MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Heidelberg str. CFSAN002069

Total Repeats: 100993

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_021812	GCA	2	6	317793	317798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826720
6502	NC_021812	AGA	2	6	317808	317813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525826720
6503	NC_021812	TGC	2	6	317831	317836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826720
6504	NC_021812	GGC	2	6	317838	317843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826720
6505	NC_021812	TCA	2	6	317865	317870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826720
6506	NC_021812	AAC	2	6	317879	317884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525826720
6507	NC_021812	CCTGG	2	10	317886	317895	0 %	20 %	40 %	40 %	525826720
6508	NC_021812	GTC	2	6	317910	317915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826720
6509	NC_021812	ATT	2	6	318016	318021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525826720
6510	NC_021812	CAC	2	6	318129	318134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6511	NC_021812	AAC	2	6	318299	318304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6512	NC_021812	AC	3	6	318346	318351	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6513	NC_021812	CACCCT	2	12	318361	318372	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	525826721
6514	NC_021812	CTG	2	6	318470	318475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826721
6515	NC_021812	T	6	6	318518	318523	0 %	100 %	0 %	0 %	525826721
6516	NC_021812	GCC	2	6	318625	318630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826721
6517	NC_021812	CGCC	2	8	318678	318685	0 %	0 %	25 %	75 %	525826721
6518	NC_021812	GTTCC	2	10	318747	318756	0 %	40 %	20 %	40 %	525826721
6519	NC_021812	GCG	2	6	318773	318778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826721
6520	NC_021812	CGC	2	6	318891	318896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826721
6521	NC_021812	CAG	2	6	318916	318921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826721
6522	NC_021812	ATAA	2	8	319071	319078	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6523	NC_021812	A	6	6	319104	319109	100 %	0 %	0 %	0 %	525826722
6524	NC_021812	TGT	2	6	319138	319143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525826722
6525	NC_021812	GCCGC	2	10	319161	319170	0 %	0 %	40 %	60 %	525826722
6526	NC_021812	CCA	2	6	319180	319185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525826722
6527	NC_021812	AGC	2	6	319198	319203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826722
6528	NC_021812	AGA	2	6	319237	319242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525826722
6529	NC_021812	CGC	2	6	319274	319279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826722
6530	NC_021812	ATT	2	6	319350	319355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525826722
6531	NC_021812	CAC	2	6	319511	319516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525826722
6532	NC_021812	TGG	2	6	319528	319533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525826722
6533	NC_021812	ACC	2	6	319740	319745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525826722
6534	NC_021812	GACG	2	8	319746	319753	25 %	0 %	50 %	25 %	525826722
6535	NC_021812	GAT	2	6	319785	319790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826722
6536	NC_021812	CTT	2	6	319796	319801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525826722
6537	NC_021812	GTG	2	6	319824	319829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525826722
6538	NC_021812	TGA	2	6	319862	319867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826722
6539	NC_021812	CGC	2	6	319948	319953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826722
6540	NC_021812	CTG	2	6	319989	319994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826722
6541	NC_021812	GATAC	2	10	320010	320019	40 %	20 %	20 %	20 %	525826723
6542	NC_021812	CTGG	2	8	320072	320079	0 %	25 %	50 %	25 %	525826723
6543	NC_021812	ATC	2	6	320106	320111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826723
6544	NC_021812	TGGC	2	8	320148	320155	0 %	25 %	50 %	25 %	525826723
6545	NC_021812	GCC	2	6	320172	320177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826723
6546	NC_021812	CTT	2	6	320184	320189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525826723
6547	NC_021812	CCG	2	6	320266	320271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826723
6548	NC_021812	GCC	2	6	320339	320344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826723
6549	NC_021812	TGA	2	6	320458	320463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826723
6550	NC_021812	CGG	2	6	320501	320506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826723
6551	NC_021812	GC	3	6	320566	320571	0 %	0 %	50 %	50 %	525826723
6552	NC_021812	TGA	2	6	320572	320577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826723
6553	NC_021812	ACC	2	6	320789	320794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525826724
6554	NC_021812	GAT	2	6	320803	320808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826724
6555	NC_021812	CAG	2	6	320827	320832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826724
6556	NC_021812	CGC	2	6	320888	320893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826724
6557	NC_021812	CAG	2	6	320912	320917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826724
6558	NC_021812	GAA	2	6	320945	320950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525826724
6559	NC_021812	GTTGG	2	10	320974	320983	0 %	40 %	60 %	0 %	525826724
6560	NC_021812	GC	3	6	320990	320995	0 %	0 %	50 %	50 %	525826724
6561	NC_021812	GCAA	2	8	320997	321004	50 %	0 %	25 %	25 %	525826724
6562	NC_021812	TGG	2	6	321027	321032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525826724
6563	NC_021812	GCC	2	6	321119	321124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826724
