MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Heidelberg str. CFSAN002069

Total Repeats: 100993

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_021812	CAGC	2	8	678972	678979	25 %	0 %	25 %	50 %	525830198
14002	NC_021812	TCA	2	6	679051	679056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525830198
14003	NC_021812	CAAT	2	8	679088	679095	50 %	25 %	0 %	25 %	525830198
14004	NC_021812	ATTT	2	8	679165	679172	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14005	NC_021812	GGT	2	6	679263	679268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14006	NC_021812	AC	3	6	679286	679291	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14007	NC_021812	CT	3	6	679343	679348	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14008	NC_021812	T	6	6	679353	679358	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14009	NC_021812	AAAT	2	8	679397	679404	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14010	NC_021812	CTT	2	6	679430	679435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14011	NC_021812	T	7	7	679438	679444	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14012	NC_021812	ACC	2	6	679579	679584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525830199
14013	NC_021812	GAC	2	6	679603	679608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525830199
14014	NC_021812	CG	3	6	679613	679618	0 %	0 %	50 %	50 %	525830199
14015	NC_021812	CGCGT	2	10	679635	679644	0 %	20 %	40 %	40 %	525830199
14016	NC_021812	ATCG	2	8	679645	679652	25 %	25 %	25 %	25 %	525830199
14017	NC_021812	CGC	2	6	679655	679660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830199
14018	NC_021812	TAA	2	6	679667	679672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525830199
14019	NC_021812	GAG	2	6	679765	679770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525830199
14020	NC_021812	CGC	2	6	679778	679783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830199
14021	NC_021812	TTC	2	6	679826	679831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525830199
14022	NC_021812	TC	3	6	679841	679846	0 %	50 %	0 %	50 %	525830199
14023	NC_021812	GCC	2	6	679849	679854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830199
14024	NC_021812	CCG	2	6	679859	679864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830199
14025	NC_021812	GCC	2	6	679871	679876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830199
14026	NC_021812	GC	3	6	679912	679917	0 %	0 %	50 %	50 %	525830199
14027	NC_021812	CGC	2	6	679922	679927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830199
14028	NC_021812	CG	3	6	680002	680007	0 %	0 %	50 %	50 %	525830199
14029	NC_021812	CT	3	6	680041	680046	0 %	50 %	0 %	50 %	525830199
14030	NC_021812	AAG	2	6	680051	680056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525830199
14031	NC_021812	GCT	2	6	680085	680090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830199
14032	NC_021812	CG	3	6	680111	680116	0 %	0 %	50 %	50 %	525830199
14033	NC_021812	GCC	2	6	680194	680199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830199
14034	NC_021812	GCT	2	6	680208	680213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830199
14035	NC_021812	CCGG	2	8	680219	680226	0 %	0 %	50 %	50 %	525830199
14036	NC_021812	CGCT	2	8	680260	680267	0 %	25 %	25 %	50 %	525830199
14037	NC_021812	GCG	2	6	680288	680293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525830199
14038	NC_021812	CCG	3	9	680450	680458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830199
14039	NC_021812	CG	3	6	680587	680592	0 %	0 %	50 %	50 %	525830199
14040	NC_021812	GGA	2	6	680610	680615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525830199
14041	NC_021812	GCT	2	6	680643	680648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830199
14042	NC_021812	GC	3	6	680650	680655	0 %	0 %	50 %	50 %	525830199
14043	NC_021812	CTG	2	6	680719	680724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830199
14044	NC_021812	ATT	2	6	680816	680821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525830199
14045	NC_021812	GCC	2	6	680843	680848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830199
14046	NC_021812	TGA	2	6	680855	680860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525830199
14047	NC_021812	CG	3	6	680902	680907	0 %	0 %	50 %	50 %	525830199
14048	NC_021812	A	6	6	680983	680988	100 %	0 %	0 %	0 %	525830199
14049	NC_021812	CA	3	6	681040	681045	50 %	0 %	0 %	50 %	525830199
14050	NC_021812	GGC	2	6	681048	681053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525830199
14051	NC_021812	ATC	2	6	681059	681064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525830199
14052	NC_021812	CGGA	2	8	681158	681165	25 %	0 %	50 %	25 %	525830199
14053	NC_021812	AC	3	6	681205	681210	50 %	0 %	0 %	50 %	525830199
14054	NC_021812	CTG	2	6	681217	681222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830199
14055	NC_021812	ACG	2	6	681234	681239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525830199
14056	NC_021812	CTG	2	6	681241	681246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830199
14057	NC_021812	TGG	2	6	681311	681316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525830199
14058	NC_021812	GCA	2	6	681348	681353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525830199
