MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Heidelberg str. CFSAN002069

Total Repeats: 100993

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_021812	AGA	2	6	583085	583090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525826937
12003	NC_021812	CAA	2	6	583140	583145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525826937
12004	NC_021812	CAA	2	6	583158	583163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525826937
12005	NC_021812	ATT	2	6	583166	583171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525826937
12006	NC_021812	CGA	2	6	583293	583298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826937
12007	NC_021812	A	6	6	583393	583398	100 %	0 %	0 %	0 %	525826937
12008	NC_021812	CGC	2	6	583517	583522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826937
12009	NC_021812	GTC	2	6	583528	583533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826937
12010	NC_021812	GAAG	2	8	583539	583546	50 %	0 %	50 %	0 %	525826937
12011	NC_021812	TGGA	2	8	583558	583565	25 %	25 %	50 %	0 %	525826937
12012	NC_021812	GC	3	6	583604	583609	0 %	0 %	50 %	50 %	525826937
12013	NC_021812	CTG	2	6	583627	583632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826937
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12015	NC_021812	GGC	2	6	583689	583694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826937
12016	NC_021812	TAT	2	6	583813	583818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525826937
12017	NC_021812	AACGT	2	10	583875	583884	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
12018	NC_021812	CAA	2	6	583947	583952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525826938
12019	NC_021812	TGGCT	2	10	584012	584021	0 %	40 %	40 %	20 %	525826938
12020	NC_021812	ACCAC	2	10	584178	584187	40 %	0 %	0 %	60 %	525826938
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12023	NC_021812	TTCCA	2	10	584252	584261	20 %	40 %	0 %	40 %	525826938
12024	NC_021812	ATGA	2	8	584311	584318	50 %	25 %	25 %	0 %	525826938
12025	NC_021812	CG	3	6	584332	584337	0 %	0 %	50 %	50 %	525826938
12026	NC_021812	CTT	2	6	584391	584396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525826938
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12031	NC_021812	CAT	2	6	584632	584637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826938
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12034	NC_021812	T	7	7	584755	584761	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12035	NC_021812	A	6	6	584780	584785	100 %	0 %	0 %	0 %	525826939
12036	NC_021812	GCA	2	6	584786	584791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826939
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12042	NC_021812	CGG	2	6	585149	585154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826939
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12054	NC_021812	ATC	2	6	586146	586151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826940
12055	NC_021812	TCACC	2	10	586216	586225	20 %	20 %	0 %	60 %	525826940
12056	NC_021812	CTG	2	6	586310	586315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826940
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12058	NC_021812	AGC	2	6	586410	586415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826940
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12061	NC_021812	GCT	3	9	586573	586581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826940
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12063	NC_021812	CT	3	6	586632	586637	0 %	50 %	0 %	50 %	525826940
12064	NC_021812	CGGCG	2	10	586661	586670	0 %	0 %	60 %	40 %	525826940
12065	NC_021812	ACC	2	6	586761	586766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525826940
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12094	NC_021812	CAT	2	6	587906	587911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826942
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12102	NC_021812	CTGG	2	8	588329	588336	0 %	25 %	50 %	25 %	525826942
12103	NC_021812	GCT	2	6	588394	588399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826942
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12105	NC_021812	CGT	2	6	588548	588553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826942
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12117	NC_021812	GCG	2	6	589144	589149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12118	NC_021812	AAC	2	6	589189	589194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525826943
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12121	NC_021812	CCGGT	2	10	589294	589303	0 %	20 %	40 %	40 %	525826943
12122	NC_021812	ATG	2	6	589345	589350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826943
12123	NC_021812	GCG	2	6	589486	589491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826943
12124	NC_021812	TGA	2	6	589564	589569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826943
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12126	NC_021812	GC	4	8	589601	589608	0 %	0 %	50 %	50 %	525826943
12127	NC_021812	ACGCG	2	10	589663	589672	20 %	0 %	40 %	40 %	525826943
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12188	NC_021812	ATA	2	6	592750	592755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12216	NC_021812	CTTT	2	8	593785	593792	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12217	NC_021812	T	7	7	593790	593796	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12218	NC_021812	CTTA	2	8	593834	593841	25 %	50 %	0 %	25 %	525826945
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12224	NC_021812	TTAAC	2	10	594131	594140	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
12225	NC_021812	TA	3	6	594204	594209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12226	NC_021812	ATTT	2	8	594247	594254	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12227	NC_021812	GTTT	2	8	594284	594291	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
12228	NC_021812	AG	3	6	594299	594304	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12229	NC_021812	CAT	2	6	594330	594335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826946
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12232	NC_021812	GCA	2	6	594432	594437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826946
12233	NC_021812	CT	3	6	594497	594502	0 %	50 %	0 %	50 %	525826946
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12236	NC_021812	GGCT	2	8	594675	594682	0 %	25 %	50 %	25 %	525826946
12237	NC_021812	CGC	2	6	594711	594716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826946
12238	NC_021812	CTC	2	6	594717	594722	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525826946
12239	NC_021812	CACGC	2	10	594749	594758	20 %	0 %	20 %	60 %	525826946
12240	NC_021812	AT	3	6	594849	594854	50 %	50 %	0 %	0 %	525826946
12241	NC_021812	AAC	2	6	594908	594913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525826946
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12243	NC_021812	A	8	8	594987	594994	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12359	NC_021812	CG	3	6	600453	600458	0 %	0 %	50 %	50 %	525826952
12360	NC_021812	TACGC	2	10	600467	600476	20 %	20 %	20 %	40 %	525826952
