MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Heidelberg str. CFSAN002069

Total Repeats: 100993

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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77002	NC_021812	CCT	2	6	3659107	3659112	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525829212
77003	NC_021812	AGTA	2	8	3659192	3659199	50 %	25 %	25 %	0 %	525829212
77004	NC_021812	GGT	2	6	3659221	3659226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525829212
77005	NC_021812	CAT	2	6	3659246	3659251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525829212
77006	NC_021812	CCG	2	6	3659260	3659265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525829212
77007	NC_021812	CTT	2	6	3659290	3659295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525829212
77008	NC_021812	TC	3	6	3659384	3659389	0 %	50 %	0 %	50 %	525829212
77009	NC_021812	CT	3	6	3659390	3659395	0 %	50 %	0 %	50 %	525829212
77010	NC_021812	CAT	2	6	3659416	3659421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525829212
77011	NC_021812	AT	3	6	3659425	3659430	50 %	50 %	0 %	0 %	525829212
77012	NC_021812	TGA	2	6	3659529	3659534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525829212
77013	NC_021812	TGT	2	6	3659550	3659555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525829212
77014	NC_021812	TTTA	2	8	3659576	3659583	25 %	75 %	0 %	0 %	525829212
77015	NC_021812	TC	3	6	3659605	3659610	0 %	50 %	0 %	50 %	525829212
77016	NC_021812	CAC	2	6	3659617	3659622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525829212
77017	NC_021812	ATG	2	6	3659637	3659642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525829212
77018	NC_021812	T	7	7	3659670	3659676	0 %	100 %	0 %	0 %	525829212
77019	NC_021812	C	6	6	3659709	3659714	0 %	0 %	0 %	100 %	525829212
77020	NC_021812	TGA	2	6	3659784	3659789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525829212
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77022	NC_021812	TAT	2	6	3659836	3659841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525829212
77023	NC_021812	AT	3	6	3659859	3659864	50 %	50 %	0 %	0 %	525829212
77024	NC_021812	TC	3	6	3659873	3659878	0 %	50 %	0 %	50 %	525829212
77025	NC_021812	T	6	6	3659879	3659884	0 %	100 %	0 %	0 %	525829212
77026	NC_021812	TAC	2	6	3659902	3659907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525829212
77027	NC_021812	GA	3	6	3659910	3659915	50 %	0 %	50 %	0 %	525829212
77028	NC_021812	ATT	2	6	3659927	3659932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525829212
77029	NC_021812	TGGT	2	8	3659948	3659955	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77030	NC_021812	GAT	2	6	3659992	3659997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77031	NC_021812	CGC	2	6	3659999	3660004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77032	NC_021812	T	7	7	3660014	3660020	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77033	NC_021812	GAA	2	6	3660048	3660053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77034	NC_021812	CTT	2	6	3660067	3660072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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77036	NC_021812	TAA	2	6	3660099	3660104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77037	NC_021812	AT	3	6	3660133	3660138	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77038	NC_021812	TGAG	2	8	3660144	3660151	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
77039	NC_021812	AT	3	6	3660192	3660197	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77040	NC_021812	CAA	2	6	3660198	3660203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77041	NC_021812	A	6	6	3660202	3660207	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77042	NC_021812	TAT	2	6	3660235	3660240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77043	NC_021812	AT	3	6	3660265	3660270	50 %	50 %	0 %	0 %	525829213
77044	NC_021812	CGA	2	6	3660289	3660294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525829213
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77050	NC_021812	A	7	7	3660408	3660414	100 %	0 %	0 %	0 %	525829213
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77053	NC_021812	TTCC	2	8	3660495	3660502	0 %	50 %	0 %	50 %	525829213
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77055	NC_021812	TGT	2	6	3660590	3660595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525829213
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77057	NC_021812	TTC	2	6	3660636	3660641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525829213
77058	NC_021812	TCA	2	6	3660699	3660704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525829213
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77111	NC_021812	GC	3	6	3663304	3663309	0 %	0 %	50 %	50 %	525829214
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77119	NC_021812	GCG	2	6	3663742	3663747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525829214
77120	NC_021812	CTT	2	6	3663762	3663767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525829214
77121	NC_021812	TGGC	2	8	3663806	3663813	0 %	25 %	50 %	25 %	525829214
77122	NC_021812	CTT	2	6	3663860	3663865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525829214
77123	NC_021812	CGG	2	6	3663884	3663889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525829214
77124	NC_021812	CTGG	2	8	3663905	3663912	0 %	25 %	50 %	25 %	525829214
