MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Heidelberg str. CFSAN002069

Total Repeats: 100993

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
71501	NC_021812	GCGATA	2	12	3388982	3388993	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	525829017
71502	NC_021812	CAT	2	6	3389017	3389022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525829017
71503	NC_021812	GCA	2	6	3389023	3389028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525829017
71504	NC_021812	AAC	2	6	3389169	3389174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525829017
71505	NC_021812	TG	3	6	3389181	3389186	0 %	50 %	50 %	0 %	525829017
71506	NC_021812	TCG	2	6	3389196	3389201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525829017
71507	NC_021812	CGT	2	6	3389210	3389215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525829017
71508	NC_021812	GCG	2	6	3389380	3389385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525829018
71509	NC_021812	ATG	2	6	3389389	3389394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525829018
71510	NC_021812	CGT	2	6	3389424	3389429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525829018
71511	NC_021812	GCA	2	6	3389469	3389474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525829018
71512	NC_021812	TTG	2	6	3389483	3389488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525829018
71513	NC_021812	CGA	2	6	3389556	3389561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525829018
71514	NC_021812	GCG	2	6	3389623	3389628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525829018
71515	NC_021812	GCG	2	6	3389648	3389653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525829018
71516	NC_021812	CG	3	6	3389733	3389738	0 %	0 %	50 %	50 %	525829018
71517	NC_021812	CGTC	2	8	3389798	3389805	0 %	25 %	25 %	50 %	525829018
71518	NC_021812	CAT	2	6	3389838	3389843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525829018
71519	NC_021812	GC	3	6	3389847	3389852	0 %	0 %	50 %	50 %	525829018
71520	NC_021812	GT	3	6	3389946	3389951	0 %	50 %	50 %	0 %	525829018
71521	NC_021812	TCT	2	6	3389954	3389959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525829018
71522	NC_021812	TTC	2	6	3389980	3389985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71523	NC_021812	CGC	2	6	3390022	3390027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71524	NC_021812	A	7	7	3390041	3390047	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71525	NC_021812	T	7	7	3390053	3390059	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71526	NC_021812	AAG	2	6	3390065	3390070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71527	NC_021812	TTA	2	6	3390086	3390091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71528	NC_021812	A	6	6	3390131	3390136	100 %	0 %	0 %	0 %	525830679
71529	NC_021812	GGC	2	6	3390184	3390189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525830679
71530	NC_021812	CAG	2	6	3390191	3390196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525830679
71531	NC_021812	ACGCAA	2	12	3390221	3390232	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	525830679
71532	NC_021812	GGC	2	6	3390233	3390238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525830679
71533	NC_021812	GCA	3	9	3390258	3390266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525830679
71534	NC_021812	AG	3	6	3390274	3390279	50 %	0 %	50 %	0 %	525830679
71535	NC_021812	TCG	2	6	3390327	3390332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830679
71536	NC_021812	CGA	2	6	3390343	3390348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525830679
71537	NC_021812	GCC	2	6	3390554	3390559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71538	NC_021812	AGG	2	6	3390581	3390586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71539	NC_021812	TGA	2	6	3390590	3390595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525829019
71540	NC_021812	GCG	2	6	3390630	3390635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525829019
71541	NC_021812	TTTCAT	2	12	3390715	3390726	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	525829019
71542	NC_021812	GGC	2	6	3390800	3390805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525829019
71543	NC_021812	CTGG	2	8	3390936	3390943	0 %	25 %	50 %	25 %	525829019
71544	NC_021812	AGC	2	6	3390980	3390985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525829019
71545	NC_021812	GCG	2	6	3391075	3391080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525829019
71546	NC_021812	GGC	2	6	3391094	3391099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525829019
71547	NC_021812	CAG	2	6	3391125	3391130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525829019
71548	NC_021812	GAC	2	6	3391164	3391169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525829019
71549	NC_021812	GCC	2	6	3391170	3391175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525829019
71550	NC_021812	CCA	2	6	3391209	3391214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525829019
71551	NC_021812	GTG	2	6	3391240	3391245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525829019
71552	NC_021812	GGCG	2	8	3391261	3391268	0 %	0 %	75 %	25 %	525829019
71553	NC_021812	GGT	2	6	3391275	3391280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525829019
71554	NC_021812	TATT	2	8	3391324	3391331	25 %	75 %	0 %	0 %	525829019
