MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Heidelberg str. CFSAN002069

Total Repeats: 100993

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_021812	TCAT	2	8	632406	632413	25 %	50 %	0 %	25 %	525826976
13002	NC_021812	CCT	2	6	632437	632442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13003	NC_021812	CAT	2	6	632470	632475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826977
13004	NC_021812	CGGCG	2	10	632683	632692	0 %	0 %	60 %	40 %	525826977
13005	NC_021812	ACC	2	6	632705	632710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525826977
13006	NC_021812	GTCC	2	8	632730	632737	0 %	25 %	25 %	50 %	525826977
13007	NC_021812	TCC	2	6	632857	632862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525826978
13008	NC_021812	TCA	2	6	632874	632879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826978
13009	NC_021812	AAG	2	6	632985	632990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525826978
13010	NC_021812	CGC	2	6	633081	633086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826978
13011	NC_021812	TTC	2	6	633091	633096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525826978
13012	NC_021812	T	6	6	633116	633121	0 %	100 %	0 %	0 %	525826978
13013	NC_021812	CG	3	6	633144	633149	0 %	0 %	50 %	50 %	525826978
13014	NC_021812	CGC	2	6	633184	633189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826978
13015	NC_021812	GC	4	8	633207	633214	0 %	0 %	50 %	50 %	525826978
13016	NC_021812	CTG	2	6	633229	633234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826978
13017	NC_021812	GGC	2	6	633244	633249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826978
13018	NC_021812	TCC	2	6	633271	633276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13019	NC_021812	CG	4	8	633316	633323	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13020	NC_021812	TATT	2	8	633355	633362	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13021	NC_021812	TGCT	2	8	633370	633377	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13022	NC_021812	GGC	2	6	633453	633458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826979
13023	NC_021812	CTGG	2	8	633529	633536	0 %	25 %	50 %	25 %	525826979
13024	NC_021812	CGA	2	6	633543	633548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826979
13025	NC_021812	GGT	2	6	633549	633554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525826979
13026	NC_021812	AGC	2	6	633596	633601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826979
13027	NC_021812	TGG	2	6	633650	633655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525826979
13028	NC_021812	CG	4	8	633735	633742	0 %	0 %	50 %	50 %	525826979
13029	NC_021812	CCG	2	6	633799	633804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826979
13030	NC_021812	GAT	2	6	633885	633890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826979
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13032	NC_021812	GCC	2	6	633988	633993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826979
13033	NC_021812	GC	3	6	634006	634011	0 %	0 %	50 %	50 %	525826979
13034	NC_021812	TTA	2	6	634070	634075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525826979
13035	NC_021812	ATG	2	6	634127	634132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13036	NC_021812	ATAA	2	8	634167	634174	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13037	NC_021812	CG	3	6	634224	634229	0 %	0 %	50 %	50 %	525826980
13038	NC_021812	A	6	6	634251	634256	100 %	0 %	0 %	0 %	525826980
13039	NC_021812	A	6	6	634266	634271	100 %	0 %	0 %	0 %	525826980
13040	NC_021812	CCG	2	6	634275	634280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826980
13041	NC_021812	CGA	2	6	634281	634286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826980
13042	NC_021812	ACC	2	6	634506	634511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525826981
13043	NC_021812	CAA	2	6	634548	634553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525826981
13044	NC_021812	CAGC	2	8	634580	634587	25 %	0 %	25 %	50 %	525826981
13045	NC_021812	AGA	2	6	634601	634606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525826981
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13048	NC_021812	A	6	6	634720	634725	100 %	0 %	0 %	0 %	525826981
13049	NC_021812	GCA	2	6	634727	634732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826981
13050	NC_021812	GGCT	2	8	634758	634765	0 %	25 %	50 %	25 %	525826981
13051	NC_021812	TC	3	6	634861	634866	0 %	50 %	0 %	50 %	525826981
13052	NC_021812	CGG	2	6	634871	634876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826981
13053	NC_021812	A	7	7	634878	634884	100 %	0 %	0 %	0 %	525826981
13054	NC_021812	TCTA	2	8	634887	634894	25 %	50 %	0 %	25 %	525826981
13055	NC_021812	GCG	2	6	635029	635034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826982
13056	NC_021812	ATA	2	6	635116	635121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826982
13057	NC_021812	CGG	2	6	635141	635146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826982
13058	NC_021812	CAG	2	6	635238	635243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826982