77125	NC_021812	AAC	2	6	3663924	3663929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525829214
77126	NC_021812	CGCT	2	8	3663984	3663991	0 %	25 %	25 %	50 %	525829214
77127	NC_021812	GCT	2	6	3664051	3664056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525829214
77128	NC_021812	TGA	2	6	3664081	3664086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525829214
77129	NC_021812	AAG	2	6	3664165	3664170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525829214
77130	NC_021812	GAT	2	6	3664350	3664355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525829214
77131	NC_021812	AGC	2	6	3664380	3664385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525829214
77132	NC_021812	CAT	2	6	3664397	3664402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525829214
77133	NC_021812	CG	3	6	3664406	3664411	0 %	0 %	50 %	50 %	525829214
77134	NC_021812	CGG	2	6	3664432	3664437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525829214
77135	NC_021812	GCC	2	6	3664455	3664460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525829214
77136	NC_021812	AGG	2	6	3664474	3664479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525829214
77137	NC_021812	CTG	2	6	3664480	3664485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525829214
77138	NC_021812	GAT	2	6	3664505	3664510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525829215
77139	NC_021812	ACG	2	6	3664573	3664578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525829215
77140	NC_021812	ATG	2	6	3664593	3664598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525829215
77141	NC_021812	TTCA	2	8	3664617	3664624	25 %	50 %	0 %	25 %	525829215
77142	NC_021812	TGA	2	6	3664723	3664728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525829215
77143	NC_021812	TGC	2	6	3664741	3664746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525829215
77144	NC_021812	AGA	2	6	3664758	3664763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525829215
77145	NC_021812	CTG	2	6	3664835	3664840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525829215
77146	NC_021812	CTG	2	6	3664912	3664917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525829215
77147	NC_021812	ACC	2	6	3664944	3664949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525829215
77148	NC_021812	CGC	2	6	3664952	3664957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525829215
77149	NC_021812	CAG	2	6	3664958	3664963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525829215
77150	NC_021812	TTC	2	6	3664977	3664982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525829215
77151	NC_021812	TAC	2	6	3665003	3665008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525829215
77152	NC_021812	GGCGAT	2	12	3665015	3665026	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	525829215
77153	NC_021812	CGC	2	6	3665102	3665107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525829216
77154	NC_021812	TGA	2	6	3665120	3665125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525829216
77155	NC_021812	GTG	2	6	3665145	3665150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525829216
77156	NC_021812	GGC	2	6	3665276	3665281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525829216
77157	NC_021812	A	6	6	3665313	3665318	100 %	0 %	0 %	0 %	525829216
77158	NC_021812	CTG	2	6	3665431	3665436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525829216
77159	NC_021812	GC	3	6	3665460	3665465	0 %	0 %	50 %	50 %	525829216
77160	NC_021812	AGA	2	6	3665474	3665479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525829216
77161	NC_021812	AGA	2	6	3665495	3665500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525829216
77162	NC_021812	GAA	2	6	3665567	3665572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525829216
77163	NC_021812	GCC	2	6	3665592	3665597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525829216
77164	NC_021812	ATC	2	6	3665634	3665639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525829216
77165	NC_021812	AGA	2	6	3665687	3665692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525829216
77166	NC_021812	GCAGGC	2	12	3665694	3665705	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	525829216
77167	NC_021812	CTG	2	6	3665769	3665774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525829216
77168	NC_021812	GAA	2	6	3665796	3665801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525829216
77169	NC_021812	CAAA	2	8	3665806	3665813	75 %	0 %	0 %	25 %	525829216
77170	NC_021812	GC	3	6	3665819	3665824	0 %	0 %	50 %	50 %	525829216
77171	NC_021812	GCG	2	6	3665835	3665840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525829216
77172	NC_021812	AACAG	2	10	3665863	3665872	60 %	0 %	20 %	20 %	525829216
77173	NC_021812	ACCA	2	8	3665923	3665930	50 %	0 %	0 %	50 %	525829216
77174	NC_021812	GGC	2	6	3665939	3665944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525829216
77175	NC_021812	TGA	2	6	3666067	3666072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525829216
77176	NC_021812	CAG	2	6	3666075	3666080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525829216
77177	NC_021812	GGC	2	6	3666122	3666127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77178	NC_021812	GCT	2	6	3666234	3666239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830737
77179	NC_021812	GCT	2	6	3666243	3666248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830737