14059	NC_021812	CG	3	6	681395	681400	0 %	0 %	50 %	50 %	525830199
14060	NC_021812	CCG	2	6	681428	681433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830199
14061	NC_021812	TCGCC	2	10	681456	681465	0 %	20 %	20 %	60 %	525830199
14062	NC_021812	TCT	2	6	681472	681477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525830199
14063	NC_021812	AAC	2	6	681527	681532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525830199
14064	NC_021812	CGG	2	6	681569	681574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525830199
14065	NC_021812	GGTTT	2	10	681660	681669	0 %	60 %	40 %	0 %	525830199
14066	NC_021812	CGC	3	9	681674	681682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830199
14067	NC_021812	CGC	2	6	681690	681695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830199
14068	NC_021812	GCGG	2	8	681705	681712	0 %	0 %	75 %	25 %	525830199
14069	NC_021812	GCA	2	6	681735	681740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525830199
14070	NC_021812	TCC	2	6	681818	681823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525830199
14071	NC_021812	ATT	2	6	681824	681829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525830199
14072	NC_021812	GGT	2	6	681885	681890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525830199
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14080	NC_021812	GTT	2	6	682155	682160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525830199
14081	NC_021812	GCC	2	6	682196	682201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830199
14082	NC_021812	CGG	2	6	682224	682229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525830199
14083	NC_021812	GGT	2	6	682272	682277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525830199
14084	NC_021812	GAC	2	6	682428	682433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525830199
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14086	NC_021812	GCC	2	6	682508	682513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830199
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14089	NC_021812	CGT	2	6	682647	682652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830199
14090	NC_021812	TGA	2	6	682740	682745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525830199
14091	NC_021812	TGG	2	6	682805	682810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525830199
14092	NC_021812	GTC	2	6	682816	682821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830199
14093	NC_021812	GGC	2	6	682837	682842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525830199
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14099	NC_021812	TAT	2	6	683150	683155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525830199
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14105	NC_021812	CGC	2	6	683388	683393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830199
14106	NC_021812	TGC	2	6	683447	683452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830199
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14108	NC_021812	TGA	2	6	683519	683524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525830199
14109	NC_021812	TTAA	2	8	683544	683551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14110	NC_021812	GCG	2	6	683618	683623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827022
14111	NC_021812	TTG	2	6	683624	683629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525827022
14112	NC_021812	CAG	2	6	683632	683637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827022
14113	NC_021812	TGA	2	6	683650	683655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525827022
14114	NC_021812	GCGCCA	2	12	683658	683669	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	525827022
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14119	NC_021812	GC	3	6	683832	683837	0 %	0 %	50 %	50 %	525827022
14120	NC_021812	GGC	2	6	683858	683863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827022
14121	NC_021812	GCCA	2	8	683882	683889	25 %	0 %	25 %	50 %	525827022
14122	NC_021812	ACGA	2	8	683906	683913	50 %	0 %	25 %	25 %	525827022
14123	NC_021812	GCT	2	6	683935	683940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827022
14124	NC_021812	GCC	2	6	683974	683979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827022
14125	NC_021812	ACGC	2	8	683989	683996	25 %	0 %	25 %	50 %	525827022
14126	NC_021812	AAT	3	9	684007	684015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525827023
14127	NC_021812	GGC	2	6	684118	684123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827023
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14129	NC_021812	CGCC	2	8	684258	684265	0 %	0 %	25 %	75 %	525827023
14130	NC_021812	AGA	2	6	684279	684284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525827023
14131	NC_021812	GCG	2	6	684384	684389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827023
14132	NC_021812	CCAG	2	8	684390	684397	25 %	0 %	25 %	50 %	525827023
14133	NC_021812	ATA	3	9	684448	684456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525827023
14134	NC_021812	CG	3	6	684506	684511	0 %	0 %	50 %	50 %	525827023
14135	NC_021812	A	6	6	684531	684536	100 %	0 %	0 %	0 %	525827023