13059	NC_021812	GCC	2	6	635260	635265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826982
13060	NC_021812	AG	3	6	635274	635279	50 %	0 %	50 %	0 %	525826982
13061	NC_021812	ACG	2	6	635413	635418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826982
13062	NC_021812	GGC	2	6	635597	635602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826982
13063	NC_021812	TCA	2	6	635608	635613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826982
13064	NC_021812	ACGCC	2	10	635666	635675	20 %	0 %	20 %	60 %	525826982
13065	NC_021812	TGA	2	6	635765	635770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826982
13066	NC_021812	CTGA	2	8	635781	635788	25 %	25 %	25 %	25 %	525826982
13067	NC_021812	ACC	2	6	635824	635829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525826982
13068	NC_021812	GCA	2	6	635864	635869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826982
13069	NC_021812	GCA	2	6	635915	635920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826982
13070	NC_021812	CGC	2	6	635921	635926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826982
13071	NC_021812	CGG	2	6	635958	635963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826982
13072	NC_021812	GCG	2	6	635977	635982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826982
13073	NC_021812	AAT	2	6	635983	635988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826982
13074	NC_021812	CAG	2	6	636093	636098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826982
13075	NC_021812	GCA	2	6	636119	636124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826982
13076	NC_021812	CGT	2	6	636129	636134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826982
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13078	NC_021812	ACG	2	6	636220	636225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826982
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13080	NC_021812	TGCT	2	8	636289	636296	0 %	50 %	25 %	25 %	525826982
13081	NC_021812	GTA	2	6	636359	636364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826982
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13083	NC_021812	GTCG	2	8	636396	636403	0 %	25 %	50 %	25 %	525826982
13084	NC_021812	CAGC	2	8	636488	636495	25 %	0 %	25 %	50 %	525826982
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13086	NC_021812	TAT	2	6	636685	636690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13087	NC_021812	AT	3	6	636702	636707	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13088	NC_021812	ATT	2	6	636756	636761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13089	NC_021812	TAC	2	6	636791	636796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13090	NC_021812	ACG	2	6	636850	636855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826983
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13092	NC_021812	CG	3	6	636928	636933	0 %	0 %	50 %	50 %	525826983
13093	NC_021812	CGT	2	6	636960	636965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826983
13094	NC_021812	TGA	2	6	636986	636991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826983
13095	NC_021812	CGTCA	2	10	637032	637041	20 %	20 %	20 %	40 %	525826983
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13097	NC_021812	TGG	2	6	637106	637111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525826983
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13099	NC_021812	ATG	2	6	637137	637142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826983
13100	NC_021812	GC	3	6	637197	637202	0 %	0 %	50 %	50 %	525826983
13101	NC_021812	CGC	2	6	637205	637210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826983
13102	NC_021812	GCCA	2	8	637213	637220	25 %	0 %	25 %	50 %	525826983
13103	NC_021812	CGC	2	6	637320	637325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826983
13104	NC_021812	GCG	2	6	637358	637363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826983
13105	NC_021812	T	8	8	637398	637405	0 %	100 %	0 %	0 %	525826983
13106	NC_021812	GCC	2	6	637408	637413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826983
13107	NC_021812	CCA	2	6	637418	637423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525826983
13108	NC_021812	CGG	2	6	637658	637663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826983
13109	NC_021812	GCT	2	6	637776	637781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826984
13110	NC_021812	CG	3	6	637815	637820	0 %	0 %	50 %	50 %	525826984
13111	NC_021812	GA	3	6	637861	637866	50 %	0 %	50 %	0 %	525826984
13112	NC_021812	CGC	2	6	637881	637886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826984
13113	NC_021812	A	6	6	637887	637892	100 %	0 %	0 %	0 %	525826984
13114	NC_021812	GACG	2	8	637935	637942	25 %	0 %	50 %	25 %	525826984
13115	NC_021812	GC	3	6	638055	638060	0 %	0 %	50 %	50 %	525826984
13116	NC_021812	GCA	3	9	638064	638072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826984
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13120	NC_021812	CAC	2	6	638284	638289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525826984
