MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Heidelberg str. CFSAN002069

Total Repeats: 100993

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7002	NC_021812	TGC	2	6	339897	339902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826740
7003	NC_021812	CGG	2	6	339910	339915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826740
7004	NC_021812	TTC	2	6	339989	339994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525826740
7005	NC_021812	TAA	2	6	340087	340092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826740
7006	NC_021812	CGA	2	6	340096	340101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826740
7007	NC_021812	CTA	2	6	340137	340142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826740
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7009	NC_021812	GGC	2	6	340235	340240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826740
7010	NC_021812	ATG	2	6	340275	340280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826740
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7012	NC_021812	GGC	2	6	340361	340366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826740
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7019	NC_021812	CAA	2	6	340540	340545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525826740
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7021	NC_021812	GAT	2	6	340586	340591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826740
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7029	NC_021812	CTTTT	2	10	340706	340715	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
7030	NC_021812	T	6	6	340712	340717	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7057	NC_021812	ATATC	2	10	342240	342249	40 %	40 %	0 %	20 %	525830132
7058	NC_021812	AGCG	2	8	342289	342296	25 %	0 %	50 %	25 %	525830132
7059	NC_021812	TA	3	6	342323	342328	50 %	50 %	0 %	0 %	525830132
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7122	NC_021812	CCG	2	6	345657	345662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826743
7123	NC_021812	GCG	2	6	345760	345765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826743
7124	NC_021812	CGC	2	6	345887	345892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826743
7125	NC_021812	TCA	2	6	345945	345950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826743
7126	NC_021812	CGC	2	6	345982	345987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826743
7127	NC_021812	TCAT	2	8	346020	346027	25 %	50 %	0 %	25 %	525826743
7128	NC_021812	TCA	2	6	346080	346085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826743
7129	NC_021812	TCA	2	6	346107	346112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826743
7130	NC_021812	GCC	2	6	346113	346118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826743
7131	NC_021812	CCG	2	6	346141	346146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826743
7132	NC_021812	CAA	2	6	346148	346153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525826743
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7134	NC_021812	GC	3	6	346182	346187	0 %	0 %	50 %	50 %	525826743
7135	NC_021812	C	6	6	346273	346278	0 %	0 %	0 %	100 %	525826743
7136	NC_021812	GCG	2	6	346325	346330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826743
7137	NC_021812	TGA	2	6	346363	346368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7138	NC_021812	AAC	2	6	346421	346426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7139	NC_021812	GCG	2	6	346501	346506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7140	NC_021812	GC	4	8	346522	346529	0 %	0 %	50 %	50 %	525826744
7141	NC_021812	CTG	2	6	346546	346551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826744
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7145	NC_021812	TAC	2	6	346668	346673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826744
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7148	NC_021812	CTG	2	6	346750	346755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826744
7149	NC_021812	GCC	2	6	346789	346794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826744
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7153	NC_021812	AAT	2	6	346987	346992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826744
7154	NC_021812	GTT	2	6	347037	347042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525826744
7155	NC_021812	AT	3	6	347120	347125	50 %	50 %	0 %	0 %	525826744
7156	NC_021812	TACC	2	8	347217	347224	25 %	25 %	0 %	50 %	525826744
7157	NC_021812	GCC	2	6	347284	347289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826744
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7164	NC_021812	CGG	2	6	347479	347484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826744
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7168	NC_021812	CCG	2	6	347594	347599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826744
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7180	NC_021812	GTTT	2	8	348144	348151	0 %	75 %	25 %	0 %	525826744
7181	NC_021812	T	6	6	348244	348249	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7182	NC_021812	GCA	3	9	348439	348447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826745
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7184	NC_021812	AGC	2	6	348485	348490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826745
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7188	NC_021812	GAAA	2	8	348685	348692	75 %	0 %	25 %	0 %	525826745
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7190	NC_021812	GC	3	6	348843	348848	0 %	0 %	50 %	50 %	525826745
7191	NC_021812	GAA	2	6	348932	348937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525826745
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7195	NC_021812	TAT	2	6	349022	349027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525826745
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7198	NC_021812	TTG	2	6	349055	349060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525826745
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7201	NC_021812	AT	3	6	349195	349200	50 %	50 %	0 %	0 %	525826745
7202	NC_021812	GCG	2	6	349278	349283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826745
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7205	NC_021812	AAC	2	6	349550	349555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7214	NC_021812	GCG	3	9	350154	350162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826746
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7221	NC_021812	ATA	2	6	351000	351005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826746
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7223	NC_021812	TTCCG	2	10	351106	351115	0 %	40 %	20 %	40 %	525826746
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7225	NC_021812	ACG	2	6	351186	351191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7226	NC_021812	TCG	2	6	351252	351257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7227	NC_021812	GGC	2	6	351267	351272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7228	NC_021812	C	7	7	351305	351311	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7229	NC_021812	TGA	2	6	351459	351464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7230	NC_021812	AAG	2	6	351481	351486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7231	NC_021812	CACCG	2	10	351613	351622	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
7232	NC_021812	G	6	6	351645	351650	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7233	NC_021812	C	7	7	351686	351692	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7234	NC_021812	TTC	2	6	351734	351739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7235	NC_021812	GTA	2	6	351806	351811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7236	NC_021812	TTA	2	6	351827	351832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7237	NC_021812	TGAT	2	8	351850	351857	25 %	50 %	25 %	0 %	525826747
7238	NC_021812	TGAC	2	8	351871	351878	25 %	25 %	25 %	25 %	525826747
7239	NC_021812	G	6	6	352042	352047	0 %	0 %	100 %	0 %	525826747
7240	NC_021812	GCC	2	6	352075	352080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826747
7241	NC_021812	ATGGCG	2	12	352158	352169	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	525826747
7242	NC_021812	GGC	2	6	352286	352291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826747
7243	NC_021812	GCT	2	6	352313	352318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826747
7244	NC_021812	A	6	6	352330	352335	100 %	0 %	0 %	0 %	525826747
7245	NC_021812	TGA	2	6	352358	352363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826747
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7247	NC_021812	CG	3	6	352533	352538	0 %	0 %	50 %	50 %	525826747
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7492	NC_021812	CT	3	6	364030	364035	0 %	50 %	0 %	50 %	525826758
7493	NC_021812	A	7	7	364099	364105	100 %	0 %	0 %	0 %	525826758
7494	NC_021812	TGA	2	6	364120	364125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826758
7495	NC_021812	CTG	3	9	364163	364171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826758
7496	NC_021812	AGT	2	6	364259	364264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826758
7497	NC_021812	CCG	2	6	364368	364373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826758
7498	NC_021812	GACC	2	8	364563	364570	25 %	0 %	25 %	50 %	525826758
7499	NC_021812	AGC	2	6	364654	364659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7500	NC_021812	TCCTG	2	10	364706	364715	0 %	40 %	20 %	40 %	525830135

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