14136	NC_021812	GCG	2	6	684545	684550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827023
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14138	NC_021812	A	7	7	684677	684683	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14139	NC_021812	CCG	2	6	684684	684689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14140	NC_021812	CGG	3	9	684696	684704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14141	NC_021812	TGT	2	6	684747	684752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14142	NC_021812	GCTA	2	8	684760	684767	25 %	25 %	25 %	25 %	525827024
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14144	NC_021812	ACC	2	6	684851	684856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525827024
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14146	NC_021812	GAG	2	6	684973	684978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14147	NC_021812	CGC	2	6	684989	684994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14148	NC_021812	ATC	2	6	685006	685011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14149	NC_021812	CGC	2	6	685017	685022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14150	NC_021812	CGT	2	6	685046	685051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14151	NC_021812	AAT	2	6	685102	685107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14152	NC_021812	AAAT	2	8	685117	685124	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14153	NC_021812	CAA	2	6	685177	685182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14154	NC_021812	ATTA	2	8	685193	685200	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14155	NC_021812	AC	3	6	685282	685287	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14156	NC_021812	GAG	2	6	685299	685304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14157	NC_021812	TAT	2	6	685334	685339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525827025
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14159	NC_021812	GCC	2	6	685441	685446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827025
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14162	NC_021812	GC	3	6	685614	685619	0 %	0 %	50 %	50 %	525827025
14163	NC_021812	GCG	2	6	685662	685667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827025
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14169	NC_021812	TCGC	2	8	685854	685861	0 %	25 %	25 %	50 %	525827025
14170	NC_021812	AGG	2	6	685918	685923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14171	NC_021812	AAG	2	6	685940	685945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525827026
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14181	NC_021812	AT	3	6	686561	686566	50 %	50 %	0 %	0 %	525827027
14182	NC_021812	GCG	2	6	686574	686579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827027
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14202	NC_021812	TTG	2	6	687445	687450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14203	NC_021812	CCA	2	6	687580	687585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525827028
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14210	NC_021812	CAGC	2	8	687748	687755	25 %	0 %	25 %	50 %	525827028
14211	NC_021812	CGGAG	2	10	687777	687786	20 %	0 %	60 %	20 %	525827028
14212	NC_021812	CCG	2	6	687813	687818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827028
14213	NC_021812	GCGA	2	8	687823	687830	25 %	0 %	50 %	25 %	525827028
14214	NC_021812	GTA	2	6	687839	687844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525827028
14215	NC_021812	TTC	2	6	687895	687900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525827028
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14217	NC_021812	GCG	2	6	687975	687980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827028
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14219	NC_021812	ACC	2	6	687998	688003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525827028
14220	NC_021812	GAG	2	6	688015	688020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525827028
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14223	NC_021812	CAC	2	6	688094	688099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525827029
14224	NC_021812	TCG	2	6	688140	688145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827029
14225	NC_021812	TCG	2	6	688153	688158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827029
14226	NC_021812	T	6	6	688222	688227	0 %	100 %	0 %	0 %	525827029
14227	NC_021812	CTG	2	6	688259	688264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827029
14228	NC_021812	GAT	2	6	688342	688347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525827029
14229	NC_021812	GGT	2	6	688355	688360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525827029
14230	NC_021812	CGC	2	6	688373	688378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827029
14231	NC_021812	CT	3	6	688389	688394	0 %	50 %	0 %	50 %	525827029
14232	NC_021812	TAA	2	6	688414	688419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525827029
14233	NC_021812	CGC	2	6	688568	688573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827029
14234	NC_021812	CAG	2	6	688658	688663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827029
14235	NC_021812	T	6	6	688702	688707	0 %	100 %	0 %	0 %	525827030
