MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Heidelberg str. CFSAN002069

Total Repeats: 100993

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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83003	NC_021812	TGC	2	6	3945662	3945667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525829429
83004	NC_021812	ACG	2	6	3945680	3945685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525829429
83005	NC_021812	TGGC	2	8	3945699	3945706	0 %	25 %	50 %	25 %	525829429
83006	NC_021812	GTT	2	6	3945738	3945743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525829429
83007	NC_021812	GAAACG	2	12	3945748	3945759	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	525829429
83008	NC_021812	TGA	2	6	3945795	3945800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525829429
83009	NC_021812	GCT	2	6	3945879	3945884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525829429
83010	NC_021812	TGA	2	6	3945902	3945907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525829429
83011	NC_021812	AGCC	2	8	3946059	3946066	25 %	0 %	25 %	50 %	525829429
83012	NC_021812	TAT	3	9	3946142	3946150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525829429
83013	NC_021812	GAA	2	6	3946158	3946163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525829429
83014	NC_021812	AGC	2	6	3946164	3946169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525829429
83015	NC_021812	CGG	2	6	3946218	3946223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525829429
83016	NC_021812	TGA	2	6	3946269	3946274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525829429
83017	NC_021812	TGC	2	6	3946287	3946292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525829429
83018	NC_021812	TGA	2	6	3946325	3946330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525829429
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83028	NC_021812	GC	3	6	3946744	3946749	0 %	0 %	50 %	50 %	525829430
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83033	NC_021812	CAG	2	6	3946902	3946907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525829430
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83042	NC_021812	TCG	2	6	3947137	3947142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525829430
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83048	NC_021812	TTA	2	6	3947497	3947502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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83050	NC_021812	ATC	2	6	3947722	3947727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525829431
83051	NC_021812	C	6	6	3947781	3947786	0 %	0 %	0 %	100 %	525829431
83052	NC_021812	GTC	2	6	3947812	3947817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525829431
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83054	NC_021812	GGC	2	6	3947974	3947979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525829431
83055	NC_021812	TGG	2	6	3948200	3948205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525829431
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83063	NC_021812	GT	3	6	3948428	3948433	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83064	NC_021812	CGG	2	6	3948478	3948483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525829432
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83069	NC_021812	TGCGT	2	10	3948763	3948772	0 %	40 %	40 %	20 %	525829432
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83083	NC_021812	TGA	2	6	3949467	3949472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525829432
83084	NC_021812	GC	3	6	3949509	3949514	0 %	0 %	50 %	50 %	525829432
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83115	NC_021812	GCT	2	6	3950920	3950925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525829433
83116	NC_021812	T	6	6	3950932	3950937	0 %	100 %	0 %	0 %	525829433
83117	NC_021812	CGT	2	6	3950945	3950950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525829433
83118	NC_021812	GAA	2	6	3950968	3950973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525829433
83119	NC_021812	TCT	2	6	3951068	3951073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525829434
83120	NC_021812	TTC	2	6	3951074	3951079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525829434
83121	NC_021812	GCG	2	6	3951081	3951086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525829434
83122	NC_021812	TGA	2	6	3951121	3951126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525829434
83123	NC_021812	GGAAGG	2	12	3951144	3951155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525829434
83124	NC_021812	CTC	2	6	3951169	3951174	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525829434
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83126	NC_021812	GCTTCC	2	12	3951212	3951223	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	525829434
83127	NC_021812	CTTTT	2	10	3951226	3951235	0 %	80 %	0 %	20 %	525829434
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83130	NC_021812	CG	3	6	3951308	3951313	0 %	0 %	50 %	50 %	525829434
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83134	NC_021812	AGCG	2	8	3951531	3951538	25 %	0 %	50 %	25 %	525829434
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83136	NC_021812	CGGT	2	8	3951569	3951576	0 %	25 %	50 %	25 %	525829434
83137	NC_021812	CAT	2	6	3951610	3951615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525829434
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83146	NC_021812	CGT	2	6	3951894	3951899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525829434
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83160	NC_021812	CAG	3	9	3952552	3952560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525829434
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83162	NC_021812	T	6	6	3952597	3952602	0 %	100 %	0 %	0 %	525829434
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83171	NC_021812	AT	3	6	3952955	3952960	50 %	50 %	0 %	0 %	525830783
83172	NC_021812	CTG	2	6	3953032	3953037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830783
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83203	NC_021812	TC	3	6	3954381	3954386	0 %	50 %	0 %	50 %	525830783
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83210	NC_021812	CTG	2	6	3954673	3954678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830783
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83214	NC_021812	ACCGT	2	10	3954830	3954839	20 %	20 %	20 %	40 %	525830783
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83217	NC_021812	GC	4	8	3954957	3954964	0 %	0 %	50 %	50 %	525830783
83218	NC_021812	GCT	2	6	3954972	3954977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830783
83219	NC_021812	GCC	2	6	3954985	3954990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830783
83220	NC_021812	GGC	2	6	3955083	3955088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525830783
83221	NC_021812	TCGATG	2	12	3955192	3955203	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525830783
83222	NC_021812	CGC	2	6	3955247	3955252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830783
83223	NC_021812	CGC	2	6	3955307	3955312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830783
83224	NC_021812	TGC	2	6	3955337	3955342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830783
83225	NC_021812	GATC	2	8	3955344	3955351	25 %	25 %	25 %	25 %	525830783
83226	NC_021812	CGTG	2	8	3955428	3955435	0 %	25 %	50 %	25 %	525830783
83227	NC_021812	CTGGC	2	10	3955498	3955507	0 %	20 %	40 %	40 %	525830783
83228	NC_021812	CGG	2	6	3955521	3955526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525830783
83229	NC_021812	CTG	2	6	3955528	3955533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830783
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83231	NC_021812	GAG	2	6	3955627	3955632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525830783
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83339	NC_021812	ACC	2	6	3961384	3961389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83340	NC_021812	CGA	2	6	3961454	3961459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525829438
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83344	NC_021812	GCCA	3	12	3961569	3961580	25 %	0 %	25 %	50 %	525829438
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83346	NC_021812	ATC	2	6	3961720	3961725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525829438
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83457	NC_021812	T	7	7	3966621	3966627	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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83466	NC_021812	GCG	2	6	3967369	3967374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525829441
83467	NC_021812	GTT	2	6	3967390	3967395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525829441
83468	NC_021812	ATC	2	6	3967451	3967456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525829441
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83488	NC_021812	GAT	2	6	3968242	3968247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525829441
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83490	NC_021812	GAC	2	6	3968305	3968310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525829441
83491	NC_021812	ACA	2	6	3968355	3968360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525829441
83492	NC_021812	TGC	2	6	3968364	3968369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525829441
83493	NC_021812	TAA	3	9	3968404	3968412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83494	NC_021812	T	7	7	3968429	3968435	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83495	NC_021812	T	6	6	3968443	3968448	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83496	NC_021812	AAAG	2	8	3968452	3968459	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
83497	NC_021812	AGC	2	6	3968468	3968473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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83499	NC_021812	T	6	6	3968530	3968535	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83500	NC_021812	AATG	2	8	3968585	3968592	50 %	25 %	25 %	0 %	525829442

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