MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Heidelberg str. CFSAN002069

Total Repeats: 100993

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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67502	NC_021812	GCAG	2	8	3203209	3203216	25 %	0 %	50 %	25 %	525828865
67503	NC_021812	CGC	2	6	3203263	3203268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525828865
67504	NC_021812	ACC	2	6	3203291	3203296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525828865
67505	NC_021812	GGC	2	6	3203434	3203439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828865
67506	NC_021812	GGC	2	6	3203455	3203460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828865
67507	NC_021812	GTCC	2	8	3203465	3203472	0 %	25 %	25 %	50 %	525828865
67508	NC_021812	GAA	2	6	3203504	3203509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525828865
67509	NC_021812	GCG	2	6	3203526	3203531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828865
67510	NC_021812	GCG	4	12	3203535	3203546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828865
67511	NC_021812	AAG	2	6	3203613	3203618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525828865
67512	NC_021812	TC	3	6	3203641	3203646	0 %	50 %	0 %	50 %	525828865
67513	NC_021812	GGT	2	6	3203677	3203682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525828865
67514	NC_021812	TGC	2	6	3203709	3203714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828865
67515	NC_021812	CGT	2	6	3203753	3203758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828865
67516	NC_021812	ATG	2	6	3203834	3203839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525828865
67517	NC_021812	CGT	2	6	3203843	3203848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828865
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67519	NC_021812	GCCAG	2	10	3203878	3203887	20 %	0 %	40 %	40 %	525828865
67520	NC_021812	ATTG	2	8	3203896	3203903	25 %	50 %	25 %	0 %	525828865
67521	NC_021812	CG	3	6	3203944	3203949	0 %	0 %	50 %	50 %	525828865
67522	NC_021812	CGC	2	6	3204051	3204056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525828865
67523	NC_021812	GGC	2	6	3204104	3204109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828865
67524	NC_021812	ACG	2	6	3204185	3204190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525828865
67525	NC_021812	GTAGGC	2	12	3204317	3204328	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	525828865
67526	NC_021812	GGC	2	6	3204362	3204367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828865
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67528	NC_021812	GCC	2	6	3204406	3204411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67529	NC_021812	AGCGC	2	10	3204423	3204432	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
67530	NC_021812	TTTC	2	8	3204504	3204511	0 %	75 %	0 %	25 %	525828866
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67532	NC_021812	TTCCGG	2	12	3204723	3204734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828866
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67534	NC_021812	TTCC	2	8	3204807	3204814	0 %	50 %	0 %	50 %	525828866
67535	NC_021812	CCAG	2	8	3204858	3204865	25 %	0 %	25 %	50 %	525828866
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67539	NC_021812	GC	3	6	3204987	3204992	0 %	0 %	50 %	50 %	525828866
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67543	NC_021812	TTA	2	6	3205166	3205171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525828866
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67549	NC_021812	TGC	2	6	3205272	3205277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828866
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67553	NC_021812	TAT	2	6	3205500	3205505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67554	NC_021812	GCG	2	6	3205554	3205559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67555	NC_021812	CT	4	8	3205585	3205592	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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67852	NC_021812	CGC	2	6	3218322	3218327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525828878
67853	NC_021812	CGG	2	6	3218385	3218390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828878
67854	NC_021812	CAGC	2	8	3218397	3218404	25 %	0 %	25 %	50 %	525828878
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67856	NC_021812	CGG	2	6	3218456	3218461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828878
67857	NC_021812	GC	3	6	3218480	3218485	0 %	0 %	50 %	50 %	525828878
67858	NC_021812	GTG	2	6	3218509	3218514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525828878
67859	NC_021812	TGC	2	6	3218549	3218554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828878
67860	NC_021812	CCGCG	2	10	3218589	3218598	0 %	0 %	40 %	60 %	525828878
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67862	NC_021812	CAGGC	2	10	3218744	3218753	20 %	0 %	40 %	40 %	525828879
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67865	NC_021812	CTG	4	12	3218773	3218784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828879
67866	NC_021812	TGGC	2	8	3218785	3218792	0 %	25 %	50 %	25 %	525828879
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67869	NC_021812	CTG	2	6	3218896	3218901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828879
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67876	NC_021812	CTG	2	6	3219169	3219174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828879
