MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Heidelberg str. CFSAN002069

Total Repeats: 100993

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_021812	T	6	6	484383	484388	0 %	100 %	0 %	0 %	525826854
10002	NC_021812	ATC	2	6	484401	484406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826854
10003	NC_021812	ATC	2	6	484425	484430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826854
10004	NC_021812	GGC	3	9	484431	484439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826854
10005	NC_021812	TA	3	6	484507	484512	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10006	NC_021812	A	6	6	484527	484532	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10007	NC_021812	ACG	2	6	484539	484544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10008	NC_021812	AAG	2	6	484603	484608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10009	NC_021812	CAAT	2	8	484624	484631	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10010	NC_021812	T	6	6	484642	484647	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10011	NC_021812	CATT	2	8	484668	484675	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10012	NC_021812	TA	3	6	484680	484685	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10013	NC_021812	CTT	2	6	484699	484704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10014	NC_021812	TAAA	2	8	484705	484712	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10015	NC_021812	AGG	2	6	484783	484788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10016	NC_021812	CT	3	6	484826	484831	0 %	50 %	0 %	50 %	525826855
10017	NC_021812	CAA	2	6	484840	484845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525826855
10018	NC_021812	CGC	2	6	484849	484854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826855
10019	NC_021812	CGG	3	9	484904	484912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826855
10020	NC_021812	TCGC	2	8	484924	484931	0 %	25 %	25 %	50 %	525826855
10021	NC_021812	GGC	2	6	484947	484952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826855
10022	NC_021812	GGC	2	6	484977	484982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826855
10023	NC_021812	ACT	2	6	485006	485011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826855
10024	NC_021812	TGA	2	6	485015	485020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826855
10025	NC_021812	CACGTC	2	12	485073	485084	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	525826855
10026	NC_021812	GCG	2	6	485092	485097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826855
10027	NC_021812	GAA	2	6	485157	485162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525826855
10028	NC_021812	CCG	2	6	485254	485259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826855
10029	NC_021812	ATT	2	6	485283	485288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525826855
10030	NC_021812	CCG	2	6	485311	485316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826855
10031	NC_021812	AACCT	2	10	485347	485356	40 %	20 %	0 %	40 %	525826855
10032	NC_021812	TGA	2	6	485399	485404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826855
10033	NC_021812	TC	3	6	485461	485466	0 %	50 %	0 %	50 %	525826855
10034	NC_021812	GTT	2	6	485514	485519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525826855
10035	NC_021812	GGC	2	6	485633	485638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826855
10036	NC_021812	TCAA	2	8	485656	485663	50 %	25 %	0 %	25 %	525826855
10037	NC_021812	A	6	6	485695	485700	100 %	0 %	0 %	0 %	525826855
10038	NC_021812	AAT	2	6	485722	485727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826855
10039	NC_021812	C	6	6	485733	485738	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10040	NC_021812	GCG	2	6	485771	485776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10041	NC_021812	CCG	2	6	485780	485785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10042	NC_021812	GTTAT	2	10	485844	485853	20 %	60 %	20 %	0 %	525826856
10043	NC_021812	T	6	6	485923	485928	0 %	100 %	0 %	0 %	525826856
10044	NC_021812	TGA	2	6	486007	486012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826856
10045	NC_021812	CGC	2	6	486123	486128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10046	NC_021812	T	6	6	486158	486163	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10047	NC_021812	GA	3	6	486209	486214	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10048	NC_021812	GTC	2	6	486235	486240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826857
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10050	NC_021812	GCT	2	6	486407	486412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826857
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10052	NC_021812	CGCCC	2	10	486499	486508	0 %	0 %	20 %	80 %	525826857
10053	NC_021812	GC	3	6	486549	486554	0 %	0 %	50 %	50 %	525826857
10054	NC_021812	CT	3	6	486606	486611	0 %	50 %	0 %	50 %	525826857
10055	NC_021812	CGC	2	6	486616	486621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826857
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10057	NC_021812	TGGC	2	8	486674	486681	0 %	25 %	50 %	25 %	525826857
10058	NC_021812	TTG	2	6	486733	486738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525826857
10059	NC_021812	GC	3	6	486814	486819	0 %	0 %	50 %	50 %	525826857
10060	NC_021812	ATG	2	6	486925	486930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826857
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10062	NC_021812	GCT	2	6	487064	487069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826857
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10064	NC_021812	ATA	2	6	487165	487170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525830162
10065	NC_021812	ATGGT	2	10	487210	487219	20 %	40 %	40 %	0 %	525830162
10066	NC_021812	CAC	2	6	487224	487229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525830162
