	525830209
15496	NC_021812	GTGCGA	2	12	752439	752450	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	525830209
15497	NC_021812	CATA	2	8	752594	752601	50 %	25 %	0 %	25 %	525830209
15498	NC_021812	ACC	2	6	752610	752615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525830209
15499	NC_021812	CGC	2	6	752646	752651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830209
15500	NC_021812	CGG	2	6	752723	752728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525830209

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