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67890	NC_021812	CGC	2	6	3219537	3219542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525828879
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67938	NC_021812	A	6	6	3221864	3221869	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67939	NC_021812	GCA	3	9	3221877	3221885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67940	NC_021812	ACATC	2	10	3221903	3221912	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
67941	NC_021812	GCA	2	6	3221946	3221951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525828882
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67945	NC_021812	GAT	2	6	3222064	3222069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525828882
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67947	NC_021812	T	6	6	3222111	3222116	0 %	100 %	0 %	0 %	525828882
67948	NC_021812	GAA	2	6	3222215	3222220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525828882
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67950	NC_021812	CTG	2	6	3222538	3222543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828882
67951	NC_021812	GGAA	2	8	3222565	3222572	50 %	0 %	50 %	0 %	525828882
67952	NC_021812	AGC	2	6	3222653	3222658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525828882
67953	NC_021812	GC	3	6	3222657	3222662	0 %	0 %	50 %	50 %	525828882
67954	NC_021812	AAT	2	6	3222751	3222756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525828882
67955	NC_021812	ACCG	2	8	3222793	3222800	25 %	0 %	25 %	50 %	525828882
67956	NC_021812	GTC	2	6	3222901	3222906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828882
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67958	NC_021812	CGTC	2	8	3222935	3222942	0 %	25 %	25 %	50 %	525828882
67959	NC_021812	TCT	2	6	3222960	3222965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525828882
67960	NC_021812	ATT	2	6	3222985	3222990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525828882
67961	NC_021812	T	6	6	3223087	3223092	0 %	100 %	0 %	0 %	525828882
67962	NC_021812	CTC	2	6	3223096	3223101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525828882
67963	NC_021812	GCG	2	6	3223121	3223126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828882
67964	NC_021812	GAC	2	6	3223147	3223152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525828882
67965	NC_021812	GCAG	2	8	3223154	3223161	25 %	0 %	50 %	25 %	525828882
67966	NC_021812	GCCTG	2	10	3223199	3223208	0 %	20 %	40 %	40 %	525828882
67967	NC_021812	CCTGG	2	10	3223212	3223221	0 %	20 %	40 %	40 %	525828882
67968	NC_021812	GT	3	6	3223295	3223300	0 %	50 %	50 %	0 %	525828882
67969	NC_021812	T	6	6	3223300	3223305	0 %	100 %	0 %	0 %	525828882
67970	NC_021812	TGC	2	6	3223312	3223317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67971	NC_021812	TGAA	2	8	3223328	3223335	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67972	NC_021812	ATA	2	6	3223392	3223397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67973	NC_021812	AG	4	8	3223415	3223422	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67974	NC_021812	AAT	2	6	3223512	3223517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525828883
67975	NC_021812	ACGGA	2	10	3223576	3223585	40 %	0 %	40 %	20 %	525828883
67976	NC_021812	GCA	2	6	3223608	3223613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525828883
67977	NC_021812	GCT	2	6	3223615	3223620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828883
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67979	NC_021812	CAGCT	2	10	3223729	3223738	20 %	20 %	20 %	40 %	525828883
67980	NC_021812	T	7	7	3223742	3223748	0 %	100 %	0 %	0 %	525828883
67981	NC_021812	CTG	2	6	3223768	3223773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828883
67982	NC_021812	ATG	2	6	3223817	3223822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525828883
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67984	NC_021812	T	7	7	3223998	3224004	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67985	NC_021812	ACG	2	6	3224017	3224022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67986	NC_021812	AATAAC	2	12	3224041	3224052	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67987	NC_021812	GAC	2	6	3224119	3224124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525828884
67988	NC_021812	A	6	6	3224179	3224184	100 %	0 %	0 %	0 %	525828884
67989	NC_021812	TCG	2	6	3224185	3224190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828884
67990	NC_021812	CGG	2	6	3224202	3224207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525828884
67991	NC_021812	ATT	2	6	3224229	3224234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525828884
67992	NC_021812	G	7	7	3224285	3224291	0 %	0 %	100 %	0 %	525828884
67993	NC_021812	TCT	2	6	3224324	3224329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525828884
67994	NC_021812	GCGA	2	8	3224345	3224352	25 %	0 %	50 %	25 %	525828884
67995	NC_021812	TGC	2	6	3224381	3224386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828884
67996	NC_021812	GATC	2	8	3224421	3224428	25 %	25 %	25 %	25 %	525828884
67997	NC_021812	ATT	2	6	3224437	3224442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525828884
67998	NC_021812	GACG	2	8	3224463	3224470	25 %	0 %	50 %	25 %	525828884
67999	NC_021812	TGC	2	6	3224516	3224521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525828884
68000	NC_021812	CCG	2	6	3224584	3224589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525828884

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