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13122	NC_021812	ATCA	2	8	638487	638494	50 %	25 %	0 %	25 %	525826985
13123	NC_021812	CTT	2	6	638516	638521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525826985
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13136	NC_021812	T	6	6	639100	639105	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13137	NC_021812	TGC	2	6	639110	639115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13138	NC_021812	TGA	2	6	639123	639128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13139	NC_021812	A	7	7	639157	639163	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13140	NC_021812	A	6	6	639185	639190	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13143	NC_021812	CG	3	6	639249	639254	0 %	0 %	50 %	50 %	525826986
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13154	NC_021812	CGG	2	6	639577	639582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826986
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13226	NC_021812	TA	4	8	643039	643046	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13235	NC_021812	ATGT	2	8	643335	643342	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13236	NC_021812	T	6	6	643361	643366	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13237	NC_021812	TGA	2	6	643378	643383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13239	NC_021812	A	7	7	643423	643429	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13240	NC_021812	ATGA	2	8	643431	643438	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13241	NC_021812	TCC	2	6	643483	643488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13242	NC_021812	TTA	2	6	643517	643522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13243	NC_021812	AGA	2	6	643545	643550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13245	NC_021812	ATG	2	6	643605	643610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826991
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13348	NC_021812	GGCA	2	8	647795	647802	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13349	NC_021812	CA	3	6	647832	647837	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13350	NC_021812	AAC	2	6	647874	647879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13357	NC_021812	AGCG	2	8	648304	648311	25 %	0 %	50 %	25 %	525826996
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13367	NC_021812	TGA	2	6	649014	649019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13368	NC_021812	CAT	2	6	649034	649039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13369	NC_021812	CTGG	2	8	649103	649110	0 %	25 %	50 %	25 %	525826997
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13475	NC_021812	CG	3	6	654583	654588	0 %	0 %	50 %	50 %	525827001
13476	NC_021812	TCG	2	6	654657	654662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827001
13477	NC_021812	CGT	2	6	654791	654796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827001
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13479	NC_021812	CTG	2	6	654914	654919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525827001
13480	NC_021812	TCA	2	6	655017	655022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525827001
13481	NC_021812	GAT	2	6	655041	655046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525827001
13482	NC_021812	ATA	2	6	655062	655067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525827001
13483	NC_021812	CAAC	2	8	655076	655083	50 %	0 %	0 %	50 %	525827001
13484	NC_021812	TCA	2	6	655090	655095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525827001
13485	NC_021812	ATA	2	6	655113	655118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525827001
13486	NC_021812	TG	3	6	655137	655142	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13487	NC_021812	CGATC	2	10	655150	655159	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
13488	NC_021812	GC	3	6	655211	655216	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13489	NC_021812	CGC	2	6	655384	655389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827002
13490	NC_021812	TGT	2	6	655426	655431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525827002
13491	NC_021812	GTG	2	6	655502	655507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525827002
13492	NC_021812	T	6	6	655554	655559	0 %	100 %	0 %	0 %	525827002
13493	NC_021812	TGT	2	6	655585	655590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525827002
13494	NC_021812	TGG	2	6	655614	655619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525827002
13495	NC_021812	CT	3	6	655734	655739	0 %	50 %	0 %	50 %	525827002
13496	NC_021812	ATA	2	6	655753	655758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525827002
13497	NC_021812	CTGGTG	2	12	655797	655808	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	525827002
13498	NC_021812	A	6	6	655849	655854	100 %	0 %	0 %	0 %	525827002
13499	NC_021812	CAAG	2	8	655864	655871	50 %	0 %	25 %	25 %	525827002
13500	NC_021812	CGC	2	6	655880	655885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525827002

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