MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Heidelberg str. CFSAN002069

Total Repeats: 100993

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
75001	NC_021812	CGT	2	6	3561008	3561013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525829151
75002	NC_021812	GATT	2	8	3561022	3561029	25 %	50 %	25 %	0 %	525829151
75003	NC_021812	GGC	3	9	3561094	3561102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525829151
75004	NC_021812	CGG	2	6	3561127	3561132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525829151
75005	NC_021812	ATT	2	6	3561137	3561142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525829151
75006	NC_021812	GGC	2	6	3561170	3561175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525829151
75007	NC_021812	GCG	2	6	3561207	3561212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525829151
75008	NC_021812	AAT	2	6	3561299	3561304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525829151
75009	NC_021812	GC	3	6	3561316	3561321	0 %	0 %	50 %	50 %	525829151
75010	NC_021812	TGGC	2	8	3561467	3561474	0 %	25 %	50 %	25 %	525829151
75011	NC_021812	A	6	6	3561528	3561533	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75012	NC_021812	T	7	7	3561561	3561567	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75013	NC_021812	AT	3	6	3561612	3561617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75014	NC_021812	ATA	2	6	3561624	3561629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75015	NC_021812	TGG	2	6	3561662	3561667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75016	NC_021812	A	7	7	3561671	3561677	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75017	NC_021812	TGT	2	6	3561818	3561823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75018	NC_021812	CGC	2	6	3561866	3561871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525829152
75019	NC_021812	TTCGC	2	10	3561873	3561882	0 %	40 %	20 %	40 %	525829152
75020	NC_021812	AC	3	6	3561884	3561889	50 %	0 %	0 %	50 %	525829152
75021	NC_021812	TGTT	2	8	3561902	3561909	0 %	75 %	25 %	0 %	525829152
75022	NC_021812	TTA	2	6	3561980	3561985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525829152
75023	NC_021812	GTC	2	6	3562024	3562029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525829152
75024	NC_021812	ATG	2	6	3562036	3562041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525829152
75025	NC_021812	ATT	2	6	3562062	3562067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525829152
75026	NC_021812	GGCT	2	8	3562072	3562079	0 %	25 %	50 %	25 %	525829152
75027	NC_021812	GCTCG	2	10	3562134	3562143	0 %	20 %	40 %	40 %	525829152
75028	NC_021812	ATTG	2	8	3562176	3562183	25 %	50 %	25 %	0 %	525829152
75029	NC_021812	CCT	2	6	3562220	3562225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525829152
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75032	NC_021812	GTAT	2	8	3562286	3562293	25 %	50 %	25 %	0 %	525829152
75033	NC_021812	T	6	6	3562326	3562331	0 %	100 %	0 %	0 %	525829152
75034	NC_021812	GC	3	6	3562365	3562370	0 %	0 %	50 %	50 %	525829152
75035	NC_021812	CTGC	2	8	3562390	3562397	0 %	25 %	25 %	50 %	525829152
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75038	NC_021812	TGC	2	6	3562484	3562489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525829152
75039	NC_021812	TGC	2	6	3562493	3562498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525829152
75040	NC_021812	TGA	2	6	3562521	3562526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525829152
75041	NC_021812	TGAA	2	8	3562529	3562536	50 %	25 %	25 %	0 %	525829152
75042	NC_021812	CAGG	2	8	3562557	3562564	25 %	0 %	50 %	25 %	525829152
75043	NC_021812	ATT	2	6	3562575	3562580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525829152
75044	NC_021812	CGC	2	6	3562600	3562605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525829152
75045	NC_021812	TGC	2	6	3562622	3562627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525829152
75046	NC_021812	GCA	2	6	3562638	3562643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525829152
75047	NC_021812	CAT	2	6	3562659	3562664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525829152
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75050	NC_021812	TC	3	6	3562902	3562907	0 %	50 %	0 %	50 %	525829152
75051	NC_021812	GAT	2	6	3562929	3562934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525829152
75052	NC_021812	GGT	2	6	3562968	3562973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525829152
75053	NC_021812	ATC	2	6	3563062	3563067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525829152
75054	NC_021812	GGCG	2	8	3563220	3563227	0 %	0 %	75 %	25 %	525829152
75055	NC_021812	ATG	2	6	3563291	3563296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75056	NC_021812	A	8	8	3563349	3563356	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75057	NC_021812	G	7	7	3563387	3563393	0 %	0 %	100 %	0 %	525829153