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10068	NC_021812	GGC	2	6	487328	487333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525830162
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10070	NC_021812	CAT	2	6	487476	487481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525830162
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10073	NC_021812	ACCC	2	8	487603	487610	25 %	0 %	0 %	75 %	525830162
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10083	NC_021812	CGC	2	6	488156	488161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826858
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10087	NC_021812	CAG	2	6	488381	488386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826858
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10093	NC_021812	TGG	2	6	488715	488720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525826859
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10098	NC_021812	CTG	2	6	488856	488861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826859
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10101	NC_021812	GCCT	2	8	489028	489035	0 %	25 %	25 %	50 %	525826859
10102	NC_021812	GTT	2	6	489086	489091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525826859
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10105	NC_021812	GATT	2	8	489203	489210	25 %	50 %	25 %	0 %	525826859
10106	NC_021812	CCATT	2	10	489245	489254	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
10107	NC_021812	ATA	2	6	489323	489328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10108	NC_021812	A	7	7	489328	489334	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10109	NC_021812	CTG	2	6	489391	489396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826860
10110	NC_021812	A	6	6	489439	489444	100 %	0 %	0 %	0 %	525826860
10111	NC_021812	GCT	2	6	489681	489686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826860
10112	NC_021812	TAC	2	6	489690	489695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826860
10113	NC_021812	TGG	2	6	489710	489715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525826860
10114	NC_021812	CGG	2	6	489746	489751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826860
10115	NC_021812	GCG	2	6	489767	489772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826860
10116	NC_021812	CG	3	6	489780	489785	0 %	0 %	50 %	50 %	525826860
10117	NC_021812	TAT	2	6	489906	489911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525826860
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10119	NC_021812	CGC	2	6	489927	489932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826860
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10122	NC_021812	TTG	2	6	489995	490000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525826860
10123	NC_021812	TGA	2	6	490025	490030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826860
10124	NC_021812	TGA	2	6	490079	490084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826860
10125	NC_021812	CAT	2	6	490116	490121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826860
10126	NC_021812	TTCCA	2	10	490281	490290	20 %	40 %	0 %	40 %	525826860
10127	NC_021812	CGC	2	6	490312	490317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826860
10128	NC_021812	TGC	2	6	490347	490352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826860
10129	NC_021812	TGG	2	6	490472	490477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525826860
10130	NC_021812	CGG	2	6	490496	490501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826860
10131	NC_021812	GGC	3	9	490516	490524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826860
10132	NC_021812	CGC	2	6	490533	490538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826860
10133	NC_021812	TGC	2	6	490547	490552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826860
10134	NC_021812	TTGA	2	8	490606	490613	25 %	50 %	25 %	0 %	525826860
10135	NC_021812	CCAG	2	8	490667	490674	25 %	0 %	25 %	50 %	525826860
10136	NC_021812	GAA	2	6	490711	490716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525826860
10137	NC_021812	ATA	2	6	490737	490742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826860
10138	NC_021812	ACG	2	6	490772	490777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10139	NC_021812	TGTC	2	8	490793	490800	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10140	NC_021812	GTTTT	2	10	490829	490838	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
10141	NC_021812	T	6	6	490835	490840	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10142	NC_021812	GGCG	2	8	490911	490918	0 %	0 %	75 %	25 %	525826861
10143	NC_021812	CGG	2	6	491013	491018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826861
10144	NC_021812	TAA	2	6	491045	491050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826861
10145	NC_021812	TCA	2	6	491078	491083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826861
10146	NC_021812	TAC	2	6	491175	491180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10147	NC_021812	GC	3	6	491199	491204	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10148	NC_021812	CG	3	6	491313	491318	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10149	NC_021812	ACT	2	6	491403	491408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10150	NC_021812	TGA	2	6	491425	491430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10151	NC_021812	C	6	6	491468	491473	0 %	0 %	0 %	100 %	525826862
10152	NC_021812	CGC	2	6	491567	491572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826862
10153	NC_021812	GC	3	6	491576	491581	0 %	0 %	50 %	50 %	525826862
10154	NC_021812	ACC	2	6	491680	491685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525826862
10155	NC_021812	CGA	2	6	491706	491711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826862
10156	NC_021812	GCG	2	6	491951	491956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826862
10157	NC_021812	CTG	2	6	491963	491968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826862