77180	NC_021812	GGC	3	9	3666249	3666257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525830737
77181	NC_021812	CGC	2	6	3666268	3666273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830737
77182	NC_021812	GCC	2	6	3666407	3666412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830737
77183	NC_021812	GC	3	6	3666443	3666448	0 %	0 %	50 %	50 %	525830737
77184	NC_021812	ACT	2	6	3666464	3666469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525830737
77185	NC_021812	TGG	2	6	3666481	3666486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525830737
77186	NC_021812	CGT	2	6	3666542	3666547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830737
77187	NC_021812	ACA	2	6	3666549	3666554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525830737
77188	NC_021812	CTG	2	6	3666619	3666624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830737
77189	NC_021812	TCAAT	2	10	3666675	3666684	40 %	40 %	0 %	20 %	525830737
77190	NC_021812	GAAT	2	8	3666714	3666721	50 %	25 %	25 %	0 %	525830737
77191	NC_021812	TGG	2	6	3666724	3666729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525830737
77192	NC_021812	CGT	2	6	3666769	3666774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830737
77193	NC_021812	GCC	2	6	3666791	3666796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830737
77194	NC_021812	GTT	2	6	3666804	3666809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525830737
77195	NC_021812	AGG	2	6	3666848	3666853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525830737
77196	NC_021812	TC	3	6	3666863	3666868	0 %	50 %	0 %	50 %	525830737
77197	NC_021812	TGG	2	6	3666919	3666924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525830738
77198	NC_021812	GCG	2	6	3666928	3666933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525830738
77199	NC_021812	GCA	2	6	3666973	3666978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525830738
77200	NC_021812	CGC	2	6	3666999	3667004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830738
77201	NC_021812	T	6	6	3667029	3667034	0 %	100 %	0 %	0 %	525830738
77202	NC_021812	TC	3	6	3667037	3667042	0 %	50 %	0 %	50 %	525830738
77203	NC_021812	GCC	2	6	3667056	3667061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830738
77204	NC_021812	GC	3	6	3667136	3667141	0 %	0 %	50 %	50 %	525830738
77205	NC_021812	CAG	3	9	3667242	3667250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525830738
77206	NC_021812	GCG	2	6	3667251	3667256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525830738
77207	NC_021812	GC	3	6	3667269	3667274	0 %	0 %	50 %	50 %	525830738
77208	NC_021812	GCGAG	2	10	3667303	3667312	20 %	0 %	60 %	20 %	525830738
77209	NC_021812	GCA	3	9	3667328	3667336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525830738
77210	NC_021812	GAT	2	6	3667361	3667366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525830738
77211	NC_021812	AGC	2	6	3667374	3667379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525830738
77212	NC_021812	ATG	3	9	3667476	3667484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525830738
77213	NC_021812	GAC	2	6	3667497	3667502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525830738
77214	NC_021812	TCC	2	6	3667560	3667565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525829217
77215	NC_021812	CGCA	2	8	3667625	3667632	25 %	0 %	25 %	50 %	525829217
77216	NC_021812	GTGG	2	8	3667732	3667739	0 %	25 %	75 %	0 %	525829217
77217	NC_021812	TCC	2	6	3667763	3667768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525829217
77218	NC_021812	CGG	2	6	3667777	3667782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525829217
77219	NC_021812	GAT	2	6	3667826	3667831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525829217
77220	NC_021812	GGT	2	6	3667846	3667851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525829217
77221	NC_021812	CCG	2	6	3667883	3667888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525829217
77222	NC_021812	CCCG	2	8	3667889	3667896	0 %	0 %	25 %	75 %	525829217
77223	NC_021812	GTC	2	6	3668027	3668032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525829217
77224	NC_021812	GCG	2	6	3668048	3668053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525829217
77225	NC_021812	GGC	2	6	3668092	3668097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525829217
77226	NC_021812	CTTT	2	8	3668141	3668148	0 %	75 %	0 %	25 %	525829217
77227	NC_021812	ATC	2	6	3668168	3668173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525829217
77228	NC_021812	GGT	2	6	3668185	3668190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525829217
77229	NC_021812	GCT	2	6	3668210	3668215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525829217
77230	NC_021812	CGG	2	6	3668223	3668228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525829217
77231	NC_021812	AAG	2	6	3668238	3668243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525829217
77232	NC_021812	GCCTG	2	10	3668247	3668256	0 %	20 %	40 %	40 %	525829217
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77350	NC_021812	ATG	2	6	3674137	3674142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525829221
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77352	NC_021812	CGTGG	2	10	3674205	3674214	0 %	20 %	60 %	20 %	525829222
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