MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Heidelberg str. CFSAN002069

Total Repeats: 100993

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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76002	NC_021812	TCA	2	6	3610165	3610170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525829183
76003	NC_021812	T	6	6	3610175	3610180	0 %	100 %	0 %	0 %	525829183
76004	NC_021812	CGG	2	6	3610189	3610194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525829183
76005	NC_021812	CCAG	2	8	3610232	3610239	25 %	0 %	25 %	50 %	525829183
76006	NC_021812	AAG	2	6	3610246	3610251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525829183
76007	NC_021812	CGC	2	6	3610289	3610294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525829183
76008	NC_021812	GCA	2	6	3610355	3610360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525829183
76009	NC_021812	TTC	2	6	3610365	3610370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525829183
76010	NC_021812	TCG	2	6	3610393	3610398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525829183
76011	NC_021812	GCC	2	6	3610456	3610461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525829183
76012	NC_021812	TTC	2	6	3610617	3610622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525829183
76013	NC_021812	GGC	2	6	3610626	3610631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525829183
76014	NC_021812	TGA	2	6	3610712	3610717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525829183
76015	NC_021812	CCG	2	6	3610721	3610726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525829183
76016	NC_021812	ACG	2	6	3610779	3610784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525829183
76017	NC_021812	ATCA	2	8	3610788	3610795	50 %	25 %	0 %	25 %	525829183
76018	NC_021812	T	7	7	3610826	3610832	0 %	100 %	0 %	0 %	525829183
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76020	NC_021812	CGG	2	6	3610941	3610946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525830725
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76024	NC_021812	CAG	2	6	3611128	3611133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525830725
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76028	NC_021812	GGC	2	6	3611290	3611295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525830725
76029	NC_021812	CAG	2	6	3611351	3611356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525830725
76030	NC_021812	GA	4	8	3611429	3611436	50 %	0 %	50 %	0 %	525830725
76031	NC_021812	AAGA	2	8	3611441	3611448	75 %	0 %	25 %	0 %	525830725
76032	NC_021812	CAG	2	6	3611509	3611514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525830725
76033	NC_021812	ACT	2	6	3611519	3611524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525830725
76034	NC_021812	CGA	2	6	3611535	3611540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525830725
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76041	NC_021812	CGG	2	6	3611847	3611852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525830725
76042	NC_021812	AAT	2	6	3611861	3611866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525830725
76043	NC_021812	GCG	2	6	3611867	3611872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525830725
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76045	NC_021812	T	6	6	3611923	3611928	0 %	100 %	0 %	0 %	525830725
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76052	NC_021812	AAT	2	6	3612106	3612111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525830725
76053	NC_021812	GCTT	2	8	3612117	3612124	0 %	50 %	25 %	25 %	525830725
76054	NC_021812	TTGCT	2	10	3612125	3612134	0 %	60 %	20 %	20 %	525830725
76055	NC_021812	TTG	2	6	3612168	3612173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76056	NC_021812	TGCG	2	8	3612210	3612217	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
76057	NC_021812	TAA	2	6	3612271	3612276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76058	NC_021812	A	6	6	3612316	3612321	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76059	NC_021812	ATG	2	6	3612333	3612338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76060	NC_021812	ATC	2	6	3612379	3612384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76061	NC_021812	A	7	7	3612399	3612405	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76062	NC_021812	TTTAA	2	10	3612421	3612430	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76063	NC_021812	A	6	6	3612429	3612434	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76064	NC_021812	AATTA	2	10	3612453	3612462	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
76065	NC_021812	ATT	2	6	3612520	3612525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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76068	NC_021812	AATT	2	8	3612580	3612587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76069	NC_021812	ATG	2	6	3612638	3612643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76070	NC_021812	ATT	2	6	3612662	3612667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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76072	NC_021812	TGT	2	6	3612703	3612708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76073	NC_021812	AG	4	8	3612724	3612731	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76074	NC_021812	AAT	2	6	3612735	3612740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525829184