75058	NC_021812	TTA	2	6	3563417	3563422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525829153
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75060	NC_021812	CTG	2	6	3563481	3563486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525829153
75061	NC_021812	CGC	2	6	3563523	3563528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525829153
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75063	NC_021812	ATT	2	6	3563640	3563645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525829153
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75071	NC_021812	GGCGG	2	10	3564145	3564154	0 %	0 %	80 %	20 %	525829154
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75089	NC_021812	CGG	2	6	3564927	3564932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525829154
75090	NC_021812	T	6	6	3565041	3565046	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75091	NC_021812	TTCT	2	8	3565048	3565055	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
75092	NC_021812	ATT	2	6	3565112	3565117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525829155
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75103	NC_021812	CGG	2	6	3565613	3565618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525829155
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75106	NC_021812	GC	3	6	3565849	3565854	0 %	0 %	50 %	50 %	525829155
75107	NC_021812	TGG	2	6	3565916	3565921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525829155
75108	NC_021812	GCGTA	2	10	3565950	3565959	20 %	20 %	40 %	20 %	525829155
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75118	NC_021812	A	6	6	3566386	3566391	100 %	0 %	0 %	0 %	525830717
75119	NC_021812	GCG	2	6	3566399	3566404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525830717
75120	NC_021812	GATC	2	8	3566484	3566491	25 %	25 %	25 %	25 %	525830717
75121	NC_021812	TCA	2	6	3566648	3566653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525830717
75122	NC_021812	GC	3	6	3566667	3566672	0 %	0 %	50 %	50 %	525830717
75123	NC_021812	CTT	2	6	3566685	3566690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525830717
75124	NC_021812	CG	3	6	3566718	3566723	0 %	0 %	50 %	50 %	525830717
75125	NC_021812	GCC	2	6	3566897	3566902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830717
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75128	NC_021812	TCAA	2	8	3566984	3566991	50 %	25 %	0 %	25 %	525830717
75129	NC_021812	AAT	2	6	3567031	3567036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525830717
75130	NC_021812	CTGT	2	8	3567046	3567053	0 %	50 %	25 %	25 %	525830717
75131	NC_021812	CAA	2	6	3567157	3567162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525830717
75132	NC_021812	GAC	2	6	3567193	3567198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525830717
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75134	NC_021812	CAG	2	6	3567241	3567246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525830717
75135	NC_021812	CTTT	2	8	3567299	3567306	0 %	75 %	0 %	25 %	525830717
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75139	NC_021812	CAT	2	6	3567610	3567615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525829156
75140	NC_021812	GCCG	2	8	3567680	3567687	0 %	0 %	50 %	50 %	525829156
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75142	NC_021812	CGC	3	9	3567760	3567768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525829156
75143	NC_021812	GCCA	2	8	3567933	3567940	25 %	0 %	25 %	50 %	525829156
75144	NC_021812	A	6	6	3568158	3568163	100 %	0 %	0 %	0 %	525829156
75145	NC_021812	A	6	6	3568212	3568217	100 %	0 %	0 %	0 %	525829156
75146	NC_021812	ACC	2	6	3568236	3568241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525829156
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75148	NC_021812	GC	5	10	3568273	3568282	0 %	0 %	50 %	50 %	525829156
75149	NC_021812	TAA	2	6	3568366	3568371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525829156
75150	NC_021812	ATA	2	6	3568434	3568439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75151	NC_021812	CCG	2	6	3568509	3568514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75152	NC_021812	CTG	2	6	3568608	3568613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75153	NC_021812	GTG	2	6	3568640	3568645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75154	NC_021812	TTG	2	6	3568680	3568685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75155	NC_021812	T	9	9	3568725	3568733	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75156	NC_021812	CG	3	6	3568825	3568830	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75157	NC_021812	ATTG	2	8	3568857	3568864	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
75158	NC_021812	ATT	2	6	3568870	3568875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75159	NC_021812	T	8	8	3568927	3568934	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75160	NC_021812	TA	3	6	3569194	3569199	50 %	50 %	0 %	0 %	525829157