6564	NC_021812	CCG	2	6	321128	321133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826724
6565	NC_021812	CTG	2	6	321137	321142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826724
6566	NC_021812	A	6	6	321223	321228	100 %	0 %	0 %	0 %	525826724
6567	NC_021812	CGA	2	6	321256	321261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826724
6568	NC_021812	TGA	2	6	321328	321333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826724
6569	NC_021812	CTG	2	6	321335	321340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826724
6570	NC_021812	GACC	2	8	321427	321434	25 %	0 %	25 %	50 %	525826724
6571	NC_021812	CG	3	6	321451	321456	0 %	0 %	50 %	50 %	525826724
6572	NC_021812	CGC	2	6	321465	321470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826724
6573	NC_021812	GAT	2	6	321494	321499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826724
6574	NC_021812	ACG	2	6	321531	321536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826724
6575	NC_021812	TGA	2	6	321697	321702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826724
6576	NC_021812	GACG	2	8	321704	321711	25 %	0 %	50 %	25 %	525826724
6577	NC_021812	TC	3	6	321726	321731	0 %	50 %	0 %	50 %	525826724
6578	NC_021812	GCC	2	6	321807	321812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6579	NC_021812	ATT	2	6	321841	321846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6580	NC_021812	GC	3	6	321967	321972	0 %	0 %	50 %	50 %	525826725
6581	NC_021812	TCG	2	6	321979	321984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826725
6582	NC_021812	CTG	2	6	321986	321991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826725
6583	NC_021812	GCTG	2	8	322021	322028	0 %	25 %	50 %	25 %	525826725
6584	NC_021812	CGC	2	6	322030	322035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826725
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6586	NC_021812	A	6	6	322188	322193	100 %	0 %	0 %	0 %	525826725
6587	NC_021812	GCT	2	6	322294	322299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826725
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6589	NC_021812	CGC	2	6	322351	322356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826725
6590	NC_021812	GGC	2	6	322360	322365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826725
6591	NC_021812	CGC	2	6	322389	322394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826725
6592	NC_021812	GCG	2	6	322422	322427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826725
6593	NC_021812	GGCG	2	8	322441	322448	0 %	0 %	75 %	25 %	525826725
6594	NC_021812	CCG	2	6	322539	322544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826725
6595	NC_021812	TCG	2	6	322545	322550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826725
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6598	NC_021812	CG	3	6	322624	322629	0 %	0 %	50 %	50 %	525826725
6599	NC_021812	TGA	2	6	322695	322700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826725
6600	NC_021812	GCCA	2	8	322703	322710	25 %	0 %	25 %	50 %	525826725
6601	NC_021812	GGGC	2	8	322759	322766	0 %	0 %	75 %	25 %	525826725
6602	NC_021812	CGT	2	6	322822	322827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826725
6603	NC_021812	CT	3	6	322841	322846	0 %	50 %	0 %	50 %	525826725
6604	NC_021812	CCG	2	6	322847	322852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826725
6605	NC_021812	TG	3	6	322879	322884	0 %	50 %	50 %	0 %	525826725
6606	NC_021812	CAG	2	6	322906	322911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826725
6607	NC_021812	GC	3	6	322920	322925	0 %	0 %	50 %	50 %	525826725
6608	NC_021812	GCG	2	6	322929	322934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826725
6609	NC_021812	ATT	2	6	322948	322953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525826725
6610	NC_021812	GGC	2	6	323062	323067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826725
6611	NC_021812	TGA	2	6	323097	323102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826725
6612	NC_021812	CTG	2	6	323141	323146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826725
6613	NC_021812	TCTA	2	8	323195	323202	25 %	50 %	0 %	25 %	525826725
6614	NC_021812	GCT	2	6	323254	323259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826726
6615	NC_021812	GC	3	6	323262	323267	0 %	0 %	50 %	50 %	525826726
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6617	NC_021812	T	6	6	323306	323311	0 %	100 %	0 %	0 %	525826726
6618	NC_021812	AAT	2	6	323324	323329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826726
6619	NC_021812	GCCAG	2	10	323343	323352	20 %	0 %	40 %	40 %	525826726
6620	NC_021812	CAGT	2	8	323413	323420	25 %	25 %	25 %	25 %	525826726
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6622	NC_021812	ACC	2	6	323454	323459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525826726
6623	NC_021812	ACC	2	6	323484	323489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525826726
6624	NC_021812	TCAT	2	8	323511	323518	25 %	50 %	0 %	25 %	525826726
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6639	NC_021812	CTG	2	6	324139	324144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826727
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6661	NC_021812	TAAT	2	8	325349	325356	50 %	50 %	0 %	0 %	525826728
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6995	NC_021812	CTG	2	6	339558	339563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826740
6996	NC_021812	GCA	2	6	339566	339571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826740
6997	NC_021812	CGC	2	6	339574	339579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826740
6998	NC_021812	CAA	2	6	339601	339606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525826740
6999	NC_021812	TGA	2	6	339649	339654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826740
7000	NC_021812	CGAAGG	2	12	339772	339783	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	525826740

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