MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Heidelberg str. CFSAN002069

Total Repeats: 100993

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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95004	NC_021812	GTG	2	6	4504874	4504879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525830861
95005	NC_021812	CTG	2	6	4504920	4504925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830861
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95011	NC_021812	AT	3	6	4505201	4505206	50 %	50 %	0 %	0 %	525830861
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95122	NC_021812	TGG	2	6	4509764	4509769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525829834
95123	NC_021812	TAA	2	6	4509771	4509776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525829834
95124	NC_021812	A	7	7	4509796	4509802	100 %	0 %	0 %	0 %	525829834
95125	NC_021812	ATT	2	6	4509809	4509814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525829834
95126	NC_021812	ACA	2	6	4509843	4509848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525829834
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95162	NC_021812	A	7	7	4511631	4511637	100 %	0 %	0 %	0 %	525829835
95163	NC_021812	TATTT	2	10	4511663	4511672	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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95236	NC_021812	T	8	8	4514743	4514750	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95237	NC_021812	TAA	2	6	4514794	4514799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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95239	NC_021812	CAT	2	6	4514902	4514907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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95241	NC_021812	CAT	2	6	4515004	4515009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525829838
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95355	NC_021812	GC	3	6	4519939	4519944	0 %	0 %	50 %	50 %	525829843
95356	NC_021812	CGG	2	6	4519947	4519952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525829843
95357	NC_021812	GAC	2	6	4519993	4519998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525829843
95358	NC_021812	TCA	2	6	4520001	4520006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525829843
95359	NC_021812	AAAC	2	8	4520082	4520089	75 %	0 %	0 %	25 %	525829844
95360	NC_021812	GGT	2	6	4520099	4520104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525829844
95361	NC_021812	AG	3	6	4520154	4520159	50 %	0 %	50 %	0 %	525829844
95362	NC_021812	ATC	2	6	4520179	4520184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525829844
95363	NC_021812	GGTA	2	8	4520210	4520217	25 %	25 %	50 %	0 %	525829844
95364	NC_021812	GAC	2	6	4520243	4520248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525829844
95365	NC_021812	GC	3	6	4520261	4520266	0 %	0 %	50 %	50 %	525829844
95366	NC_021812	GC	3	6	4520268	4520273	0 %	0 %	50 %	50 %	525829844
95367	NC_021812	CATC	2	8	4520282	4520289	25 %	25 %	0 %	50 %	525829844
95368	NC_021812	GTA	2	6	4520291	4520296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525829844
95369	NC_021812	TCT	2	6	4520371	4520376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525829844
95370	NC_021812	GTG	2	6	4520382	4520387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525829844
95371	NC_021812	TCG	2	6	4520389	4520394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525829844
95372	NC_021812	GCC	2	6	4520433	4520438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525829844
95373	NC_021812	GTGG	2	8	4520439	4520446	0 %	25 %	75 %	0 %	525829844
95374	NC_021812	AAG	2	6	4520470	4520475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525829844
95375	NC_021812	CCAG	2	8	4520513	4520520	25 %	0 %	25 %	50 %	525829844
95376	NC_021812	ATC	2	6	4520599	4520604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525829844
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95378	NC_021812	GCAGTC	2	12	4520763	4520774	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	525829844
95379	NC_021812	TCA	2	6	4520806	4520811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525829844
95380	NC_021812	CAT	2	6	4520841	4520846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525829844
95381	NC_021812	ATC	2	6	4520914	4520919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525829844
95382	NC_021812	CGG	2	6	4521015	4521020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525829844
95383	NC_021812	GCAG	2	8	4521136	4521143	25 %	0 %	50 %	25 %	525829845
95384	NC_021812	GTT	2	6	4521157	4521162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525829845
95385	NC_021812	GCT	2	6	4521212	4521217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525829845
95386	NC_021812	GCG	2	6	4521378	4521383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525829845
95387	NC_021812	CAG	2	6	4521431	4521436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525829845
95388	NC_021812	CGCAG	2	10	4521469	4521478	20 %	0 %	40 %	40 %	525829845
95389	NC_021812	CCAG	2	8	4521538	4521545	25 %	0 %	25 %	50 %	525829845
95390	NC_021812	TCG	2	6	4521585	4521590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525829845
95391	NC_021812	CGA	2	6	4521592	4521597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525829845
95392	NC_021812	CAG	2	6	4521623	4521628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525829845
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95394	NC_021812	CCGCG	2	10	4521886	4521895	0 %	0 %	40 %	60 %	525829845
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95399	NC_021812	TGCT	2	8	4522147	4522154	0 %	50 %	25 %	25 %	525829845
95400	NC_021812	GCC	3	9	4522211	4522219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525829846
95401	NC_021812	TGGT	2	8	4522349	4522356	0 %	50 %	50 %	0 %	525829846