14236	NC_021812	ACGGC	2	10	688791	688800	20 %	0 %	40 %	40 %	525827030
14237	NC_021812	CG	3	6	688809	688814	0 %	0 %	50 %	50 %	525827030
14238	NC_021812	GGC	2	6	688891	688896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827030
14239	NC_021812	TATT	2	8	688925	688932	25 %	75 %	0 %	0 %	525827030
14240	NC_021812	TGC	2	6	688985	688990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827030
14241	NC_021812	GC	3	6	689046	689051	0 %	0 %	50 %	50 %	525827030
14242	NC_021812	GCCA	2	8	689093	689100	25 %	0 %	25 %	50 %	525827030
14243	NC_021812	CAT	2	6	689116	689121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525827030
14244	NC_021812	GC	3	6	689214	689219	0 %	0 %	50 %	50 %	525827030
14245	NC_021812	CCG	2	6	689289	689294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827030
14246	NC_021812	GC	3	6	689307	689312	0 %	0 %	50 %	50 %	525827030
14247	NC_021812	CAG	2	6	689326	689331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827030
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14280	NC_021812	AAC	2	6	691084	691089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14281	NC_021812	TGTA	2	8	691185	691192	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14282	NC_021812	GAT	2	6	691205	691210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14312	NC_021812	T	6	6	692655	692660	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14313	NC_021812	GAA	2	6	692705	692710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14316	NC_021812	TAA	2	6	692841	692846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14317	NC_021812	ATAAA	2	10	692933	692942	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14318	NC_021812	TTA	2	6	692947	692952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14320	NC_021812	A	6	6	692981	692986	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14321	NC_021812	AATGG	2	10	693092	693101	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
14322	NC_021812	CATA	2	8	693152	693159	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14323	NC_021812	A	6	6	693164	693169	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14326	NC_021812	TAA	2	6	693250	693255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14327	NC_021812	ATA	2	6	693439	693444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14346	NC_021812	AAG	2	6	694672	694677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525827034
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14348	NC_021812	T	7	7	694789	694795	0 %	100 %	0 %	0 %	525827034
14349	NC_021812	CAT	2	6	694796	694801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525827034
14350	NC_021812	CTT	2	6	694811	694816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525827035
14351	NC_021812	CAGC	2	8	694864	694871	25 %	0 %	25 %	50 %	525827035
14352	NC_021812	A	6	6	694952	694957	100 %	0 %	0 %	0 %	525827035
14353	NC_021812	GCA	2	6	694958	694963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827035
14354	NC_021812	GGCG	2	8	695008	695015	0 %	0 %	75 %	25 %	525827035
14355	NC_021812	GCG	2	6	695167	695172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827035
14356	NC_021812	CAGC	2	8	695245	695252	25 %	0 %	25 %	50 %	525827035
14357	NC_021812	GTT	2	6	695255	695260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525827035
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14360	NC_021812	CAG	2	6	695388	695393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827035
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14364	NC_021812	GAT	2	6	695513	695518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525827035
14365	NC_021812	A	6	6	695565	695570	100 %	0 %	0 %	0 %	525827035
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14368	NC_021812	CGA	2	6	695780	695785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525827036
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14487	NC_021812	GGC	2	6	701420	701425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525827041
14488	NC_021812	GC	5	10	701433	701442	0 %	0 %	50 %	50 %	525827041
14489	NC_021812	GCC	2	6	701485	701490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827041
14490	NC_021812	CCG	2	6	701518	701523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827041
14491	NC_021812	AGT	2	6	701573	701578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525827041
14492	NC_021812	ATTT	2	8	701613	701620	25 %	75 %	0 %	0 %	525827041
14493	NC_021812	CTC	2	6	701636	701641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525827042
14494	NC_021812	CAC	2	6	701705	701710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525827042
14495	NC_021812	AGATC	2	10	701806	701815	40 %	20 %	20 %	20 %	525827042
14496	NC_021812	GTC	2	6	701820	701825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827042
14497	NC_021812	GTA	2	6	701960	701965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525827042
14498	NC_021812	GGCTTC	2	12	702029	702040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827042
14499	NC_021812	CAC	2	6	702068	702073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525827042
14500	NC_021812	AT	3	6	702096	702101	50 %	50 %	0 %	0 %	525827042

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