MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Heidelberg str. CFSAN002069

Total Repeats: 100993

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_021812	CGA	2	6	607648	607653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826958
12502	NC_021812	TCG	2	6	607707	607712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826958
12503	NC_021812	CCCG	2	8	607766	607773	0 %	0 %	25 %	75 %	525826958
12504	NC_021812	CCA	3	9	607822	607830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525826958
12505	NC_021812	CG	3	6	607834	607839	0 %	0 %	50 %	50 %	525826958
12506	NC_021812	T	7	7	607894	607900	0 %	100 %	0 %	0 %	525826958
12507	NC_021812	TGGC	2	8	607939	607946	0 %	25 %	50 %	25 %	525830186
12508	NC_021812	TG	3	6	607962	607967	0 %	50 %	50 %	0 %	525830186
12509	NC_021812	GCC	3	9	608020	608028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830186
12510	NC_021812	GGC	2	6	608065	608070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525830186
12511	NC_021812	TAA	2	6	608207	608212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525830186
12512	NC_021812	AAT	2	6	608262	608267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525830186
12513	NC_021812	CGGCC	2	10	608315	608324	0 %	0 %	40 %	60 %	525830186
12514	NC_021812	ACC	2	6	608426	608431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525830186
12515	NC_021812	TCA	2	6	608485	608490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525830186
12516	NC_021812	CTT	2	6	608585	608590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525830186
12517	NC_021812	GCA	2	6	608687	608692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525830186
12518	NC_021812	T	6	6	608723	608728	0 %	100 %	0 %	0 %	525830186
12519	NC_021812	CAT	2	6	608729	608734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525830186
12520	NC_021812	GCC	2	6	608756	608761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830186
12521	NC_021812	TAA	2	6	608798	608803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525830186
12522	NC_021812	CAAC	2	8	608867	608874	50 %	0 %	0 %	50 %	525830186
12523	NC_021812	T	6	6	608898	608903	0 %	100 %	0 %	0 %	525830186
12524	NC_021812	GAA	2	6	608958	608963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525826959
12525	NC_021812	ACG	2	6	608965	608970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826959
12526	NC_021812	AAT	2	6	608993	608998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826959
12527	NC_021812	GCCT	2	8	609033	609040	0 %	25 %	25 %	50 %	525826959
12528	NC_021812	CCT	2	6	609046	609051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525826959
12529	NC_021812	CT	3	6	609050	609055	0 %	50 %	0 %	50 %	525826959
12530	NC_021812	CGTC	2	8	609244	609251	0 %	25 %	25 %	50 %	525826959
12531	NC_021812	AAT	2	6	609379	609384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826959
12532	NC_021812	GCC	2	6	609452	609457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826959
12533	NC_021812	CAA	2	6	609622	609627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525826959
12534	NC_021812	CG	3	6	609630	609635	0 %	0 %	50 %	50 %	525826959
12535	NC_021812	ATTA	2	8	609704	609711	50 %	50 %	0 %	0 %	525826959
12536	NC_021812	A	6	6	609790	609795	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12537	NC_021812	TGTC	2	8	609823	609830	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12538	NC_021812	GCCAAA	2	12	609878	609889	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	525826960
12539	NC_021812	GC	3	6	609926	609931	0 %	0 %	50 %	50 %	525826960
12540	NC_021812	GCG	2	6	610047	610052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826960
12541	NC_021812	GCA	2	6	610104	610109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826960
12542	NC_021812	GACT	2	8	610118	610125	25 %	25 %	25 %	25 %	525826960
12543	NC_021812	CGTGC	2	10	610166	610175	0 %	20 %	40 %	40 %	525826960
12544	NC_021812	CAGCG	2	10	610238	610247	20 %	0 %	40 %	40 %	525826960
12545	NC_021812	CGG	2	6	610262	610267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826960
12546	NC_021812	GCT	2	6	610289	610294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826960
12547	NC_021812	CGA	2	6	610306	610311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826960
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12549	NC_021812	ACGG	2	8	610417	610424	25 %	0 %	50 %	25 %	525826960
12550	NC_021812	CGC	2	6	610427	610432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826960
12551	NC_021812	GC	5	10	610459	610468	0 %	0 %	50 %	50 %	525826960
12552	NC_021812	ACC	2	6	610478	610483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525826960
12553	NC_021812	GCG	2	6	610492	610497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826960
12554	NC_021812	CCA	2	6	610522	610527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525826960
12555	NC_021812	GAT	2	6	610550	610555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826960
12556	NC_021812	CG	3	6	610557	610562	0 %	0 %	50 %	50 %	525826960
12557	NC_021812	TCG	2	6	610669	610674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826960
12558	NC_021812	TTC	2	6	610733	610738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525826960
12559	NC_021812	ACC	2	6	610751	610756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525826960
12560	NC_021812	GCG	2	6	610773	610778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826960
12561	NC_021812	TGAA	2	8	610857	610864	50 %	25 %	25 %	0 %	525826960
12562	NC_021812	CATC	2	8	610867	610874	25 %	25 %	0 %	50 %	525826960
12563	NC_021812	TCA	2	6	610902	610907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826960
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12565	NC_021812	ACG	2	6	611069	611074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826960
12566	NC_021812	TCC	2	6	611089	611094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12567	NC_021812	AGGG	2	8	611095	611102	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
12568	NC_021812	TGG	2	6	611176	611181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525826961
12569	NC_021812	GGT	2	6	611211	611216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525826961
12570	NC_021812	CTT	2	6	611228	611233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525826961
