MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Heidelberg str. CFSAN002069

Total Repeats: 100993

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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96002	NC_021812	CGA	2	6	4549856	4549861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525829868
96003	NC_021812	GCG	2	6	4549946	4549951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525829868
96004	NC_021812	CCA	2	6	4550054	4550059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525829868
96005	NC_021812	GCA	2	6	4550096	4550101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525829868
96006	NC_021812	T	8	8	4550106	4550113	0 %	100 %	0 %	0 %	525829868
96007	NC_021812	GATGG	2	10	4550118	4550127	20 %	20 %	60 %	0 %	525829868
96008	NC_021812	TCG	2	6	4550212	4550217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525829868
96009	NC_021812	GAAT	2	8	4550280	4550287	50 %	25 %	25 %	0 %	525830867
96010	NC_021812	GGAGGG	2	12	4550441	4550452	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	525830867
96011	NC_021812	CCA	2	6	4550503	4550508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525830867
96012	NC_021812	GGT	2	6	4550540	4550545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525830867
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96022	NC_021812	TTA	2	6	4551087	4551092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525829870
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96027	NC_021812	CAG	2	6	4551308	4551313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525829870
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96035	NC_021812	GC	3	6	4551655	4551660	0 %	0 %	50 %	50 %	525829871
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96102	NC_021812	CGA	2	6	4554584	4554589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525829874
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96112	NC_021812	GGA	2	6	4555026	4555031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525829874
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96114	NC_021812	GC	3	6	4555068	4555073	0 %	0 %	50 %	50 %	525829874
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96232	NC_021812	GCG	2	6	4561244	4561249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525829878
96233	NC_021812	GCG	2	6	4561307	4561312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525829878
96234	NC_021812	TCA	2	6	4561320	4561325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525829878
96235	NC_021812	GGC	2	6	4561419	4561424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525829878
96236	NC_021812	ACT	2	6	4561457	4561462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525829878
96237	NC_021812	CCG	2	6	4561484	4561489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525829878
96238	NC_021812	GGC	2	6	4561540	4561545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525829878
96239	NC_021812	GCA	2	6	4561611	4561616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525829878
96240	NC_021812	CTGG	2	8	4561617	4561624	0 %	25 %	50 %	25 %	525829878
96241	NC_021812	CGG	2	6	4561625	4561630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525829878
96242	NC_021812	TAT	2	6	4561640	4561645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525829878
96243	NC_021812	ATC	2	6	4561686	4561691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525829879
96244	NC_021812	GGC	3	9	4561800	4561808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525829879
96245	NC_021812	GGTTGT	2	12	4561817	4561828	0 %	50 %	50 %	0 %	525829879
96246	NC_021812	CTGGCG	2	12	4561860	4561871	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	525829879
96247	NC_021812	GAT	2	6	4561913	4561918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525829879
96248	NC_021812	CT	3	6	4561940	4561945	0 %	50 %	0 %	50 %	525829879
96249	NC_021812	CGCGC	2	10	4561950	4561959	0 %	0 %	40 %	60 %	525829879
96250	NC_021812	AGG	2	6	4561960	4561965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525829879
96251	NC_021812	TCG	2	6	4562023	4562028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525829879
96252	NC_021812	CAGC	2	8	4562049	4562056	25 %	0 %	25 %	50 %	525829879
96253	NC_021812	GTG	2	6	4562073	4562078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525829879
96254	NC_021812	CGC	2	6	4562116	4562121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525829879
96255	NC_021812	CGG	2	6	4562138	4562143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525829879
96256	NC_021812	CGC	2	6	4562146	4562151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525829879
96257	NC_021812	TGG	2	6	4562191	4562196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525829879
96258	NC_021812	GAC	2	6	4562247	4562252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525829879
96259	NC_021812	GCTG	2	8	4562281	4562288	0 %	25 %	50 %	25 %	525829879
96260	NC_021812	GGCG	2	8	4562329	4562336	0 %	0 %	75 %	25 %	525829879
96261	NC_021812	TGGC	2	8	4562345	4562352	0 %	25 %	50 %	25 %	525829879
96262	NC_021812	GT	3	6	4562399	4562404	0 %	50 %	50 %	0 %	525829879
96263	NC_021812	CGG	2	6	4562429	4562434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525829879
96264	NC_021812	ACT	2	6	4562443	4562448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525829879
96265	NC_021812	CGATT	2	10	4562521	4562530	20 %	40 %	20 %	20 %	525829879
96266	NC_021812	CTGGCG	2	12	4562550	4562561	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	525829879
96267	NC_021812	GCG	2	6	4562571	4562576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525829879
96268	NC_021812	GAC	2	6	4562605	4562610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96269	NC_021812	CAG	2	6	4562626	4562631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525829880
96270	NC_021812	ATT	2	6	4562662	4562667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525829880
96271	NC_021812	ATT	2	6	4562674	4562679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525829880
96272	NC_021812	ACC	2	6	4562749	4562754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525829880
96273	NC_021812	CTGG	2	8	4562766	4562773	0 %	25 %	50 %	25 %	525829880
96274	NC_021812	ATT	2	6	4562836	4562841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525829880
96275	NC_021812	TAA	2	6	4562874	4562879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525829880
96276	NC_021812	GGC	2	6	4562899	4562904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525829880
96277	NC_021812	CG	3	6	4562930	4562935	0 %	0 %	50 %	50 %	525829880
96278	NC_021812	GC	3	6	4562940	4562945	0 %	0 %	50 %	50 %	525829880
96279	NC_021812	GCC	2	6	4562977	4562982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525829880
