MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Heidelberg str. CFSAN002069

Total Repeats: 100993

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11502	NC_021812	AG	3	6	557913	557918	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11503	NC_021812	CAGG	2	8	557925	557932	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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11505	NC_021812	CTTC	2	8	558068	558075	0 %	50 %	0 %	50 %	525826919
11506	NC_021812	CGA	3	9	558087	558095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826919
11507	NC_021812	CTGT	2	8	558352	558359	0 %	50 %	25 %	25 %	525826919
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11512	NC_021812	TAC	2	6	558581	558586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11513	NC_021812	TTA	2	6	558587	558592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11514	NC_021812	GT	3	6	558599	558604	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11515	NC_021812	AAT	2	6	558670	558675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11516	NC_021812	TAC	2	6	558721	558726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11517	NC_021812	AT	4	8	558811	558818	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11519	NC_021812	CAA	2	6	558871	558876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11520	NC_021812	A	6	6	558891	558896	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11523	NC_021812	ACA	2	6	559120	559125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11525	NC_021812	AGAAT	2	10	559143	559152	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11526	NC_021812	AG	3	6	559190	559195	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11527	NC_021812	A	7	7	559208	559214	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11529	NC_021812	A	6	6	559246	559251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11531	NC_021812	A	6	6	559307	559312	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11532	NC_021812	TA	4	8	559358	559365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11537	NC_021812	CAT	2	6	559469	559474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11549	NC_021812	TTTG	2	8	559768	559775	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11550	NC_021812	TCA	2	6	559831	559836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826920
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11554	NC_021812	AT	3	6	560137	560142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11555	NC_021812	C	6	6	560149	560154	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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11557	NC_021812	ATA	2	6	560203	560208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11558	NC_021812	TA	3	6	560235	560240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11559	NC_021812	TGGC	2	8	560257	560264	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11560	NC_021812	GC	3	6	560266	560271	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11561	NC_021812	TATT	2	8	560374	560381	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11562	NC_021812	TAA	2	6	560389	560394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11563	NC_021812	CCTCT	2	10	560437	560446	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
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11572	NC_021812	TTTAC	2	10	561002	561011	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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11588	NC_021812	A	6	6	561973	561978	100 %	0 %	0 %	0 %	525830178
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11601	NC_021812	A	6	6	562620	562625	100 %	0 %	0 %	0 %	525830178
11602	NC_021812	TTTA	2	8	562754	562761	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11603	NC_021812	TTG	2	6	562827	562832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11604	NC_021812	GC	3	6	562854	562859	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11605	NC_021812	ATG	2	6	562916	562921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11614	NC_021812	A	8	8	563138	563145	100 %	0 %	0 %	0 %	525830179
11615	NC_021812	ATT	2	6	563166	563171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11616	NC_021812	A	8	8	563212	563219	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11617	NC_021812	TGA	2	6	563369	563374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11620	NC_021812	CTG	2	6	563447	563452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11621	NC_021812	CA	3	6	563492	563497	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11622	NC_021812	ATA	2	6	563522	563527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11623	NC_021812	AAG	2	6	563555	563560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11624	NC_021812	ATA	2	6	563601	563606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11625	NC_021812	AATAT	2	10	563615	563624	60 %	40 %	0 %	0 %	525826922
11626	NC_021812	ACAT	2	8	563739	563746	50 %	25 %	0 %	25 %	525826922
11627	NC_021812	TA	3	6	563766	563771	50 %	50 %	0 %	0 %	525826922
11628	NC_021812	A	7	7	563862	563868	100 %	0 %	0 %	0 %	525826922
11629	NC_021812	A	6	6	564003	564008	100 %	0 %	0 %	0 %	525826922
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11631	NC_021812	T	6	6	564274	564279	0 %	100 %	0 %	0 %	525826922
11632	NC_021812	AG	4	8	564281	564288	50 %	0 %	50 %	0 %	525826922
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11641	NC_021812	CTT	2	6	564814	564819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11644	NC_021812	TAA	2	6	564852	564857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11645	NC_021812	A	6	6	564915	564920	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11646	NC_021812	ATA	2	6	564929	564934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11647	NC_021812	A	6	6	564960	564965	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11649	NC_021812	TTA	2	6	564981	564986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11653	NC_021812	TCC	2	6	565130	565135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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11662	NC_021812	TTG	2	6	565710	565715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11745	NC_021812	TATTT	2	10	569988	569997	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11980	NC_021812	GAGAA	2	10	581919	581928	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
11981	NC_021812	A	6	6	581927	581932	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11982	NC_021812	AAG	2	6	581975	581980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11983	NC_021812	TCGG	2	8	581996	582003	0 %	25 %	50 %	25 %	525826936
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11986	NC_021812	GTA	2	6	582295	582300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826936
11987	NC_021812	ATG	2	6	582301	582306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826936
11988	NC_021812	CTG	2	6	582334	582339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826936
11989	NC_021812	CA	3	6	582392	582397	50 %	0 %	0 %	50 %	525826936
11990	NC_021812	GTC	2	6	582421	582426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826936
11991	NC_021812	GGC	2	6	582546	582551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826936
11992	NC_021812	GTA	2	6	582589	582594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826936
11993	NC_021812	TCG	2	6	582598	582603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826936
11994	NC_021812	CCGGG	2	10	582611	582620	0 %	0 %	60 %	40 %	525826936
11995	NC_021812	GCCA	2	8	582730	582737	25 %	0 %	25 %	50 %	525826936
11996	NC_021812	A	6	6	582799	582804	100 %	0 %	0 %	0 %	525826937
11997	NC_021812	CGG	2	6	582824	582829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826937
11998	NC_021812	CTG	2	6	582919	582924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826937
11999	NC_021812	CGAA	2	8	582977	582984	50 %	0 %	25 %	25 %	525826937
12000	NC_021812	GTT	2	6	583033	583038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525826937

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