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76084	NC_021812	TGAA	2	8	3613422	3613429	50 %	25 %	25 %	0 %	525829185
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76093	NC_021812	GC	3	6	3614079	3614084	0 %	0 %	50 %	50 %	525829185
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76100	NC_021812	GCGCT	2	10	3614564	3614573	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
76101	NC_021812	CGC	2	6	3614622	3614627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76102	NC_021812	CAA	2	6	3614635	3614640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76103	NC_021812	GCT	2	6	3614660	3614665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830726
76104	NC_021812	ACT	2	6	3614871	3614876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525830726
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76106	NC_021812	AGT	2	6	3614969	3614974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525830726
76107	NC_021812	GA	3	6	3614993	3614998	50 %	0 %	50 %	0 %	525830726
76108	NC_021812	CGC	2	6	3615075	3615080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830726
76109	NC_021812	CGC	2	6	3615122	3615127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830726
76110	NC_021812	GGGC	2	8	3615149	3615156	0 %	0 %	75 %	25 %	525830726
76111	NC_021812	CGG	2	6	3615183	3615188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525830726
76112	NC_021812	TGA	2	6	3615217	3615222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525830726
76113	NC_021812	GCT	2	6	3615231	3615236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830726
76114	NC_021812	GC	3	6	3615237	3615242	0 %	0 %	50 %	50 %	525830726
76115	NC_021812	GTC	2	6	3615243	3615248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830726
76116	NC_021812	TGGC	2	8	3615273	3615280	0 %	25 %	50 %	25 %	525830726
76117	NC_021812	AAT	2	6	3615285	3615290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525830726
76118	NC_021812	CA	3	6	3615321	3615326	50 %	0 %	0 %	50 %	525830726
76119	NC_021812	CGA	2	6	3615374	3615379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525830726
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76233	NC_021812	A	7	7	3620319	3620325	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76234	NC_021812	TGC	2	6	3620370	3620375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525829189
76235	NC_021812	CGC	2	6	3620397	3620402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525829189
76236	NC_021812	GC	3	6	3620413	3620418	0 %	0 %	50 %	50 %	525829189
76237	NC_021812	GCA	2	6	3620526	3620531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525829189
76238	NC_021812	TGG	2	6	3620591	3620596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525829189
76239	NC_021812	TGAC	2	8	3620624	3620631	25 %	25 %	25 %	25 %	525829189
76240	NC_021812	TCT	2	6	3620639	3620644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525829189
76241	NC_021812	CGC	2	6	3620655	3620660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525829189
76242	NC_021812	GTA	2	6	3620684	3620689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525829189
76243	NC_021812	TCA	2	6	3620768	3620773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525829189
76244	NC_021812	GC	3	6	3620805	3620810	0 %	0 %	50 %	50 %	525829189
76245	NC_021812	GC	3	6	3620813	3620818	0 %	0 %	50 %	50 %	525829189
76246	NC_021812	ATTAA	2	10	3620912	3620921	60 %	40 %	0 %	0 %	525829189
76247	NC_021812	GCA	2	6	3621084	3621089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525829189
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76249	NC_021812	AG	3	6	3621231	3621236	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76250	NC_021812	TGG	2	6	3621241	3621246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525829190
76251	NC_021812	ACG	2	6	3621279	3621284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525829190
76252	NC_021812	GAA	2	6	3621333	3621338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525829190
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76255	NC_021812	TCC	2	6	3621626	3621631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525829190
76256	NC_021812	GA	3	6	3621809	3621814	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76257	NC_021812	TA	3	6	3621885	3621890	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76258	NC_021812	AAC	2	6	3621892	3621897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76259	NC_021812	TCG	2	6	3621994	3621999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76260	NC_021812	GAT	2	6	3622031	3622036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525830727
76261	NC_021812	CAG	2	6	3622044	3622049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525830727
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76264	NC_021812	T	8	8	3622351	3622358	0 %	100 %	0 %	0 %	525829191
76265	NC_021812	TTC	2	6	3622363	3622368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525829191
76266	NC_021812	TCA	2	6	3622380	3622385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525829191
76267	NC_021812	GAC	2	6	3622402	3622407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525829191
76268	NC_021812	CAG	2	6	3622424	3622429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525829191
76269	NC_021812	GCT	2	6	3622447	3622452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525829191
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76271	NC_021812	T	6	6	3622517	3622522	0 %	100 %	0 %	0 %	525829191