96280	NC_021812	GAG	3	9	4563001	4563009	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525829880
96281	NC_021812	GCG	2	6	4563083	4563088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525829880
96282	NC_021812	TGG	2	6	4563089	4563094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525829880
96283	NC_021812	CGGCG	2	10	4563114	4563123	0 %	0 %	60 %	40 %	525829880
96284	NC_021812	GGC	2	6	4563184	4563189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525829880
96285	NC_021812	GCT	2	6	4563219	4563224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525829880
96286	NC_021812	ATC	2	6	4563227	4563232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525829880
96287	NC_021812	TGA	2	6	4563244	4563249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525829880
96288	NC_021812	CTTT	2	8	4563255	4563262	0 %	75 %	0 %	25 %	525829881
96289	NC_021812	CAC	2	6	4563279	4563284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525829881
96290	NC_021812	ACC	2	6	4563309	4563314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525829881
96291	NC_021812	CGG	3	9	4563328	4563336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525829881
96292	NC_021812	CGC	2	6	4563344	4563349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525829881
96293	NC_021812	TCA	2	6	4563377	4563382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525829881
96294	NC_021812	CGC	2	6	4563433	4563438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525829881
96295	NC_021812	CAG	2	6	4563450	4563455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525829881
96296	NC_021812	GGC	2	6	4563480	4563485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525829881
96297	NC_021812	GAT	2	6	4563486	4563491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525829881
96298	NC_021812	CACG	2	8	4563500	4563507	25 %	0 %	25 %	50 %	525829881
96299	NC_021812	GGC	2	6	4563564	4563569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525829881
96300	NC_021812	GCC	2	6	4563621	4563626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525829881
96301	NC_021812	CGC	2	6	4563637	4563642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525829881
96302	NC_021812	A	6	6	4563736	4563741	100 %	0 %	0 %	0 %	525829881
96303	NC_021812	GGC	2	6	4563768	4563773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525829881
96304	NC_021812	ATT	2	6	4563780	4563785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525829881
96305	NC_021812	GAA	2	6	4563816	4563821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525829881
96306	NC_021812	AC	3	6	4563940	4563945	50 %	0 %	0 %	50 %	525829881
96307	NC_021812	GTC	2	6	4563951	4563956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525829881
96308	NC_021812	TGG	2	6	4564024	4564029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525829881
96309	NC_021812	CGC	2	6	4564055	4564060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525829881
96310	NC_021812	GC	3	6	4564095	4564100	0 %	0 %	50 %	50 %	525829881
96311	NC_021812	GC	3	6	4564135	4564140	0 %	0 %	50 %	50 %	525829881
96312	NC_021812	ACC	2	6	4564176	4564181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525829881
96313	NC_021812	TTTG	2	8	4564249	4564256	0 %	75 %	25 %	0 %	525829881
96314	NC_021812	TGC	2	6	4564270	4564275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525829881
96315	NC_021812	CGA	2	6	4564355	4564360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525829881
96316	NC_021812	TGA	2	6	4564419	4564424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525829882
96317	NC_021812	GCG	2	6	4564430	4564435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525829882
96318	NC_021812	GGC	2	6	4564505	4564510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525829882
96319	NC_021812	GTT	2	6	4564543	4564548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525829882
96320	NC_021812	GCC	2	6	4564559	4564564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525829882
96321	NC_021812	GTG	2	6	4564583	4564588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525829882
96322	NC_021812	TGG	2	6	4564632	4564637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525829882
96323	NC_021812	ATGA	2	8	4564718	4564725	50 %	25 %	25 %	0 %	525829882
96324	NC_021812	CG	3	6	4564831	4564836	0 %	0 %	50 %	50 %	525829882
96325	NC_021812	CG	3	6	4564846	4564851	0 %	0 %	50 %	50 %	525829882
96326	NC_021812	ATGAA	2	10	4564947	4564956	60 %	20 %	20 %	0 %	525829882
96327	NC_021812	GTG	2	6	4564961	4564966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525829882
96328	NC_021812	GCG	2	6	4564996	4565001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525829883
96329	NC_021812	GCGCTG	2	12	4565034	4565045	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	525829883
96330	NC_021812	CGGGAA	2	12	4565092	4565103	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	525829883
96331	NC_021812	GCG	2	6	4565118	4565123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525829883
96332	NC_021812	GCT	2	6	4565180	4565185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525829883
96333	NC_021812	TGA	2	6	4565186	4565191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525829883
96334	NC_021812	GCG	2	6	4565290	4565295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525829883
96335	NC_021812	TGA	2	6	4565356	4565361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525829883
96336	NC_021812	GC	3	6	4565389	4565394	0 %	0 %	50 %	50 %	525829883
96337	NC_021812	CAGCTT	2	12	4565439	4565450	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	525829883
96338	NC_021812	CGC	2	6	4565461	4565466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525829883
96339	NC_021812	GAAG	2	8	4565522	4565529	50 %	0 %	50 %	0 %	525829883
96340	NC_021812	TCG	2	6	4565570	4565575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525829884
96341	NC_021812	GCCGG	2	10	4565578	4565587	0 %	0 %	60 %	40 %	525829884
96342	NC_021812	CTG	2	6	4565623	4565628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525829884
96343	NC_021812	CTG	2	6	4565677	4565682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525829884
96344	NC_021812	GCAG	2	8	4565697	4565704	25 %	0 %	50 %	25 %	525829884
96345	NC_021812	GGC	2	6	4565754	4565759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525829884
96346	NC_021812	GGT	2	6	4565781	4565786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525829884
96347	NC_021812	GAG	2	6	4565839	4565844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525829884
96348	NC_021812	GCG	2	6	4565905	4565910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525829884
96349	NC_021812	TACCG	2	10	4565928	4565937	20 %	20 %	20 %	40 %	525829884
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