12571	NC_021812	CTT	2	6	611258	611263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525826961
12572	NC_021812	TTG	2	6	611329	611334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525826961
12573	NC_021812	CTT	2	6	611339	611344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525826961
12574	NC_021812	TTC	2	6	611388	611393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525826961
12575	NC_021812	TAA	2	6	611533	611538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12576	NC_021812	CCG	2	6	611577	611582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826962
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12578	NC_021812	CGC	2	6	611834	611839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826962
12579	NC_021812	ACCA	2	8	611873	611880	50 %	0 %	0 %	50 %	525826962
12580	NC_021812	TCA	2	6	611917	611922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826962
12581	NC_021812	GC	3	6	611925	611930	0 %	0 %	50 %	50 %	525826962
12582	NC_021812	GAT	2	6	611958	611963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826962
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12585	NC_021812	ATT	2	6	612038	612043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525826962
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12587	NC_021812	CGC	2	6	612208	612213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826962
12588	NC_021812	GCC	2	6	612333	612338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826963
12589	NC_021812	GCG	2	6	612513	612518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826963
12590	NC_021812	GTT	2	6	612545	612550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525826963
12591	NC_021812	TAC	2	6	612551	612556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826963
12592	NC_021812	GC	3	6	612568	612573	0 %	0 %	50 %	50 %	525826963
12593	NC_021812	CTG	3	9	612610	612618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826963
12594	NC_021812	TCA	2	6	612622	612627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826963
12595	NC_021812	GC	3	6	612628	612633	0 %	0 %	50 %	50 %	525826963
12596	NC_021812	CGGCAG	2	12	612653	612664	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	525826963
12597	NC_021812	CG	3	6	612665	612670	0 %	0 %	50 %	50 %	525826963
12598	NC_021812	ACC	2	6	612735	612740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525826963
12599	NC_021812	AGTTAA	2	12	612751	612762	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	525826963
12600	NC_021812	AAC	2	6	612770	612775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525826963
12601	NC_021812	TTC	2	6	612791	612796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525826963
12602	NC_021812	CAT	2	6	612817	612822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826963
12603	NC_021812	GAT	2	6	612830	612835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826963
12604	NC_021812	GCC	2	6	612845	612850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826963
12605	NC_021812	CCA	2	6	612895	612900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525826963
12606	NC_021812	TGA	2	6	612922	612927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826963
12607	NC_021812	CTG	3	9	612998	613006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826963
12608	NC_021812	TAA	2	6	613037	613042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826963
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12610	NC_021812	TCT	2	6	613146	613151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525826963
12611	NC_021812	GCC	2	6	613167	613172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826963
12612	NC_021812	CACG	2	8	613339	613346	25 %	0 %	25 %	50 %	525826964
12613	NC_021812	GC	3	6	613357	613362	0 %	0 %	50 %	50 %	525826964
12614	NC_021812	GAC	3	9	613406	613414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826964
12615	NC_021812	T	6	6	613436	613441	0 %	100 %	0 %	0 %	525826964
12616	NC_021812	TTA	2	6	613512	613517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525826964
12617	NC_021812	GCC	2	6	613518	613523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826964
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12619	NC_021812	TTC	2	6	613694	613699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525826964
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12621	NC_021812	ACC	2	6	613797	613802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525826964
12622	NC_021812	ATGC	2	8	613948	613955	25 %	25 %	25 %	25 %	525826964
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12630	NC_021812	GGC	2	6	614262	614267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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12812	NC_021812	ATA	2	6	623276	623281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12822	NC_021812	CTG	2	6	623882	623887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826968
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12850	NC_021812	TGC	2	6	625109	625114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826969
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12852	NC_021812	GAACG	2	10	625184	625193	40 %	0 %	40 %	20 %	525826969
12853	NC_021812	CCG	2	6	625202	625207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826969
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12855	NC_021812	GTCGG	2	10	625286	625295	0 %	20 %	60 %	20 %	525826969
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12861	NC_021812	A	7	7	625705	625711	100 %	0 %	0 %	0 %	525826969
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12983	NC_021812	TGG	2	6	631661	631666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525826975
12984	NC_021812	TGAC	2	8	631706	631713	25 %	25 %	25 %	25 %	525826975
12985	NC_021812	ATT	2	6	631737	631742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525826976
12986	NC_021812	TCG	2	6	631752	631757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826976
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12991	NC_021812	CCGT	2	8	631917	631924	0 %	25 %	25 %	50 %	525826976
12992	NC_021812	GT	3	6	631947	631952	0 %	50 %	50 %	0 %	525826976
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