71555	NC_021812	GCG	2	6	3391352	3391357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525829019
71556	NC_021812	TCT	2	6	3391379	3391384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525829019
71557	NC_021812	GCT	2	6	3391425	3391430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525829019
71558	NC_021812	ATCT	2	8	3391438	3391445	25 %	50 %	0 %	25 %	525829019
71559	NC_021812	TAT	2	6	3391508	3391513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71560	NC_021812	ACT	2	6	3391627	3391632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525829020
71561	NC_021812	A	6	6	3391749	3391754	100 %	0 %	0 %	0 %	525829020
71562	NC_021812	GC	3	6	3391888	3391893	0 %	0 %	50 %	50 %	525829020
71563	NC_021812	GAT	2	6	3391896	3391901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525829020
71564	NC_021812	GCT	2	6	3391958	3391963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525829020
71565	NC_021812	CGG	2	6	3391987	3391992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525829020
71566	NC_021812	CTG	2	6	3392061	3392066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525829020
71567	NC_021812	CAC	2	6	3392072	3392077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525829020
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71569	NC_021812	GCG	2	6	3392139	3392144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525829020
71570	NC_021812	AGC	2	6	3392158	3392163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525829020
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71573	NC_021812	CGGG	2	8	3392270	3392277	0 %	0 %	75 %	25 %	525829020
71574	NC_021812	GC	3	6	3392291	3392296	0 %	0 %	50 %	50 %	525829020
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71583	NC_021812	GTC	2	6	3392575	3392580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525829020
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71585	NC_021812	CTG	2	6	3392595	3392600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525829020
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71588	NC_021812	CGA	2	6	3392726	3392731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525829020
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71590	NC_021812	CGA	2	6	3392987	3392992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525829020
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71601	NC_021812	CT	3	6	3393542	3393547	0 %	50 %	0 %	50 %	525829020
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71611	NC_021812	AG	3	6	3394004	3394009	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71612	NC_021812	GTT	2	6	3394078	3394083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71613	NC_021812	TA	3	6	3394088	3394093	50 %	50 %	0 %	0 %	525829021
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71974	NC_021812	TCG	2	6	3410457	3410462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525829033
71975	NC_021812	GTT	2	6	3410464	3410469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525829033
71976	NC_021812	ACC	2	6	3410522	3410527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525829033
71977	NC_021812	GGT	2	6	3410536	3410541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525829033
71978	NC_021812	GCT	2	6	3410563	3410568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525829033
71979	NC_021812	CGG	2	6	3410601	3410606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525829033
71980	NC_021812	ACA	2	6	3410616	3410621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525829033
71981	NC_021812	GGC	2	6	3410668	3410673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525829033
71982	NC_021812	TGC	3	9	3410682	3410690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525829033
71983	NC_021812	CGCGC	2	10	3410738	3410747	0 %	0 %	40 %	60 %	525829033
71984	NC_021812	GGGTA	2	10	3410757	3410766	20 %	20 %	60 %	0 %	525829033
71985	NC_021812	CTG	2	6	3410861	3410866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525829034
71986	NC_021812	TGG	2	6	3410877	3410882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525829034
71987	NC_021812	GAT	2	6	3411020	3411025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525829034
71988	NC_021812	GAT	2	6	3411028	3411033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525829034
71989	NC_021812	TAC	2	6	3411070	3411075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525829034
71990	NC_021812	CG	3	6	3411086	3411091	0 %	0 %	50 %	50 %	525829034
71991	NC_021812	TGA	2	6	3411117	3411122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525829034
71992	NC_021812	TGC	2	6	3411135	3411140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525829034
71993	NC_021812	TGGTC	2	10	3411163	3411172	0 %	40 %	40 %	20 %	525829034
71994	NC_021812	CTG	2	6	3411205	3411210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71995	NC_021812	T	6	6	3411248	3411253	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71996	NC_021812	CGC	2	6	3411329	3411334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525829035
71997	NC_021812	GTAAC	2	10	3411355	3411364	40 %	20 %	20 %	20 %	525829035
71998	NC_021812	GGCC	2	8	3411416	3411423	0 %	0 %	50 %	50 %	525829035
71999	NC_021812	CTG	2	6	3411438	3411443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525829035
72000	NC_021812	GCC	2	6	3411474	3411479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525829035

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