MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Heidelberg str. CFSAN002069

Total Repeats: 100993

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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8002	NC_021812	AGA	2	6	389372	389377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525830140
8003	NC_021812	ATA	3	9	389435	389443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525830140
8004	NC_021812	CTA	2	6	389503	389508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525830140
8005	NC_021812	TTAC	2	8	389538	389545	25 %	50 %	0 %	25 %	525830140
8006	NC_021812	ACC	2	6	389592	389597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525830140
8007	NC_021812	GAA	2	6	389605	389610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525830140
8008	NC_021812	CAG	2	6	389654	389659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525830140
8009	NC_021812	TTTA	2	8	389720	389727	25 %	75 %	0 %	0 %	525830140
8010	NC_021812	ATC	2	6	389769	389774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525830140
8011	NC_021812	ATG	2	6	389824	389829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525830140
8012	NC_021812	CCTT	2	8	389856	389863	0 %	50 %	0 %	50 %	525830140
8013	NC_021812	TTTCT	2	10	389879	389888	0 %	80 %	0 %	20 %	525830140
8014	NC_021812	CTGTT	2	10	389894	389903	0 %	60 %	20 %	20 %	525830140
8015	NC_021812	TGA	2	6	389972	389977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525830141
8016	NC_021812	GAA	2	6	390040	390045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525830141
8017	NC_021812	TTG	2	6	390058	390063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525830141
8018	NC_021812	CCGA	2	8	390066	390073	25 %	0 %	25 %	50 %	525830141
8019	NC_021812	CATA	2	8	390106	390113	50 %	25 %	0 %	25 %	525830141
8020	NC_021812	AG	3	6	390125	390130	50 %	0 %	50 %	0 %	525830141
8021	NC_021812	AT	3	6	390173	390178	50 %	50 %	0 %	0 %	525830141
8022	NC_021812	ATA	2	6	390198	390203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525830141
8023	NC_021812	TGG	2	6	390214	390219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525830141
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8026	NC_021812	AAGC	2	8	390307	390314	50 %	0 %	25 %	25 %	525830141
8027	NC_021812	CCG	2	6	390423	390428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830141
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8034	NC_021812	AG	3	6	390622	390627	50 %	0 %	50 %	0 %	525830141
8035	NC_021812	TGT	2	6	390680	390685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525830141
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8039	NC_021812	TCAT	2	8	390950	390957	25 %	50 %	0 %	25 %	525826780
8040	NC_021812	AGC	2	6	391018	391023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826781
8041	NC_021812	CAT	3	9	391056	391064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826781
8042	NC_021812	CAG	2	6	391074	391079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826781
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8044	NC_021812	AATCC	2	10	391129	391138	40 %	20 %	0 %	40 %	525826781
8045	NC_021812	TCTT	2	8	391205	391212	0 %	75 %	0 %	25 %	525826781
8046	NC_021812	AAT	2	6	391253	391258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826781
8047	NC_021812	CTTC	2	8	391262	391269	0 %	50 %	0 %	50 %	525826781
8048	NC_021812	T	7	7	391279	391285	0 %	100 %	0 %	0 %	525826781
8049	NC_021812	ATA	2	6	391402	391407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826781
8050	NC_021812	TTG	2	6	391458	391463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525826781
8051	NC_021812	ACC	2	6	391495	391500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525826781
8052	NC_021812	TC	3	6	391608	391613	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8053	NC_021812	TAT	2	6	391633	391638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8054	NC_021812	ATT	2	6	391650	391655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8055	NC_021812	AAT	2	6	391750	391755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525830142
8056	NC_021812	TGT	2	6	391880	391885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525830142
8057	NC_021812	TCA	2	6	391976	391981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525830142
8058	NC_021812	C	6	6	392026	392031	0 %	0 %	0 %	100 %	525830142
8059	NC_021812	A	7	7	392047	392053	100 %	0 %	0 %	0 %	525830142
8060	NC_021812	ACT	2	6	392156	392161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525830142
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8063	NC_021812	CAG	2	6	392193	392198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525830142
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8068	NC_021812	CGAT	2	8	392422	392429	25 %	25 %	25 %	25 %	525830142
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8072	NC_021812	TA	3	6	392657	392662	50 %	50 %	0 %	0 %	525830143
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8104	NC_021812	CGG	2	6	393850	393855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826783
8105	NC_021812	GCAA	2	8	393903	393910	50 %	0 %	25 %	25 %	525826783
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8110	NC_021812	A	6	6	394171	394176	100 %	0 %	0 %	0 %	525826783
8111	NC_021812	GAG	2	6	394273	394278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525826783
8112	NC_021812	CAT	2	6	394285	394290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826783
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8121	NC_021812	ATTC	2	8	394642	394649	25 %	50 %	0 %	25 %	525826783
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8123	NC_021812	CTCTC	2	10	394708	394717	0 %	40 %	0 %	60 %	525826784
8124	NC_021812	AAT	2	6	394810	394815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826784
8125	NC_021812	GACGA	2	10	394868	394877	40 %	0 %	40 %	20 %	525826784
8126	NC_021812	CACG	2	8	394919	394926	25 %	0 %	25 %	50 %	525826784
8127	NC_021812	TTCC	2	8	394970	394977	0 %	50 %	0 %	50 %	525826784
8128	NC_021812	GAC	2	6	394985	394990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826784
8129	NC_021812	GAC	2	6	395000	395005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826784
8130	NC_021812	TTA	2	6	395146	395151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525826784
8131	NC_021812	AGT	2	6	395189	395194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826784
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8133	NC_021812	CATT	2	8	395207	395214	25 %	50 %	0 %	25 %	525826784
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8136	NC_021812	CACC	2	8	395396	395403	25 %	0 %	0 %	75 %	525826784
8137	NC_021812	AATA	2	8	395425	395432	75 %	25 %	0 %	0 %	525826784
8138	NC_021812	GCG	2	6	395706	395711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826784
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8141	NC_021812	GAG	2	6	395787	395792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525826784