75161	NC_021812	CAGC	2	8	3569207	3569214	25 %	0 %	25 %	50 %	525829157
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75163	NC_021812	TGG	2	6	3569302	3569307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525829157
75164	NC_021812	GTG	2	6	3569322	3569327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525829157
75165	NC_021812	TGA	2	6	3569365	3569370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525829157
75166	NC_021812	GGC	2	6	3569396	3569401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525829157
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75172	NC_021812	CG	3	6	3569629	3569634	0 %	0 %	50 %	50 %	525829157
75173	NC_021812	GGC	2	6	3569657	3569662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525829157
75174	NC_021812	TTG	2	6	3569752	3569757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525829157
75175	NC_021812	TGC	2	6	3569806	3569811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525829157
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75178	NC_021812	TCG	2	6	3569855	3569860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525829157
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75180	NC_021812	CGG	2	6	3569887	3569892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525829157
75181	NC_021812	CGG	2	6	3569923	3569928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525829157
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75190	NC_021812	TGG	2	6	3570475	3570480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525829157
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75200	NC_021812	CGG	2	6	3570934	3570939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525829157
75201	NC_021812	CTTG	2	8	3571109	3571116	0 %	50 %	25 %	25 %	525829157
75202	NC_021812	AAC	2	6	3571168	3571173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525829157
75203	NC_021812	TGAG	2	8	3571178	3571185	25 %	25 %	50 %	0 %	525829157
75204	NC_021812	GTAC	2	8	3571189	3571196	25 %	25 %	25 %	25 %	525829158
75205	NC_021812	TC	3	6	3571248	3571253	0 %	50 %	0 %	50 %	525829158
75206	NC_021812	GCT	2	6	3571272	3571277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525829158
75207	NC_021812	CTG	2	6	3571294	3571299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525829158
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75209	NC_021812	TGA	2	6	3571418	3571423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525829158
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75212	NC_021812	GCG	2	6	3571612	3571617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525829158
75213	NC_021812	GCG	2	6	3571640	3571645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525829158
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75219	NC_021812	CTG	2	6	3571888	3571893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525829158
75220	NC_021812	ACGCC	2	10	3571931	3571940	20 %	0 %	20 %	60 %	525829158
75221	NC_021812	TGG	2	6	3571958	3571963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525829158
75222	NC_021812	GGCGCG	2	12	3571981	3571992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525829158
75223	NC_021812	CCG	2	6	3572036	3572041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525829158
75224	NC_021812	TCT	2	6	3572069	3572074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525829158
75225	NC_021812	TGC	2	6	3572090	3572095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525829158
75226	NC_021812	TTG	2	6	3572107	3572112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525829158
75227	NC_021812	T	6	6	3572137	3572142	0 %	100 %	0 %	0 %	525829158
75228	NC_021812	GTG	2	6	3572143	3572148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525829158
75229	NC_021812	AAG	2	6	3572179	3572184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525829158
75230	NC_021812	GGCA	2	8	3572363	3572370	25 %	0 %	50 %	25 %	525829158
75231	NC_021812	GCG	2	6	3572393	3572398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75232	NC_021812	GTAGC	2	10	3572438	3572447	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
75233	NC_021812	GCC	2	6	3572497	3572502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525829159
75234	NC_021812	GGC	2	6	3572612	3572617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525829159
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75354	NC_021812	TCGG	2	8	3578746	3578753	0 %	25 %	50 %	25 %	525829164
75355	NC_021812	AT	3	6	3578772	3578777	50 %	50 %	0 %	0 %	525829164
75356	NC_021812	CAA	2	6	3578793	3578798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525829164
75357	NC_021812	TGC	2	6	3578840	3578845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525829164
75358	NC_021812	GC	3	6	3578844	3578849	0 %	0 %	50 %	50 %	525829164
75359	NC_021812	A	7	7	3578876	3578882	100 %	0 %	0 %	0 %	525829164
