MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Heidelberg str. CFSAN002069

Total Repeats: 100993

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10622	NC_021812	CGC	2	6	513767	513772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826881
10623	NC_021812	CTG	2	6	513775	513780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826881
10624	NC_021812	TCA	2	6	513818	513823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826881
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10646	NC_021812	GGCA	2	8	514819	514826	25 %	0 %	50 %	25 %	525826882
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10648	NC_021812	GCCA	2	8	514882	514889	25 %	0 %	25 %	50 %	525826882
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10689	NC_021812	CGC	2	6	516797	516802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826884
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10723	NC_021812	CGG	2	6	518033	518038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826885
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10742	NC_021812	GAT	2	6	519009	519014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826885
10743	NC_021812	A	6	6	519016	519021	100 %	0 %	0 %	0 %	525826885
10744	NC_021812	CGA	2	6	519025	519030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10745	NC_021812	TTA	2	6	519059	519064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525826886
10746	NC_021812	CGG	2	6	519094	519099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826886
10747	NC_021812	GCTG	2	8	519103	519110	0 %	25 %	50 %	25 %	525826886
10748	NC_021812	GCA	2	6	519211	519216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826886
10749	NC_021812	GCCA	2	8	519227	519234	25 %	0 %	25 %	50 %	525826886
10750	NC_021812	CGGCG	2	10	519319	519328	0 %	0 %	60 %	40 %	525826886
10751	NC_021812	TGAT	2	8	519390	519397	25 %	50 %	25 %	0 %	525826886
10752	NC_021812	T	6	6	519410	519415	0 %	100 %	0 %	0 %	525826886
10753	NC_021812	GGC	3	9	519628	519636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826886
10754	NC_021812	GTATC	2	10	519709	519718	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
10755	NC_021812	ACGTC	2	10	519772	519781	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
10756	NC_021812	GCTG	2	8	519852	519859	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10757	NC_021812	AAT	2	6	519892	519897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10758	NC_021812	GCA	2	6	519971	519976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10759	NC_021812	ACC	2	6	520015	520020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10760	NC_021812	GCT	3	9	520108	520116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826887
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10762	NC_021812	ATCG	2	8	520145	520152	25 %	25 %	25 %	25 %	525826887
10763	NC_021812	TTTC	2	8	520213	520220	0 %	75 %	0 %	25 %	525826887
10764	NC_021812	ACGCC	2	10	520234	520243	20 %	0 %	20 %	60 %	525826887
10765	NC_021812	CGG	2	6	520267	520272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826887
10766	NC_021812	TCA	2	6	520317	520322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826887
10767	NC_021812	ATG	2	6	520329	520334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826887
10768	NC_021812	AAT	2	6	520350	520355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10769	NC_021812	T	6	6	520367	520372	0 %	100 %	0 %	0 %	525830164
10770	NC_021812	GCG	2	6	520629	520634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525830164
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10772	NC_021812	T	6	6	520747	520752	0 %	100 %	0 %	0 %	525830164
10773	NC_021812	TTC	2	6	520759	520764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525830164
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10775	NC_021812	GGC	2	6	520890	520895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10776	NC_021812	ATT	2	6	520919	520924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10777	NC_021812	GCG	2	6	520951	520956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10778	NC_021812	GATT	2	8	521022	521029	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10779	NC_021812	TGG	2	6	521116	521121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10780	NC_021812	AT	3	6	521123	521128	50 %	50 %	0 %	0 %	525826888
10781	NC_021812	TGC	2	6	521183	521188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826888
10782	NC_021812	A	7	7	521334	521340	100 %	0 %	0 %	0 %	525826888
10783	NC_021812	CTGA	2	8	521427	521434	25 %	25 %	25 %	25 %	525826888
10784	NC_021812	CG	3	6	521441	521446	0 %	0 %	50 %	50 %	525826888
10785	NC_021812	A	6	6	521469	521474	100 %	0 %	0 %	0 %	525826888
10786	NC_021812	ACA	2	6	521500	521505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525826888
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10792	NC_021812	CAT	2	6	521735	521740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826888
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10798	NC_021812	GCT	2	6	521898	521903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826888
10799	NC_021812	GCT	2	6	521910	521915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826888
10800	NC_021812	GAC	2	6	521955	521960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826888
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10803	NC_021812	GT	3	6	522209	522214	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10804	NC_021812	GTT	2	6	522307	522312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525830165
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10809	NC_021812	TGA	2	6	522525	522530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826889
10810	NC_021812	TCG	2	6	522542	522547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826889
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10832	NC_021812	GAT	2	6	523787	523792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525830166
10833	NC_021812	ATAG	2	8	523961	523968	50 %	25 %	25 %	0 %	525830166
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10839	NC_021812	CG	3	6	524175	524180	0 %	0 %	50 %	50 %	525830166
10840	NC_021812	CG	3	6	524211	524216	0 %	0 %	50 %	50 %	525830166
10841	NC_021812	ACGTT	2	10	524273	524282	20 %	40 %	20 %	20 %	525830166
10842	NC_021812	ATTTC	2	10	524291	524300	20 %	60 %	0 %	20 %	525830166
10843	NC_021812	CAT	2	6	524363	524368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10844	NC_021812	CGA	2	6	524423	524428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826890
10845	NC_021812	GCG	2	6	524443	524448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826890
10846	NC_021812	TAA	2	6	524463	524468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826890
10847	NC_021812	CGC	2	6	524546	524551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826890
10848	NC_021812	CCG	2	6	524581	524586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826890
10849	NC_021812	CTG	3	9	524652	524660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826890
10850	NC_021812	GCC	2	6	524671	524676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826890
10851	NC_021812	TCT	2	6	524680	524685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525826890
10852	NC_021812	TGC	2	6	524695	524700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826890
10853	NC_021812	CCA	2	6	524765	524770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525826890
10854	NC_021812	AAGT	2	8	524835	524842	50 %	25 %	25 %	0 %	525826890
10855	NC_021812	C	6	6	524915	524920	0 %	0 %	0 %	100 %	525826890
10856	NC_021812	CAA	2	6	525014	525019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525826890
10857	NC_021812	A	6	6	525061	525066	100 %	0 %	0 %	0 %	525826890
10858	NC_021812	CAT	2	6	525098	525103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826890
10859	NC_021812	CAT	2	6	525131	525136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826890
10860	NC_021812	CGCC	2	8	525180	525187	0 %	0 %	25 %	75 %	525826890
10861	NC_021812	TGC	2	6	525259	525264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826890
10862	NC_021812	AAAG	2	8	525267	525274	75 %	0 %	25 %	0 %	525826890
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10864	NC_021812	TGC	2	6	525349	525354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826890
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10989	NC_021812	TACT	2	8	531990	531997	25 %	50 %	0 %	25 %	525826893
10990	NC_021812	ATTG	2	8	532176	532183	25 %	50 %	25 %	0 %	525826893
10991	NC_021812	CGG	2	6	532301	532306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826893
10992	NC_021812	TAT	2	6	532319	532324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525826893
10993	NC_021812	TTG	2	6	532327	532332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525826893
10994	NC_021812	CGG	2	6	532339	532344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826893
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