MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Heidelberg str. CFSAN002069

Total Repeats: 100993

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14502	NC_021812	CGG	2	6	702182	702187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827042
14503	NC_021812	TGG	2	6	702276	702281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525827042
14504	NC_021812	TCT	2	6	702294	702299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525827042
14505	NC_021812	GCG	2	6	702382	702387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827042
14506	NC_021812	ATCGC	2	10	702399	702408	20 %	20 %	20 %	40 %	525827042
14507	NC_021812	GCG	2	6	702453	702458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827042
14508	NC_021812	GCG	2	6	702544	702549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827042
14509	NC_021812	CT	3	6	702612	702617	0 %	50 %	0 %	50 %	525827042
14510	NC_021812	CCG	3	9	702664	702672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827042
14511	NC_021812	CGC	2	6	702724	702729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827042
14512	NC_021812	TGA	2	6	702796	702801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525827042
14513	NC_021812	GGC	2	6	702819	702824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827042
14514	NC_021812	GA	3	6	702841	702846	50 %	0 %	50 %	0 %	525827042
14515	NC_021812	GCTG	2	8	702868	702875	0 %	25 %	50 %	25 %	525827042
14516	NC_021812	CATA	2	8	702911	702918	50 %	25 %	0 %	25 %	525827042
14517	NC_021812	CTC	2	6	702921	702926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14518	NC_021812	AT	3	6	702957	702962	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14519	NC_021812	AAGTA	2	10	703005	703014	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
14520	NC_021812	TGTGA	2	10	703017	703026	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
14521	NC_021812	TAT	2	6	703048	703053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14522	NC_021812	ACAT	2	8	703059	703066	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14523	NC_021812	TAAA	2	8	703077	703084	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14524	NC_021812	ATT	2	6	703148	703153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14525	NC_021812	TAA	2	6	703161	703166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14526	NC_021812	GC	3	6	703221	703226	0 %	0 %	50 %	50 %	525827043
14527	NC_021812	GACC	2	8	703274	703281	25 %	0 %	25 %	50 %	525827043
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14530	NC_021812	TGC	3	9	703564	703572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827043
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14532	NC_021812	CTT	3	9	703703	703711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14533	NC_021812	CCG	2	6	703733	703738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14534	NC_021812	AAC	2	6	703786	703791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14535	NC_021812	ATT	2	6	703805	703810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14536	NC_021812	CGGG	2	8	703920	703927	0 %	0 %	75 %	25 %	525827044
14537	NC_021812	ATACCG	2	12	704057	704068	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525827044
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14544	NC_021812	CG	3	6	704555	704560	0 %	0 %	50 %	50 %	525827044
14545	NC_021812	TGA	2	6	704625	704630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525827044
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14554	NC_021812	TACG	2	8	705112	705119	25 %	25 %	25 %	25 %	525827044
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14558	NC_021812	ATCA	2	8	705379	705386	50 %	25 %	0 %	25 %	525827044
14559	NC_021812	GCT	2	6	705396	705401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827044
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14562	NC_021812	CGATG	2	10	705458	705467	20 %	20 %	40 %	20 %	525827045
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14575	NC_021812	GC	3	6	706110	706115	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14576	NC_021812	GTA	2	6	706134	706139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14581	NC_021812	CGTC	2	8	706476	706483	0 %	25 %	25 %	50 %	525827046
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14590	NC_021812	ATT	2	6	706958	706963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14591	NC_021812	TGC	2	6	706974	706979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14594	NC_021812	GC	3	6	707051	707056	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14595	NC_021812	GGCG	2	8	707089	707096	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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14598	NC_021812	TCG	2	6	707392	707397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14599	NC_021812	GC	3	6	707401	707406	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14600	NC_021812	AAG	2	6	707429	707434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14602	NC_021812	TAA	2	6	707623	707628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525827047
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14608	NC_021812	CGC	2	6	707964	707969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827047
14609	NC_021812	TCA	2	6	708028	708033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525827047
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14611	NC_021812	CGA	2	6	708212	708217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827047
14612	NC_021812	GAA	2	6	708260	708265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525827047
14613	NC_021812	CAA	2	6	708306	708311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525827047
14614	NC_021812	ATA	2	6	708322	708327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525827047
14615	NC_021812	CG	3	6	708381	708386	0 %	0 %	50 %	50 %	525827047
14616	NC_021812	A	7	7	708407	708413	100 %	0 %	0 %	0 %	525827047
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14869	NC_021812	TGA	2	6	720557	720562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525827058
14870	NC_021812	ACG	2	6	720574	720579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827058
14871	NC_021812	CGC	2	6	720587	720592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827058
14872	NC_021812	GAT	3	9	720618	720626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525827058
14873	NC_021812	GCGAA	2	10	720665	720674	40 %	0 %	40 %	20 %	525827058
14874	NC_021812	GATG	2	8	720704	720711	25 %	25 %	50 %	0 %	525827058
14875	NC_021812	AGC	2	6	720733	720738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827058
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14878	NC_021812	CCA	2	6	721000	721005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525827059
14879	NC_021812	TCGC	2	8	721155	721162	0 %	25 %	25 %	50 %	525827059
14880	NC_021812	TCA	2	6	721219	721224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525827059
14881	NC_021812	ATT	2	6	721360	721365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14882	NC_021812	GC	3	6	721406	721411	0 %	0 %	50 %	50 %	525827060
14883	NC_021812	CCTT	2	8	721418	721425	0 %	50 %	0 %	50 %	525827060
14884	NC_021812	CT	3	6	721427	721432	0 %	50 %	0 %	50 %	525827060
14885	NC_021812	CTG	2	6	721486	721491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827060
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14888	NC_021812	A	6	6	721586	721591	100 %	0 %	0 %	0 %	525827060
14889	NC_021812	CCG	2	6	721633	721638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827060
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14897	NC_021812	T	7	7	722081	722087	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14898	NC_021812	GCA	2	6	722099	722104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14907	NC_021812	ATC	2	6	722528	722533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525827061
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14909	NC_021812	CCGC	2	8	722636	722643	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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14913	NC_021812	CGC	2	6	722771	722776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830203
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14920	NC_021812	CTTC	2	8	723024	723031	0 %	50 %	0 %	50 %	525830203
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14933	NC_021812	GC	3	6	723594	723599	0 %	0 %	50 %	50 %	525830203
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14980	NC_021812	TTAGCG	2	12	725896	725907	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525827063
14981	NC_021812	GTT	2	6	725949	725954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525827063
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14986	NC_021812	GCAGGC	2	12	726129	726140	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	525827063
14987	NC_021812	GC	3	6	726154	726159	0 %	0 %	50 %	50 %	525827063
14988	NC_021812	CGC	2	6	726225	726230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827063
14989	NC_021812	GC	3	6	726243	726248	0 %	0 %	50 %	50 %	525827063
14990	NC_021812	GCG	2	6	726251	726256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827063
14991	NC_021812	CTT	2	6	726257	726262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525827063
14992	NC_021812	GCT	2	6	726267	726272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827063
14993	NC_021812	TTA	2	6	726289	726294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525827063
14994	NC_021812	CGA	2	6	726326	726331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827063
14995	NC_021812	TGA	2	6	726387	726392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525827063
14996	NC_021812	CT	3	6	726455	726460	0 %	50 %	0 %	50 %	525827063
14997	NC_021812	AGTT	2	8	726683	726690	25 %	50 %	25 %	0 %	525827063
14998	NC_021812	CTG	2	6	726691	726696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827063
14999	NC_021812	TTC	2	6	726715	726720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525827063
15000	NC_021812	CGA	2	6	726749	726754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827063

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