12361	NC_021812	CG	3	6	600507	600512	0 %	0 %	50 %	50 %	525826952
12362	NC_021812	GGC	2	6	600612	600617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826952
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12364	NC_021812	AGC	3	9	600711	600719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826952
12365	NC_021812	GCGG	2	8	600789	600796	0 %	0 %	75 %	25 %	525826953
12366	NC_021812	CCT	2	6	600828	600833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525826953
12367	NC_021812	CGC	2	6	600907	600912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826953
12368	NC_021812	ATC	2	6	600920	600925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826953
12369	NC_021812	CCG	2	6	600948	600953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826953
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12372	NC_021812	AAT	2	6	601084	601089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826953
12373	NC_021812	TCT	2	6	601106	601111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525826953
12374	NC_021812	ACG	2	6	601115	601120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826953
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12376	NC_021812	TTA	2	6	601228	601233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12377	NC_021812	A	6	6	601392	601397	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12378	NC_021812	CAAG	2	8	601440	601447	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12379	NC_021812	CCG	2	6	601474	601479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826954
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12381	NC_021812	TGCC	2	8	601545	601552	0 %	25 %	25 %	50 %	525826954
12382	NC_021812	CGA	2	6	601590	601595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826954
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12387	NC_021812	GGT	2	6	601927	601932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525826954
12388	NC_021812	TGA	2	6	601950	601955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826954
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12392	NC_021812	CTGG	2	8	602149	602156	0 %	25 %	50 %	25 %	525826954
12393	NC_021812	A	6	6	602247	602252	100 %	0 %	0 %	0 %	525826954
12394	NC_021812	GCA	2	6	602304	602309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826954
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12407	NC_021812	CGG	3	9	603385	603393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826954
12408	NC_021812	ACG	2	6	603428	603433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826954
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12411	NC_021812	CAT	2	6	603704	603709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12441	NC_021812	CAGC	2	8	605030	605037	25 %	0 %	25 %	50 %	525826955
12442	NC_021812	CAG	2	6	605060	605065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826955
12443	NC_021812	GCA	2	6	605095	605100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826955
12444	NC_021812	G	6	6	605204	605209	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12445	NC_021812	GGACA	2	10	605223	605232	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
12446	NC_021812	TATT	2	8	605247	605254	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12447	NC_021812	AAAT	2	8	605265	605272	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12448	NC_021812	TTTG	2	8	605282	605289	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
12449	NC_021812	TTA	2	6	605414	605419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12450	NC_021812	A	7	7	605432	605438	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12451	NC_021812	TGA	2	6	605453	605458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826956
12452	NC_021812	GGT	2	6	605501	605506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525826956
12453	NC_021812	TTC	2	6	605519	605524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525826956
12454	NC_021812	AT	3	6	605550	605555	50 %	50 %	0 %	0 %	525826956
12455	NC_021812	TAA	2	6	605639	605644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826956
12456	NC_021812	GC	3	6	605663	605668	0 %	0 %	50 %	50 %	525826956
12457	NC_021812	CAA	2	6	605738	605743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525826956
12458	NC_021812	GCCG	2	8	605747	605754	0 %	0 %	50 %	50 %	525826956
12459	NC_021812	TCT	2	6	605763	605768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525826956
12460	NC_021812	GTA	2	6	605779	605784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826956
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12469	NC_021812	AGG	2	6	605994	605999	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525826956
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12471	NC_021812	CGC	2	6	606046	606051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826956
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12473	NC_021812	CGT	2	6	606113	606118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826956
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12475	NC_021812	TC	4	8	606246	606253	0 %	50 %	0 %	50 %	525826957
12476	NC_021812	CAA	2	6	606270	606275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525826957
12477	NC_021812	CAA	2	6	606434	606439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525826957
12478	NC_021812	ACG	2	6	606467	606472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826957
12479	NC_021812	CAG	2	6	606501	606506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826957
12480	NC_021812	GCCA	2	8	606511	606518	25 %	0 %	25 %	50 %	525826957
12481	NC_021812	GC	3	6	606525	606530	0 %	0 %	50 %	50 %	525826957
12482	NC_021812	TAA	2	6	606558	606563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826957
12483	NC_021812	CAGCGC	2	12	606645	606656	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	525826957
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12485	NC_021812	CGG	2	6	606756	606761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826957
12486	NC_021812	GAT	2	6	606767	606772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826957
12487	NC_021812	CGG	2	6	606849	606854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826957
12488	NC_021812	GCG	2	6	606886	606891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826957
12489	NC_021812	CAC	2	6	606921	606926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525826957
12490	NC_021812	CGC	2	6	606932	606937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826957
12491	NC_021812	GCT	2	6	606996	607001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826957
12492	NC_021812	GCT	2	6	607100	607105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826957
12493	NC_021812	TCG	2	6	607144	607149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826957
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12498	NC_021812	GTCAG	2	10	607488	607497	20 %	20 %	40 %	20 %	525826958
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12500	NC_021812	GA	3	6	607584	607589	50 %	0 %	50 %	0 %	525826958

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