95402	NC_021812	CGG	2	6	4522374	4522379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525829846
95403	NC_021812	CCA	2	6	4522431	4522436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525829846
95404	NC_021812	CG	3	6	4522440	4522445	0 %	0 %	50 %	50 %	525829846
95405	NC_021812	GAT	2	6	4522459	4522464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525829846
95406	NC_021812	GAC	2	6	4522530	4522535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525829846
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95408	NC_021812	CAG	2	6	4522636	4522641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525829846
95409	NC_021812	CGA	2	6	4522692	4522697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525829846
95410	NC_021812	GCTG	2	8	4522779	4522786	0 %	25 %	50 %	25 %	525829846
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95412	NC_021812	CA	3	6	4522920	4522925	50 %	0 %	0 %	50 %	525829846
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95417	NC_021812	GAGCC	2	10	4523040	4523049	20 %	0 %	40 %	40 %	525829846
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95422	NC_021812	TCG	2	6	4523201	4523206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525829846
95423	NC_021812	CG	3	6	4523213	4523218	0 %	0 %	50 %	50 %	525829846
95424	NC_021812	CGG	3	9	4523220	4523228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525829846
95425	NC_021812	CG	3	6	4523310	4523315	0 %	0 %	50 %	50 %	525829846
95426	NC_021812	CAG	2	6	4523386	4523391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525829846
95427	NC_021812	GCT	2	6	4523397	4523402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525829846
95428	NC_021812	AGCGC	2	10	4523527	4523536	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
95429	NC_021812	CAT	2	6	4523557	4523562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525829847
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95431	NC_021812	GCT	2	6	4523641	4523646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525829847
95432	NC_021812	GCA	2	6	4523715	4523720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525829847
95433	NC_021812	CAT	2	6	4523758	4523763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525829847
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95435	NC_021812	CTTG	2	8	4523829	4523836	0 %	50 %	25 %	25 %	525829847
95436	NC_021812	CG	4	8	4523968	4523975	0 %	0 %	50 %	50 %	525829847
95437	NC_021812	GAG	2	6	4524046	4524051	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525829847
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95439	NC_021812	GCC	2	6	4524142	4524147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525829847
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95441	NC_021812	CTT	2	6	4524213	4524218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525829847
95442	NC_021812	ATA	2	6	4524236	4524241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525829847
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95444	NC_021812	TCA	3	9	4524281	4524289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525829847
95445	NC_021812	GT	3	6	4524344	4524349	0 %	50 %	50 %	0 %	525829847
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95447	NC_021812	ATC	2	6	4524391	4524396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525829847
95448	NC_021812	CG	3	6	4524489	4524494	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95449	NC_021812	A	9	9	4524497	4524505	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95450	NC_021812	GAT	2	6	4524516	4524521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95451	NC_021812	CAC	2	6	4524550	4524555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95452	NC_021812	CA	3	6	4524579	4524584	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
95453	NC_021812	GAT	2	6	4524605	4524610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95454	NC_021812	TGA	2	6	4524613	4524618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95455	NC_021812	TGG	2	6	4524619	4524624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95456	NC_021812	T	6	6	4524720	4524725	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95457	NC_021812	GTCA	2	8	4524750	4524757	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
95458	NC_021812	CGG	2	6	4524758	4524763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
95459	NC_021812	GGTT	2	8	4524837	4524844	0 %	50 %	50 %	0 %	525829848
95460	NC_021812	GCA	2	6	4524895	4524900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525829848
95461	NC_021812	ACC	2	6	4524903	4524908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525829848
95462	NC_021812	CTG	2	6	4525005	4525010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525829848
95463	NC_021812	CG	3	6	4525040	4525045	0 %	0 %	50 %	50 %	525829848
95464	NC_021812	GC	3	6	4525102	4525107	0 %	0 %	50 %	50 %	525829848
95465	NC_021812	TAT	2	6	4525127	4525132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525829848
95466	NC_021812	GTG	2	6	4525173	4525178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525829848
95467	NC_021812	CGC	2	6	4525189	4525194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525829848
95468	NC_021812	AGG	2	6	4525424	4525429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525829848
95469	NC_021812	AT	3	6	4525441	4525446	50 %	50 %	0 %	0 %	525829848
95470	NC_021812	GCC	2	6	4525511	4525516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525829848
95471	NC_021812	AATATC	2	12	4525594	4525605	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	525829848
95472	NC_021812	GAGT	2	8	4525629	4525636	25 %	25 %	50 %	0 %	525829848
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95474	NC_021812	CTG	2	6	4525689	4525694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525829849
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