8142	NC_021812	AACTC	2	10	395846	395855	40 %	20 %	0 %	40 %	525826784
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8145	NC_021812	CTCA	2	8	395988	395995	25 %	25 %	0 %	50 %	525826784
8146	NC_021812	CATAT	2	10	396000	396009	40 %	40 %	0 %	20 %	525826784
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8150	NC_021812	CTG	2	6	396129	396134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826784
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8152	NC_021812	ATG	2	6	396301	396306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826784
8153	NC_021812	CCAAC	2	10	396317	396326	40 %	0 %	0 %	60 %	525826784
8154	NC_021812	TCC	2	6	396336	396341	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525826784
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8216	NC_021812	AAGA	2	8	400021	400028	75 %	0 %	25 %	0 %	525826787
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8221	NC_021812	A	7	7	400236	400242	100 %	0 %	0 %	0 %	525830146
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8228	NC_021812	CTG	2	6	400674	400679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826789
8229	NC_021812	ATC	2	6	400699	400704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826789
8230	NC_021812	CATT	2	8	400730	400737	25 %	50 %	0 %	25 %	525826789
8231	NC_021812	TGGCC	2	10	400748	400757	0 %	20 %	40 %	40 %	525826789
8232	NC_021812	AAAT	2	8	400823	400830	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8233	NC_021812	TA	3	6	400885	400890	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8234	NC_021812	GTT	2	6	400916	400921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525830147
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8237	NC_021812	TAA	2	6	401046	401051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525830147
8238	NC_021812	A	6	6	401189	401194	100 %	0 %	0 %	0 %	525830147
8239	NC_021812	ATG	2	6	401229	401234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525830147
8240	NC_021812	ATG	2	6	401238	401243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525830147
8241	NC_021812	GCG	2	6	401306	401311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525830147
8242	NC_021812	CCA	2	6	401317	401322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525830147
8243	NC_021812	TTG	2	6	401460	401465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525830147
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8245	NC_021812	TCG	2	6	401724	401729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826790
8246	NC_021812	GGGC	2	8	401736	401743	0 %	0 %	75 %	25 %	525826790
8247	NC_021812	AAT	2	6	401749	401754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826790
8248	NC_021812	GCG	2	6	401832	401837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826790
8249	NC_021812	TAA	2	6	401894	401899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826790
8250	NC_021812	AGCA	2	8	402046	402053	50 %	0 %	25 %	25 %	525826790
8251	NC_021812	GCC	2	6	402075	402080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826790
8252	NC_021812	GCA	2	6	402129	402134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826790
8253	NC_021812	CTG	2	6	402209	402214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826790
8254	NC_021812	AGC	2	6	402234	402239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826790
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8262	NC_021812	CGT	2	6	402593	402598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826791
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8264	NC_021812	GCCA	2	8	402623	402630	25 %	0 %	25 %	50 %	525826791
8265	NC_021812	GC	3	6	402693	402698	0 %	0 %	50 %	50 %	525826791
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8270	NC_021812	TCT	2	6	402804	402809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525826791
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8272	NC_021812	ATTG	2	8	402825	402832	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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8278	NC_021812	CTG	2	6	403196	403201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830148
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8319	NC_021812	GCG	2	6	405200	405205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826793
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8348	NC_021812	AAAC	2	8	406496	406503	75 %	0 %	0 %	25 %	525830149
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8350	NC_021812	GAA	2	6	406573	406578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525830149
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8352	NC_021812	TC	3	6	406588	406593	0 %	50 %	0 %	50 %	525830149
8353	NC_021812	CT	3	6	406608	406613	0 %	50 %	0 %	50 %	525830149
8354	NC_021812	T	6	6	406661	406666	0 %	100 %	0 %	0 %	525830149
8355	NC_021812	ATC	2	6	406737	406742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525830149
8356	NC_021812	GATA	2	8	406761	406768	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8357	NC_021812	CTAA	2	8	406778	406785	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8358	NC_021812	CGC	2	6	406864	406869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8359	NC_021812	GCG	2	6	406872	406877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8360	NC_021812	GGCT	2	8	406955	406962	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8361	NC_021812	TGG	2	6	406978	406983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8362	NC_021812	TTTAC	2	10	407002	407011	20 %	60 %	0 %	20 %	525826796
8363	NC_021812	CTCA	2	8	407017	407024	25 %	25 %	0 %	50 %	525826796
8364	NC_021812	ATA	2	6	407050	407055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826796
8365	NC_021812	AAT	2	6	407056	407061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826796
8366	NC_021812	TGA	2	6	407064	407069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826796
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8491	NC_021812	AGT	2	6	412904	412909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826799
8492	NC_021812	CAG	2	6	412934	412939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826799
8493	NC_021812	CGATT	2	10	412940	412949	20 %	40 %	20 %	20 %	525826799
8494	NC_021812	ATG	2	6	413010	413015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826799
8495	NC_021812	AAT	2	6	413021	413026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826799
8496	NC_021812	TAGCG	2	10	413062	413071	20 %	20 %	40 %	20 %	525826799
8497	NC_021812	AGA	2	6	413074	413079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525826799
8498	NC_021812	A	8	8	413093	413100	100 %	0 %	0 %	0 %	525826799
8499	NC_021812	TCA	2	6	413107	413112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826799
8500	NC_021812	GCT	2	6	413220	413225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826799

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