76272	NC_021812	TTA	2	6	3622630	3622635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525829191
76273	NC_021812	GGC	2	6	3622648	3622653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525829191
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76276	NC_021812	GCTG	2	8	3622802	3622809	0 %	25 %	50 %	25 %	525829192
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76300	NC_021812	ACTTT	2	10	3623965	3623974	20 %	60 %	0 %	20 %	525829193
76301	NC_021812	TCCC	2	8	3623986	3623993	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
76302	NC_021812	C	6	6	3623991	3623996	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
76303	NC_021812	TTGC	2	8	3624018	3624025	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
76304	NC_021812	T	6	6	3624113	3624118	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76305	NC_021812	TTC	2	6	3624156	3624161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76306	NC_021812	TCC	2	6	3624171	3624176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76307	NC_021812	CGACGC	2	12	3624182	3624193	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
76308	NC_021812	ATTTC	2	10	3624200	3624209	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
76309	NC_021812	TGT	2	6	3624276	3624281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76310	NC_021812	GT	4	8	3624292	3624299	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76311	NC_021812	GC	3	6	3624301	3624306	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76312	NC_021812	GCAAA	2	10	3624348	3624357	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
76313	NC_021812	TAA	2	6	3624363	3624368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76314	NC_021812	CAA	2	6	3624375	3624380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76315	NC_021812	CAA	2	6	3624455	3624460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525829194
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76327	NC_021812	AAGA	2	8	3625093	3625100	75 %	0 %	25 %	0 %	525829194
76328	NC_021812	GGC	2	6	3625120	3625125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525829194
76329	NC_021812	GC	3	6	3625124	3625129	0 %	0 %	50 %	50 %	525829194
76330	NC_021812	GCT	2	6	3625200	3625205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525829194
76331	NC_021812	ATG	2	6	3625216	3625221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525829194
76332	NC_021812	TTA	2	6	3625271	3625276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525829194
76333	NC_021812	GC	3	6	3625303	3625308	0 %	0 %	50 %	50 %	525829194
76334	NC_021812	CGG	2	6	3625368	3625373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525829194
76335	NC_021812	CAT	2	6	3625386	3625391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525829194
76336	NC_021812	CGT	2	6	3625408	3625413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525829194
76337	NC_021812	CG	3	6	3625431	3625436	0 %	0 %	50 %	50 %	525829194
76338	NC_021812	GAT	2	6	3625509	3625514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525829194
76339	NC_021812	CTT	2	6	3625536	3625541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525829194
76340	NC_021812	TGGGC	2	10	3625562	3625571	0 %	20 %	60 %	20 %	525829194
76341	NC_021812	CGG	2	6	3625614	3625619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525829194
76342	NC_021812	CAC	2	6	3625686	3625691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525829194
76343	NC_021812	TGG	2	6	3625736	3625741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525829194
76344	NC_021812	CAT	2	6	3625743	3625748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525829194
76345	NC_021812	TTA	2	6	3625837	3625842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525829195
76346	NC_021812	CGG	2	6	3625895	3625900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525829195
76347	NC_021812	TCG	2	6	3625930	3625935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525829195
76348	NC_021812	CGCC	2	8	3626042	3626049	0 %	0 %	25 %	75 %	525829195
76349	NC_021812	GTG	2	6	3626058	3626063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525829195
76350	NC_021812	CAG	2	6	3626064	3626069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525829195
76351	NC_021812	GCT	2	6	3626088	3626093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525829195
76352	NC_021812	GCG	2	6	3626163	3626168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525829195
76353	NC_021812	TCT	2	6	3626263	3626268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525829195
76354	NC_021812	GCG	2	6	3626434	3626439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525829195
76355	NC_021812	TGC	2	6	3626440	3626445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525829195
76356	NC_021812	CG	3	6	3626472	3626477	0 %	0 %	50 %	50 %	525829195
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76471	NC_021812	CGG	2	6	3632200	3632205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525829198
76472	NC_021812	AAT	2	6	3632390	3632395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525829198
76473	NC_021812	A	6	6	3632450	3632455	100 %	0 %	0 %	0 %	525829198
76474	NC_021812	AGC	2	6	3632463	3632468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525829198
76475	NC_021812	ATC	2	6	3632502	3632507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525829198
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