75360	NC_021812	GCG	2	6	3578903	3578908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525829164
75361	NC_021812	GGCG	2	8	3578913	3578920	0 %	0 %	75 %	25 %	525829164
75362	NC_021812	CTG	2	6	3579004	3579009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525829164
75363	NC_021812	TCA	2	6	3579084	3579089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525829164
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75366	NC_021812	AG	3	6	3579164	3579169	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75367	NC_021812	ACA	2	6	3579192	3579197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75368	NC_021812	TAT	2	6	3579272	3579277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75369	NC_021812	GC	3	6	3579308	3579313	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75370	NC_021812	TGG	2	6	3579454	3579459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525829165
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75372	NC_021812	TATT	2	8	3579633	3579640	25 %	75 %	0 %	0 %	525829165
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75402	NC_021812	T	8	8	3581081	3581088	0 %	100 %	0 %	0 %	525830718
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75457	NC_021812	CTG	2	6	3584149	3584154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525829168
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75460	NC_021812	GC	3	6	3584255	3584260	0 %	0 %	50 %	50 %	525829168
75461	NC_021812	CGG	2	6	3584296	3584301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525829168
75462	NC_021812	GTCA	2	8	3584306	3584313	25 %	25 %	25 %	25 %	525829168
75463	NC_021812	GTT	2	6	3584388	3584393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525829168
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75467	NC_021812	GCT	2	6	3584670	3584675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525829168
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75470	NC_021812	ATTG	2	8	3584802	3584809	25 %	50 %	25 %	0 %	525829168
75471	NC_021812	CAG	2	6	3584812	3584817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525829168
75472	NC_021812	CGG	2	6	3584846	3584851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525829168
75473	NC_021812	CTG	2	6	3585001	3585006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525829168
75474	NC_021812	ACG	2	6	3585014	3585019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525829168
75475	NC_021812	TGA	2	6	3585059	3585064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525829168
75476	NC_021812	CGA	2	6	3585099	3585104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525829168
75477	NC_021812	GCA	2	6	3585141	3585146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525829168
75478	NC_021812	TCCA	2	8	3585175	3585182	25 %	25 %	0 %	50 %	525829168
75479	NC_021812	ATA	2	6	3585185	3585190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525829168
75480	NC_021812	CGA	2	6	3585261	3585266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525829168
75481	NC_021812	TGA	2	6	3585279	3585284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525829168
75482	NC_021812	AG	3	6	3585382	3585387	50 %	0 %	50 %	0 %	525829168
75483	NC_021812	AGTC	2	8	3585403	3585410	25 %	25 %	25 %	25 %	525829168
75484	NC_021812	T	6	6	3585514	3585519	0 %	100 %	0 %	0 %	525829168
75485	NC_021812	AG	3	6	3585552	3585557	50 %	0 %	50 %	0 %	525829168
75486	NC_021812	GAC	2	6	3585646	3585651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525829168
75487	NC_021812	CCG	2	6	3585666	3585671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525829168
75488	NC_021812	GCA	2	6	3585744	3585749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525829168
75489	NC_021812	GGCT	2	8	3585832	3585839	0 %	25 %	50 %	25 %	525829168
75490	NC_021812	AGG	2	6	3585851	3585856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525829168
75491	NC_021812	ATT	2	6	3585861	3585866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525829168
75492	NC_021812	GCG	2	6	3585941	3585946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525829168
75493	NC_021812	TCC	2	6	3585996	3586001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525829168
75494	NC_021812	TCT	2	6	3586066	3586071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525829168
75495	NC_021812	GCG	3	9	3586094	3586102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525829168
75496	NC_021812	ATG	2	6	3586133	3586138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525829168
75497	NC_021812	GAT	2	6	3586150	3586155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525829168
75498	NC_021812	ATG	2	6	3586207	3586212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525829168
75499	NC_021812	GCG	2	6	3586217	3586222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525829168
75500	NC_021812	ATG	2	6	3586380	3586385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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