10158	NC_021812	TCG	2	6	492032	492037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826862
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10161	NC_021812	GC	3	6	492140	492145	0 %	0 %	50 %	50 %	525826862
10162	NC_021812	CCG	2	6	492393	492398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826862
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10165	NC_021812	GGGC	2	8	492708	492715	0 %	0 %	75 %	25 %	525826862
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10168	NC_021812	CGC	2	6	492857	492862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826862
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10174	NC_021812	GGT	2	6	493065	493070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525826862
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10182	NC_021812	GCG	2	6	493472	493477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826862
10183	NC_021812	CTA	2	6	493485	493490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826862
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10188	NC_021812	GGC	2	6	493647	493652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826862
10189	NC_021812	A	6	6	493707	493712	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10190	NC_021812	GCG	2	6	493714	493719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10191	NC_021812	CAGTT	2	10	493823	493832	20 %	40 %	20 %	20 %	525826863
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10194	NC_021812	CTC	2	6	493912	493917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525826863
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10197	NC_021812	TCG	2	6	494022	494027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826863
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10201	NC_021812	CAAAA	2	10	494312	494321	80 %	0 %	0 %	20 %	525826863
10202	NC_021812	GCAG	2	8	494340	494347	25 %	0 %	50 %	25 %	525826863
10203	NC_021812	CGT	2	6	494399	494404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826863
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10219	NC_021812	AATC	2	8	495128	495135	50 %	25 %	0 %	25 %	525826864
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10221	NC_021812	ACGCC	2	10	495193	495202	20 %	0 %	20 %	60 %	525826864
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10223	NC_021812	TCATTC	2	12	495297	495308	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	525826864
10224	NC_021812	T	6	6	495371	495376	0 %	100 %	0 %	0 %	525826864
10225	NC_021812	CCG	2	6	495415	495420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826864
10226	NC_021812	TTC	2	6	495458	495463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525826864
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10228	NC_021812	TAAA	2	8	495511	495518	75 %	25 %	0 %	0 %	525826864
10229	NC_021812	ATCA	2	8	495692	495699	50 %	25 %	0 %	25 %	525826864
10230	NC_021812	ATAA	2	8	495716	495723	75 %	25 %	0 %	0 %	525826864
10231	NC_021812	TAA	2	6	495796	495801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826864
10232	NC_021812	GCT	2	6	495827	495832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826864
10233	NC_021812	CCA	2	6	495837	495842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525826864
10234	NC_021812	GAC	2	6	495848	495853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826864
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10236	NC_021812	TCT	2	6	496052	496057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525826865
10237	NC_021812	TAA	2	6	496067	496072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826865
10238	NC_021812	TAA	2	6	496198	496203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826865
10239	NC_021812	GC	3	6	496213	496218	0 %	0 %	50 %	50 %	525826865
10240	NC_021812	ATC	2	6	496332	496337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826865
10241	NC_021812	TATAA	2	10	496374	496383	60 %	40 %	0 %	0 %	525826865
10242	NC_021812	CAC	2	6	496389	496394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525826865
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10368	NC_021812	GCA	2	6	501783	501788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826872
10369	NC_021812	CTT	2	6	501799	501804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525826872
10370	NC_021812	CTC	2	6	501827	501832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525826872
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10385	NC_021812	AAC	2	6	502354	502359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10386	NC_021812	A	6	6	502379	502384	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10388	NC_021812	A	7	7	502407	502413	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10389	NC_021812	ACA	2	6	502446	502451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10390	NC_021812	GCA	2	6	502486	502491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10392	NC_021812	AAT	2	6	502520	502525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10393	NC_021812	ATC	2	6	502553	502558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10481	NC_021812	A	7	7	506852	506858	100 %	0 %	0 %	0 %	525826875
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10489	NC_021812	CCG	2	6	507190	507195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826875
10490	NC_021812	ATAC	2	8	507227	507234	50 %	25 %	0 %	25 %	525826875
10491	NC_021812	GC	3	6	507275	507280	0 %	0 %	50 %	50 %	525826875
10492	NC_021812	GCC	2	6	507292	507297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826875
10493	NC_021812	GCC	3	9	507330	507338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826875
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10499	NC_021812	CA	3	6	507596	507601	50 %	0 %	0 %	50 %	525826876
10500	NC_021812	TGA	2	6	507724	507729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826876

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